幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Nextera DNA Flex製品は、現在Illumina DNA Prepと呼ばれています。（M）は、350 bp以下のインサートサイズを生成するビーズ結合トランスポソームを示します。Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、20091656、20091658、20091660）を注文することをお勧めします。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D(20027213、20027214、20042666、20042667)のIDTの生産は終了しており、最終注文日は2025年1月30日です。
Illumina DNA Prep は、以前はNextera DNA Flexと呼ばれていましたが、ヒト全ゲノムシーケンスからシーケンスアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、幅広いDNAインプットタイプと量からノーマライズされたシーケンス対応ライブラリーを調製するための迅速でロバストかつ柔軟なワークフローを提供します。1
Illumina DNA Prep ワークフローは、DNA インプット量やゲノム サイズに関係なく、一貫したインサートサイズ、均一なカバレッジ、最適化されたパフォーマンスを実現します。ビーズベースのテクノロジーにより、バイアスやエラーの可能性が最小限に抑えられるため、再現性の高いシーケンスデータが得られます。
Illumina DNA/RNA UD Indexes Setは、最大384のユニークデュアルインデックスを提供し、読み取りを精確に割り当て、フロー セルの有効に利用できるようにします。
幅広いアプリケーションで使用できる、高速で最適化されたシーケンスライブラリー調製ソリューションを見つけましょう。
A fast, integrated workflow for preparing libraries for use in a wide range of sequencing applications.
Illumina DNA Prep with Enrichment
A complete targeted resequencing solution for a wide range of applications, with fast integrated workflow and options for custom and fixed enrichment panels.
An efficient, fast, and integrated library preparation workflow that yields highly accurate data for sensitive sequencing applications.
| アッセイ時間 | ～3-4時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 | さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 |
| ハンズオンタイム | 1〜1.5時間 |
| インプット量 | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 |
| システム | MiSeqシステム, iSeq 100システム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ |
| 核酸の種類 | DNA |
| Sample type details | Blood, dried blood spots, saliva, and amplified single cell DNA or cDNA. FFPE samples are demonstrated but not validated. |
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 唾液 |
| 生物種カテゴリー | ショウジョウバエ, すべて, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌 |
| 生物種詳細 | 任意の種に対応 |
| Analytical sensitivity | ～ 350 bp |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
シーケンスに使用するサンプルプーリングのレベルに関係なく、各Illumina DNA Prepキットには、プロトコールを完了するために以下のインデックスキットのうちの一つが必要です。可能な限り、独自のデュアルインデックスを使用することをお勧めします。お客様のアプリケーションに最適なインデックスオプションの選択の詳細をご覧ください。
インデックスキットには、Nextera DNAまたはNextera XT Index Kitとの互換性はありません。
Flex Lysis Kitは、Illumina DNA Prepでの血液DNA抽出を補完する別個の製品です。
Illumina精製ビーズはIllumina DNA Prepキットに含まれており、別途購入する必要はありません。
Illumina DNA Prepは、幅広いDNAインプット範囲（1～500 ng）をサポートし、大きな全ゲノムからアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、わずか約3.5時間でシーケンスサンプル用の高品質のライブラリーを提供します。
| 装置 | サンプルタイプとアプリケーション （最小カバレッジまたはリード／サンプル） |
フローセルあたりのサンプル | 推奨リード長 |
|---|---|---|---|
| NextSeq 2000システム | ヒトゲノム（30xカバレッジ、>120 Gb） | P2 - 1サンプル、P3 - 3サンプル、P4 - 4サンプル | 2 x 150 bp |
細菌分離株全ゲノム（5 Mbゲノムの30xカバレッジ、1サンプルあたり150 Mb） |
P1 - 192サンプル、P2 - 384サンプル | 2 x 150 bp | |
シャローショットガンメタゲノミクス（1Mシングルリードまたは2M PEリード／サンプル） |
P1 - 96サンプル、P2 - 384サンプル | 2x150または2x300 bp | |
ショットガンメタゲノミクス（10Mシングルリードまたは20M PEリード／サンプル） |
P1 - 10サンプル、P2 - 40サンプル、P3 - 120サンプル、P4 - 180サンプル | 2x150または2x300 bp | |
| NovaSeq 6000システム | ヒトゲノム（30xカバレッジ、>120 Gb） | SP - 2サンプル、S1 - 4サンプル、S2 - 10サンプル、S4 - 24サンプル | 2 × 150 bp |
細菌分離株全ゲノム（5 Mbゲノムの30xカバレッジ、1サンプルあたり150 Mb） |
SP - 384サンプル | 2 × 150 bp | |
シャローショットガンメタゲノミクス（1Mシングルリードまたは2M PEリード／サンプル） |
