GenomeStudioソフトウェア

イルミナのマイクロアレイベースのジェノタイピングアッセイデータを解析するための統合プラットフォーム

GenomeStudioソフトウェアの概要

GenomeStudio Softwareにより、イルミナアレイプラットフォームで生成されたデータを視覚化し、解析します。この強力なソリューションは、マイクロアレイデータのジェノタイピング解析をサポートします。パフォーマンスが最適化されたツールと使いやすいグラフィカルインターフェースにより、データを迅速かつ簡単に意味のある結果に変換できます。

ジェノタイピングデータ解析のハイライト

GenomeStudio Softwareは、効率的なジェノタイピングデータのノーマライゼーション、ジェノタイピングコール、クラスター化、データ強度解析、ヘテロ接合性喪失(LOH)計算、コピー数変動(CNV)解析を提供します。このソフトウェアは、信頼できるアルゴリズムを使用して、ノーマライズ、クラスター化、およびジェノタイプ呼び出しを行います。

  • 何百万ものマーカーとプローブにわたるSNPおよびCNVデータを解析
  • コピー数解析のためのLog R比とB対立遺伝子頻度の推定
  • ジェノタイプを呼び出し、SNP統計を生成し、データをノーマライズしてクラスター化し、サンプルの外れ値を検出します
  • ジェノタイプデータをさまざまなサードパーティのアプリケーションにエクスポートし、複数のCNVアルゴリズムにアクセスし、数値バリエーション解析ツールをコピー
  • 複数サンプルのゲノム全体のコピー数異常を調べるための染色体ヒートマップを作成

メチル化データ解析のハイライト

GenomeStudio Softwareは、Infiniumメチル化アレイデータの解析をサポートします。このソフトウェアは、メチル化レベル(ベータ値)を計算し、実験グループ間の異なるメチル化レベルを分析します。

  • シングル塩基分解能でシトシンメチル化を検出
  • ゲノム全体のメチル化シグネチャーを同定
  • メチル化レベルを計算し、CpGアイランド情報を可視化
  • 2つの実験グループ間の異なるメチル化レベルの解析
  • ラインプロット、棒グラフ、散布図、ヒストグラム、デンドログラム、ボックスプロット、ヒートマップ、またはコントロールサマリーレポートとして結果を視覚化

合理化されたポリポリドイドジェノタイピング

GenomeStudio Softwareは、二倍体生物と倍数体生物の両方からのジェノタイピングデータの解析を可能にし、生物学的洞察をより効率的に推進します。コムギやジャガイモなどの多倍体生物のジェノタイピングから得られたデータを解析するには、生物の倍数性のレベルと種類に依存する特別な考慮事項が必要です。


GenomeStudio Softwareでは、多倍体生物のジェノタイプを自動ジェノタイプコーリングにより合理化された方法で解析できます。このソフトウェアにより、必要な数のクラスターを呼び出すことができ、六倍体またはオクトロイド種の研究が可能になります。

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GenomeStudio Softwareへのアクセスはイルミナのマイクロアレイに含まれています。

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