GenomeStudioソフトウェア

イルミナのマイクロアレイベースのジェノタイピングアッセイデータを解析するための統合プラットフォーム

GenomeStudioソフトウェアの概要

GenomeStudioソフトウェアでは、イルミナのアレイプラットフォームで生成されたマイクロアレイデータを視覚化し、分析することが可能です。この強力なソリューションは、マイクロアレイデータのジェノタイピング解析をサポートします。フォーマンスが最適化されたツールと使いやすいグラフィカルインターフェースにより、データを迅速かつ簡単に有意義な結果へと変えることができます。

ジェノタイピングデータ解析のハイライト

GenomeStudioソフトウェアは、効率的なジェノタイピングデータのノーマライゼーション、ジェノタイピングコール、クラスター化、データ強度解析、ヘテロ接合性喪失(LOH)計算、コピー数変動(CNV)解析を提供します。このソフトウェアは、信頼できるアルゴリズムを使用して、ノーマライズ、クラスター化、およびジェノタイプ呼び出しを行います。

  • 何百万ものマーカーとプローブにわたるSNPおよびCNVデータを解析
  • コピー数解析のためのLog R比とbアリル頻度の推定
  • ジェノタイプを呼び出し、SNP統計を生成し、データをノーマライズしてクラスター化し、サンプルの外れ値を検出します
  • ジェノタイプデータをさまざまなサードパーティアプリケーションにエクスポートし、複数のCNVアルゴリズムとコピー数バリエーション解析ツールにアクセス
  • 複数サンプルのゲノム全体のコピー数異常を調べるための染色体ヒートマップを作成

メチル化データ解析のハイライト

GenomeStudioソフトウェアは、Infiniumメチル化アレイデータの解析をサポートします。このソフトウェアは、メチル化レベル(ベータ値)を計算し、実験グループ間の異なるメチル化レベルを解析します。

  • シングル塩基分解能でシトシンメチル化を検出
  • ゲノム全体のメチル化シグネチャを同定
  • メチル化レベルを計算し、CpGアイランド情報を可視化
  • 2つの実験グループ間の異なるメチル化レベルの解析
  • 折れ線グラフ、棒グラフ、散布図、ヒストグラム、デンドログラム、ボックスプロット、ヒートマップ、またはコントロールサマリーレポートとして結果を視覚化

合理化された多倍体ジェノタイピング

GenomeStudioソフトウェアは、二倍体生物と倍数体生物の両方からのジェノタイピングデータの解析を可能にし、生物学的な洞察をより効率的に推進します。小麦やジャガイモなどの多倍体生物のジェノタイピングから得られたデータを解析するには、生物の倍数性のレベルと種類に依存する特別な考慮事項が必要です。


GenomeStudioソフトウェアでは、自動化されたジェノタイプコールにより、多倍体生物のジェノタイプの解析が合理化された方法で実行されます。このソフトウェアにより、必要な数のクラスターを呼び出すことができ、六倍体またはオクトロイド種の研究が可能になります。

GenomeStudioソフトウェア

GenomeStudioソフトウェアへのアクセスはイルミナのマイクロアレイに含まれています。

サポートリソースをご覧ください

GenomeStudioソフトウェアサポート
ユーザーガイド、コンピューティング要件、FAQ、文書、その他の技術情報をご覧ください。
GenomeStudioソフトウェアプラグイン
GenomeStudioソフトウェアからエクスポートされたアレイデータを解析するためのカスタマイズされたプラグインやアルゴリズムにアクセスできます。

関連ソフトウェア

専門家と話す

当社のソフトウェア製品の詳細については、こちらまでお問い合わせください。