複雑なワークフローやマイクロフルイディクスを必要とせず、mRNAキャプチャー、バーコード、ライブラリー調製のための利用しやすく拡張性の高いシングルセルRNA-Seqソリューション
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Single Cell 3のRNAライブラリー調製キットは、簡単で拡張性が高く、マイクロフルイディクスを使用しないワークフローにより、より多くのラボでシングルセルRNAシーケンス（scRNA-Seq）を実施できるようにします。研究者は、他のシングルセルアプローチのような予算や技術上の制約なしに、より大規模でより多様なマルチオミクス研究を行うことができます。
Illumina Single Cell 3のRNAライブラリー調製は、数百から数十万の細胞まで幅広い処理範囲に容易に拡張できます。この細胞スループットの増加により、希少な細胞タイプを明らかにする可能性がもたらされます。また、このアッセイは、サンプルマルチプレックスと並行して1つのサンプルから最大96のサンプルを実行する柔軟性もあります。
Illumina Single Cell 3' RNA Prepキットは、高い転写および遺伝子感度を提供し、イルミナならではの高品質なデータを実現します。穏やかな分離技術は、他の方法では見逃されがちな脆弱な細胞の検出に役立ちます。また、このアッセイは、拡張マルチオミクスアプリケーション用のカスタムシングルセル測定と互換性があります。
Illumina Single Cell 3のRNAライブラリー調製キットは、高価なマイクロフルイディクス装置や手間のかかるプロトコールを必要としません。シンプルな手動ワークフローと柔軟な停止ポイントを使用して、ベンチトップでシングルセル研究を実施できます。
ボルテックスミキサーを使用してテンプレートエマルジョンを作成し、シングルセルmRNAをキャプチャーしてバーコード化します。
cDNAを生成し、シーケンス用のシングルセルライブラリーを調製します。
NGSシステムでシーケンスを行い、研究の規模に合わせます。
DRAGENおよびPartekソフトウェアを使用して、シングルセルデータを解析し視覚化します。
| Assay time | ~15 hr from cell capture to library prep |
|---|---|
| Content specifications | Captures the coding transcriptome |
| Description | Single-cell mRNA capture, barcoding, and library prep with a simple manual workflow, high transcript sensitivity, and cost-effective scalability. |
| Hands-on time | 10 mins for cell capture |
| Input quantity | 100 to 200,000 cells |
| システム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| Mechanism of action | PIPseq technology |
| 手法 | mRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大96プレックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 骨髄, シングルセル |
| 生物種カテゴリー | すべて, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト |
| ストランド特異性 | ストランド情報あり |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 転写産物バリアント |
Illumina Single Cell 3' RNA Prepには、セルキャプチャーとライブラリー調製試薬の両方が含まれます。アッセイしたい細胞数に合うサイズキットを選択してください。キットは、Illumina Single Cell 3' RNA CaptureおよびIllumina Single Cell Library Prepとしても個別に入手できます。
1回のランで8つを超えるサンプルのマルチプレックスを行う場合は、Illumina Single Cell Unique Dual Indexesを使用します。単一核をインプットするには、Illumina Single Cell Nuclei Isolation Kitを使用します。カスタムRNAタグシーケンスのエンリッチメントには、Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification Kitを使用します。
新規ユーザーは、必要な付属装置用にIllumina Single Cell Prep Starter Equipmentを注文する必要があります。
神経組織は、生物の生涯を通して継続的に再編成とリモデリングを行う多様な細胞型からなる複雑な組織で構成されています。 Illumina Single Cell 3' RNA Prepは、研究者が転写感度によって神経細胞集団の真の多様性を明らかにするのに役立ち、以下に関する洞察を提供します。
がんは、複雑な細胞集団が関与する動的で多様な疾患です。がんを発生させる細胞の種類と変異を理解するには、高度な方法が必要です。Illumina Single Cell 3' RNA Prepキットは、サイエンティストの次のことに役立ちます。
免疫系は、病原体の同定、ターゲット化、除去に向けて連携する多様な細胞型の複雑な階層で構成されています。 Illumina Single Cell 3’ RNA Prepキットは、研究者が以下のような解析を行う際に役立ちます：
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000システム | 1ランあたりのサンプル数： |
2 x 100 bp |
| NovaSeq 6000システム | 1ランあたりのサンプル（デュアルフローセル）： |
2 x 100 bp |
| NovaSeq X Plusシステム | 1ランあたりのサンプル（デュアルフローセル）： |
2 x 100 bp |
シングルセルRNA-Seqでは、バルクサンプリングで見落とされがちな細胞の違いを調べることができます。ハイスループットとロースループットのシングルセルシーケンス手法を紹介します。
シングルセルシーケンスにより、研究者は、シングルセル内のDNA、RNA、エピジェネティクス、タンパク質レベルでがんを引き起こす要因を理解することができます。
マルチオミクスプロファイリングを使用して探索力を高め、遺伝型と表現型のマッチング精度を高めます。
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。
PIPseqケミストリーによるシングルセルmRNAキャプチャーとバーコード化
ボルテックスミキサーを使用してテンプレートエマルジョンを作成し、シングルセルmRNAをキャプチャーしてバーコード化します。cDNAを生成し、シーケンス用のシングルセルライブラリーを調製します。NGSシステムでシーケンスを行い、研究の規模に合わせます。DRAGENおよびPartekソフトウェアを使用してscRNA-Seqデータを解析します。
数千規模の細胞の高解像度scRNA-Seq
NIH3T3（マウス）とHEK 293（ヒト）細胞株の混合培養の効果的な分離を示すバーコードランクプロット（左）とバーンヤード散布図（右）。Illumina Single Cell 3’ RNA Prep T2キットを使用して、5%未満のマルチプレットで4106個の細胞がキャプチャーされました。
数万規模の細胞の高解像度scRNA-Seq
凍結保存ヒト末梢血単核細胞（PBMC）のシングルセルRNA-Seq Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T20キットを使用してキャプチャーした31,613の細胞のUMAPにより、多様な免疫細胞集団を分析します。
数十万規模の細胞の高解像度scRNA-Seq
凍結組織由来のマウス脳核用のscRNA-Seq Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T100キットを使用してキャプチャーした155,000個の核のUMAP解析により、多様な脳細胞集団を解析します。
