Illumina Custom Enrichment Panel v2
複数のターゲットシーケンスアプリケーションに対応する、シンプルかつ効率的なターゲットカスタムエンリッチメントパネル。
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、オンビーズタグメンテーションに続いて、簡素化された90分間のハイブリダイゼーションステップを用いることで、RNAシーケンス（RNA-Seq）用途に非常に高速なソリューションを提供します。
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス付きシーケンスライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。
<9時間
アッセイ時間
<2時間
ハンズオンタイム
10 ng RNA、20 ng FFPE RNA、最大1000 ngの高品質RNA
インプット量
概要
迅速、シンプル、そしてスケーラブルなワークフロー
ハンズオンタイムは2時間未満、総時間9時間未満でシーケンス対応ライブラリーを調製およびエンリッチメントします。イルミナのハイスループットシーケンス装置と組み合わせることで、1ランあたりのサンプル数を大幅に増加させます。
困難なサンプルから得られる高品質データ
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織切片など、限られた出発材料や損傷・分解したサンプルから、再現性のある結果の取得を可能にします。
手頃な価格で効率的なカバレッジ
卓越したキャプチャー効率とカバレッジ均一性により、シーケンス深度のごく一部で探索力を最大化し、バイアスのない正確な検出に必要なシーケンス深度を最小限に抑えます。
柔軟なモジュール式パネル設計
事前に構築された検証済みプローブ、または最大限の柔軟性を実現するカスタムv2プローブパネルを用いて、アレル特異的発現、融合検出、バイオマーカースクリーニングなどの探索研究をサポートします。DesignStudioソフトウェアを使用してカスタムプローブパネルを設計します。
仕様
| アッセイ時間 | <9時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) |
| コンテンツ仕様 | DesignStudioアッセイツールで設計されたカスタムv2オリゴ、またはイルミナエクソームパネルで使用する場合のコーディングトランスクリプトーム全体を使用してカスタムターゲットをキャプチャー |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織切片やその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプやインプットから、スプライスバリアント、遺伝子融合、および小型ヌクレオチドバリアントのターゲット転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション |
| ハンズオンタイム | <2時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA、最大1000 ngの高品質RNA |
| システム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 手法 | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | Any species, ヒト, ウイルス |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） |
必要な製品
RNA Prep with Enrichmentワークフローを完了するには、ライブラリー調製キット、プローブパネル、およびインデックスアダプター（すべて別売）を使用する必要があります。
オプションのコンポーネントには、以下が含まれます：
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment：推奨とは異なるプレキシティで処理するユーザー向けのエンリッチメント試薬のみ
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation：推奨とは異なるプレキシティで処理するユーザー向けのプレエンリッチメント試薬のみ
/
件
アプリケーション
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、アレル特異的発現、融合検出、バイオマーカースクリーニングなどの検出および探索研究を含む幅広いRNA-Seqアプリケーションに対応するターゲットシーケンスライブラリーの調製において、サンプルタイプおよびRNAインプット量の柔軟性を実現します。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina RNA Prep with Enrichment
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550システム | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 中間出力：5 高出力：16 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NextSeq 1000システム, NextSeq 2000システム | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2：16 P3：48 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000システム | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP：32 S1：64 S2：164 S4：384 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| MiSeqシステム | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大25サンプル（サンプルあたり1 Mリードに基づく） |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550システム | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大384サンプル（サンプルあたり1 Mリードに基づく） |
2 × 150 bp |
アプリケーションノート
関連するアプリケーションと手法
NGSを使用して、新規の微生物の発見、感染拡大の監視、食料源の分析などを行うことができます。
研究にRNA-Seqを用いて、がん遺伝子の発現およびトランスクリプトームの変化を検出し、新規がん転写産物を同定します。
ドキュメント
製品資料
製品比較
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | <9時間 | 約2日 | 6.5時間 |
