植物と動物のジェノタイピング

育種決定を支援する発見とスクリーニングのためのツール

デジタルタブレットを持ち、川の近くでメモを取っている男性の研究者。芝生の開けた場所で建物と牛がぼやけて見える農地。

ゲノムバリアントから物理的形質まで

動物と植物のジェノタイピングは、近代の農業研究の中心となってきました。イルミナのマイクロアレイは、選抜と育種の決定を知らせるための、既知のゲノムマーカーのハイスループットのスクリーニングを可能にします。アレイベースの研究は、SNP(1 塩基変異多型)マーカーと形質または疾患の間の新しい関連性を発見するためにも使用できます。

植物と動物のジェノタイピングアプリケーション

カスタムアレイ

すべてのヒト以外の生物に遺伝学的調査が広範に行われているわけではないため、特定の動植物種の市販のジェノタイピングアレイが欠如しています。イルミナは、関心のある生物種向けに、発見されたすべてのマーカーを考慮してデザインすることができるカスタムマイクロアレイを提供しており、ジェノタイピング研究による望ましい表現型形質に関連するバリアントの同定を可能にします。イルミナの技術は、主要なアグリゲノミクス共同体との継続的な作業を通して、広範な生物種における新しい関連マーカーの同定に使用されています。

コピー数バリエーション研究

自然多様性の一般的な形態であるコピー数バリエーション(CNV)も遺伝性です。それは、アグリゲノミクスにおいて重要な役割を果たしているように思われます。CNVの違いは健康形質と生産形質に関連付けることができ、表現型の多様性をもたらします。動物および植物のジェノタイピング研究において、高濃度プローブの送液はCNVのブレークポイントの同定に使用でき、最終的にゲノム改善を加速します。CNVの影響が主要なゲノムセグメントのコピー数の違い、ゲノムの構造的変化またはその両方の組み合わせの結果なのかを判断するために、研究は現在も進行中です。

ファインマッピングと候補遺伝子領域ジェノタイピング

マイクロアレイベースの動物と植物のジェノタイピングは、ファインマップ形質の作成および/または遺伝子型・表現型の仮説試験に使用することができます。定量的形質遺伝子座(QTL)分析は、差次的遺伝子発現がどのように表現型バリエーションをもたらすかを明らかにするために、結果上で実行することができます。

全ゲノム関連解析

動物または植物のゲノム全体にわたる関連性マッピングは、生物種の適応性(例:多種多様の環境条件に対して)に対する連鎖形質の遺伝的位置と構造を知るきっかけとなります。これらの解析の結果は、商業的な農作物と動物の群れの価値を高める全ゲノム選抜アプリケーション(例:指紋、ネットメリット、マーカー支援育種)をサポートします。イルミナのマイクロアレイは、焦点を絞ったコンテンツ、カスタム機能、便利なアドオンコンテンツ機能を提供します。

主な動物と植物のジェノタイピングのストーリー

動物のジェノタイピングに関するお客様のストーリー

サムネール

肉牛の育種計画の改善

育種計画の改善、特定の遺伝子の選択能力、および雄牛の遺伝的価値をより早く、よりよく理解することで、ゲノム選択がどのように牛の増産を促進したかを学びましょう。

サムネール

ゲノム検査が乳牛群を改善する方法

Canadian Dairy NetworkのジェネラルマネージャーであるBrian Van Doormaal氏が、ゲノム検査がどのように乳牛の価値をより適切に定義し、酪農場の牛群を改善できるかについて説明します。

植物と動物のジェノタイピング向けの主な製品

Infinium HTS iSelect Custom Beadchip

完全にカスタマイズ可能なマイクロアレイで、あらゆる生物種にわたり、実質的にあらゆるターゲットを精査し、お客様独自の研究ニーズに対応します。

Infinium XT iSelect-96キット

非ヒトには最大10万の単一または複数種のカスタムバリアント、ヒトには5万のカスタムバリアントの生産規模のジェノタイピングを可能にする包括的なマイクロアレイソリューションです。

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補足資料

肉牛育種の未来

Sandhill農場では形質選抜プロセスにゲノムテクノロジーを取り入れ、より予測可能な種牛の保存を可能にしました。

倍数体生物ジェノタイピング

GenomeStudioソフトウェアは倍数体クラスターモジュールを含むようになったため、最も複雑なゲノムをもつ生物種の分析ができるようになりました。

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