腫瘍の変異負荷

腫瘍変異負荷(TMB)とは?

腫瘍変異負荷(TMB)は、腫瘍ゲノムのコーディング領域内の体細胞変異の数です。これは、チェックポイント阻害剤などの免疫療法薬に対する反応と相関します。1-5研究では、腫瘍の変異量または負荷が高いと、腫瘍細胞によって発現される免疫原性ネオアンチゲンが免疫療法に対する反応を誘発する可能性が高まることが示されています。1-4

TMBと関連するがんの種類は?

多くの臨床研究で、高い変異負荷が、黒色腫、結腸、非小細胞肺がん(NSCLC)などのがんに対してチェックポイント阻害剤療法を受けている患者の延命効果の改善と相関することが実証されています。CheckMate 227のような過去の臨床試験のデータから、NSCLCではTMBが高いほど臨床転帰の改善と関連することが明らかになっています。6

TMB有病率

進行がん患者の13~26%が、腫瘍タイプ全体でTMB-Highの結果を示します。5,7-10

NGSを使用したTMBのテスト

TMBを正確に評価するには、約1.1 Mbのコーディングゲノムを持つ大規模なアッセイが必要です。11, 12 Comprehensive Genomic Profiling(CGP)は、TMBを含む数百のバイオマーカーを同時に解析します。

CGPを使用した高TMBのプレシジョンメディシンの改善

CGPを用いて血液から測定したTMB(bTMB)は、メガ塩基あたり≥20の変異がmNSCLCで検出された場合に、臨床転帰の改善と関連しています。13-15

TMBに対する免疫療法

臨床試験と規制当局の承認により、複数の腫瘍タイプに対するがん免疫療法がいくつか確立されています。16 これらの治療法に対する反応を予測するのに役立つ分子シグネチャーを同定する能力は、これらの治療法から誰が恩恵を受けるかをより良く予測するために重要です。

腫瘍変異負荷(TMB)とマイクロサテライト不安定性(MSI)ステータスは、患者の免疫療法への反応を示すFDA承認の2つのバイオマーカーであり、ガイドラインにより検査に推奨されています。17-18

高TMBのがんに対する承認済み療法

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TMB NGS検査のための包括的なゲノムプロファイリングアプローチの使用

包括的ゲノムプロファイリング(CGP)は、ヌクレオチドレベルの分解能でバイオマーカーを検出することができ、通常、すべての大きなゲノムシグネチャ(TMB、MSI)で構成され、臨床的に実行可能な変化を見つける能力を最大化します。

単一遺伝子および小規模のホットスポットパネル検査法は、既知および新規のバイオマーカーや分子シグネチャーを検出するのに十分ではないため、重要な実行可能なバリアントが欠落している可能性があります。19-22 CGPはゲノムの幅広い分子カバレッジを提供し、1回の検査で臨床的に重要な遺伝子の包括的なセットをキャプチャーします。

