ハンズオンタイム2時間未満、合計9時間未満でライブラリーを調製し、濃縮します。このワークフローにより、TruSeq RNA Exomeと比較して50％以上の時間を節約できます。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。

困難なサンプルから高品質のデータ

新鮮サンプルまたは凍結サンプルのトータルRNAわずか10 ng、または分解サンプル（FFPEなど）のトータルRNA 20 ngから高感度を得ることができます。

手頃な価格と焦点

標的トランスクリプトームのコード領域を分離することで、何分の1かのシーケンス深度で検出力が最大になります。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、優れたキャプチャ効率とカバレッジ均一性を提供することで、正確な検出に必要なシーケンス深度をバイアスなしで最小限に抑えるように設計されています。濃縮反応ごとに必要なプローブは2.5 µLのみです。

モジュラーパネル設計による柔軟性

事前に構築され、検証されたさまざまなプローブプールから選択するか、または独自のプローブをカスタマイズして最大限の柔軟性を実現します。新しいユニークデュアルインデックスのSet CおよびD（近日公開）を使用して、1回の実行で最大384サンプルのマルチプレックスを行います。モジュラー設計は、関心領域全体で幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートし、アリル特異性発現、融合遺伝子検出、バイオマーカーのスクリーニングなどの検出および発見研究を可能にします。

RNAエクソームの能力

RNAエクソームを含む膨大な数の標的遺伝子の迅速でターゲット化した調査を達成します。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、コーディングRNAシーケンスの包括的カバレッジを提供する高度に最適化されたプローブセットを備えたIllumina Exome Panelで使用できます。Illumina Exome Panelには425,000を超えるプローブが含まれ、それぞれがRefSeqエクソームの98％以上をカバーするNCBI37/hg19リファレンスゲノムに対して構築されています。プローブセットは、21,415の関心遺伝子を対象として、214,000を超えるターゲットをキャプチャします。

呼吸器系ウイルスの検出

Respiratory Virus Oligo Panelは、コロナウイルス株を含む一般的な呼吸器系ウィルスの高感度な検出と特性評価を提供します。ハイブリッドキャプチャーベースのターゲットエンリッチメントに使用されるオリゴプローブは、変異原性の高い領域内でも効果を維持しながら、急速に進化するRNAウイルスをターゲット化できます。Respiratory Virus Oligo PanelとIllumina RNA Prep with Enrichmentを使用します。

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Frequently Purchased Together

仕様

推奨プロジェクト

装置	推奨サンプル数	リード長
NextSeq 550 System	Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel Mid Output: 5 High Output: 16 (based on 25M reads per sample)	2 × 100 bp
NextSeq 2000 System	Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2: 16 P3: 40 (based on 25M reads per sample)	2 × 100 bp
NovaSeq 6000 System	Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 (based on 25M reads per sample)	2 × 100 bp
MiSeq System, MiSeq	Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel Up to 25 samples (based on 1M reads per sample)	2 × 75 bp
MiniSeq System	Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel Up to 25 samples (based on 1M reads per sample)	2 × 75 bp
NextSeq 550 System	Illumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel Up to 384 samples (based on 1M reads per sample)	2 × 75 bp

製品比較

	Illumina RNA Prep with Enrichment	TruSeq RNA Exome	Illumina Stranded mRNA Prep
Automation Capability	Liquid Handling Robots	Liquid Handling Robots	Liquid Handling Robots
Method	mRNA Sequencing, Target Enrichment, Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing	Exome Sequencing, mRNA Sequencing	mRNA Sequencing
Technology	Sequencing	Sequencing	Sequencing
Variant Class	Gene Fusions, Novel Transcripts, Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Transcript Variants	Novel Transcripts, Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Transcript Variants	Gene Fusions, Novel Transcripts, Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Transcript Variants

ライブラリー調製の目的：

ターゲットRNAシーケンス

効率的にシーケンス：

NextSeq 550システム

NextSeq 2000システム

NovaSeq 6000システム

データを解析：

DRAGEN RNAパイプライン

RNA-Seq Differential Expression

RNA-Seq Alignmentアプリ

DRAGEN RNA Pathogen Detectionアプリ

Respiratory Virus Oligo Panelによって検出されたウイルス

ヒトコロナウイルス229E
ヒトコロナウイルスNL63
ヒトコロナウイルスOC43
ヒトコロナウイルスHKU1
SARS-CoV-2
ヒトアデノウイルスB1
ヒトアデノウイルスC2
ヒトアデノウイルスE4
ヒトボカウイルス1型（霊長目ボカパルボウイルス1型分離株st2）
ヒトボカウイルス2c型PK分離株PK-5510
ヒトボカウイルス3型

