ターゲットシーケンス

重要な遺伝子や関心のあるゲノム領域に絞って解析を行うことで、シーケンスコスト、解析時間、データ解析の負荷を低減できます。

ターゲットリシーケンス

ターゲットシーケンスやリシーケンスでは、遺伝子の一部や関心のあるゲノム領域を選択してシーケンスします。次世代シーケンサー(NGS)を用いたターゲット解析では、特定の領域に絞って解析を行うことで、時間やコスト、データ解析の負担を効率化できます。対象には、エクソーム(ゲノム中のタンパク質コード領域)、特定の目的遺伝子(カスタムコンテンツ)、遺伝子内の特定領域、ミトコンドリアDNAなどが含まれます。

手法ガイドで研究をさらに推進

この包括的なガイドでは、ターゲットリシーケンスからRNA-Seq、ターゲットメタゲノミクス、エピジェネティクスまで、幅広いNGS手法について解説しています。

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ターゲットリシーケンスの主な利点:

  • 関心のある領域に的を絞って解析することで、より管理しやすいデータセットを生成
  • シーケンスコストとデータ解析の負担を軽減
  • より広範な解析手法と比べてターンアラウンドタイムを短縮
  • 高いカバレッジによるディープシーケンスを可能にし、希少バリアントの検出を支援

全ゲノムシーケンス(WGS)などの包括的な解析アプローチと比較して、ターゲットリシーケンスは関心領域を解析するための費用対効果に優れた手法です。ターゲットNGSでは、1塩基多型から挿入・欠失まで、幅広いゲノム変異を検出できます。また、研究対象の表現型に関与する可能性が高い領域に解析対象を絞ることで、リソースを効率的に活用しながら、より管理しやすいデータセットを取得できます。さらに、ターゲットアプローチではより高いカバレッジを実現できるため、全ゲノムシーケンスやサンガーシーケンスでは検出コストが高くなる希少バリアントの同定にも有効です。

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NGSとqPCRの詳細

NGSとサンガーシーケンスの比較

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NGSでは特定の遺伝子やDNA領域をどのように解析できますか?

一般的なターゲットNGSの手法と、その違いについてご紹介します。主な手法としては以下が挙げられます。

その他のターゲットNGS手法を見る

がん細胞
ターゲットNGSはどのように活用できますか?

ターゲットシーケンスにより、がんや微生物学をはじめとするさまざまな研究領域で、遺伝子バリアントの発見、確認、スクリーニングを実現できます。

ターゲットNGSの使用法を探る 
ゲノムサーベイランス

NGSは、感染症の脅威を特定し、その拡大状況を追跡するための効果的なゲノムサーベイランス戦略を支援します。ターゲットシーケンスは、人獣共通感染症病原体や呼吸器病原体のモニタリングに活用できます。

ジェノタイピング技術

最先端のジェノタイピング技術により、1塩基変異やコピー数バリアントなど多様な遺伝学的バリアントを解析し、疾患の分子レベルでの理解を深めることができます。

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Target Enrichment
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Target enrichment captures genomic regions of interest by using hybridization to target-specific biotinylated probes.

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ターゲットNGSを活用した、びまん性神経膠腫の遺伝学的マーカーの高精度な検出と腫瘍特性解析についてご覧ください。
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Dr. Samuel Myllykangasが、最新のNGS技術と今後の技術革新により、遺伝学的検査の将来がどのように変わる可能性があるのかを解説します。
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生殖系列CNV解析
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Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentを活用した、生殖細胞系列CNV解析向けの効率的なエクソームシーケンスワークフローをご紹介します。ライブラリー調製から解析結果の取得までをシームレスに実現します。
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