インタラクティブなオミクスのナレッジベースとデータ検索エンジンで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
世界最大の生物学的データベースの1つであるCorrelation Engineは、ライフサイエンス分野の研究者に、膨大な数の高品質なオミクススケール解析と洞察に富んだ科学的ツールへの前例のないアクセスを提供します。 このナレッジベースは、 オミクス研究の標準化された解析から導き出された数十億のデータポイントを精査することで、新たな発見を促進します。 独自のアルゴリズムが相関解析を自動化して簡素化し、プライベートデータと数千の公開データセットをスキャンすることで、比較可能な洞察を導き出します。"
Correlation Engineが提供するもの：
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, MiniSeq System, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, iScan, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
|---|---|
| ソフトウェアフォーマット | クラウド |
| テクノロジー | マイクロアレイ, シーケンス |
ISO 27001 Certified by Schellman
Illumina has received ISO 27001 certification of its information security management system (ISMS) supporting Correlation Engine. This certification ensures that sensitive data contained or collected by these solutions are protected. The certification was performed by Schellman, an ANSI National Accreditation Board (ANAB) and United Kingdom Accreditation Service (UKAS) accredited certification body based in the US.
ISO 27701 Certified by Schellman
Correlation Engine is compliant with global and local data privacy and requirements with 27701:2019 certification.
GDPR
Correlation Engine features multiple system controls that you can use to manage authorization, authentication, and data control, including deletion as needed. Access logs are retained for seven years. These features help researchers ensure compliance with the General Data Protection Regulation.
Correlation Engineは、プライベートデータを、高度にキュレーションされた公開データと生物学的コンテキストに統合する、使いやすいインタラクティブなゲノミクス解析プラットフォームを提供します。アプリケーションは、疾患メカニズム、薬物ターゲット、予後または予測バイオマーカーを特定するための初期段階の研究をサポートします。
高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システムにより、遺伝子解析ラボはサンプルを追跡し、ワークフローを効率的かつ安全に管理することができます。
使いやすいクラウドベースのゲノムラン管理とバイオインフォマティクスコンピューティングおよびストレージ環境により、で高性能なシーケンスオペレーションを実現します。
このソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、およびデータ解析のための使いやすい統合ソリューションを提供します。
NGSデータを精確、包括的かつ効率的に二次解析します。
BaseSpace Sequence Hubは、一般的なイルミナシーケンス方法に対応したさまざまなNGSデータ分析アプリを提供します。
シーケンサーのシームレスな統合と柔軟なワークフローのための安全でスケーラブルなバイオインフォマティクスプラットフォーム。
Correlation Engine
インタラクティブなオミクスのナレッジベースで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
Partek Flow
Partek Flowソフトウェアは、使いやすいバイオインフォマティクスプラットフォームで、ビジュアルユーザーインターフェースで次世代シーケンサーと大規模マルチオミクスデータの解析を簡素化します。
説明可能なAIとユーザー設定の自動化のサポートにより、希少疾患のゲノミクスやその他の生殖細胞系研究アプリケーションのための高効率 データ解釈ワークフローを実現します。