ヒトパラインフルエンザウイルス1型
ヒトパラインフルエンザウイルス2型
ヒトパラインフルエンザウイルス3型
ヒトパラインフルエンザウイルス4a型
ヒトメタニューモウイルス（CAN97-83）
呼吸器合胞体ウイルス（タイプA）
ヒトRSウイルス9320（タイプB）
A型インフルエンザウイルス（A/Puerto Rico/8/1934（H1N1））
A型インフルエンザウイルス（A/Korea/426/1968（H2N2））
A型インフルエンザウイルス（A/New York/392/2004（H3N2））
A型インフルエンザウイルス（A/goose/Guangdong/1/1996（H5N1））

ヒトボカウイルス4型NI株HBoV4-NI-385
KIポリオーマウイルスストックホルム60
WUポリオーマウイルス
ヒトパレコウイルス1型PicoBank/HPeV1/a
ヒトパレコウイルス6型
ヒトライノウイルスA89
ヒトライノウイルスC（024株）
ライノウイルスB14
ヒトエンテロウイルスC104株：AK11
ヒトエンテロウイルスC109分離株NICA08-4327

A型インフルエンザウイルス（A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013（H7N9））
A型インフルエンザウイルス（A/Hong Kong/1073/99（H9N2））
A型インフルエンザウイルス（A/Texas/50/2012（H3N2））
A型インフルエンザウイルス（A/Michigan/45/2015（H1N1））
B型インフルエンザウイルス（B/Lee/1940）
B型インフルエンザウイルス（B/Wisconsin/01/2010）
B型インフルエンザウイルス（B/Brisbane/60/2008）
B型インフルエンザウイルス（B/Colorado/06/2017）
B型インフルエンザウイルス（B/Washington/02/2019）
人間制御遺伝子

一般的な呼吸器系ウィルス、最近のインフルエンザ系統、およびSARS-CoV-2を検出するための7,800のプローブと、陽性対照として機能するヒューマンプローブがあります。これらのプローブは80merのオリゴが、非常に接近して配置されたもので、パネル内のすべてのウイルスの完全なゲノムカバレッジを提供します。

Illumina RNA Prep with Enrichmentは高速ワークフローを実現します

オンビーズタグメンテーションと90分の単一ハイブリダイゼーションの手順を組み合わせることで、TruSeq RNA Exomeと比較して少ない手順でより迅速なワークフローを実現します。

ローインプットサンプルからの高品質データ

Illumina RNA Prep with Enrichmentは、Universal Human Reference（UHR）からトータルRNAインプット量10 ngと100 ngの間で高いデータ整合性を実現します。UHR RNAライブラリーをNovaSeq 6000システムでシーケンスし、ライブラリーごとに2,500万クラスターにサブサンプリングしました。BaseSpace RNA-Seq Alignment v1.1.1アプリを使用してデータを解析しました。

BCR-ABL1融合遺伝子の検出

Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してK-562細胞株のRNA 10 ngから調製したライブラリーでは、BCR-ABL1遺伝子融合の検出に成功しました。上のアライメントトラックはすべてのリードを示し、下のトラックはBCR-ABL1融合遺伝子をサポートするリードのみを示しています。

遺伝子融合検出

融合遺伝子（融合前）	RIN	RNAインプット	検出
BCR-ABL 1（K-562）	7.4	10 ng	6/6レプリケート（100%）
TPM3-NTRK1（大腸がん）	2.5	20 ng	6/6レプリケート（100%）

Illumina RNA Prep with Enrichmentによるコーディング領域のカバレッジ

Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してUHR RNA 10 ngとFFPE RNA 20 ngから調製したライブラリーは、生成されたデータの85％以上が転写産物（コーディングとUTR）にアラインされたことを示しています。比較のために、TruSeq RNA Exomeライブラリーのデータを示します。