シーケンスランの簡単な作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータの解析、結果の表示
Local Run Managerソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータの解析、および結果の表示のために設計された統合ソリューションです。アンプリコンシーケンス、ターゲットシーケンスなど、幅広いアプリケーションに対応する幅広い自動データ解析ツールを提供します。
さまざまな解析モジュールを使用してデータ解析を実行
解釈しやすい包括的なPDFレポートの作成
マニフェストやリファレンスゲノムなどのサンプルファイルやインプットファイルを記録する
解析完了時に解析メトリクスを表示
対応機器
Local Run Managerソフトウェアは装置制御ソフトウェアと統合されており、MiniSeqおよびiSeq 100システムに直接ウェブブラウザからアクセスできます。装置外バージョンが利用可能で、iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、NextSeq 550システムと互換性があります。
ほとんどのLocal Run Manager解析モジュールでは、特定のラン用のライブラリー調製キットを選択するように指示されます。各Local Run Managerソフトウェア解析モジュールと互換性のあるキットをご覧ください。
イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina DNAおよびTruSeq Ampliconパネルの効率的なバリアント検出を可能にします。
対応機器：
全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、特定の関心領域に対してバリアント解析を実行します。
対応機器：
デマルチプレックスされたFASTQファイルを生成し、さらなる下流解析を可能にします。
対応機器：
このモジュールでは、DNAライブラリーの存在量、断片長、サンプル品質を評価します。ライブラリーQCワークフローは、各DNAサンプルの特性に関する高レベルのレポートを提供します。
対応機器：
腫瘍学遺伝子パネル170 IUO/PEOアッセイから生成された調製済みDNAおよびRNAライブラリーのランセットアップ、シーケンス、解析をサポートします。
対応機器：
全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、特定の関心領域に対してバリアント解析を実行します。このワークフローは、Nextera断片化を使用して断片化されたPCRアンプリコンの解析を目的としています。
対応機器：
リードをアライメントし、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスのためのバリアント解析を実行します。
対応機器：
イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina RNAターゲットパネルの効率的な差次的発現解析を可能にします。
対応機器：
TruSight RNA Fusion Panelキットで調製したRNAライブラリーのリードをアライメントし、融合を検出します。
対応機器：
リードヒットと出力ヒットをアライメントします。オプションの新規前駆体発見とペアワイズ差次発現解析を実行します。
対応機器：
TruSight Oncology 500アッセイを使用して調製したサンプルのフィルター処理済みレポートを解析して生成し、固形腫瘍に関連する>500の遺伝子を解析します。
対応機器：
固形腫瘍に関連する15の遺伝子について、TruSight Tumor 15アッセイを使用して調製されたサンプルについて、フィルターされたレポートを解析し、生成します。
対応機器：
16SリボソームRNAの特定の領域を増幅することで、メタゲノムサンプルから生物を分類します。このワークフローは原核生物専用です。
対応機器：
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特定の解析ソフトウェアモジュールをダウンロードするか、Local Run Managerテクニカルサポート情報にアクセスしてください。
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