医療関連感染症(HAI)は、医療現場で発生する感染症であり、高所得国の患者の約7%、急性期病院の低中所得国の患者の約15%に発症すると推定されています。これらの感染症は、多剤耐性生物によって引き起こされることが多く、重大な罹患率と死亡率、医療費の増加、規制の不遵守につながる可能性があります。HAIサーベイランスは、感染予防と感染制御プログラムの中核的な要素であり、感染拡大と感染経路の特定、感染予防と感染制御対策の指針、特定の病原体と耐性パターンの有病率と分布に関する貴重なデータの提供に役立ちます。1
これらのサーベイランスの取り組みの一環として、ゲノミクスは病原体の遺伝子構造に関する重要な洞察を解明し、アウトブレイクと感染経路のより正確な同定と追跡を可能にしています。次世代シーケンサー(NGS)により、ラボやクリニックは超並列ワークフローを使用して、前例のないスピードとスケーラビリティでゲノムHAI関連の研究を行うことができます。
DNAシーケンスは、HAIの原因となる特定の微生物を同定し、抗菌薬に耐性を与える遺伝子の存在など、その遺伝子構造を特徴付ける強力なツールです。この情報は、医療施設内での感染拡大を追跡し、さらなる感染拡大を防止するための的を絞った感染管理対策を実施するために使用できます。
病院の廃水中の抗生物質耐性遺伝子を研究者がどのように発見し、環境への耐性菌の循環を理解しているかをお読みください。
HAIの脅威が高まっている中で、研究者がNGSを使用して多剤耐性病原体を追跡し、病院の他の方法と比較した様子をご覧ください。
全ゲノムシーケンスサーベイランスと電子カルテ(EHR)の機械学習を組み合わせることで、検出されなかった感染拡大や感染経路をこの現場の変化の可能性があるレポートでどのように特定できるかをお読みください。
このアプリケーションノートでは、イルミナシーケンスとSRST2 BaseSpaceアプリを使用した病原性分離株の包括的な同定について概説します。
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ネバダ州立保健研究所では、イルミナのシーケンスプラットフォームが、世界的な健康上の脅威であるCandida aurisを検出するためにどのように使用されているか、トレース感染の防止と感染拡大の防止のためにご覧ください。
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マルチプレックスの力で何百もの生物を解析するための微生物全ゲノムシーケンスのためのイルミナのソリューションをご覧ください。低頻度バリアントとゲノム再構成を確実に検出します。
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