新しいイルミナDNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、20091656、20091658、20091660）の注文をお勧めします。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214, 20042666, 20042667)は廃止されており、最終注文日は2025年1月30日です。これはPON2023-1440で発表されています。
Illumina RNA Library Prep with Enrichmentトレーニング
20044763
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、オンビーズタグメンテーションテクノロジーをベースに、シンプルなシングルハイブリダイゼーションを活かして、RNAベースのライブラリー調製と濃縮のための超高速ワークフローをお届けします。
このテクノロジーの詳細はこちら
ハンズオンタイム2時間未満、合計9時間未満でライブラリーを調製し、濃縮します。このワークフローにより、TruSeq RNA Exomeと比較して50％以上の時間を節約できます。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーがお届けするさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
新鮮サンプルまたは凍結サンプルのトータルRNAわずか10 ng、または分解サンプル（FFPEなど）のトータルRNA 20 ngから高感度を得ることができます。
標的トランスクリプトームのコード領域を分離することで、何分の1かのシーケンス深度で検出力が最大になります。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、優れたキャプチャ効率とカバレッジ均一性を提供することで、正確な検出に必要なシーケンス深度をバイアスなしで最小限に抑えるように設計されています。濃縮反応ごとに必要なのは2.5 µLプローブのみです。
事前に構築と検証のすんださまざまなプローブプールから選択するか、または独自のプローブをカスタマイズして最大限の柔軟性を活かします。1回のランで最大384のサンプルをマルチプレックスします。モジュラー設計 は、関心領域にわたる幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートし、アリル特異的発現、融合検出、バイオマーカースクリーニングなどの検出および発見研究を可能にします。
RNAエクソームを含む膨大な数の標的遺伝子の迅速でターゲット化した調査を達成します。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、コーディングRNAシーケンスの包括的カバレッジを提供する高度に最適化されたプローブセットを備えたIllumina Exome Panelで使用できます。Illumina Exome Panelには425,000を超えるプローブが組み込まれており、いずれもNCBI37/hg19リファレンスゲノムに対して構築されていて、98％を超えるRefSeqエクソームをカバーしています。プローブセットは、21,415の関心遺伝子を対象として、214,000を超えるターゲットをキャプチャします。
Respiratory Virus Oligo Panelは、コロナウイルス株を含む一般的な呼吸器系ウィルスの高感度な検出と特性評価を提供します。ハイブリッドキャプチャーベースのターゲットエンリッチメントに使用されるオリゴプローブは、変異原性の高い領域内でも効果を維持しながら、急速に進化するRNAウイルスをターゲット化できます。Respiratory Virus Oligo PanelとIllumina RNA Prep with Enrichmentを使用します。
詳細はこちら| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 中出力：5 高出力：16 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2：16 P3：40 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP：32 S1：64 S2: 164 S4：384 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| MiSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel 最大25サンプル（サンプルあたり1M0万リードに基づく） |
2 × 75 bp |
| MiniSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel 最大25サンプル（サンプルあたり1M0万リードに基づく） |
2 × 75 bp |
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel 最大384サンプル（サンプルあたり1M0万リードに基づく） |
2 × 75 bp |
| MiSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大25サンプル（サンプルあたり1M0万リードに基づく） |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大384サンプル（サンプルあたり1M0万リードに基づく） |
2 × 150 bp |
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
オンビーズタグメンテーションと90分の単一ハイブリダイゼーションの手順を組み合わせることで、TruSeq RNA Exomeと比較して少ない手順でより迅速なワークフローを実現します。
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、Universal Human Reference（UHR）からトータルRNAインプット量10 ngと100 ngの間で高いデータ整合性を実現します。UHR RNAライブラリーをNovaSeq 6000システムでシーケンスし、ライブラリーごとに2,500万クラスターにサブサンプリングしました。BaseSpace RNA-Seq Alignment v1.1.1アプリを使用してデータを解析しました。
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してK-562細胞株のRNA 10 ngから調製したライブラリーでは、BCR-ABL1遺伝子融合の検出に成功しました。上のアライメントトラックはすべてのリードを示し、下のトラックはBCR-ABL1融合遺伝子をサポートするリードのみを示しています。
| 融合遺伝子（融合前） | RIN | RNAインプット | 検出 |
|---|---|---|---|
| BCR-ABL 1（K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6レプリケート（100%） |
| TPM3-NTRK1（大腸がん） | 2.5 | 20 ng | 6/6レプリケート（100%） |
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してUHR RNA 10 ngとFFPE RNA 20 ngから調製したライブラリーは、生成されたデータの85％以上が転写産物（コーディングとUTR）にアラインされたことを示しています。比較のために、TruSeq RNA Exomeライブラリーのデータを示します。
Brochure | PDF 1 MB
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Improved detection of circulating transcripts
Application Note | PDF < 1 MB
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 RNA sequencing solution
Application Note | PDF < 1 MB
Enrichment of coding transcripts in degraded samples using hybrid probe capture
Application Note | PDF < 1 MB
Surveillance of infectious disease through wastewater sequencing
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Rapid detection of respiratory pathogens using the MiniSeq System
Application Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 6 versions
Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Reference Guide Documentation
Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Documentation
Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Checklist Documentation
Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Consumables & Equipment Documentation
すべて Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Support すべて イルミナDNA RNA UDインデックス Support
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
A high-performing, fast, and integrated workflow for sensitive applications such as human whole-genome sequencing.
