Infinium MethylationEPIC Kit

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kitは、ヒトメチロームの最も生物学的に重要な領域 にある935,000を超えるCpG部位をターゲットとするゲノムワイドなメチル化スクリーニングツールで、前身のMethylationEPIC v1.0との後方互換性を最大化します。このアレイは、ゲノム全体のCpGを単一ヌクレオチドの分解能で定量的に調べる能力を維持しつつ、リード深度とは無関係に非常に正確で正確なメチル化測定を提供します。FFPEから単離されたものを含む 複数のDNAサンプルタイプは、合理化された使いやすいInfinium Methylationアッセイを使用して解析できます。他の方法と比較して、スケーラビリティとサンプルあたりの総コストが低いため、MethylationEPIC v2.0を使用して大規模コホートをスクリーニングし、疾患メカニズムに対する強力な生物学的洞察を発見することができます。

ゲノムワイドで最先端のコンテンツ

EPIC v1.0の専門家による評価に基づいて、性能の低いプローブは除去され、エピジェネティクス研究の発見力を高めるために最先端のコンテンツに置き換えられました。EPIC v2.0のターゲットエンハンサーとスーパーエンハンサー、追加のCTCF結合部位、CNV検出領域、EPIC v1.0でカバーされていないCpGアイランド、一般的ながんドライバー変異で、186,000のCpGが追加されました。アップデートされたv2.0 Beadchipでは、ATAC-SeqおよびChIP-seq実験で同定されたクロマチンのオープン領域もプロファイルされます。MethylationEPIC v2.0でカバーされるコンテンツのより詳細な説明は、製品データシートに記載されています。

信頼できるテクノロジー

イルミナのメチル化BeadChipsは、10年以上にわたり、エピジェネティクスの分野で画期的な研究に力を入れてきました。現在までに発表されたエピゲノムワイド関連研究（EWAS）の ほとんどは、MethylationEPICまたはその前身であるHumanMethylation450で完了しています。その結果、研究者は、遺伝子発現オムニバス（GEO）やがんゲノムアトラス（TCGA）などのデータレポジトリの膨大な量のパブリックメチル化アレイデータから恩恵を受けることができます。さらに、腫瘍やその他の疾患に対する機械学習の分類機能は、メチル化アレイデータに基づいて構築されており、メチル化BeadChipデータ形式で簡単にアクセスできます。

シンプルなデータ解析

MethylationEPIC v2.0データ解析はGenomeStudio Methylation Moduleによってサポートされています。GenomeStudio Softwareは、簡単な一次解析と品質管理を可能にします。直感的な視覚化ツールにより、研究者はヒートマップ、散布図、線プロットなどのデータを1つのグラフで表示できます。高度な下流解析では、Rソフトウェアフレームワークの多くの無料パッケージにより、メチル化データ（SeSAMe、minfiなど）のノーマライゼーションと差分解析が可能になります。説明ビデオと包括的なユーザーガイドでは、これらのデータ解析パッケージの使用について説明しています。

FFPEを含む複数のサンプルタイプに対応

Infinium Methylationアッセイの堅牢性は、FFPE組織サンプルから高いデータ品質を得るのに役立ちます。FFPEとの互換性はがんの研究に不可欠であり、腫瘍の大規模なバイオレポジトリで研究を完了することができます。Infiniumアッセイは、新鮮/凍結組織、全血、口腔細胞、cfDNA、唾液、およびその他のサンプルタイプとも互換性があります。