RNAシーケンス(RNA-Seq)は、トランスクリプトーム研究を急進的に変えています 高感度かつ高精度なツールでトランスクリプトーム全体の発現を評価することにより、他の研究デザインでは環境条件をさまざまに変えてもこれまで検出されなかった、例えば治療に反応して起こるさまざまな病態の変化などが明らかになっています。
RNA-Seqでは、一回のアッセイで既知と新規の両者の特性を検出でき、予備知識の有無に関わらず、転写産物アイソフォーム、遺伝子融合、一塩基多型、アリル特異的遺伝子発現などの現象を検出できます。1,2
次世代シーケンサー(NGS)によるRNA-Seqは、トランスクリプトーム研究に用いる手法としてRNA-Seqを選択する研究者が増え続けています。
RNA-Seqがさまざまな分野の研究をどのように進めているか、また、遺伝子制御研究がどのように補完的な情報を提供できるかご紹介します。
eBookをダウンロードイルミナのNGSテクノロジーがどのように機能し、どのような実験に対応できるのかをご紹介します。
がんRNA-Seqによる遺伝子発現とトランスクリプトーム変化を研究します。
メタトランスクリプトミクスにより、複雑な微生物コミュニティにおける遺伝子発現を解析します。
薬物反応RNAバイオマーカーを研究します。
Partek Flowは、RNA-Seq実験によって生成される大量のデータを効率的に視覚化および解析するための便利なツールを備えています。あらゆるスキルレベルの研究者が、これまでになく迅速かつ簡単にゲノムデータを探索できるようになります。
このRNAシーケンス手法ガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのイルミナのソリューションについて解説します。イルミナのRNAシーケンスワークフローは、ライブラリー調製、シーケンシング、データ解析をシームレスに統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。
ガイドをダウンロードRNA-Seqライブラリー調製の進歩は、トランスクリプトーム研究に革命をもたらしています。当社の強化されたRNAシーケンスライブラリー調製ポートフォリオは、さまざまなタイプのシーケンス研究に対応しています。これらのソリューションは、迅速なターンアラウンドタイム、幅広い研究の柔軟性、およびシーケンスのスケーラビリティを可能にします。
RNAライブラリー調製の詳細はこちらイルミナのベンチトップ型シーケンスシステムは、世界中のラボでNGSテクノロジーをより身近なものにしています。これらのシステムが、微生物学研究、がん研究などにおいて、画期的な進歩をもたらすスピード、パワー、柔軟性をどのように実現しているかをご覧ください。MiSeq i100シリーズや、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、NGS研究の目標を手の届くものにします。
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次世代RNAシーケンスアプリケーションに対応するイルミナソリューションの詳細はこちらをご覧ください。
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)とその他の低品質サンプルのRNA-Seqは、疾患研究に貴重な洞察を提供します。
疾患に関連する遺伝子ターゲットとパスウェイを探索します。
ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールにより、バイオインフォマティクスの経験に関係なく、生物学者のRNA-Seqデータ解析が簡素化されます。
COVID-19の疾患重症度に関連する遺伝子変異を同定し、NGSとマイクロアレイを用いてSARS-CoV-2に対する免疫応答をプロファイリングします。
組織の形態と遺伝子活性を合わせて視覚化することができ、細胞間の位置関係や、それらが組織の形成、機能、病態にどのように関与しているかを可視化することができます。
この費用対効果の高い柔軟なワークフローでは、シングルセルの遺伝子発現を測定でき、通常はバルクサンプリングメソッドでマスクされた細胞の違いを探索できる高解像度分析が可能になります。