iSeqのパワーと携帯性

いくつかのラボ停電を除き、iSeqはフルフォースで実行され、鎖RNA-seq調製とそれに続く溶液中のハイブリダイゼーション濃縮反応を組み合わせたターゲット濃縮戦略を使用して、エンドツーエンドの次世代シーケンス（NGS）反応を実施していました。Catherine Prattは、シーケンスの進行中、適切なシーケンス技術とプロトコールについて地元の科学者のトレーニングを行っていました。これらすべての研究により、EVDの感染拡大の原因となった菌株を特徴付ける高品質で正確なデータが得られました。

最初のEVD症例は、2018年5月にエクアトゥール州のビコロ健康区で同定されました。7月の巡回までに、Bikoro、Iboko、Wangataの3つの地域で54人が感染し、33人が命を落としました。7月の集大成で、皆が安堵を吸い込み、感染拡大が宣言され、海外のファーストレスポンダーがKinshasaを退去し始めました。わずか1週間後の8月1日、オクアトゥール州から東に2,000 km離れた北キブ地域で2回目の感染拡大が検出されました。

INRBで新たに確立したフィールドシーケンス機能がテストされ、新しい感染拡大に迅速に対応できるようになりました。Muyemebe博士とそのチームは、サンプルの受領から4日以内に実用的なデータを生成できました。このデータから、北キヴ島での感染拡大は、エクアトゥー州での最近の感染拡大とは無関係であることがわかりました。

iSeqはタイムリーで重要な情報を提供し、ウイルス株が確認されました。この情報は、感染拡大に対応するための次のステップを決定する上で役立ちました。iSeqの高品質で正確なシーケンスデータと広範な疫学的所見を組み合わせることで、地元の科学者は感染パターンを分析し、感染拡大の原因を追跡できるようになりました。イルミナのテクノロジーが加わったことで、この公衆衛生上の危機への効果的な対応が可能になりました。

Wileyの目標は、アフリカ全土でトレーニングを受けたサイエンティストのネットワークを構築し、公衆衛生の蔓延への対応を現地で迅速に行えるようにすることです。新しい現実は、この作業を実施するためにファンシーゲノムセンターにサンプルを送付する必要がないということです。シーケンスを実行できる範囲は大幅に拡大しています。サンプル処理用のプロトコールと試薬は、より使いやすく、シーケンサーはより携帯性に優れています。その結果、データや結果をより迅速に生成し、NGSを感染拡大への対応のための別のツールにすることができます。

また、イルミナでは、ヒト（およびウイルス）ゲノムを解き放ち、健康を改善するシーケンサーを構築することで、アフリカ全土でこれらのイニシアチブを支援できることを誇りに思っています。

*この記事に含まれる情報は、必ずしも政府の立場や方針を反映したものではなく、正式な支持を推測すべきではありません。