トータルRNAシーケンス

コーディングRNAとノンコーディングRNAの両方をキャプチャーして、トランスクリプトームを包括的に把握

トータルRNAシーケンスの紹介

トータルRNAシーケンス(トータルRNA-Seq)による全トランスクリプトーム解析では、コーディングRNAに加えて、複数種のノンコーディングRNAを検出します。トータルRNA-Seqは、遺伝子および転写産物の量を正確に測定し、既知および新規のトランスクリプトームの特性を同定することができます。

トータルRNA-Seqは、高品質および低品質のRNAサンプルの両方をカバーします。種特異的リボソームのRNAプローブは、豊富なRNA種を効率的に除去できます。これにより、ライブラリーキャプチャーの対象となる断片化された転写産物と完全な転写産物の両方が残ります。

Profile view of male scientist standing in front of NextSeq 1000/2000 displaying load cartridge screen and inserting reagent cartridge. Blurry female scientist in the foreground.

トータルRNAシーケンスの利点

トータルRNA-Seqは、コーディングRNAと複数のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。

既知と新規の両方の現象を検出し、設計済みプローブは不要

研究者は、コーディングとノンコーディングのRNA転写産物にわたるバイオマーカーを同定可能

目的の表現型を包括的に理解可能

幅広いダイナミックレンジで全トランスクリプトームのプロファイリングが可能

トータルRNAシーケンスのワークフロー

イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡略化する、統合型全トランスクリプトームシーケンシングのワークフローを提供します。

RNA sequencing methods guide cover. Close up image of a female scientist pipetting clear liquid into tube; NextSeq 1000/2000 reagent cartridge and sample plate on the lab bench.

RNAシーケンス手法ガイド

このガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのソリューションを提供します。イルミナのRNA-Seqワークフローは、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析を統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。

RNA-Seq向けライブラリー調製

イルミナの充実したRNA-Seqライブラリー調製ポートフォリオには、豊富なrRNAの除去機能が含まれているため、トランスクリプトームの高価値な部分に集中することができます。

Female scientist holding a single pipette in one hand and a tube in the other.

RNA-Seqの記事

RNAシーケンスの検討事項

RNA-Seqに必要なリード長と深度について学び、実験デザインに役立つリソースを見つけることができます。

NGSを使用した希少な遺伝性疾患の研究

全エクソームシーケンスとトランスクリプトームシーケンスは、希少な疾患に関連する変異とパスウェイを解明する上で有益であることが実証されています。

がんにおけるlncRNAの役割を解読する

特定の長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)をサイレンシングすると、がん細胞の破壊に役立つ可能性があるという研究結果について、BiogazelleのJo Vandesompele, PhDが解説します。

注目の製品

Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit

ヒト、マウス、ラット、細菌サンプルにおけるリボソームRNAおよびヒトグロビンmRNAの除去を可能にするスタンドアロンキット。

関連ソリューション

がん研究:遺伝子発現研究

コーディングRNAバイオマーカーとノンコーディングRNAバイオマーカーの両方における遺伝子発現の変化をトータルRNA-Seqでモニタリングすることで、研究者はどのバリアントが腫瘍の分類と進行に影響するかを把握することができます。

アグリゲノミクス:ディープトランスクリプトームシーケンス

植物は大きく、反復的なゲノムを持っているため、発現の弱い遺伝子のシーケンスが困難になることがあります。ウルトラディープRNAシーケンスなら、これらの遺伝子の解析を容易にすることができます。

複雑な疾患バイオマーカーの同定

複雑な疾患の研究者がトータルRNA-Seqを使用すると、1回の解析でコーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAを研究できるため、幅広い疾患関連バイオマーカー候補を視覚化することができます。

空間トランスクリプトーム

RNA-Seqを使用して複雑な組織構造における転写活性を空間的に解像する

補足資料

RNA-Seqデータ解析

ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールにより、バイオインフォマティクスの経験に関係なく、生物学者のRNA-Seqデータ解析が簡素化されます。

ペアエンドRNA-Seq

すべてのイルミナシーケンスシステムは、ペアエンドシーケンスが可能で、新規RNA転写物や遺伝子融合などの検出を容易にします。

シングルセルRNAシーケンス

バルクサンプリングで見落とされがちな細胞間の差異を考察し、高感度のシングルセルシーケンス手法を探索します。

お問い合わせ

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