はじめに： トータルRNAシーケンス
TruSeq Stranded Total RNAによるトータルRNAシーケンス（全トランスクリプトーム解析）により、コーディングRNAおよび複数のノンコーディングRNAを含むトランスクリプトームの完全な全体像が得られます。また、高感度かつ高精度で発現を定量化でき、同様にトランスクリプトームの既知および新規の特長を同定することができます。
Ribo-Zeroケミストリーは豊富なRNA種を効率的に除去し、分解した転写産物、および良質な転写産物どちらについてもライブラリー作成ができます。Total RNAシーケンス（Total RNA-Seq）は、正常サンプルおよび低品質／FFPEサンプル双方を最適にカバーします。
トータルRNAシーケンスの利点
トータルRNA-SeqはコーディングRNAおよび複数のノンコーディングRNAを解析し、トランスクリプトームの全体像を示します。
- 既知および新規特長双方の捕捉
- 研究者は広範囲な転写産物全体でバイオマーカーを同定することが可能
- 対象となる表現型のより包括的な理解
- 幅広いダイナミックレンジにわたるトランスクリプトームのプロファイリングが可能
全ゲノムアレイからトータルRNAシーケンスへの移行
ボストン大学医学センターの肺専門医、救命救急医のDr. Avrum Spiraは、肺障害の診断および治療のためのバイオマーカーを開発するために、全ゲノム遺伝子発現アレイを用いて臨床サンプルを解析することを目標として研究室を始めました。今日、Dr. Spiraの研究室では、トータルRNA-Seqを使って発現アレイでは検出できない可能性のある新規で稀な転写産物を解明しています。
ケーススタディを読む
Deciphering the Role of Long Non-Coding RNA in Cancer
Researchers at Biogazelle are using RNA-Seq to reveal how lncRNAs can be specific to cell types. They discovered that silencing certain lncRNAs can help destroy cancer cells.
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トータルRNAシーケンスのワークフロー
イルミナはライブラリー調製からデータ解析や生物学的解釈に至るまでのプロセス全体を単純化する統合化トータルRNA-Seqワークフローを提供します。
ワークフローが合理化かつ統合されているだけでなく、イルミナのSequence by Synthesis (SBS)ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、全世界のシーケンスデータの約90%を生み出しています*。
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RNA シーケンス検討事項
遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析、など、それぞれのRNA-Seq実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015