SP - 384サンプル | 2 × 150 bp | |
ショットガンメタゲノミクス（10Mシングルリードまたは20M PEリード／サンプル） |
SP - 80サンプル、S1 - 150サンプル、S2 - 384サンプル | 2 × 150 bp | |
| NovaSeq Xシステム | ヒトゲノム（30xカバレッジ、>120 Gb） | 1.5B - 4サンプル、10B - 24サンプル、25B - 64サンプル | 2 × 150 bp |
細菌分離株全ゲノム（5 Mbゲノムの30xカバレッジ、1サンプルあたり150 Mb） |
1.5B - 384サンプル | 2 × 150 bp | |
シャローショットガンメタゲノミクス（1Mシングルリードまたは2M PEリード／サンプル） |
1.5B - 384サンプル | 2x150または2x300 bp | |
ショットガンメタゲノミクス（10Mシングルリードまたは20M PEリード／サンプル） |
1.5B - 150サンプル、10B - 384サンプル | 2x150または2x300 bp |
Use microbial whole-genome sequencing to map genomes of novel organisms, finish genomes of known organisms, or compare genomes across multiple samples.
Large whole-genome sequencing informs disease research and population genomics studies and reveals disease-associated alleles.
Comprehensively sample all genes in all organisms in complex samples to evaluate bacterial diversity and detect unculturable microorganisms using NGS.
| Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | Nextera XT DNA Library Preparation Kit | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | ～3-4時間 | 合計アッセイ時間5時間 | ～6時間 | ～5.5時間でDNA抽出からライブラリーのノーマライズまで。（ライブラリー調製時間：～90分）。 |
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 | さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 | ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 | 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 | 小規模ゲノム、PCRアンプリコンおよびプラスミド用のシーケンスライブラリーを90分で調製でき、必要なインプット量が少量です。 |
| ハンズオンタイム | 1〜1.5時間 | 4時間 | ～4時間 | 15分 |
| インプット量 | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 | DNA 1 ug | 100 ng ゲノムDNA | 1 ng DNA |
| システム | MiSeqシステム, iSeq 100システム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | MiSeqシステム, iSeq 100システム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiniSeq System, NextSeq 500システム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 | 酵素による断片化 |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス | シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス | シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス | アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, 16S rRNAシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | ユニークにインデックスされた最大384サンプルをプールし、一緒にシーケンスできます。 |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA | DNA |
| Sample type details | Blood, dried blood spots, saliva, and amplified single cell DNA or cDNA. FFPE samples are demonstrated but not validated. | |||
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 唾液 | FFPE非対応 | FFPE非対応, 少量インプットサンプル | 少量インプットサンプル, シングルセル |
| 生物種カテゴリー | ショウジョウバエ, すべて, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌 | その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 | その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 | ショウジョウバエ, すべて, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, 真菌, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌 |
| 生物種詳細 | 任意の種に対応 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | 任意の種に対応 |
| Analytical sensitivity | ～ 350 bp | 350 bpまたは550 bp | 350 bpまたは550 bp | 300 bp～1.5 kb |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント |
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.
Calculator to help determine the reagents and sequencing runs needed to arrive at desired coverage for your experiment.
