TruSight Hereditary Cancer Panel

遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。

DNAからデータまで約48時間

アッセイ時間

約2時間

ハンズオンタイム

DNA 50~1,000 ng 

インプット量

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概要

TruSight Hereditary Cancer Panelは、生殖系列変異を評価するための専門家による定義されたコンテンツを提供します。

  • 広範なパネルには、遺伝性がんの素因に関連する113の遺伝子が含まれます

  • 簡単プロトコールにより、迅速で柔軟なライブラリー調製と濃縮が可能

  • ランごとに2~256サンプルのサンプルスループットを有するすべてのイルミナベンチトップシーケンスシステムとの互換性

  • ハイブリッドキャプチャーエンリッチメントにより、1塩基変異(SNP)、Indel、コピー数バリアント(CNV)を正確に検出するための良好なカバレッジ均一性が得られます

専門家が選定したコンテンツ

このパネルは、主要なオピニオンリーダーからのインプットに基づいて開発され、113の遺伝子と125のSNPにわたる10,341のプローブが含まれています。

高速ライブラリー調製と濃縮ワークフロー

このパネルは、Illumina DNA Prep with Enrichmentライブラリー調製ワークフローで使用され、酵素ベースのDNA断片化を利用して、装置のコストおよび機械的な断片化の必要性を排除します。Illumina DNA Prep with Enrichmentは、ユーザーフレンドリーなワークフローのために複数の自動化システムで認定されています。

スケーラブル

最大384サンプルまで利用可能なインデックスにより、すべてのイルミナベンチトップシーケンスシステムにおいて、柔軟なバッチサイズとスケーラビリティを実現します。 

仕様

必要な製品

TruSight Hereditary Cancer Panel ワークフローには、TruSight Hereditary Cancer Enrichmentオリゴ、Illumina DNA Prep with Enrichment、Illumina DNA/RNA UD インデックス、およびシーケンス試薬が必要です。

/

アプリケーション

TruSight Hereditary Cancer Panelは、非常に効率的なターゲット次世代シーケンサー(NGS)パネルであり、研究者は、専門家が定義したコンテンツセットにアクセスすることで、がんの素因と過去に関連付けられた遺伝子内のバリエーションを解析できます。

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

TruSight遺伝性がん – 濃縮オリゴ

Illumina DNA Prep with Enrichment

Illumina DNA/RNA UD Indexes

プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

Samples per run: 2 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(推奨最大値)

MiniSeq System

Samples per run: mid-output: 5, high-output: 16 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(推奨最大値)

MiSeq System

Samples per run: v2 Micro: 2, v2 Standard: 9, v3 Standard: 16 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(推奨最大値)

NextSeq 500 System

Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(推奨最大値)

NextSeq 550 System

Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(推奨最大値)

ドキュメント

製品資料

TruSight Hereditary Cancer Panelの遺伝子コンテンツ

がんの素因に関連する113の遺伝子をターゲットとし、主要なガイドラインで推奨され、症例と対照の集団研究で評価された10,341のプローブを含んでいます。

リスク低減に関連する主要ガイドラインに含まれる遺伝子

TruSight Hereditary Cancer Panelには、乳がん・結腸がん・卵巣がん・胃がんなどの遺伝性素因に一般的に関連する遺伝子の広範なリストが含まれており、主要なガイドラインで推奨されています。 

ライブラリー調製 (5)

TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)

20029551

TruSight Hereditary Cancer - Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96ライブラリー(8、12プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16のライブラリー(16、1プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)]でのみ注文が可能です。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16ライブラリー調製用試薬が入っています。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples)]でのみ注文が可能です。

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インデックスアダプター (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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試薬 (10)

iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle)

20031371

iSeq 100システムでの300サイクルランをサポートするクラスター試薬とシーケンス試薬を含むi1フローセル1個とプレフィルドカートリッジ1個が含まれます。

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iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle) 4 pack

20031374

iSeq 100システム上で4 × 300サイクルのランをサポートするクラスター化試薬およびシーケンス試薬を含むi1フローセル4個およびプレフィルドカートリッジ4個が含まれます。

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iSeq 100 i1 Reagent v2 (300-cycle) 8 pack

20040760

iSeq 100システム上で8 × 300サイクルのランをサポートするクラスター試薬とシーケンス試薬を含むi1フローセル8個とプレフィルドカートリッジ8個が含まれます。

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MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300-cycles)

MS-103-1002

MiSeqシステムの最大325サイクルのシーケンス用のキット試薬を提供します。 4M 内容:ペアエンド試薬プレート(300サイクル)、MiSeqマイクロフローセル、洗浄バッファー。

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MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)

MS-102-2002

MiSeq v2 Reagentキット、キットあたり300サイクル。

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MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)

MS-102-3003

MiSeqシステム上で最大625サイクルのシーケンスを行える試薬キットが提供されています。内容:ペアエンド試薬プレート(600サイクル)、MiSeqフローセル、洗浄バッファー。

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MiniSeq Mid Output Kit (300-cycles)

FC-420-1004

300サイクルのシーケンス用のキット試薬に加え、中出力ラン(最大8M0万リード)でのデュアルインデックスサポートを提供します。内容:中出力試薬カートリッジ(300サイクル)、フローセル、ハイブリダイゼーションバッファー。

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MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles)

FC-420-1003

300サイクルのシーケンス用のキット試薬と、ハイアウトプットラン(最大25Mリード)でのデュアルインデックスサポートを提供します。内容:高出力試薬カートリッジ(300サイクル)、フローセル、ハイブリダイゼーションバッファー。

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NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (300 Cycles)

20024905

300サイクルのシーケンス用のキット試薬に加え、中出力ラン(最大130Mリード)でのデュアルインデックスサポートを提供します。内容:中出力試薬カートリッジ(300サイクル)、中出力フローセルカートリッジ、バッファーカートリッジ。

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NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (300 Cycles)

20024908

300サイクルのシーケンス用のキット試薬と、ハイアウトプットラン(最大400Mリード)でのデュアルインデックスサポートを提供します。内容:高出力試薬カートリッジ(300サイクル)、高出力フローセルカートリッジ、バッファーカートリッジ。

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アクセサリー製品 (1)

Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)

20018706

Illumina DNA PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentで血液サンプルを処理するための試薬が含まれます。ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプター試薬は別売りです。

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選択中の製品一覧

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よくある質問(FAQ)

TruSight Hereditary Cancer Panelには、乳がん・結腸がん・卵巣がん・胃がんなどの遺伝性素因に一般的に関連する遺伝子の広範なリストが含まれています。

TruSight Hereditary Cancer Panelは、あらゆるベンチトップのイルミナシーケンスシステム(iSeq 100、MiSeq、MiniSeq、NextSeqシステム)で実行できます。

TruSight Hereditary Cancer Panelには、125の一塩基多型(SNP)が含まれています。このうち、48個がID SNPで、77個がポリジェニックリスクスコアリング(PRS)に使用されています。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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