トータルRNAシーケンスの紹介
トータルRNAシーケンス（RNA-Seq）による全トランスクリプトーム解析は、コーディングに加えて複数の形態のノンコーディングRNAを検出します。Total RNA-Seqは、遺伝子と転写産物の量を正確に測定し、トランスクリプトームの既知および新規の特徴を同定することができます。
Total RNA-Seqは、正常または低品質のサンプルで最適なカバレッジを提供します。種特異的リボソームRNAプローブは、豊富なRNA種を効率的に除去できます。これにより、断片化した転写産物とインタクトな転写産物の両方がライブラリーキャプチャーに残ります。
トータルRNAシーケンスの利点
Total RNA-Seqは、コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームの包括的なビューを提供します。
- 既知の特徴だけでなく、新規の特徴もキャプチャー
- 研究者は幅広い転写産物でバイオマーカーを同定できます
- 関心のある表現型をより包括的に理解できる
- 幅広いダイナミックレンジでトランスクリプトーム全体のプロファイリングが可能
全ゲノムアレイからトータルRNA-Seqへの移行
Boston University Medical Centerの肺および救命救急医であるAvrum Spira博士は、全ゲノム遺伝子発現アレイを用いてサンプルを解析し、肺疾患の潜在的なバイオマーカーを研究することを目的としたラボを立ち上げました。Spiraのラボが、発現アレイでは検出できない可能性のある新規で希少な転写物を発見するために、どのようにトータルRNA-Seqを使用しているかをご覧ください。
ケーススタディを読む。
がんにおける長鎖ノンコーディングRNAの役割の解読
Biogazelleの研究者たちは、RNA-Seqを使用して、lncRNAが細胞型にどのように特異的であるかを明らかにしています。研究者らは、特定のlncRNAをサイレンシングするとがん細胞の破壊に役立つことを発見しました。
インタビューを読む
トータルRNAシーケンスワークフロー
イルミナのSequencing by Synthesis（SBS）ケミストリーは、最も広く採用されている次世代シーケンサー（NGS）テクノロジーであり、世界のシーケンスデータの約90%を生成します。*
イルミナは、高品質のデータに加えて、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡素化する統合全トランスクリプトームシーケンスワークフローを提供しています。
トータルRNA-Seqのためのライブラリー調製
当社の強化されたRNA-Seqライブラリー調製ポートフォリオには、豊富なrRNAの除去が含まれているため、トランスクリプトームの高価値部分に集中できます。
詳細はこちらRNA シーケンス検討事項
遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析、など、それぞれのRNA-Seq実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。
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NGSを使用した希少な未診断の遺伝性疾患の研究
全エクソームシーケンスとトランスクリプトームシーケンスは、希少疾患に関連する変異とパスウェイを明らかにする上で有益であることが証明されています
詳細はこちら主な製品
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
The stand-alone Illumina Ribo-Zero Plus kit allows for ribosomal RNA removal in human, mouse, rat, and bacterial samples.
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Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
Rapid library preparation from a broad range of sample types for studying the coding and non-coding transcriptome with unparalleled study flexibility.
Learn More関連ソリューション
がん研究：遺伝子発現研究
コーディングRNAバイオマーカーとノンコーディングRNAバイオマーカーの両方における遺伝子発現の変化をトータルRNA-Seqでモニタリングすることで、研究者はどのバリアントが腫瘍の分類と進行に影響するかを理解するのに役立ちます。がんRNA-Seqについてもっと知る。
アグリゲノミクス：ディープトランスクリプトームシーケンス
植物には大きな反復ゲノムがあり、弱い発現遺伝子のシーケンスが困難になることがあります。超ディープRNAシーケンスは、これらの遺伝子の解析を容易にします。植物シーケンスの詳細はこちら。
複雑な疾患バイオマーカーの同定
Total RNA-Seqにより、複雑な疾患の研究者は1回の解析でコーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAを研究でき、疾患に関連する可能性のある幅広いバイオマーカーを可視化できます。複雑な疾患研究の詳細はこちら。
RNAベースの薬物反応バイオマーカーの発見
RNA-Seqを使って、新規のRNAに基づく薬剤応答性バイオマーカーを同定する方法をご紹介します。新規ユーザーがこのアプリケーションを使用するためのリソースにアクセスできます。医薬品開発のためのRNAバイオマーカー解析の詳細はこちら。
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Additional Resources
RNA-Seq データ解析
ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールが、バイオインフォマティクスの経験がなくても、生物学者のためのmRNA-Seqデータ解析を簡素化させます。
低クオリティと FFPE サンプルのための RNA-Seq
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE)および低クオリティサンプルのRNA-Seqにより、疾患研究のための価値のある情報をもたらします。
ペアエンド RNA シーケンス
ペアエンドRNA-Seqにより融合遺伝子や新規スプライスアイソフォームの特徴づけなどの探索アプリケーションを可能にします。
*データ計算はファイルに保存しています。Illumina, Inc., 2015