ゲノムおよびメチロームシーケンス

イルミナの5塩基ゲノムソリューションが、単一サンプルからDNAの遺伝塩基とエピジェネティック塩基の同時シーケンスを実現

アブストラクト ゲノムおよびメチロームのシーケンス

メチローム解析の利点

DNAメチル化などのエピジェネティック修飾は、根底にあるDNA配列を変えることなく、遺伝子制御を誘導します。メチローム解析は、ゲノム全体のメチル化パターンを明らかにすることができます。遺伝子制御に関するこれらの洞察は、遺伝子変異の影響についての理解を促し、遺伝子発現研究を補完します。

5-base DNA methylation diagram

ゲノムとメチロームの同時シーケンス

遺伝子シーケンスとエピジェネティクスシーケンスを組み合わせたマルチオミクスアプローチは、発生と疾患の複雑なパスウェイの解明に貢献します。イルミナの5塩基ゲノムソリューションは、遺伝的バリアントとメチル化パターンの同時検出を可能にします。この次世代シーケンサー(NGS)法は、単一の使いやすいアッセイで、ゲノムおよびメチロームの正確なシーケンスを提供します。本ソリューションをサポートする独自のイノベーションとして、新しい変換ケミストリーや、デュアルDNAおよびメチル化アノテーションと可視化のための高度なアルゴリズムが挙げられます。

単一アッセイで2つの洞察

DNAとメチル化を同時に解析できる、シンプルかつ効率的な単一アッセイにより、ゲノムとエピゲノムに潜む疾患の新たなメカニズムを解き明かします。5塩基ソリューションの革新性を、ぜひご覧ください。

マルチオミクスイノベーションの実践

Dr Daniel Wiseは、マルチオミクスの洞察をイルミナ5塩基ソリューションと統合することにより、結腸がん研究を変革しています。

サムネール

5塩基ゲノムによるゲノムおよびメチローム解析の利点

イルミナ5塩基ソリューションは、遺伝子制御の解明を目指す研究者にさまざまな利点を提供します。

5塩基に関する洞察: 遺伝的バリアントとメチル化を単一のアッセイで正確に検出

シンプルさ:  シングルステップの変換からライブラリー調製まで1日で完了*

柔軟性:さまざまなサンプルタイプと、全ゲノムまたはエンリッチメント手法に対応

手頃な価格:メチロームとゲノムの両方の洞察が得られる効率的なシーケンス

シームレスなソリューションを単一のプロバイダーから提供:イルミナライブラリー調製から解析までのソリューションとサポート

* 1日完結のライブラリー調製は、キットの全ゲノムシーケンスバージョンに適用されます。

イルミナ
5塩基ソリューションのしくみを教えてください

従来のメチル化変換テクノロジーでは非メチル化シトシンがチミへとに変換されますが、イルミナ独自の変換ケミストリーではメチル化シトシンを選択的にチミンに変換します。ヒトの健常ゲノムではシトシンの大部分が非メチル化であるため、この選択的な変換により、より複雑性の高いライブラリー生成が可能になります。さらに、新しいインフォマティクスと組み合わせることによって、包括的で費用対効果の高い5塩基解析と洞察が実現します。

5塩基アッセイは、遺伝子とエピジェネティクスシーケンスという2つの異なるアッセイを置き換えることができます。これにより、メチル化の洞察を得るための追加シーケンスを最小限に抑え、時間およびコストの削減に貢献します。

Novel chemistry allows direct conversion of 5mC to T

新しい手法では、5mCをTに直接変換できます。上段はインプットDNA、下段は変換されたDNAを表します。

 

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5塩基解析によるマルチオミクス洞察

遺伝性疾患やがんをはじめとする複雑な疾患のメカニズム解明に向けて、メチロームとゲノムを統合的に研究することの価値をご体感ください。

5塩基ソリューションワークフロー

合理化された5塩基ワークフローには、DNAからシーケンスシステムまでを約6時間で完了できる最適化された全ゲノムライブラリー調製が含まれています。さらに、DNAとメチル化の両方を対象としたアノテーションと可視化を行う、使いやすい解析を提供します。

