Illumina RNA Prep with Enrichment

Illumina RNA Prep with Enrichmentはビーズ上でのタグメンテーション技術を使用しシンプルな1回のハイブリダイゼーションを行うことで、RNAベースのライブラリー調製および濃縮を極めて迅速なワークフローにしています。

迅速かつシンプルで拡張性の高いワークフロー

総所要時間9時間以内、ハンズオンタイム2時間以内でライブラリー調製と濃縮ができます。このワークフローで、TruSeq RNA Exomeと比べ50%超の時間が節約できます。イルミナ認定の自動化オプションは、当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。

解析困難なサンプルから高品質のデータを

新鮮／凍結サンプルのトータルRNAであれば10 ng、分解サンプル（FFPEなど）のトータルRNAでも20 ngほどの少量で高感度を達成できます。

手頃なコストとフォーカス

ターゲットトランスクリプトームのコード領域だけを対象とすることにより、わずかなシーケンス深度で最大の検出力が得られます。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、優れたキャプチャー効率とカバレッジ均一性をもたらし、バイアスを入れず精確に検出するために必要なシーケンス深度を最小化できるように作られています。各濃縮反応には、わずか2.5 µLのプローブが必要です。

柔軟性の高いモジュールパネル設計

さまざまな既製の検証済みプローブプールから選ぶことも、独自のプローブをカスタマイズすることもでき、最大限の柔軟性があります。新しくなったユニークデュアルインデックスSet CとD（近日発売予定）により、1回のランで最大384サンプルのマルチプレックスが可能です。目的とする領域の幅広いRNA-Seqアプリケーションに対応するモジュール設計で、アリル特異的発現解析、遺伝子融合検出、バイオマーカースクリーニングなど、さまざまな検出や探索が可能です。

RNAエクソーム解析が可能

RNAエクソームを含む膨大な数のターゲット遺伝子を迅速に狙って解析します。Illumina RNA Prep with Enrichmentに、コーディングRNA配列を網羅的にカバーする高度に最適化されたプローブセット、Illumina Exome Panelを組み合わせることもできます。Illumina Exome Panelには425,000を超えるプローブが含まれます。各プローブはNCBI37/hg19のリファレンスゲノムに対して構築され、RefSeqエクソームの98%超を網羅しています。このプローブセットで、目的とする21,415個の遺伝子に及ぶ214,000個を超えるターゲットをキャプチャーできます。 

呼吸器系ウイルスの検出

Respiratory Virus Oligo Panelは、コロナウイルス株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度検出と特性解析が可能です。ハイブリキャプチャー法によるターゲット濃縮に使用するオリゴプローブは、高変異領域内であっても効率的なため、急速に進化するRNAウイルスをターゲットにすることができます。Respiratory Virus Oligo PanelはIllumina RNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用します。