Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。

3024 samples per week on a single iSCAN

サンプルスループット

アレイあたり8サンプル

サンプル数

~ 930k

マーカー数

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概要

Infinium MethylationEPIC v2.0 Kitは、ヒトのメチロームの生物学的に最も重要な領域にある約 930,000 個の固有のメチル化部位をターゲットとするゲノム全体のメチル化解析ツールです。

  • リード深度とは無関係に正確かつ精度の高いメチル化測定を行う、単一ヌクレオチド分解能でのCpGの定量的精査

  • GenomeStudio Methylation Moduleによる一次解析と品質管理

  • EPIC v1.0の専門家による評価に基づくコンテンツの更新

費用対効果の高い解析

比較的手頃な価格でゲノムワイドをカバーし、疾患メカニズムについての優れた生物学的洞察をスケーラブルに発見できます。

エピジェネティクス研究者からの信頼

Illumina Methylation BeadChipは、10年を超える画期的な研究を強化し、現在までに公表されているほとんどのエピゲノムワイド関連研究(EWAS)は、MethylationEPICまたはその先行モデルによって行われています。Gene Expression Omnibus(GEO)やThe Cancer Genome Atlas(TCGA)などのデータリポジトリでメチル化データを活用します。

FFPEとの互換性

全血に加えて、Methylation EPICv2.0はFFPEサンプルタイプとも互換性があり、腫瘍の大規模なバイオレポジトリーで研究を完了できます。

仕様

必要な製品

一度に実行するサンプル数と一致するキットの購入が必要です。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていないことに注意してください。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。キットにはメチル化スクリーニングに必要な試薬がすべて含まれていますが、Zymo Researchから購入する必要があるバイサルファイト変換キットは別売りのオプション製品です。

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アプリケーション

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、がん、遺伝性疾患、老化、分子疫学の研究アプリケーションのためのメチル化ベースのバイオマーカーの発見を可能にする頑強なマイクロアレイです。

ワークフローの例

1
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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

Infinium HD Methylation Assay

関連するアプリケーションと手法

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Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit Infinium Custom Methylation Kit Infinium Methylation Screening Array-48キット Infinium Mouse Methylation BeadChip
Assay type Infinium HD Methylation Infinium HD Methylation
Automation capability Automated array loader Automated array loader Automated array loader, Liquid handling robot(s) Automated array loader
説明 Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、ゲノムワイドなメチル化スクリーニングツールであり、その機能コンテンツは強化され、専門家により選択されています。本キットはiScanまたはNextSeq 550システムで処理され、サンプルプーリングやインデックス作成を必要としない、シンプルで使いやすいワークフローに従います。 集団の健康アプリケーションのための既知の一般的な疾患との関連性の高度にスケーラブルで手頃な価格でのメチル化解析。>1,000のサンプル、最大数百万のサンプルの研究に最適です。
インプット量 250 ng DNA 250 ng DNA DNA 50 ng 250 ng DNA
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan iScan iScan iScan
手法 Methylation array Methylation array Methylation array Methylation array
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA
Number of markers ~ 930k Fixed markers: 285k
サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり24サンプル アレイあたり48サンプル アレイあたり12サンプル
Sample throughput 3024 samples per week on a single iSCAN 16,128 samples per week
Specialized sample types Blood, FFPE tissue Blood, Cell-free DNA, Saliva Low-input samples Blood
Species category ヒト マウス, ヒト ヒト マウス
テクノロジー Microarray Microarray Microarray Microarray
バリアントクラス Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines Differentially methylated cytosines

選択ツール:

Infinium MethylationEPIC v2.0 coverage of genomic regions

Infinium MethylationEPIC v2.0のゲノム領域のカバレッジ

新しく強化されたコンテンツは、将来のエピジェネティックな発見を可能にします。

Dense coverage of CpG islands

CpGアイランドの高密度カバレッジ

Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChipで十分にカバーされなかったCpGアイランドとエクソンは、追加のプローブで完全にカバーされています。

Robust data with FFPE samples

FFPEサンプルを用いた頑強なデータ

FFPE組織サンプルは、修正版のInfinium Methylation HD Assayで頑強な性能を示します。貴重なサンプルと最適なサンプルの完全性のために、Infinium FFPE QCおよびDNA Restoration Kitが推奨されます。

High backwards compatibility with previous BeadChips

以前のBeadChipとの高度な後方互換性

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、Infinium MethylationEPIC v1.0およびHumanMethylation450 BeadChipの既存のCpGバックボーン上に構築されています。

EPIC v2.0 キット (4)

Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (8 Spl)

20087706

8サンプルBeadChipと、8つのDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が1つ含まれています。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (16 Spl)

20087707

2つの8サンプルBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (32 Spl)

20087708

4つの8サンプルBeadChipと、32のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (96 Spl)

20087709

12の8サンプルBeadChipと、96のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。バイサルファイト変換キットは別売りです。

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EPIC v2.0 セミカスタムキット (3)

Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (16 Spl)

20097750

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、16サンプルを処理するための試薬を含む2つのビーズチップが含まれています。

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カスタマイズ

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (32 Spl)

20097751

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、32サンプルを処理するための試薬を含む4つのビーズチップが含まれています。

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カスタマイズ

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (96 Spl)

20097752

EPIC v2の上に3,000~10,000種類のビーズタイプのカスタムセレクションを含むセミカスタムEPIC v2。キットには、96サンプルを処理するための試薬を含む12のビーズチップが含まれています。

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カスタマイズ

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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お問い合わせ

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よくある質問(FAQ)

Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip Kitは、強力なInfinium Chemistryを活用して、バイサルファイト変換されたゲノムDNAの高度にマルチプレックス化されたジェノタイピングに基づいて、CpGアイランドでのシトシンメチル化を検出します。定量的アレイベースのメチル化測定の詳細はこちら。

このキットは、単一 CpG サイト レベルで定量的なメチル化測定を提供するマイクロアレイテクノロジーである Illumina Methylation Assayを使用しており、正常細胞および疾患細胞における DNA メチル化生物学的役割を調査する研究を強化します。 Illumina Methylation Assayの詳細はこちら。

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kitには、ATAC-SeqおよびChIP-seq実験で特定された原発腫瘍に関連する既知のエンハンサー、スーパーエンハンサー、CTCF結合部位、クロマチンのオープン領域をターゲットとする186Kの新しいプローブが含まれています。Infinium MethylationEPIC v2.0データシートでは、さらに詳しい改善点ついてご覧いただけます。

MethylationEPICv2.0データ解析はイルミナソフトウェアによってサポートされています。GenomeStudioソフトウェアは品質管理を容易にし、コアラボで基本的な品質管理に引き続き使用されていますが、サードパーティ製のBioconductorパッケージは下流の解析に最も優れた機能を提供します。Rソフトウェアフレームワークの多くの無料パッケージは、メチル化データのノーマライゼーションと差分解析を可能にします。メチル化アレイデータ解析のヒントをもっと見る。

Zymo EZ DNA Methylation Lightning Kitが、Infiniumワークフローに推奨されるバイサルファイト変換キットです。他社のバイサルファイト変換キットは別途購入する必要があります。Infinium Methylation BeadChip用の検証済みバイサルファイト変換キットの詳細はこちら。

BeadChipあたりのスキャン時間は約18~37分です。

はい、Infinium MethylationEPIC v1.0とHumanMethylation450 BeadChip Kitは廃版になりました。同じく信頼性の高いInfiniumケミストリーを基礎として構築されたInfinium MethylationEPIC v2.0 Kitが、専門家が厳選した強化コンテンツを提供し、両方のキットの代替品として推奨されています。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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