Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

CpGアイランド、遺伝子、エピゲノムワイド関連解析用エンハンサーを広範囲にカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。

週に>1000サンプル(8サンプルBeadChipのTecanあたり)

サンプルスループット

アレイあたり8サンプル

サンプル数

> 935,000

マーカー数

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概要

Infinium MethylationEPIC v2.0キットは、ヒトメチロームの最も生物学的に重要な領域の> 935K CpG部位をターゲットとするゲノムワイドなメチル化スクリーニングツールです。

  • リード深度とは無関係に正確かつ精度の高いメチル化測定を行う、単一ヌクレオチド分解能でのCpGの定量的精査

  • GenomeStudio Methylation Moduleによる一次解析と品質管理

  • EPIC v1.0の専門家による評価に基づくコンテンツの更新

費用対効果の高いスクリーニング

サンプルあたりの総コストが比較的低く、拡張性があるため、ラボは大規模なコホートを効率的にスクリーニングできます。

エピジェネティクス研究者からの信頼

イルミナのメチル化BeadChipsは、>10年にわたる画期的な研究に力を入れており、現在までに公表されているほとんどのエピゲノムワイド関連研究(EWAS)は、メチル化EPICまたはその前身について完了しています。Gene Expression Omnibus(GEO)やThe Cancer Genome Atlas(TCGA)などのデータリポジトリでメチル化データを活用します。

複数のサンプルタイプに対応

このアッセイはFFPEと互換性があり、腫瘍の大規模なバイオレポジトリーで実行できる研究を提供します。また、新鮮/凍結組織、全血、口腔細胞、cfDNA、唾液、その他のサンプルタイプとも互換性があります。


仕様


必要な製品

一度に実行するサンプル数と一致するキットの購入が必要です。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていないことに注意してください。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。キットにはメチル化スクリーニングに必要な試薬がすべて含まれていますが、バイサルファイト変換キットは別売りのオプション製品です。 

/ 結果

アプリケーション

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、がん、遺伝性疾患、老化、分子疫学の研究アプリケーションのためのメチル化ベースのバイオマーカーの発見を可能にする頑強なマイクロアレイです。

ワークフローの例

1
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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit



関連するアプリケーションとメソッド

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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit Infinium Custom Methylation Kit Infinium Mouse Methylation BeadChip
Assay type Infinium HD Methylation Infinium HD Methylation
自動化に関する互換性 Automated Array Loader Automated Array Loader Automated Array Loader
説明

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、ゲノムワイドなメチル化スクリーニングツールであり、その機能コンテンツは強化され、専門家により選択されています。本キットはiScanまたはNextSeq 550システムで処理され、サンプルプーリングやインデックス作成を必要としない、シンプルで使いやすいワークフローに従います。

インプット量 250 ng DNA DNA250 ng超
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan iScan iScan
手法 Methylation Array Methylation Array Methylation Array
核酸の種類 DNA DNA DNA
マーカー数

> 935,000

固定マーカー:285,000超
サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり12サンプル
サンプルスループット

週に>1000サンプル(8サンプルBeadChipのTecanあたり)

週に>1000サンプル(8サンプルBeadChipのTecanあたり)

サンプルタイプの詳細

口腔細胞および新鮮/凍結組織にも対応

新鮮/凍結組織に使用できます。DACなどの外因性化学物質によって誘導されるDNAメチル化の変化を解析します。

サンプルタイプ Blood, FFPE Tissue, Cell-Free DNA, Saliva Blood, Cell-Free DNA, Saliva Blood, FFPE Tissue, Saliva
生物種 ヒト マウス, ヒト マウス
テクノロジー Microarray Microarray Microarray
バリアントクラス Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines

選択ツール:

