ターゲットエンリッチメント
ターゲットエンリッチメントとは？
ターゲットエンリッチメントは、ターゲット特異的ビオチン化プローブへのハイブリダイゼーションによって特定の遺伝子または関心のあるゲノム領域をキャプチャーすることで機能し、その後、磁気プルダウンによって単離され、次世代シーケンス（NGS）でシーケンスされます。
イルミナのライブラリー調製およびエンリッチメントキットは、ターゲットエンリッチメントのための完全なソリューションを提供します。Illumina DNA Prep with Enrichmentは、ビーズ結合トランスポソーム介在性タグメンテーションケミストリーとハイブリッドキャプチャーターゲットエンリッチメントを組み合わせ、ワークフロー時間を短縮し、genomic DNA、組織、血液、唾液およびFFPEサンプル用のターゲットエンリッチメントリシーケンスのための正確で信頼性の高いアッセイを生成します。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、cfDNAサンプルからの高感度変異検出のための迅速で柔軟なライブラリー調製を提供します。
NGSターゲットエンリッチメントのメリット
ハイブリダイゼーションによるエンリッチメントは、特定のサンプル中における、特定の遺伝子バリアントの解析に有効な戦略です。
ターゲットエンリッチメントにより、研究者は堅牢で簡単なワークフローを使用して、エクソームや多数の遺伝子（> 50遺伝子）を確実にシーケンスできます。幅広いインプットの種類と量に対応し、信頼性の高い結果を提供します。用途は以下のとおりです。
- ヒト全エクソームシーケンス（WES）
- がん、遺伝性疾患、感染症の研究のための事前設計された（固定された）シーケンスパネル
- ターゲットシーケンス用のカスタムエンリッチメントパネル
ターゲットエンリッチメントとその他のリシーケンス戦略の比較
ハイブリッドキャプチャーによるターゲットエンリッチメントにより、研究者は特定の研究テーマに関連するゲノムの領域をターゲットにすることができます。ターゲットリシーケンスは、PCRやサンガーシーケンスよりも高い発見力（新規バリアントを同定する能力）と高い変異分解能を提供します。
PCRベースのアンプリコンシーケンスと比較して、ハイブリダイゼーションによるエンリッチメントシーケンスは、より多くの全遺伝子量を対象とし、すべてのバリアントタイプのプロファイリングをより包括的にサポートすることができます。遺伝子総量が多いほど、既知のバリアントと新規のバリアントの両方の特性を評価し、探索関連のアプリケーションを利用することができます。
詳細はこちら：
アンプリコンシーケンスと比較したターゲットエンリッチメントの利点*
ターゲットエンリッチメント |
アンプリコンシーケンス |
| 大きな遺伝子構成、通常は50個超の遺伝子 | 小さな遺伝子構成、通常は50個未満の遺伝子 |
| すべてのバリアントタイプを対象とした、より包括的なプロファイリング | 1塩基変異（SNV）と挿入・欠失（Indel）の解析に理想的 |
| より包括的な手法だが、ハンズオンタイムとターンアラウンドタイム**が長い | より手頃な価格で、より簡単なワークフロー |
* 社内データ、イルミナ 2018年
** ターンアラウンドタイムは、ライブラリー調製アッセイタイム（DNAからライブラリーの終了まで）が対象です。
推奨されるターゲットエンリッチメントワークフロー
ユーザーフレンドリーなオートメーション対応ワークフローは、研究者に迅速かつ柔軟なソリューションを提供します。ビーズ上でのタグメンテーションケミストリーは、幅広いDNAインプット量、様々なサンプルサイズ、および幅広いアプリケーションに対応することができます。
主な感染性疾患ターゲットエンリッチメントソリューション
Viral Surveillance Panel v2
SARS-CoV-2、インフルエンザ、アルボウイルス、ターゲットエンリッチメントを伴う肝炎を含む>200ウイルスおよびサブタイプの全ゲノムシーケンスと特性評価。
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel
このNGSベースのターゲットエンリッチメントワークフローは、呼吸器系病原体や抗菌薬耐性アリルをターゲットとし、簡便なデータ解析を提供します。
画期的なゲノム探索へのアクセスを強化
イルミナのベンチトップ型シーケンスシステムは、世界中のラボでNGSテクノロジーをより身近なものにしています。これらのシステムが、微生物学研究、がん研究などにおいて、画期的な進歩をもたらすスピード、パワー、柔軟性をどのように実現しているかをご覧ください。MiSeq i100シリーズや、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、NGS研究の目標を手の届くものにします。
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主な製品
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment. Fast, flexible library prep for highly sensitive mutation detection from cfDNA sample
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BaseSpace Sequence Hub
Data management and simplified bioinformatics for labs getting started and for rapidly scaling next-generation sequencing (NGS) operations.
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Illumina Custom Enrichment Panel v2
Custom targeted enrichment sequencing panels designed for content of interest.
Learn More関連ソリューション
複雑な疾患研究
アレイや次世代シーケンサー（NGS）の手法により、複雑な疾患研究を促進するためのグローバルな遺伝子解析が可能になります。
詳細はこちら体細胞バリアント解析
腫瘍検体の体細胞バリアントプロファイリングを実行する。
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ゲノムのタンパク質コード領域を調査し、疾患と集団医学に対する遺伝学の影響を明らかにする。
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次世代シーケンサー（NGS）は仮説不要の手法として、わずか1個の一塩基多型（SNP）だけが異なる感染症株を区別し、複数のテストの代替法として使用できます。
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一塩基多型（SNP）とバリアントを検出する手法を比較しながら、ニーズに最適なアプローチを決定します。サイエンティストがバリアントを機能に結び付け、疾患の生物学的側面の貴重な洞察を得る能力をどのように加速しているかを学びましょう。
補足資料
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs.
研究ニーズに合わせてカスタマイズされたパネルコンテンツ
Illumina Custom Enrichment Panel v2では、完全なカスタムパネルまたはスパイクインパネルを作成できます。迅速な配送、高いオンターゲットエンリッチメント、および効率的で信頼性の高い結果を得るための合理化されたワークフローをお楽しみください。
生殖系列CNV解析
Illumina DNA PrepとExome 2.5 Enrichmentを使用して、ライブラリー調製から洞察まで、合理化されたエクソームシーケンスワークフローで生殖系列CNV解析を実現する様子をご覧ください。
NGS Workflow Finder
次回のワークフローから手探りをなくしましょう。NGSワークフローファインダーは、パーソナライズされたソリューションの提案とリソースを提供し、自信を持ってシーケンスが進められるようサポートします。