NovaSeq Xシリーズのご購入
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、オンビーズタグメンテーションに続いて、90分のハイブリダイゼーションステップを簡素化することで、RNAシーケンス（RNA-Seq）用に非常に高速なソリューションを提供します。
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。
<9時間
アッセイ時間
<2時間
ハンズオンタイム
10 ng RNA、20 ng FFPE RNA
インプット量
概要
迅速、シンプル、そしてスケーラブルなワークフロー
ハンズオンタイムは2時間未満、合計9時間未満でシーケンス対応ライブラリーを調製し、濃縮します。イルミナのハイスループットシーケンス装置と組み合わせることで、ランごとのサンプル数を大幅に増加
困難なサンプルから高品質のデータ
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織など、限られた出発材料や損傷サンプルまたは分解サンプルから再現性のある結果を提供
手頃な価格で十分な機能を備えたRNA-Seq
シーケンス深度のほんの一部で探索力を最大化します。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、優れたキャプチャー効率とカバレッジの均一性を提供することで、精確な検出に必要なシーケンス深度をバイアスなしで最小限に抑えるように設計されています。
柔軟なモジュール式パネル設計
事前に構築され検証済みのさまざまなプローブまたは最大限の柔軟性のためカスタムプローブを用いてアレル特異的発現・融合検出・バイオマーカースクリーニングなどを検出して発見します。
仕様
| アッセイ時間 | <9時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) |
| コンテンツ仕様 | Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション |
| ハンズオンタイム | <2時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA |
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 手法 | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト, ウイルス |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
必要な製品
RNA Prep with Enrichmentワークフローを完了するには、ライブラリー調製・プローブパネル・インデックスアダプター（すべて別売）を使用する必要があります。
オプションのコンポーネントには、以下が含まれます：
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment：推奨とは異なるプレキシティで処理されるお客様専用のエンリッチメント試薬が含まれます
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation：推奨とは異なるプレキシティで処理されるお客様専用のプレエンリッチメント試薬が含まれます。
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件
アプリケーション
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、対立遺伝子特異的発現・融合検出・バイオマーカースクリーニングなどの検出および探索研究をサポートする幅広いRNA-Seqアプリケーション用のターゲットシーケンスライブラリーの調製において、サンプルタイプとRNAインプット量に柔軟性を与えます。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina RNA Prep with Enrichment
シーケンス
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 中間出力：5 高出力：16 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NextSeq 1000 System, NextSeq 2000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2：16 P3：48 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP：32 S1：64 S2：164 S4：384 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 100 bp |
| MiSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大25サンプル（サンプルあたり1 Mリードに基づく） |
2 x 150 bp |
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance PanelまたはPan-Coronavirus Panel 最大384サンプル（サンプルあたり1 Mリードに基づく） |
2 x 150 bp |
アプリケーションノート
関連するアプリケーションと手法
NGSを使用して、新規の微生物の発見、感染拡大の監視、食料源の分析などを行うことができます。
RNA-Seq を用いて、がん遺伝子の発現およびトランスクリプトームの変化を検出し、新規がん転写産物を同定します。
ドキュメント
製品資料
製品比較
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | <9時間 | 約2日 | 6.5時間 |
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) |
| コンテンツ仕様 | Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 | 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション |
| ハンズオンタイム | <2時間 | 約11時間 | <3時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA | 標準品質トータルRNA25～1,000 ng |
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 | ポリAキャプチャー、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 手法 | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | エクソームシーケンス, mRNAシーケンス | mRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | FFPE非対応, 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | ヒト, ウイルス | ヒト | 哺乳類, ウシ, マウス, ヒト, ラット |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | ストランド情報あり | ストランド情報あり |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント | 1塩基変異多型（SNP）, 新規点転写産物, 転写産物バリアント | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
Illumina RNA Prep with Enrichmentは高速ワークフローを実現します
オンビーズタグメンテーションと90分間のハイブリダイゼーションの手順を組み合わせることで、TruSeq RNA Exomeと比較して少ない手順でより迅速なワークフローを実現します。
ローインプットサンプルからの高品質データ
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、Universal Human Reference（UHR）からトータルRNAインプット量10 ngと100 ngの間で高いデータ整合性を実現します。
