コーディングトランスクリプトームとノンコーディングトランスクリプトーム全体にわたる明確で包括的な解析のための合理化されたRNA-Seqソリューションで、研究の優れた柔軟性を実現します。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plusは、遺伝子や転写産物の量を正確に測定し、コーディングRNAや複数の種類のノンコーディングRNAにおける既知および新規の特徴を検出できます。研究者は、代替転写産物・遺伝子融合・対立遺伝子特異的発現の発見に信頼度を持つことができます。さらに、Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plusマイクロバイオームは、メタトランスクリプトミクスアプリケーションに高品質のデータを提供します。
| アッセイ時間 | 約7時間 |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robots |
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー |
| 説明 | 低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。 |
| ハンズオンタイム | <3時間 |
| インプット量 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨 |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 手法 | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| Nucleic acid type | RNA |
| Specialized sample types | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue |
| Species category | マウス, ヒト, ラット, Bacteria |
| 生物種詳細 | Ribo-Zero Plusは、ヒト細胞質およびミトコンドリアrRNA・マウスrRNA・ラットrRNA・細菌（大腸菌および枯草菌）rRNA・ヒトβグロビン転写産物を含む複数種から豊富な転写産物を除去します Ribo-Zero Plus Microbiomeは、Ribo-Zero Plusが除去した転写産物だけでなく、多様な微生物種、ATCC MSA-2002、MSA-2005、MSA-2006を含む複数種から豊富な転写産物を除去します |
| Strand specificity | Stranded |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
処理のニーズに合ったライブラリー調製キットのサイズ（16サンプルまたは96サンプル）を選択してください。
別途、マルチプレックス実行のためにインデックスを注文する必要があります。ターゲットシーケンススループットに最適なインデックスオプションを選択してください。シーケンススループットとマルチプレックスを行う機能は、シーケンサーとフローセル試薬によって異なります。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero PlusまたはRibo-Zero Plus Microbiomeキットを使用すると、低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンス対応ライブラリーを約7時間で、ハンズオンタイムは3時間未満で調製できます。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Mid output: 2 samples per flow cell High output: 8 samples per flow cell |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | P2: 8 samples per flow cell P3: 24 samples per flow cell |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP: 16 samples per flow cell S1: 32 samples per flow cell S2: 82 samples per flow cell S4: 200 samples per flow cell |
2 × 75 bp |
コーディングRNAと複数のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。
Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.
| Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |||
|---|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 約7時間 | 11.5時間 | 11.5時間 | ||
| Automation capability | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots | ||
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | ||
| 説明 | 低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。 | 全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。 | 血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。 | ||
| ハンズオンタイム | <3時間 | 5.5時間 | 5.5時間 | ||
| インプット量 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨 | 高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。 | 0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA | ||
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | ||
| 作用機序 | 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR | ||
| 手法 | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing | Whole-transcriptome sequencing | Whole-transcriptome sequencing | ||
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 | ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製, ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。 | ||
| Nucleic acid type | RNA | RNA | RNA | ||
| Specialized sample types | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue | FFPE tissue | Blood | ||
| Species category | マウス, ヒト, ラット, Bacteria | マウス, ヒト, ラット | マウス, ヒト, ラット | ||
| 生物種詳細 | Ribo-Zero Plusは、ヒト細胞質およびミトコンドリアrRNA・マウスrRNA・ラットrRNA・細菌（大腸菌および枯草菌）rRNA・ヒトβグロビン転写産物を含む複数種から豊富な転写産物を除去します Ribo-Zero Plus Microbiomeは、Ribo-Zero Plusが除去した転写産物だけでなく、多様な微生物種、ATCC MSA-2002、MSA-2005、MSA-2006を含む複数種から豊富な転写産物を除去します | rRNAの除去：ヒト、マウス、ラットのrRNAを除去 | rRNAの除去：ヒト、マウス、およびラットのrRNA（細胞質およびミトコンドリア）およびグロビンmRNAを除去 | ||
| Strand specificity | Stranded | ||||
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | ||
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