体細胞腫瘍学研究アプリケーションをはじめ、幅広い用途に対応した効率的なバリアント解釈を実現します。
重要なバイオマーカーを同定し、シグネチャー中のどの遺伝子が主な疾患領域の最良マーカー、最適な治療ターゲット、および作用機序を提供するのかを探索します。
逆相関を探索し、薬剤の新しい目的を示す遺伝子-疾患化合物間の繋がりを発見します。
公開データや内部データのシグネチャーとの相関を見つけ、さらにパスウェイなどの生物学的状態や機能に対応するシグネチャーを特定することで、作用機序の解明を支援します。
公開されている毒性試験を活用して化合物のシグネチャーを評価し、キュレーションされた研究やメタ解析アプリを利用して、他の既知の毒性ゲノムシグネチャーとの重複を明らかにします。
研究者らは、イルミナCorrelation Engineを活用して成果を上げています
ピッツバーグ大学ヘルスサイエンスライブラリーの研究者が、包括的なデータベースを活用し、探索と論文発表を迅速化している事例をご紹介します。
オミクスデータから探索へ、道のりを加速
Correlation Engineの256 Kのキュレーションオミクスシグネチャーにより、データを迅速に相関付け、データに関する質問します。
さまざまなデータタイプを関連付ける
特定のクエリに対する新しい相関と関連性が迅速に特定され、遺伝子、疾患、化合物、組織、パスウェイ間のデータ主導の関連性が明らかになります。
Body Atlas
Body Atlasは、遺伝子が発現される場所とその場所における発現レベルに関する洞察を提供します。
Disease Atlas
Disease Atlasは、照会されたデータに関連する疾患、形質、および状態間の相関関係を提供します。
Pharmaco Atlas
Pharmaco Atlasは、化合物の探索、化合物に対するゲノムおよびエピゲノムの応答、およびクエリデータに関連する治療に役立ちます。
メタ解析
データシグネチャーの集合を使用してクエリを実行し、コンセンサスシグネチャーを導き出すほか、相関のあるバイオグループ（パスウェイ、機能グループなど）を探索することもできます。ダウンロード可能なヒートマップで結果を表示。
Correlation Engineに収録されている189,000件を超えるデータシグネチャーから得られる有意な結果を、効率的に調査・定量化する方法をご紹介します。
Correlation Engineから有益な分析結果を引き出す3つの一般的な方法をご紹介します。
Correlation Engine文献検索アプリケーションを無料でお試しください。
Correlation Engineを活用した高度なマルチオミクス解析ワークフローをご覧ください。
イルミナの包括的なディスカバリープラットフォーム、Correlation Engineなら、増え続ける複雑なオミクスデータから有益な洞察を導き出すことができます。その方法をご覧ください。
Partek Flowデータビューアーは、直感的な設定方法と機能を備えた視覚化機能を備えています。このデモで、生産性を向上させる方法をご覧ください。
RNA発現（RNA-Seq、発現アレイ）、ジェノタイピング/SNP GWAS、DNAタンパク質相互作用解析、体細胞変異解析、DNAメチル化解析をサポートします。
はい、このようなナレッジベースのシグネチャーは、Correlation Engineではバイオグループと呼ばれます。Pathway Enrichmentアプリを使用して、GOコンソーシアム、MSigDB、TargetScan、InterProの遺伝子またはタンパク質セットに対応するバイオグループでバイオセットが濃縮されているかどうかを判断します。
Correlation Engineは、NCBI Gene ID、遺伝子記号、NCBIアクセッション番号、ENSEMBL ID、RefSeq識別子、IPI ID、およびほとんどのAffymetrix、Illumina、Agilent、およびGE HealthcareプラットフォームからのカスタムIDを含む、ほとんどの公開および標準商用プラットフォーム識別子を認識します。
Correlation Engineは、独自のランクベースの統計を使用して、インポートするデータとその他すべての実験データの間の関連性を計算します。これにより、実験結果を世界の実験の文脈に当てはめて、結果を検証し、新しい関連性を探索し、新しい実験をデザインすることができます。また、すべてのバイオグループとデータを関連付けるため、研究を構成する遺伝子やタンパク質に共通する特徴を探索できます。
Correlation Engineについては26,000を超える研究があり、190,000を超える公開データシグネチャーに対応しています。 Correlation Engineの研究は毎週更新されます。
詳細や30日間のCorrelation Engine無料トライアルについては、お問い合わせください。
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、当社までお問い合わせください。
DRAGEN二次解析でゲノムの洞察を最大化します。最新情報、よくある質問、製品サポートをご覧ください。
プライベートデータと公開データセットを組み合わせて、コホートを迅速に構築および調査する試験デザインツールです。
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