ゲノムおよびメチロームシーケンス

イルミナの5塩基ゲノムソリューションにより、単一サンプルからDNAの遺伝塩基とエピジェネティック塩基の同時シーケンスを実現

アブストラクト ゲノムおよびメチロームのシーケンス

メチローム解析の利点

DNAメチル化などのエピジェネティックな修飾は、根底にあるDNA配列を変えることなく遺伝子制御を誘導します。メチローム解析では、ゲノム全体のメチル化パターンを明らかにすることができます。遺伝子制御に関するこれらの洞察は、遺伝子変異の影響についての理解を促し、遺伝子発現研究を補完します。

5-base DNA methylation diagram

ゲノムとメチロームの同時シーケンス

遺伝子シーケンスとエピジェネティクスシーケンスを組み合わせたマルチオミクスアプローチは、発生と疾患の複雑なパスウェイを解明するうえで役立ちます。イルミナの5塩基ゲノムソリューションは、遺伝的バリアントとメチル化パターンの同時検出を可能にします。この次世代シーケンサー(NGS)法は、単一の使いやすいアッセイで、正確なゲノムシーケンスとメチロームシーケンスを提供します。イルミナ5塩基ソリューションをサポートする独自のイノベーションには、新しい変換ケミストリーや、デュアルDNAおよびメチル化アノテーションと可視化のための高度なアルゴリズムが含まれます。

1回のアッセイ、2つの洞察

DNAとメチル化を対象とした1回の効率化されたアッセイで、ゲノムとエピゲノムにおける疾患の隠れたメカニズムを明らかにします。イルミナ5塩基ソリューションが、なぜこれほど革新的なのかをご覧ください。

マルチオミクスイノベーションの実例

Dr Daniel Wiseは、イルミナ5塩基ソリューションを用いてマルチオミクスの知見を統合し、大腸がん研究に革新をもたらしています。

サムネール

5塩基ゲノムによるゲノムおよびメチローム解析の利点

イルミナ5塩基ソリューションは、遺伝子制御の解明を目指す研究者にさまざまな利点を提供します。

5塩基に関する洞察: 遺伝的バリアントとメチル化を1回のアッセイで正確に検出

シンプルさ: シングルステップの変換とライブラリー調製が1日で完了*

柔軟性:さまざまなサンプルタイプ、全ゲノムまたはエンリッチメント手法に対応

手頃な価格:メチロームとゲノムの両方の洞察を得るための効率的なシーケンス

シームレスなソリューションを単一のプロバイダーから:イルミナライブラリー調製から解析までのソリューションとサポート。

* 1日で完了するライブラリー調製は、全ゲノムシーケンス用キットにのみ適用されます。

イルミナの仕組み
5塩基ソリューションの作業原理とは?

従来のメチル化変換テクノロジーでは非メチル化シトシンがチミンに変換されます。一方、イルミナ独自の変換ケミストリーではメチル化シトシンを選択的にチミンに変換します。健常なヒトゲノムでは大部分のシトシンが非メチル化であるため、メチル化シトシンのみを変換することで、より複雑性の高いライブラリーを生成できます。さらに新しいインフォマティクスと組み合わせることで、包括的でコスト効率に優れた5塩基に関する洞察が得られます。

5塩基アッセイは、これまで別々に行っていた遺伝およびエピジェネティクスの2つのシーケンスアッセイを1つに統合でき、メチル化の洞察を得るための追加シーケンスを最小限に抑え、時間と予算を節約できます。

Novel chemistry allows direct conversion of 5mC to T

新しい手法では、5mCからTへの直接変換が可能です。上段はインプットDNA、下段は変換されたDNAを表します。

5塩基ソリューションワークフロー

合理化された5塩基ワークフローには、DNAからシーケンスシステムまで約6時間かかる最適化された全ゲノムライブラリー調製が含まれており、デュアルDNAおよびメチル化アノテーションと可視化のための使いやすい解析を提供します。

1
ライブラリー調製
2
シーケンス
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データ解析

合理化された5塩基ワークフローには、ターゲットエンリッチメントライブラリー調製の最適化、デュアルDNAとメチル化アノテーションのための使いやすい解析、ターゲット遺伝子の可視化が含まれます。

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ライブラリー調製
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シーケンス
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データ解析
サムネール

1回のアッセイにおけるゲノムおよびエピゲノムの洞察

1回のマルチオミクスアッセイで遺伝学とエピジェネティックな洞察を解き放つ。イルミナ5塩基ソリューションは、DNAメチル化とゲノムバリアントコールを1つのワークフローに合理化し、シンプルな統合ソリューションを通じてより深い生物学的発見を可能にします。

専門家の話を聞く

サムネール

希少疾患におけるエピジェネティックなシグネチャー

Dr Bekim Sadikovicは、希少な遺伝性疾患を理解するために、イルミナ5塩基ソリューションを用いて遺伝的バリアントとメチル化パターンを検出しています。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションに関する見解

Cande Rogert博士が、メチル化プロファイルのためのイルミナの5塩基ゲノムソリューションと、DRAGEN分析によるバリアント検出を行います。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションのご紹介

この単一アッセイソリューションは、メチル化検出とバリアントコーリングを1つの合理化されたワークフローに統合することで、マルチオミクス解析を簡素化します。

よくある質問

DNAメチル化を検出する一般的な方法では、バイサルファイトまたは酵素を使用して、メチル化されていないCをTに変換します。これにより、ヌクレオチドの多様性が低下し、リードのアライメントがより困難になります。バイサルファイト処理もDNAを損傷し、データギャップを残す可能性があります。イルミナの5塩基ケミストリーは、シンプルなシングルステップで5mCのみをTに直接変換するため、ライブラリーの複雑さは保持されます。

全ゲノムシーケンスはゲノム全体を対象とし、ターゲットエンリッチメントシーケンスは特定のゲノム領域に焦点を当てます。どちらの方法でも、単一塩基の分解能でDNAメチル化を検出できます。

このアッセイは、セルフリーDNA、および血液、細胞株、または新鮮凍結組織から抽出されたDNAを含む複数のサンプルタイプと互換性があります。

イルミナ5塩基ソリューションは、非修飾塩基、アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)とともに5-メチルシトシン(5mC)を検出します。DNAメチル化は、遺伝子発現を調節するための重要なエピジェネティックな修飾です。

5塩基バイオインフォマティクスソリューションには高度な専門知識は必要ありません。高度に精確なバリアントとメチル化の検出を行います。これはシンプルで強力かつ使いやすいマルチオミクス解析ソリューションです。Illumina Connected Multiomicsからの洞察は、DRAGEN解析によりサポートされています。

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補足資料

5塩基ソリューションポスター

このポスターでは、簡潔で統合されたマルチオミクスライブラリー調製を使用して、ゲノムとメチル化のシグネチャを同時に検出します。

イルミナ5塩基ソリューションのしくみとは?

このブログでは、メチル化プロファイリングと高精度の遺伝子バリアントコーリングを同時に行うための、合理化されたエンドツーエンドのNGSライブラリ調整および解析ワークフローについて説明します。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションの概要

このイルミナ5塩基テクノロジーの概要では、デュアルオミクスの洞察をこれまで以上に迅速かつ簡単に得られる方法を説明します。

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