論文集

CRISPR-Cas9は、最近開発されたゲノム編集技術で、サイエンティストは正確なゲノム操作を迅速かつ便利に実行できます。このテクノロジーには幅広いアプリケーションがあります。他の分子生物学技術と同様に、得られた結果が高い特異性を持つことが重要です。このレビューでは、ゲノム全体の特異性とオフターゲット効果を確認するためのCRISPR-Cas9実験におけるゲノム技術とハイスループットシーケンスの使用を示す最近の論文に焦点を当てています。

シングルセル組織シーケンスの推進力のほとんどは、細胞系統と残存病変の検出が最重要課題であるがん研究からもたらされています。神経発生や免疫学など、非常に複雑な生物学的システムの理解を深めるためにも、同じアプローチが用いられています。本文書では、シングルセルシーケンスおよびローインプットアプリケーションと技術におけるイルミナテクノロジーの使用を実証した最近の論文に焦点を当てています。

シーケンス技術の登場以来、サイエンティストはDNA活性を評価する技術の発明と改良を続けてきました。シーケンスの再構成、DNAの切断、低レベルDNA、メチル化パターン、DNAとタンパク質の相互作用、タンパク質とタンパク質の相互作用などの研究に、特殊な手法が利用できるようになりました。このDNAシーケンス法のコレクションには、長所と短所、各プロトコールの概略図、および関連する出版物が含まれています。

RNA-Seqは、最も引用されているNGS手法の1つとして、RNA転写産物の豊富さとシーケンスについて説明しています。遺伝子発現と制御に関するこのような詳細な情報は、疾患状態、治療への応答、またはさまざまな環境条件下で起こる変化を解明することができます。このコレクションには、転写、RNA-タンパク質相互作用、RNA修飾、RNA構造、および低レベルRNAを分析するためのプロトコール図、利点と欠点、および関連出版物が含まれています。

複雑な疾患は、複数の遺伝的要因と環境的要因の結果です。メンデル形質（または単純形質）は、特定の遺伝モデルに従っておらず、通常集団でより頻繁に発生するため、メンデル形質と区別されます。これらの疾患の一部は高度に遺伝性ですが、現在知られている遺伝的バリアントは、推定される遺伝性の一部のみを説明することができます。このレビューでは、ゲノム技術とNGSが複雑な疾患の研究にどのように役立つかの一般的な概要を説明します。

環境の変化、人口の増加、栄養需要の高まりを考えると、農業を最適化する必要性は根本的に重要です。農業におけるゲノムイノベーションを活用することで、これらの課題に対処するためのより生産的で持続可能な実践が可能になります。このレビューでは、農業におけるゲノミクスの応用ならびに、現代のブリーダーに対して農業を前進させる強力なツールを提供するアグリゲノミクスにおける最近のイノベーションの概要が紹介されています。

シーケンス情報は、がんゲノムに関する知識をすでに劇的に向上させています。また、腫瘍細胞と周囲の微小環境との相互作用を理解するためにも使用できます。RNA-Seqを用いた発現解析は、腫瘍環境で活性化され、がん細胞の増殖、生存、浸潤、転移、および免疫抑制に関与するパスウェイを特定するのに役立ちます。これらの経路を免疫療法と並行してターゲットにすることで、有望な治療戦略が得られる可能性があります。

メタゲノミクスは、最も急速に成長している科学分野の1つであり、ラボで培養できない微生物からのDNAの研究です。シーケンス技術の最近の改良により、環境または臨床研究サンプルから直接取得した個々の微生物から、特別な培養方法を必要とすることなく、ほぼ完全なゲノムアセンブリが生成されました。このメタゲノムシーケンス情報の急増は、微生物集団とその環境やヒトの健康への影響に対する新たな認識を呼び起こしています。