Infinium MethylationEPIC v2.0 coverage of genomic regions

Infinium Methylationゲノム領域のEPIC v2.0カバレッジ

新しく強化されたコンテンツは、将来のエピジェネティックな発見を可能にします。

Dense coverage of CpG islands

CpGアイランドの高密度カバレッジ

Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChipで十分にカバーされなかったCpGアイランドとエクソンは、追加のプローブで完全にカバーされています。

Robust data with FFPE samples

FFPEサンプルによる堅牢なデータ

FFPE組織サンプルは、修正版のInfinium Methylation HD Assayで堅牢な性能を示します。貴重なサンプルと最適なサンプルの完全性のために、Infinium FFPE QCおよびDNA Restoration Kitsが推奨されます。

High backwards compatibility with previous BeadChips

以前のBeadChipとの高度な後方互換性

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、Infinium MethylationEPIC v1.0およびHumanMethylation450 BeadChipsの既存のCpGバックボーン上に構築されています。

EPIC v2.0 キット (4)

Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (8 Spl)

20087706

8サンプルBeadChipと、8つのDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が1つ含まれています。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (16 Spl)

20087707

2つの8サンプルBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (32 Spl)

20087708

4つの8サンプルBeadChipと、32のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (96 Spl)

20087709

12の8サンプルBeadChipと、96のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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EPIC v2.0 セミカスタムキット (3)

Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (16 Spl)

20097750

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、16サンプルを処理するための試薬を含む2つのビーズチップが含まれています。

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (32 Spl)

20097751

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、32サンプルを処理するための試薬を含む4つのビーズチップが含まれています。

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カスタマイズ

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (96 Spl)

20097752

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、96サンプルを処理するための試薬を含む12のビーズチップが含まれています。

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カスタマイズ

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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選択中の製品一覧

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よくある質問(FAQ)

Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip Kitは、強力なInfinium Chemistryを活用して、バイサルファイト変換されたゲノムDNAの高度にマルチプレックス化されたジェノタイピングに基づいて、CpGアイランドでのシトシンメチル化を検出します。定量的アレイベースのメチル化測定の詳細はこちら

このキットは、イルミナメチル化アッセイを使用しています。これは、単一CpG部位レベルでの定量的メチル化測定を提供するマイクロアレイテクノロジーであり、正常細胞および疾患細胞におけるDNAメチル化の生物学的役割を調べる研究に力を与えます。 イルミナメチル化アッセイの詳細はこちら

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kitには、ATAC-SeqおよびChIP-seq実験で特定された原発腫瘍に関連する既知のエンハンサー、スーパーエンハンサー、CTCF結合部位、クロマチンのオープン領域をターゲットとする186Kの新しいプローブが含まれています。Infinium MethylationEPIC v2.0データシートでは、さらに詳しい改善点ついてご覧いただけます。

GenomeStudio Methylation Moduleは、ベータ値を抽出し、Infinium MethylationEPICアレイデータのクラスター化とノーマライゼーションを提供します。さらに、chAMPやSeSAMeなどのバイオコンダクタには、強化されたノーマライゼーションと視覚化のオプションを提供する多くのフリーウェアアプリケーションがあります。イルミナは、これらのフリーウェアソリューションのテクニカルサポートを直接提供していません。 メチル化アレイデータ解析のヒントをもっと見る。

Zymo EZ DNA Methylation Lightning Kitが、Infiniumワークフローに推奨されるバイサルファイト変換キットです。他社のバイサルファイト変換キットは別途購入する必要があります。Infinium Methylation BeadChips用の検証済みバイサルファイト変換キットの詳細はこちら。

出力ファイルは、デフォルト設定であるJPEGファイルで平均約2.75 Gb以下です。

BeadChipあたりのスキャン時間は約18~37分です。

はい、Infinium MethylationEPIC v1.0およびHumanMethylation450 BeadChipキットは製造中止となりました。同じ信頼性の高い Infiniumケミストリー基盤上に構築されたInfinium MethylationEPIC v2.0キットは、専門家が選定した内容を強化し、両方のキットの代替品として推奨します。 Infinium  

/ 結果

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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