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) |
| コンテンツ仕様 | DesignStudioアッセイツールで設計されたカスタムv2オリゴ、またはイルミナエクソームパネルで使用する場合のコーディングトランスクリプトーム全体を使用してカスタムターゲットをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織切片やその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプやインプットから、スプライスバリアント、遺伝子融合、および小型ヌクレオチドバリアントのターゲット転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 | 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション |
| ハンズオンタイム | <2時間 | 約11時間 | <3時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA、最大1000 ngの高品質RNA | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA | 標準品質トータルRNA25～1,000 ng |
| システム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 | ポリAキャプチャー、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 手法 | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | エクソームシーケンス, mRNAシーケンス | mRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | FFPE非対応, 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | Any species, ヒト, ウイルス | ヒト | 哺乳類, ウシ, マウス, ヒト, ラット |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | ストランド情報あり | ストランド情報あり |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） | 1塩基変異多型（SNP）, 新規点転写産物, 転写産物バリアント | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
Illumina RNA Prep with Enrichmentは高速ワークフローを実現
オンビーズタグメンテーションと90分間のハイブリダイゼーションステップを組み合わせることで、TruSeq RNA Exomeと比較してステップ数が少なく、より迅速なワークフローを実現します。
ローインプットサンプルからの高品質データ
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、Universal Human Reference（UHR）由来のトータルRNAにおいて、インプット量10 ngと100 ngの間で高いデータ整合性を実現します。
低インプットサンプルからのBCR-ABL1遺伝子融合の検出
Illumina RNA Prep with EnrichmentおよびIllumina Exome Panelを使用してK-562細胞株由来のRNA 10 ngから調製したライブラリーでは、BCR-ABL1遺伝子融合の検出に成功しました。上側のアライメントトラックはすべてのリードを示し、下側のトラックはBCR-ABL1融合遺伝子を支持するリードのみを示しています。
Illumina RNA Prep with Enrichmentによるコーディング領域のカバレッジ
Illumina RNA Prep with EnrichmentおよびIllumina Exome Panelを用いて、10 ngのUHR RNAおよび20 ngのFFPE RNAから調製したライブラリーでは、生成されたデータの85%以上がコーディング転写産物およびUTRにアラインメントされたことを示しています。比較のために、TruSeq RNA Exomeライブラリーのデータを示します。
低インプットサンプルおよびFFPEサンプルからの遺伝子融合検出
K-562細胞株（RNAインテグリティ番号、RIN = 7.4、DV200 = 90%）および結腸がん細胞株（RIN = 2.5、DV200 = 85%）の6レプリケートにおけるBCR-ABL1およびTPM3-NTRK1遺伝子融合のコール率は100%。
| 融合遺伝子（融合前） | RIN | RNAインプット | 検出 |
| BCR-ABL 1（K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6レプリケート（100%） |
| TPM3-NTRK1（結腸がん） | 2.5 | 20 ng | 6/6レプリケート（100%） |
リソース
動画とウェビナー
Illumina RNA Prep with Enrichment：ご紹介
ご紹介：Illumina RNA Prep with Enrichment
このイルミナテクニカルサポートウェビナーでは、Illumina RNA Prep with Enrichmentワークフローを紹介します。このウェビナーは、固定パネルとカスタムパネルによるエンリッチメントを使用したターゲットRNAシーケンスに関心のあるユーザーを対象としています。
RNAシーケンス パートI：Illumina RNAライブラリー調製ワークフローのご紹介
RNAシーケンス：Illumina RNAライブラリー調製ワークフローのご紹介
RNAシーケンス：イルミナのRNAライブラリー調製ワークフローをご紹介します。このセッションでは、RNAインプット用のサンプル調製キットのオプションを確認します。
RNAシーケンス パートII：イルミナのRNA Prepプロトコールのベストプラクティス
RNAシーケンス：Illumina RNA Prepプロトコールのベストプラクティス
このウェビナーでは、ビーズ処理、定量法、ライブラリーQC、トラブルシューティングビューのベストプラクティスについて説明します。
セルフリーRNAからのトランスレーショナルバイオマーカー同定の進歩
セルフリーRNAからのトランスレーショナルバイオマーカー同定の進歩
リキッドバイオプシーはセルフリーDNAと関連づけられることがもっとも多いですが、新しい研究では、血液中のより多様な分析対象を調べることにさらなる価値があることが示されています。セルフリーRNA（cfRNA）は、多くの組織における動的変化を反映することが示されている分子のひとつです。イルミナの研究者は、cfRNAの全トランスクリプトームライブラリー調製において、スケーラブルなエンドツーエンドのワークフローソリューションを実現するために、主要な変数を最適化しました。
その他のリソース
