がんシングルセル解析

バルクセル解析とシングルセル解析のどちらを選択するかは、研究全体の目標によって異なります。シングルセルのプロファイリングは、ユニークな集団ががんにどのように影響し、治療的にどのように利用されるかを理解するのに役立ちます。

バルクセルシーケンスよりもシングルセルシーケンスの方が優れている主な利点は、以下のとおりです。

• 腫瘍微小環境における機能的細胞集団の検出
• 免疫細胞（B細胞やT細胞など）や線維芽細胞などの非がん性細胞集団が腫瘍生物学に与える影響を解明
• がんの進行におけるエピジェネティックな不均一性の影響の理解
• 腫瘍サンプルから体細胞バリアントの進化を構築
• がん幹細胞集団の同定と特徴付け

がんのシーケンス法をさらに探求する

シングルセルトランスクリプトミクスにスポットライト（アプリケーションノートPDF、14ページ）

シングルセルトランスクリプトミクスは、細胞の機能や個々の細胞が環境内で相互作用する様子について、これまでにない洞察を可能にします。イルミナのNGSテクノロジーは、シングルセル遺伝子発現研究の探索力を最大化し、研究者は1回のアッセイで何百万もの個々の細胞を高い精度と感度でアッセイすることができます。

シングルセルRNA-Seqの詳細はこちら

シングルセル遺伝子発現とクロマチンアクセシビリティを統一（テクニカルノートPDF、7ページ）

ATAC-Seqは、不均一性の細胞集団を持つさまざまな組織における細胞型特異的クロマチンアクセシビリティの研究に使用でき、クロマチンパッケージングやその他の要因が遺伝子発現に及ぼす影響をより深く理解するのに役立ちます。シングルセルATAC-Seqは、Tn5タグメンテーションと、シングルセルのコンパートメント化とバーコード化を組み合わせたものです。Tn5トランスポゼースは、シーケンスアダプターでオープンクロマチン領域にタグ付けします。次に、タグ付けされたDNA 断片を精製し、増幅し、シーケンシングします。

ATAC-Seqについてもっと知る

NextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムにおける全長 V(D)J 免疫レパートリーシーケンス（IR-Seq）（アプリケーションノートPDF、5 ページ）

シングルセル免疫レパートリーは、生物内の個々の免疫細胞の多様な集合を指し、それぞれが表面に固有の受容体分子を備えています。これらの受容体は、免疫細胞が病原体または異常細胞などの脅威を認識し、それに対応することを可能にします。

シングルセル免疫レパートリーの解析には、これらの受容体をコードする遺伝子シーケンスの研究が含まれ、個々の細胞レベルでの免疫システムの多様性、機能性、特異性に関する洞察を提供します。この解析は、疾患における免疫反応の理解、個別化医療アプローチの促進、ターゲット療法の開発において有望です。