1
ライブラリー調製
2
シーケンス
3
データ解析

合理化された5塩基ワークフローには、最適化されたターゲットエンリッチメントライブラリー調製に加え、DNAとメチル化のデュアルアノテーションを行う使いやすい解析機能、ならびにターゲット遺伝子の可視化機能が含まれています。

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ライブラリー調製
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シーケンス
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データ解析
サムネール

単一アッセイからゲノムおよびエピゲノムの洞察

単一のマルチオミクスアッセイで遺伝学とエピジェネティックな洞察を解き放つ。イルミナ5塩基ソリューションは、DNAメチル化とゲノムバリアントコールを1つのワークフローに合理化し、シンプルな統合ソリューションを通じてより深い生物学的発見を可能にします。

専門家の話を聞く

Daniel Wise presenting
マルチオミクスイノベーションの実践

Dr Daniel Wiseは、イルミナ5塩基ソリューションを活用し、直腸粘液の分析による結腸がん検出に革新的な研究アプローチをもたらしました。これは、マルチオミクス、エピジェネティクス、メタゲノムの洞察を統合した、革新的かつ非侵襲的なサンプリング手法です。

サムネール

EpiSignによるによるイルミナ5塩基シーケンスの検証

Dr Bekim Sadikovic(Director of the Molecular Genetics Laboratory、London Health Sciences Centre Research Institute)が、イルミナ5塩基ソリューションの検証から得られた洞察を共有します。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションに関する見解

Dr Cande Rogertより、DRAGEN分析を用いたメチル化プロファイリングおよびバリアント検出のためのイルミナの5塩基ゲノムソリューションについてご紹介いただきます。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションのご紹介

この単一アッセイソリューションは、メチル化検出とバリアントコーリングを1つの合理化されたワークフローに統合することで、マルチオミクス解析を簡素化します。

よくある質問

DNAメチル化を検出する一般的な方法では、バイサルファイトまたは酵素を使用して、メチル化されていないCをTに変換します。これにより、ヌクレオチドの多様性は低下し、リードのアライメントがより困難になります。バイサルファイト処理もDNAを損傷し、データギャップを残す可能性があります。イルミナの5塩基ケミストリーは、シンプルなシングルステップで5mCのみをTに直接変換するため、ライブラリーの複雑さが保持されます。

全ゲノムシーケンスはゲノム全体を対象とし、ターゲットエンリッチメントシーケンスは特定のゲノム領域に焦点を当てます。どちらの方法でも、単一塩基の分解能でDNAメチル化を検出できます。

本アッセイは、セルフリーDNA、および血液、細胞株、または新鮮凍結組織から抽出されたDNAを含む複数のサンプルタイプと互換性があります。

イルミナ5塩基ソリューションは、非修飾塩基、アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)とともに5-メチルシトシン(5mC)を検出します。DNAメチル化は、遺伝子発現を調節するための重要なエピジェネティックな修飾です。

5塩基バイオインフォマティクスソリューションには高度な専門知識は必要ありません。高度に精確なバリアントとメチル化の検出を行います。これはシンプルで強力かつ使いやすいマルチオミクス解析ソリューションです。Illumina Connected Multiomicsからの洞察は、DRAGEN解析によりサポートされています。

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補足資料

5塩基ソリューションポスター

このポスターでは、簡潔で統合されたマルチオミクスライブラリー調製を使用して、ゲノムとメチル化のシグネチャを同時に検出します。

イルミナ5塩基ソリューションのしくみとは?

このブログでは、メチル化プロファイリングと高精度の遺伝子バリアントコーリングを同時に行うための、合理化されたエンドツーエンドのNGSライブラリ調整および解析ワークフローについて説明します。

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションの概要

このイルミナ5塩基テクノロジーの概要では、デュアルオミクスの洞察をこれまで以上に迅速かつ簡単に得る方法を説明します。

高精度なメチル化とバリアント検出

イルミナの5-Base DNA Prepは、標準的なメチル化アッセイに匹敵するDNAメチル化検出と、WGSに匹敵する生殖細胞系列バリアントコールを提供します。

高度ながん研究のための統合解析

このチラシでは、イルミナ5塩基を用いた同時バリアントとDNAメチル化プロファイリングが、がん研究におけるより深い洞察をどのようにサポートするかを解説しています。

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