ゲノミクスで免疫疾患に関する洞察を得る

免疫ゲノム研究

ゲノム解析テクノロジーは、免疫細胞の機能とシグナル伝達を解明することで免疫学研究を前進させることができます。複雑な自己免疫疾患(ループス、関節リウマチ、多発性硬化症など)やその他の免疫疾患の原因はまだよくわかっていません。

イルミナの免疫ゲノミクスソリューションは、免疫学研究者が潜在的な自己免疫疾患のメカニズム、免疫レパートリー、および免疫関連遺伝子変異の機能的結果に関する洞察を得るのに役立ちます。次世代シーケンサー(NGS)は、研究コミュニティが免疫応答を高解像度でマッピングするために必要な品質、スループット、リード長を提供します。マイクロアレイは、ヒト免疫系における遺伝的変異の大規模研究のための高密度コンテンツを提供します。 

免疫学研究論文のレビュー
免疫学研究レビュー

免疫学者がNGSを使用する多様な方法を示す査読付き論文の要約をご覧ください。

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NGSは、一見無限の標的を認識することのできる免疫細胞の膨大なレパートリーをマッピングする強力な免疫ゲノム研究ツールであることが証明されています。1 レパートリーシーケンスにより、研究者は自己免疫疾患、血液悪性腫瘍、その他の疾患にかかりやすい個人に見られるユニークな受容体バリアントを同定することができました。2  

T細胞受容体レパートリー解析

研究者は、T細胞受容体(TCR)レパートリーとミトコンドリアDNAおよびピウイ相互作用RNAのシーケンスにより、疾患のメカニズムを解明します。

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免疫ゲノミクス研究論文

 
腫瘍特異的HLAリガンド
腫瘍特異的HLAリガンドを用いた高精度な免疫療法

RNA-Seqとヒト白血球抗原(HLA)のタイピングは、ターゲット探索プラットフォームのパワーと効率を高めています。

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ターゲットDNA解析
HLA遺伝&学自己免疫疾患

研究者はNGSでゲノムのクエリを行い、ハイスループットジェノタイピングを実施して免疫介在性疾患の新規リスク遺伝子座を同定します。

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乳がん
NGSはバイオマーカー探索に有用であることが証明されました

研究者は、がん遺伝子発現解析、免疫学研究、免疫療法バイオマーカー研究にNGSを使用します。

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COVID-19免疫応答研究

SARS-CoV-2ウイルスに対する個々の免疫系の反応を調べることで、疾患の感受性と重症度に対する理解を深めることができます。ウイルスに対する免疫反応を研究し、遺伝的リスク因子を同定する方法を探ります。

免疫応答プロファイリングの詳細はこちら
免疫反応プロファイリング
シングルセルテクノロジーを使用した免疫の発見の深化
シングルセル

シングルセルツールを用いたマルチオミクス解析により、希少な免疫細胞タイプの新しいバイオマーカーを発見し、ハイコンテントフローサイトメトリーの特性解析実験につなげた方法をご覧ください。

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免疫ゲノミクスによる抗腫瘍T細胞レパートリーのデコード
T細胞と腫瘍細胞

Johns Hopkins University School of Medicineの腫瘍学助教授であるKellie Smith博士が、がんネオアンチゲンと免疫反応の相互作用の理解に関する研究を発表します。

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Paul Klenerman(オックスフォード大学)、Shruti Naik(ニューヨーク大学)、およびAna Anderson(ハーバード大学医学部)が、NGSデータが非定型免疫細胞集団と組織特異的免疫応答の理解をどのように照らしているかについて語っています。

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蛍光免疫細胞

AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus、TCRベータパネル:T細胞受容体(TCR)のベータ鎖再配列のシーケンスにより、T細胞の多様性とクローン性増殖を調べます。

AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR(Short Read)パネル:TCRベータ鎖の再構成シーケンスにより腫瘍サンプル中のT細胞の多様性とクローン増殖を測定する FFPE互換パネル。

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel:腫瘍と免疫系の相互作用に関与する395の遺伝子を調査する ターゲットRNA発現パネル。

Infinium Immunoarray:自己免疫疾患と免疫機能に関連する遺伝子変異を1つのマイクロアレイで 評価します。

シングルセルオミクスと細胞免疫研究

イルミナゲノミクスポッドキャストのエピソード45で、Shalin Naik博士は、免疫系を理解するためにシングルセルゲノミクスを使用することについて話しています。

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腫瘍免疫原性研究
腫瘍およびT細胞

NGSは、腫瘍が免疫反応を回避できる変異や、T細胞性免疫を高めるネオアンチゲンを同定するのに役立ちます。免疫腫瘍学研究の詳細はこちら

複雑な疾患のゲノミクス
複雑な疾患のゲノミクス

イルミナのシーケンスでは、自己免疫性疾患やリウマチ性疾患、アテローム性動脈硬化症、精神疾患、その他の疾患を分子レベルで理解するための新しい方法を導入しています。複雑な疾患研究の詳細はこちら

統合ゲノミクスによるIBD発見の推進
免疫ゲノミクスによるIBD発見の推進

Carl Anderson博士が、炎症性腸疾患(IBD)研究における統合的研究アプローチについて説明します。

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細胞と抗体
自己免疫の謎を解き明かす

Carola Vinuesa博士が、NGSが自己免疫を調節する細胞と分子の複雑な相互作用をどのように解明できるかについて解説します。

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ポッドキャストを聴いている人
ゲノミクスと免疫疾患

Janna Saarela博士が、一般的および希少な免疫疾患の背後にあるメカニズムを同定するためのゲノミクスの使用について説明します。

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NextSeq 1000/2000システムでの免疫レパートリーシーケンス
NextSeq 1000/2000システムでの免疫レパートリーシーケンス

このアプリノートでは、免疫レパートリーシーケンスについて学び、ランごとにより多くのサンプルで高品質のリードを取得する方法をご紹介します。

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参考文献
  1. Woodsworth D.J.、Castellarin M.、およびHolt R.A.の健康と疾患におけるT細胞レパートリーのシーケンス解析。ゲノム医療 2013; 5:98。
  2. Robins H. Immunosequencing:免疫レパートリーディープシーケンスの応用。Curr Opin Immunol. 2013; 25: 646-652.