NovaSeq Xシリーズのご購入
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AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、腫瘍と免疫系の相互作用に関与する395の遺伝子におけるがんバイオマーカーの発現を定量化するためのターゲットリシーケンス研究アッセイです。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）
アッセイ時間
<1.5時間
ハンズオンタイム
1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨
インプット量
概要
パネル機能
Immune Response Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction（PCR）ベースのライブラリー調製、Illumina sequencing by synthesis（SBS）次世代シーケンサー（NGS）テクノロジー、自動解析を含むRNAからアノテーションへの統合バリアントソリューションの一部です。
このパネルは、異なる白血球サブセット、抗原提示、チェックポイント経路、腫瘍進行に関連するバイオマーカーを検出します。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
仕様
| アッセイ時間 | 6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
|---|---|
| コンテンツ仕様 | 免疫反応に関連する395の遺伝子 |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| インプット量 | 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ |
| 核酸の種類 | RNA |
| アンプリコン数 | 合計398（1プール） |
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 転写産物バリアント |
必要な製品
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelワークフローには、Immune Response Panel、Library PLUSキット、およびインデックスアダプターが必要です。また、全RNAをcDNAに変換するには、cDNA合成キットが必要です。
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件
アプリケーション
ワークフローの例
ライブラリー調製
AmpliSeq for Illumina 免疫応答パネル
解析
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| iSeq 100システム | 4 samples per run (assumes 1 million reads per sample) |
2 × 150 bp |
| MiniSeqシステム | Samples per run: mid output: 8, high output: 24 (assumes 1 million reads per sample) |
2 × 150 bp |
| MiSeqシステム | Samples per run (by reagent kit version): v2 micro: 4, v2: 15, v3: 24 (assumes 1 million reads per sample) |
2 × 150 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
ターゲットシーケンスまたはリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたは関心のあるゲノム領域が単離され、シーケンスされるため、ラボのリソースを節約できます。
イルミナのがん研究向けNGSとマイクロアレイテクノロジーが、がんゲノム分野における革新を牽引します。
NGSとアレイソリューションにより、免疫レパートリー、疾患メカニズム、免疫関連遺伝子変異の機能的影響に関する洞察を得ることができます。
ドキュメント
製品資料
マニュアルとサポート情報
- AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelリファレンスガイド
- TG VeriSeq NIPT Solution v2 RUO製品マニュアル
- AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelの資料
- Infinium Global Clinical Research Array Documentation
- Illumina Adapter Sequences
- Index Adapters Pooling Guide
- AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel消耗品および機器
- AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelチェックリスト
- イルミナアダプター配列
- TG VeriSeq NIPT Solution v2 RUO Assayソフトウェアリリースノート
- All AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelのサポート Support
パネル (1)
AmpliSeq™ Immune Response Panel for Illumina®
20019169
AmpliSeq Library PLUS for Illuminaと組み合わせると、24反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。
List Price:
Discounts:
ライブラリー調製 (3)
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (6)
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
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アクセサリー製品 (3)
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
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MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100試薬
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
AmpliSeq for Illuminaオンデマンド
5,000を超えるプレテスト済み遺伝子のカタログから選択することで、ヒト疾患研究のためのパネルデザインを効率的かつ便利にカスタマイズできます。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
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