ゲノムおよびメチロームのシーケンス

イルミナの5塩基ゲノムソリューションにより、単一サンプルからDNAの遺伝塩基とエピジェネティック塩基の同時シーケンスを実現

アブストラクト ゲノムおよびメチロームのシーケンス

メチローム解析の利点

DNAメチル化などのエピジェネティックな修飾は、根底にあるDNA配列を変えることなく遺伝子制御を誘導します。メチローム解析では、ゲノム全体のメチル化パターンを明らかにすることができます。遺伝子制御に関するこれらの洞察は、遺伝子変異の影響についての理解を促し、遺伝子発現研究を補完します。

5-base DNA methylation diagram

ゲノムとメチロームの同時シーケンス

遺伝子シーケンスとエピジェネティクスシーケンスを組み合わせたマルチオミクスアプローチは、発生と疾患の複雑なパスウェイを解明するうえで役立ちます。イルミナの5塩基ゲノムソリューションは、遺伝的バリアントとメチル化パターンの同時検出を可能にします。この次世代シーケンサー(NGS)法は、単一の使いやすいアッセイで、正確なゲノムシーケンスとメチロームシーケンスを提供します。イルミナ5塩基ソリューションをサポートする独自のイノベーションには、新しい変換ケミストリーや、デュアルDNAおよびメチル化アノテーションと可視化のための高度なアルゴリズムが含まれます。

サムネール

5塩基ゲノムによるゲノムおよびメチローム解析の利点

イルミナ5塩基ソリューションは、遺伝子制御の解明を目指す研究者にさまざまな利点を提供します。

5塩基に関する洞察: 遺伝的バリアントとメチル化を1回のアッセイで正確に検出

シンプルさ: シングルステップの変換とライブラリー調製が1日で完了*

柔軟性:さまざまなサンプルタイプ、全ゲノムまたはエンリッチメント手法に対応

手頃な価格:メチロームとゲノムの両方の洞察を得るための効率的なシーケンス

シームレスなソリューションを単一のプロバイダーから:イルミナライブラリー調製から解析までのソリューションとサポート。

* 1日完結のライブラリー調製は、キットの全ゲノムシーケンスバージョンに適用されます。

イルミナの仕組み
5塩基溶液の作業?

従来のメチル化変換テクノロジーでは非メチル化シトシンをチミンに変換しますが、イルミナ独自の変換ケミストリーではメチル化シトシンを選択的にチミンに変換します。健康なヒトゲノムのシトシンの大部分はメチル化されていないため、メチル化シトシンの選択的な変換により、より複雑なライブラリーが生成され、新しいインフォマティクスと組み合わせることで、包括的で費用対効果の高い5塩基に関する洞察が得られます。

5塩基アッセイは、2つの別々の遺伝とエピジェネティクスシーケンスアッセイを置き換えることができ、メチル化の洞察を得るための増分シーケンスを最小限に抑え、時間と予算を節約できます。

Novel chemistry allows direct conversion of 5mC to T

新しい手法では、5mCからTへの直接変換が可能です。上段はインプットDNA、下段は変換されたDNAを表します。

サムネール

単一アッセイにおけるゲノムおよびエピゲノムの洞察

単一のマルチオミクスアッセイで遺伝学とエピジェネティックな洞察を解き放つ。イルミナの5塩基ソリューションは、DNAメチル化とゲノムバリアントコーリングを1つのワークフローに合理化し、シンプルな統合ソリューションを通じてより深い生物学的発見を可能にします。

よくある質問

DNAメチル化を検出する一般的な方法では、バイサルファイトまたは酵素を使用して、メチル化されていないCをTに変換します。これにより、ヌクレオチドの多様性が低下し、リードのアライメントがより困難になります。バイサルファイト処理もDNAを損傷し、データギャップを残す可能性があります。イルミナの5塩基ケミストリーは、シンプルなシングルステップで5mCのみをTに直接変換するため、ライブラリーの複雑さは保持されます。

全ゲノムシーケンスはゲノム全体を対象とし、ターゲットエンリッチメントシーケンスは特定のゲノム領域に焦点を当てます。どちらの方法でも、単一塩基の分解能でDNAメチル化を検出できます。

このアッセイは、セルフリーDNA、および血液、細胞株、または新鮮凍結組織から抽出されたDNAを含む複数のサンプルタイプと互換性があります。

イルミナの5塩基ソリューションは、非修飾塩基、アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)とともに5-メチルシトシン(5mC)を検出します。DNAメチル化は、遺伝子発現を調節するための重要なエピジェネティックな修飾です。

5塩基バイオインフォマティクスソリューションには高度な専門知識は必要ありません。高度に精確なバリアントとメチル化の検出を行います。これはシンプルで強力かつ使いやすいマルチオミクス解析ソリューションです。Illumina Connected Multiomicsからの洞察は、DRAGEN解析によりサポートされています。

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補足資料

5塩基ソリューションポスター

このポスターでは、簡潔で統合されたマルチオミクスライブラリー調製を使用して、ゲノムとメチル化のシグネチャを同時に検出します。

イルミナの5塩基ソリューションの仕組み

このブログでは、メチル化プロファイリングと高精度の遺伝子変異コールを同時に行うための、合理化されたエンドツーエンドのNGSライブラリー調製と解析ワークフローについて説明します。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションの概要

このイルミナ5塩基テクノロジーの概要では、デュアルオミクスの洞察をこれまで以上に迅速かつ簡単に得られる方法を説明します。

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