Illumina Single Cell 3' RNA Prepワークフロー
Illumina Single Cell 3' RNA Prepワークフローにより、シングルセルシーケンスにおいて、いかにシンプルかつ手頃な価格で、マイクロフルイディクス装置の必要をなくせるかをご覧ください。多様な細胞タイプにわたる実績のある性能と信頼性の高い、高品質のデータにより、シングルセルの分解能での解析がこれまでになく簡単になり、次のブレークスルーを後押しします。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8 samples, 2000 cells/sample)
20135689
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 2000 cells per sample.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8 samples, 10,000 cells/sample)
20135691
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 10,000 cells per sample.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4 samples, 20,000 cells/sample)
20135692
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 20,000 cells per sample.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2 samples, 100,000 cells/sample)
20135693
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 100,000 cells per sample.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions)
20132789
Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions), used following Illumina Single Cell 3' RNA Capture.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples, 2000 cells/sample)
20132790
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 2000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples, 10,000 cells/sample)
20132791
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 10,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples, 20,000 cells/sample)
20132792
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 20,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples, 100,000 cells/sample)
20132793
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 100,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Unique Dual Indexes (96 indexes, 96 samples)
20132788
Illumina Single Cell Unique Dual Indexes (96 indexes, 96 samples), optional accessory for use with the Illumina Single Cell Library Prep for high-plex pooling of libraries.
List Price:
Discounts:
Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples)
20132795
Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples), optional reagents for nuclei isolation, washing, and resuspension for input into Illumina Single Cell 3' RNA Prep.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification Kit
20132794
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification (SEA) Kit, optional reagents for use with Illumina Single Cell 3' RNA Capture and Illumina Single Cell Library Prep for custom single-cell applications.
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Prep Starter Equipment
20132796
Illumina Single Cell Prep Starter Equipment, one-time purchase accessory equipment required to prepare Illumina Single Cell 3' RNA kits and Illumina Single Cell Library Prep kits.
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製品名
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Illumina Single Cell 3のRNAライブラリー調製キットは、あらかじめテンプレート化されたインスタントパーティション（PIP）を備えたPIPseqテクノロジーを使用しています。PIPは、複雑な細胞混合物を、シングルセルRNAシーケンス（scRNA-Seq）などのシングルセルアプリケーション用に簡単に処理できるバーコード付きテンプレート粒子でパーティションに分離できます。
はい、信頼できる結果を得るには、当社のボルテックスミキサーとドライバスが必要です。ボルテックスミキサーは、一貫した乳化を実現するよう設計されています。ドライバスは正確な温度プロファイルを保証します。一般的なドライバスでは、当社の溶解プロトコールで説明されているような迅速な温度変化は許容されません。
はい。細胞または核にFluent DSP/メタノール固定の実証プロトコールを使用します。パラホルムアルデヒド（PFA）固定は現在互換性がありません。
いいえ、現在3' mRNAキャプチャーのみが利用可能です。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyoインサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
DRAGEN二次解析でゲノムの洞察を最大化します。最新情報、よくある質問、製品サポートをご覧ください。
鎖情報を正確に測定し、タンパク質コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出のための迅速で費用対効果の高いワークフロー。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
当社の製品・サービスに関する情報や、テクノロジーに関するご質問への回答をお求めの場合、お気軽にお問い合わせください。
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