低インプットサンプルからのBCR-ABL1遺伝子融合の検出
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してK-562細胞株のRNA 10 ngから調製したライブラリーでは、BCR-ABL1遺伝子融合の検出に成功しました。上のアライメントトラックはすべてのリードを示し、下のトラックはBCR-ABL1融合遺伝子をサポートするリードのみを示しています。
Illumina RNA Prep with Enrichmentによるコーディング領域のカバレッジ
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを用いて、10 ng UHR RNAと20 ng FFPE RNAから調製したライブラリーは、生成されたデータの85%以上がコーディング転写産物およびUTRにアラインされたことを示しています。比較のために、TruSeq RNA Exomeライブラリーのデータを示します。
低インプットサンプルおよびFFPEサンプルからの遺伝子融合検出
K-562細胞株（RNAインテグリティ番号、RIN = 7.4、DV200 = 90%）および結腸がん細胞株（RIN = 2.5、DV200 = 85%）の6つのレプリケートにおけるBCR-ABL1およびTPM3-NTRK1遺伝子融合の100%コール率。
| 融合遺伝子（融合前） | RIN | RNAインプット | 検出 |
| BCR-ABL 1 （K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6レプリケート（100%） |
| TPM3-NTRK1 （大腸がん） | 2.5 | 20 ng | 6/6レプリケート（100%） |
リソース
Illumina RNA Prep with Enrichment：ご紹介
RNAシーケンス パートI：Illumina RNAライブラリー調製ワークフローのご紹介
RNAシーケンス パートII：Illumina RNA Prepプロトコールのベストプラクティス
セルフリーRNAからのトランスレーショナルバイオマーカー同定の進歩
プローブデザインからデータ解析まで、複数のターゲットシーケンスアプリケーションに対応する包括的なソリューション 当社のカスタム設計パネルはGCが豊富でシーケンスが難しい領域をカバーし、高い均一性とカバレッジを保証します。
ライブラリー調製 (2)
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040536
16のライブラリー（16、1プレックス濃縮反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。濃縮プローブパネル、Purification Beads、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)
20040537
96ライブラリー（32、3プレックス濃縮反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。濃縮プローブパネル、Purification Beads、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
パネル (4)
Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only
20020183
イルミナDNA Prep with Enrichmentとペアで8回の濃縮反応、TruSeq RNA Exomeとペアで12回の反応、イルミナRNA prep with enrichmentとペアで32回の反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Respiratory Virus Oligos Panel V2
20044311
イルミナRNA Prep with Enrichment（96サンプル）キットと組み合わせると、32の3プレックス濃縮反応に十分です。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Viral Surveillance Panel, RUO 96 Rxns
20088154
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットと組み合わせた場合、32、3プレックスのエンリッチメント反応に十分なウイルスサーベイランスパネルが含まれます。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns
20088155
Illumina RNA Prep with Enrichmentキットと組み合わせた場合、32、3プレックスの濃縮反応に十分なViral Surveillance Panelが含まれます。ライブラリー調製および濃縮キットとインデックスアダプターは別売りです。
サービス (1)
Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training
20044763
アクセサリー製品 (2)
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples)
20040540
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットの高速ハイブリダイゼーションエンリッチメント試薬を含み、16回の1プレックスエンリッチメント反応に対応します。推奨されるものとは異なるプレキシティで、お客様による処理をサポートします。濃縮前の試薬は含まれません。エンリッチメントによる完全な調製については、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
List Price:
Discounts:
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040542
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットの16ライブラリー用のプリエンリッチメントモジュールが含まれています。推奨されるものとは異なるプレキシティで、お客様による処理をサポートします。濃縮試薬および精製ビーズは含まれません。濃縮による完全な調製には、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
イルミナでは、陽性対照サンプルとしてAgilent Technologies Universal Human Reference RNA（UHR）（カタログ番号740000）の使用を推奨しています。
Illumina Exome Panel、Respiratory Virus Oligos Panel V2、Viral Surveillance Panel、Pan-Coronavirus Panelは、Illumina RNA Prep and Enrichmentキットと共に使用できます。
eBLTLは、濃縮ビーズ連結トランスポソームで、1回の迅速な反応ステップで断片化し、アダプタータグシーケンスを追加することによりcDNAにタグ付けします。
16サンプルキットは1プレックスのワークフローを可能にし、96サンプルキットは3プレックスのワークフローを可能にします。いずれかのワークフローにアクセサリー製品を追加することで、推奨されるものとは異なるプレキシティで処理できます。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500 v2
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
複雑なワークフローやマイクロフルイディクスを必要とせず、mRNAキャプチャー、バーコード、ライブラリー調製のための利用しやすくスケーラブルなシングルセルRNA-Seqソリューション
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
Illumina UD Indexes
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。
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