Illumina Stranded Total RNA Prepは、ハンズオンタイムを短縮した高速ワークフローを実現します。時間は、使用する機器、処理されるサンプル数、自動化手順、またはユーザーエクスペリエンスによって異なる場合があります。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero PlusをTruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zeroと比較しました。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plusは、特に10 ngおよび1 ngのトータルUHR RNAという低インプットの場合、rRNAの除去においてより効果的でした。
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion kitは、糞便サンプル中のrRNA（5S、16S、23S）レベルを効果的に除去します。結果は、2つの糞便サンプル混合物（サンプル1およびサンプル2）を用いて、Ribo-Zero Plus rRNA Depletion KitおよびX社の市販リボ欠失キットと比較されています。
Illumina Stranded Total RNA Prepキットには、ヒト、マウス、ラット、細菌、疫学サンプルなどの複数の種から豊富なrRNAを除去するための (A) Ribo-Zero Plus、またはメタトランスクリプトーム研究用の糞便サンプルなどの複雑な微生物サンプル中の豊富なrRNAを強力に枯渇させる (B) Ribo-Zero Plus Microbiomeが含まれます。
A. Ribo-Zero Plusキット
| 枯渇ターゲット | rRNA ターゲット |
| ヒト細胞質rRNA | 28S、18S5.8S、および5S |
| ヒトミトコンドリアrRNA | 12S、および16S |
| ヒトβグロビン転写物 | HBA1、HBA2、HBB、HBG1、HBG2 |
| マウスおよびラット | 12S、16S、28S、18S5.8S、および5S |
| グラム陰性菌rRNA | 大腸菌：5S、16S、23S |
| >グラム陽性菌rRNA | 枯草菌 5S、16S、23S |
B. Ribo-Zero Plus Microbiomeキット
| 枯渇ターゲット | rRNA ターゲット |
| 微生物rRNA* | 大人と乳幼児に共通の細菌種やATCC MSA-2002、MSA-2005、MSA-2006などの多様な微生物：5S、16S、23S |
*Illumina Stranded Total Ribo-Zero Plus Microbiomeキット（カタログ番号20072063）のみに含まれています。rRNA除去はヒト微生物rRNA向けに最適化されており、その他のサンプルタイプを使用した場合には性能が変動することがあります。
DiversigenおよびDNA GenotekのDr. Tonya Ward、Dr. Emily Hollister、Dr. Le Françoisが、メタトランスクリプトーム研究のワークフローをどのようにして開発したのか、未来に潜在的に強い影響力を持つこの研究分野に対する彼らの見解を参照してください。
このウェビナーでは、この分野の3名の著名な専門家がサンプルの収集と処理、rRNA枯渇、およびバイオインフォマティクス解析に関する洞察と重要な検討事項を共有します。
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (16 Samples)
20040525
16サンプル調製用の試薬とRibo-Zero Plus Depletionモジュールが含まれます。IDT for Illumina RNA UDインデックス、Ligationとのみ互換性があります。インデックスおよび精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (96 Samples)
20040529
96サンプル調製用の試薬とRibo-Zero Plus Depletionモジュールが含まれます。IDT for Illumina RNA UDインデックス、ライゲーションにのみ対応しています。インデックスおよび精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome (96 Samples)
20072063
96ライブラリー調製用の試薬とRibo-Zero Plus Microbiome Depletionモジュールが含まれます。IDT for Illumina RNA UDインデックス、Ligationとのみ互換性があります。インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091655
Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples) には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091657
Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091659
Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091661
Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040553
96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040554
96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040555
96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040556
96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Stranded Total RNA Library Prep Training
20044764
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Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus Microbiomeキットには、一般的な成人および乳児の腸内細菌を含む多様な微生物種の5S、16S、および23S rRNAをターゲットとする拡張キャプチャープローブが含まれており、Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kitは大腸菌 および 枯草菌 の5S、16S、および23Sをターゲットとしています。
Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus Microbiomeは、ヒト、マウス、ラット、およびヒトの腸や皮膚に一般的に見られるさまざまな細菌株を含む複数の種から、ヒトグロビン転写産物およびrRNAを枯渇させます。イルミナは、記載されている以外の種のrRNA除去を保証することはできません。
Agilent TechnologiesのUniversal Human Reference RNA陽性対照（カタログ番号740000）は、Illumina Stranded Total RNA Prepとの併用を推奨します。
最終的なライブラリーの品質と濃度を確認するには、以下の2つの方法を使用できます：
NextSeq 1000/2000シーケンスシステムを使用する場合、1 μLのライブラリーを1:10,000に希釈し、KAPA qPCRライブラリー定量キットを用いて解析します
他のすべてのシーケンスシステムでは、Agilent 2100バイオアナライザーおよびDNA 1000キットを使用して、1 µLのライブラリーを解析します
Illumina Stranded Total RNA Prepは、起点のストランドをターゲットとしています。
Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus Microbiomeキットを使用する場合、最適なパフォーマンスを得るために推奨されるRNAの最小投与量は25 ngです。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
BaseSpace Sequence Hubで、ランの管理、解析、保存、シーケンスデータの共有を行います。アプリケーション、サブスクリプションオプション、ドキュメントを検索。
NextSeq 1000/2000システムの試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
鎖情報を正確に測定し、タンパク質コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出のための迅速で費用対効果の高いワークフロー。
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
使いやすいクラウドベースのゲノムラン管理とバイオインフォマティクスコンピューティングおよびストレージ環境により、で高性能なシーケンスオペレーションを実現します。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
当社の製品・サービスに関する情報や、テクノロジーに関するご質問への回答をお求めの場合、お気軽にお問い合わせください。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。
