ウイルスサーベイランスパネル

Viral Surveillance Panelは、SARS-CoV-2、インフルエンザ、ポリオを含む66種のウイルスの全ゲノムシーケンスと特性評価をターゲットエンリッチメントとともに提供します。 続きを読む...
製品の選択

ウイルスサーベイランスパネル、RUO 96 Rxns

20088154

価格
 
 

VSP w ILMN RNA Prep w Enrich A、96 Rxns

20087932

価格
 
 

VSP w ILMN RNA Prep w Enrich B、96 Rxns

20087929

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インデックスアダプター

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A、タグメンテーション(96インデックス、96サンプル)

20091654

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B、タグメンテーション(96インデックス、96サンプル)

20091656

価格
 
 

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C、タグメンテーション(96インデックス、96サンプル)

20091658

価格
 
 

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D、タグメンテーション(96インデックス、96サンプル)

20091660

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アクセサリー製品

Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation(96サンプル)

20040537

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96インデックス、96サンプル)

20027213

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96インデックス、96サンプル)

20027214

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96インデックス、96サンプル)

20042666

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96インデックス、96サンプル)

20042667

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製品のハイライト

Viral Surveillance Panel with Illumina RNA Prep with Enrichmentキットを使用すると、研究者は、SARS-CoV-2、インフルエンザ、サル痘ウイルス、ポリオウイルスなど、公衆衛生に高リスクの66のウイルスを特徴づける全ゲノムシーケンス(WGS) データを取得できます。この設計により、プロアクティブで広範な病原体サーベイランスが可能になります。ハイブリッドキャプチャーパネルは、ウイルスゲノムのバリエーションを可能にし、変異や新規株の検出を可能にします。

ウイルス検出のためのターゲットエンリッチメント

ハイブリッドキャプチャー法によるターゲットエンリッチメント により、ショットガンメタゲノムシーケンスに必要な高いリード深度を必要とせずに、複数のウイルスの全ゲノムシーケンスが可能になります。同時に複数のウイルスのWGSにより、ウイルスの進化と幅広いウイルスサーベイランスを理解することができます。1

アンプリコンシーケンスなどの他のターゲットリシーケンス法と比較して、ハイブリッドキャプチャーによるエンリッチメントにより、複数のウイルスを一度により包括的に特性化し、シーケンスが難しいゲノムを持つ、より大きなタイル状のプローブパネルが可能になります。さらに、ハイブリッドキャプチャープロトコールに使用されるオリゴプローブは、非常に変異原性の強い領域でも有効であり続け、RNAウイルスなどの急速に進化するウイルスをターゲットにすることができます。

合理化されたワークフロー

この包括的なワークフローにより、研究者と公衆衛生サイエンティストは、1つのパネル/ワークフローで複数の高リスクウイルス(両方のDNA & RNA)を監視できます。このワークフローでは、ライブラリー調製、ターゲットエンリッチメント、シーケンス、データ解析を統合します。このワークフローは、全核酸抽出から 全ウイルスゲノムを濃縮することを目的としています。対応するデータ解析は、DRAGEN Microbial Enrichmentアプリで完了できます。

1. Gaudin M and Desnues C. Hybrid Capture-Based Next Generation Sequencingとそのヒト感染症への応用。前面の微生物。2018; 9:2924。

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仕様

製品比較

ウイルスサーベイランスパネル Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス
核酸タイプ RNA, DNA RNA, DNA RNA, DNA
生物種カテゴリー ウイルス ウイルス, ヒト 細菌, ウイルス
自動化に関する互換性 自動液体分注システム 自動液体分注システム 自動液体分注システム

それぞれのワークフロー例

 

サポートデータと図

ウイルスサーベイランスパネルに含まれる
アデノウイルス B型肝炎ウイルス パレコウイルス
愛知ウイルス C型肝炎ウイルス パルボウイルス
アストロウイルス E型肝炎ウイルス ポリオウイルス
Chapareウイルス ヒト免疫不全ウイルス1 ポリマウイルス
チクングニアウイルス ヒト免疫不全ウイルス2 呼吸器合胞体ウイルス
Coronavirus-229E A型インフルエンザウイルス ライノウイルス
Coronavirus-HKU1 B型インフルエンザウイルス リフトバレー熱ウイルス
Coronavirus-OC43 日本脳炎ウイルス ロタウイルス
Coronavirus-NL63 ジュニンウイルス 風疹ウイルス
コクサッキーウイルス カヤサヌール森林病ウイルス サビアウイルス
クリミア・コンゴ出血熱ウイルス ラッサ熱ウイルス サリウイルス
デングウイルス1型 Lujoヘモリファジー熱ウイルス サポウイルス
デングウイルス2型 マチュポウイルス SARS-COV
デングウイルス3型 マールブルクウイルス SARS-COV-2
デングウイルス4型 MERS-CoV ダニ媒介性脳炎ウイルス
東ウマ脳炎ウイルス メタニューモウイルス Tenoウイルスにトルクをかける
エボラウイルス サル痘ウイルス バリオラウイルス
エンテロウイルス ニパウイルス ベネズエラウマ脳炎ウイルス
グアナリトウイルス ノロウイルス 西ナイルウイルス
ハンタウイルス Omsk出血熱ウイルス 西ウマ脳炎ウイルス
ヘンドラヘニパウイルス 腫瘍溶解性ヒトパピローマウイルス 黄熱ウイルス
A型肝炎ウイルス パラインフルエンザウイルス ジカウイルス

関連製品

Illumina RNA Prep with Enrichment

卓越したキャプチャー効率とカバレッジの均一性で、膨大な数の標的遺伝子の迅速な探索を実現します。