NGSワークフローステップ

NGSワークフローの準備

次世代シーケンサーワークフローは、核酸の単離から始まり、ライブラリー調製が続きます。ライブラリーは、幅広いアプリケーションとスループットに対応するよう設計されたイルミナのシーケンスシステムでシーケンスされます。その後、生成されたデータを解析して洞察を得ます。

各ステップの基本をご紹介します。NGSワークフローのご計画にお役立てください。

ステップ1：核酸抽出

NGS実験の全体的なワークフローは、遺伝物質の分離から始まります。核酸は、バルク組織、個々の細胞、または生体液などのサンプルから分離されます。抽出後のほとんどのNGSワークフローで、QCステップを行う必要があります。純度評価にはUV分光光度法、核酸定量には蛍光測定法の使用をお勧めします。

ステップ2：DNAライブラリー調製

ライブラリー調製プロセスでは、ゲノムDNAサンプル（またはcDNAサンプル）を断片ライブラリーに変換した後に、NGS装置でシーケンスすることができます。

ライブラリー調製の詳細はこちら

ステップ3：シーケンシング

ヌクレオチドは、特定のユースケースに推奨されるリード長（シーケンサーが読み取るDNA断片の長さ）と深度（サンプルごとに取得される「リード」数）で、イルミナのシーケンサーでリードされます。

イルミナは、実績のあるSequence by Synthesis（SBS）ケミストリーを使用して伸長しているDNA鎖に組み込まれている単一塩基を検出します。幅広いスループットとアプリケーションをサポートするため、いくつかのシーケンスプラットフォームを利用できるため、研究の質問が何であっても、シンプルなプッシュボタン操作によるワークフローでより迅速に回答を得るのに役立ちます。

詳細については、以下のリソースをご覧ください。

SBSテクノロジーのご紹介

大規模並列シーケンスが可能な、イルミナの次世代シーケンサーテクノロジーをご紹介します。

XLEAP-SBSのケミストリー

NovaSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、当社史上最も高速かつ高品質、そして最もロバストなSequence by Synthesis（SBS）ケミストリーである、XLEAP-SBSの手法に対応しています。

ベンチトップシーケンサー

ベンチトップシーケンサーを比較して、それぞれに研究目標に最適なものがどれであるかご確認ください。

ステップ4：データ解析およびデータ解釈

バイオインフォマティクスツールを使用して、イルミナのシーケンサーから出る一連のAs、Ts、Gs、Cs、またはリードを理解します。

NGS解析は、非常にアクセスしやすくなっています。一部の装置には、すぐに使用できるデータ解析が内蔵されており、バイオインフォマティクスの経験のない新規ユーザーや、追加のラボスタッフを雇用する予算がないラボでも簡単に使用できます。Illumina Connected Softwareポートフォリオは、ハイインパクトな研究を推進するために、多用途で統合可能、かつアクセスしやすいデータ解析ソリューションを提供します。

詳細については、以下のリソースをご覧ください。

注目のワークフロー：RNAシーケンシング

RNA分離

サンプルタイプに応じて、複数のサードパーティ製のRNA単離キットから選択可能です。

シーケンス

MiSeq i100 シリーズ

小型パネルの場合：ターゲットリシーケンス、メタゲノム、小規模ゲノムシーケンス、ターゲット遺伝子発現プロファイリングなど。

NextSeq 1000/2000システム

大型パネルの場合：ターゲットシーケンス、RNA-Seq、シングルセル法、エクソームシーケンスなど。

補足資料

NGSチュートリアル

動画、オンライントレーニング、および技術記事で、ライブラリー調製、シーケンス、およびデータ解析に関連するヒントとベストプラクティスが得られるNGSチュートリアルです。

NGSアプリケーション

研究の焦点が何であっても、NGSは、多様性のあるサンプルタイプに対して発表されている幅広いアレイを使用して、さまざまな生物学的疑問に対する答えを追求する上で重要な役割を果たします。

NGSの使用についてご質問がありますか？

特定の研究分野におけるNGSについてご質問がございましたら、お気軽にお問い合わせください。専門スタッフがご質問にお答えし、お客様の環境に最適なソリューションをご提案いたします。

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