プローブデザインからデータ解析まで、複数のターゲットシーケンスアプリケーションに対応する包括的ソリューション。当社のカスタム設計パネルは、高い均一性とカバレッジを実現し、GCリッチ領域やシーケンスが困難な領域のカバレッジを向上させます。
ライブラリー調製 (2)
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040536
16のライブラリー（16、1プレックス濃縮反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。濃縮プローブパネル、Purification Beads、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)
20040537
96ライブラリー（32、3プレックス濃縮反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。濃縮プローブパネル、Purification Beads、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
パネル (4)
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、1,536 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応384回分に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルのデザインを可能にし、384 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると96濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルデザインを可能にし、32 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると8濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only
20020183
Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせることで8濃縮反応、TruSeq RNA Exomeと組み合わせることで12反応、Illumina RNA Prep with Enrichmentと組み合わせることで32反応に対応します。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training
20044763
Illumina RNA Prep with Enrichment Kitの2日間のオンサイトトレーニング。ハンズオントレーニングには、RNAインプットの定量化のほか、ベストプラクティス、トラブルシューティングのヒント、アプリケーションワークフローに特化したイルミナがサポートする解析ツールに関するトレーニングが含まれます。
アクセサリー製品 (2)
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples)
20040540
16、1プレックス濃縮反応用の、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットの高速なハイブリダイゼーション濃縮用試薬が含まれています。推奨されているプレキシティとは異なる条件で処理を行うお客様をサポートします。濃縮前の試薬は含まれません。濃縮も含めた調製には、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
List Price:
Discounts:
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040542
16ライブラリー用のIllumina RNA Prep with Enrichmentキットの濃縮前モジュールが含まれます。推奨されているプレキシティとは異なる条件で処理を行うお客様をサポートします。濃縮試薬およびPurification Beadsは含まれません。濃縮も含めた調製には、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
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よくある質問（FAQ）
イルミナでは、陽性対照サンプルとしてAgilent Technologies Universal Human Reference RNA（UHR）（カタログ番号740000）の使用を推奨しています。
Illumina Exome PanelおよびIllumina Custom Enrichment Panel v2は、Illumina RNA Prep and Enrichmentキットで使用できます。
eBLTLはエンリッチメントビーズ連結トランスポソームで、1回の迅速な反応ステップでcDNAを断片化し、アダプタータグ配列を付加することによりタグメンテーションを行います。
16サンプルキットは1プレックスのワークフローを可能にし、96サンプルキットは3プレックスのワークフローを可能にします。いずれかのワークフローにアクセサリー製品を追加することで、推奨とは異なるプレキシティで処理できます。
/
件
NovaSeq X Series Reagent Kits
NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyo インサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。
MiSeq i100 シリーズ用 試薬キット
MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。
Illumina Stranded mRNA Prep
高精度なストランド情報により、タンパク質コーディングトランスクリプトームを正確かつバイアスなく検出する、迅速かつコスト効率に優れたワークフローです。
NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
複雑なワークフローやマイクロフルイディクスを必要とせず、mRNAキャプチャー、バーコード、ライブラリー調製のための利用しやすくスケーラブルなシングルセルRNA-Seqソリューション
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
cDNA合成とアダプタータグ付けをひとつの工程にまとめた、RNAエクソーム解析のための迅速でシンプルなライブラリー調製ワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kit
Reagent v2.5 Kitは、初期の蛍光強度を維持する耐久性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性と性能が向上しています。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
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