医療関連感染のサーベイランス
NGSを活用することで、従来よりも精確に病原体の遺伝的構成を同定し、感染の発生や伝播経路を追跡することができます。その詳細をご紹介します。
精確かつ完全な微生物ゲノムを生成し、微生物を包括的に解析
単離微生物の全ゲノムシーケンス(WGS)は、新規生物のゲノムマッピングを行う場合、既知の生物のゲノムを解読する場合、複数サンプル間でゲノムを比較する場合などに重要な役割を果たすツールです。細菌、ウイルス、その他の微生物の全ゲノムシーケンスは、精確なリファレンスゲノムの生成、微生物の同定、比較ゲノム研究において重要です。1~6
従来の手法とは異なり、NGSベースの微生物ゲノムシーケンスは、手間のかかるクローン作成ステップに依存しないため、時間を節約し、ワークフローを簡素化することができます。また、NGSは、他の方法では見逃される可能性がある、または同定するのにコストがかかりすぎるような低頻度の変異やゲノム再編成を同定することができます。
De novo 全ゲノムシーケンスは、ゲノムリファレンスを使用せずにゲノムを組み立てる方法で、新規の微生物ゲノムのシーケンシングによく使用されます。7 イルミナのシーケンサーは、高品質のドラフトゲノムおよび微生物の全ゲノムアセンブリのために、比類のない生リードの精度とリード深度を実現します。8
微生物全ゲノムリシーケンスは、細菌、ウイルス、または他の微生物の全ゲノムをシーケンシングし、そのシーケンスを既知のリファレンスと比較する手法です。低頻度の変異を検出し、重要な欠失や挿入を発見し、微生物株間の他の遺伝的変化を解明するためには、迅速かつ精確に微生物リファレンスゲノムシーケンス情報を生成することが不可欠です。9~12
次回のワークフローから手探りをなくしましょう。NGSワークフローファインダーは、パーソナライズされたソリューションの提案とリソースを提供し、自信を持ってシーケンスが進められるようサポートします。
微生物の全ゲノムシーケンスなどのシーケンシングアプリケーションで使用するライブラリーを迅速かつ一体的に調製するためのワークフロー。
迅速でコスト効率の高い、微生物全ゲノムシーケンスアプリケーションに最適な強力かつコンパクトなシステム。
使いやすく、低コストのエコシステムで実現するNGSテクノロジーを、微生物全ゲノムシーケンスアプリケーションにご活用ください。
微生物全ゲノムシーケンスアプリケーション向けの、シンプルで手軽に使えるベンチトップ型シーケンサー。
SRST2アプリは、MLSTデータベースからのST(シーケンスタイプ)および/または毒素遺伝子、耐性遺伝子、プラスミドレプリコンのシーケンスデータベースからのリファレンス遺伝子の存在をレポートします。
微生物WGSによる包括的な分離株の識別と特性解析により、感染拡大を検出することができます。
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