シングルNGSアッセイによる腫瘍タイプの評価

CGPは、より効果的な治療パスとがん患者のための革新的な臨床試験オプションの特定に役立つ、実行可能な結果と実行可能な結果の可能性の両方を提供できます。

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CGPの概要

CGP検査の概要と、CGP検査がどのように患者の転帰を改善するかをご覧ください。

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参考文献
  1. Rizvi NA, Hellmann MD, Snyder A, et al. Mutational landscape determines sensitivity to PD-1 blockade in non-small cell lung cancer. Science. 2015;348 (6230):124-128.
  2. Snyder A, Makarov V, Merghoub T, et al. Genetic Basis for Clinical Response to CTLA-4 Blockade in Melanoma. N Engl J Med. 2014;371(23):2189-2199.
  3. Allen EM, Miao D, Schilling B, Shukla SA, Blank C, Zimmer L. Genomic correlates of response to CTLA-4 blockade in metastatic melanoma. Science. 2015;350(6257):207-211.
  4. Garofalo A, Sholl L, Reardon B, et al. The impact of tumor profiling approaches and genomic data strategies for cancer precision medicine. Genome Med. 2016;8(1):79. doi:10.1186/s13073-016-0333-9.
  5. Marabelle A, Fakih M, Lopez J, et al. ペムブロリズマブで治療された進行固形腫瘍患者の転帰と腫瘍変異負荷との関連性:マルチコホート、非盲検、第II相KEYNOTE-158試験の前向きバイオマーカー解析。Lancet Oncol. 2020;21(10):1353-1365. doi.org/10.1016/S1470-2045(20)30445-9.
  6. Hellmann MD, Ciuleanu TE, Pluzanski A, et al. 腫瘍の変異負荷が高い肺がんにおけるニボルマブとイピリムマブの併用療法。N Engl J Med. 2018;378(22): 2093–2104。
  7. 欧州臨床腫瘍学会。ガイドライン | ESMO。ESMOウェブサイト。https://www.esmo.org/guidelines。2021年2月10日にアクセス。16.
  8. Cristescu, R, Aurora-Garg, D, Albright, D, et al. 全エクソームシーケンスで評価した腫瘍変異負荷とペムブロリズマブ単剤療法の転帰との関連。ポスター発表:2020年米国がん研究会バーチャル年次総会II、2020年6月22~24日。LB-261。
  9. Samstein RM, Lee CH, Shoushtari AN, et al. Tumor mutational load predicts survival after immunotherapy across multiple cancer types. Nat Genet. 2019;51(2):202-206. doi:10.1038/s41588-018-0312-8。
  10. Goodman AM, Kato S, Bazhenova L, et al. 多様ながんにおける免疫療法への反応の独立予測因子としての腫瘍変異負荷。Mol Cancer Ther. 2017;16(11):2598-2608. doi:10.1158/1535-7163.MCT-17-0386.
  11. Chalmers ZR, Connelly CF, Fabrizio D, et al. Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden. Genome Med. 2017;9(1):34. 2017年4月19日発行。doi:10.1186/s13073-017-0424-2。
  12. Buchhalter I, Rempel E, Endris V, et al. Size matters: Dissecting key parameters for panel-based tumor mutational burden analysis. Int J Cancer. 2019;144(4):848-858. doi:10.1002/ijc.31878。
  13. Rizvi NA, Cho BC, Reinmuth N, et al. 転移性非小細胞肺癌のファーストライン治療における、トレメリムマブ併用または非併用のデュルバルマブと標準化学療法の比較:MYSTIC第III相無作為化臨床試験。JAMA Oncol. 2020;6(5):661-674. doi:10.1001/jamaoncol.2020.0237.
  14. Garassino MC、Gadgeel SM、Rodriguez-Abreu Dら KEYNOTE-189試験における血液TMB(bTMB)の評価:転移性非扁平上皮NSCLCの第一選択療法としてのペメトレキセドとプラチナの併用下でのペムブロリズマブ(pembro)と化学療法(chemo)の併用とプラセボと化学療法の併用の比較。J Clin Oncol. 2020;38:15_suppl, 9521-9521. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-3771.
  15. Gandara DR, Paul SM, Kowanetz M, et al. アテゾリズマブで治療された非小細胞肺がん患者の臨床的利益の予測因子としての血液ベースの腫瘍変異量。Nat Med. 2018;24(9):1441-1448. doi:10.1038/s41591-018-0134-3。
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  17. Luchini C, Bibeau F, Ligtenberg MJ, et al. ESMOは、がんの免疫療法のためのマイクロサテライト不安定性検査、およびPD-1/PD-L1発現と腫瘍変異負荷との関連性について推奨しており、系統的レビューベースのアプローチです。Ann. Oncol. 2019;30(8):1232-1243. doi:https://doi.org/10.1093/annonc/mdz116.
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