(A) ビーズ結合トランスポソームは、gDNAの断片化およびイルミナシーケンスプライマーの付加を同時に媒介します。(B) サイクルを減らしたPCR増幅により、すぐにシーケンスできるDNA断片を増幅し、インデックスとアダプターを付加します。(C) すぐにシーケンスできる断片を洗浄しプーリングします。
DNA抽出からライブラリーノーマライゼーションおよびプーリングまでのワークフロー時間の総比較。Illumina DNA Prepは、ステップ数が最も少なく、合計ワークフロー時間が最も速いワークフローを作成します。
(A) Illumina DNA Prepは、TruSeq DNA Nanoキットに匹敵するゲノム全体で均一なカバレッジを提供します。(B) GC含有率が極めて高いまたは低い微生物のカバレッジを示します。オンビーズタグメンテーションライブラリー調製の化学的性質が改善されたことから、Illumina DNA PrepはNextera XTよりも均一なカバレッジを示しています。
Illumina DNA Prepキットを開始するための入門プレゼンテーション資料。
イルミナの迅速でシンプルなライブラリー調製とエンリッチメントワークフローを体験してください。
Ginkgo BioworksとBayerの合弁企業であるJoyn Bioは、イルミナのNGSを使用して、Ginkgoの合成生物学の専門知識とBayerの微生物および農業の専門知識を統合し、農業ソリューション用の微生物を設計しています。
Illumina DNA Prepは、酵素による断片化の利便性を提供し、ライブラリー調製後の定量化の必要性を最小限に抑えます。
DNAライブラリー調製とRNAライブラリー調製の両方に、使いやすく、迅速でシンプルなソリューションを提供するために設計されたイルミナのテクノロジーについてご覧ください。
オンビーズタグメンテーションライブラリー調製ケミストリーは、DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションを統合します。
Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (24 Samples, IPB)
20060060
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。イルミナ精製ビーズが含まれています。エンリッチメントプローブパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (96 Samples, IPB)
20060059
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。イルミナ精製ビーズが含まれています。エンリッチメントプローブパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Nextera™ DNA CD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)
20018708
20のインデックス、8つのi500および12のi700インデックスを含み、96のサンプルのラベル付けに十分な96のデュアルインデックス機能を提供します。インデックスは96ウェル形式で提供されます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Nextera DNA Flex - Customer Site
20022900
ゲノムDNAの定量と品質管理、ライブラリーの品質と量の確認、Nextera DNA Flexワークフロー全体のトレーニング。
Illumina® Lysis Kit
20042221
Illumina DNA PCR-Free Prepで血液サンプルを処理するための溶解キットが1つ含まれています。ライブラリー調製アダプターとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Beads 30 ml
20119944
Illumina Purification Beads 30 ml
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Illumina DNA PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentで血液サンプルを処理するための試薬が含まれます。ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプター試薬は別売りです。
List Price:
Discounts:
NextSeq PhiX Control Kit
FC-110-3002
NextSeqイルミナシーケンスプラットフォーム用DNAコントロール。10 µnM PhiXソリューションで最大150 bpのシングルエンドリードおよびペアエンドリードに対応。
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
はい、イルミナは血液と唾液の両方に対して特定の抽出プロトコールを設計しました。プロトコールはIllumina DNA Prepリファレンスガイドに記載されています。
一般的に、Illumina DNA Prepは、ほとんどのリキッドハンドリング処理システムと互換性を持たせるように設計されています。イルミナの自動化パートナーは全員、1つ以上の既存の自動化プラットフォームに対応する手法を構築しています。
詳細については、ライブラリー調製の自動化ページをご覧ください。
GCが豊富な領域のカバレッジは、使用するサーマルサイクラーのモデル、設定、性能の影響を受ける可能性があります。イルミナは、Illumina DNA Prepとの併用に向けて、Bio-Rad DNA Engine Tetrad 2、Bio-Rad S1000、Bio-Rad C1000、およびMJ Research PTC-225 DNA Engine Tetradサーマルサイクラーを検証しました。その他のサーマルサイクラーでは性能が異なるため、ゲノムカバレッジに影響を与える可能性があります。
はい、Illumina DNA Prepの最小インプット範囲（1～500 ng）では、Dryed Blood Spot（DBS）カードから抽出されたDNAを使用できます。
Advanced chemistry, optics, and informatics combine to deliver exceptional sequencing speed and data quality, outstanding throughput, and scalability.
Reagents for the NextSeq 1000/2000 System feature easy-to-use cartridges and multiple flow cell configurations for flexible sequencing options.
Library prep and enrichment kit that delivers highly sensitive, comprehensive respiratory pathogen identification and antimicrobial resistance insights.
A complete targeted resequencing solution for a wide range of applications, with fast integrated workflow and options for custom and fixed enrichment panels.
低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
Illumina Complete Long Read with Enrichmentのライブラリー調製キットを使用して、タンパク質コード遺伝子内のマッピング困難な領域のカバレッジを強化するための最適化されたデザイン済みパネル。必要な30倍以上の標準的なショートリード全ゲノムと組み合わせて解析。
ヒトゲノムのマッピング困難な領域に対処するための、費用効率に優れ、柔軟性のある、ターゲット化したロングリードソリューション。
1. Bruinsma S, Burgess J, Schlingman D, et al. ビーズ結合トランスポソームは、NGSライブラリー調製のためのノーマライゼーションフリーワークフローを可能にします。2018;19:722。BMC Genomics. 2018年10月1日オンライン公開。doi: 10.1186/s12864-018-5096-9
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