Local Run Manager

シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータの解析、結果の表示が簡単

統合データ解析

Local Run Managerソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータの解析、および結果の表示のために設計された統合ソリューションです。アンプリコンシーケンス、ターゲットシーケンスなど、幅広いアプリケーションに対応する幅広い自動データ解析ツールを提供します。 

  • さまざまな解析モジュールを使用してデータ解析を実行

  • 解釈しやすい包括的なPDFレポートの作成 

  • マニフェストやリファレンスゲノムなどのサンプルファイルやインプットファイルを記録する  

  • 解析完了時に解析メトリクスを表示

 

適合機器

Local Run Managerソフトウェアは装置制御ソフトウェアと統合されており、MiniSeqおよびiSeq 100システムに直接ウェブブラウザからアクセスできます。装置外バージョンが利用可能で、iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、NextSeq 550システムと互換性があります。

注目のLocal Run Managerモジュール

DNAアンプリコン解析モジュール

イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina DNAおよびTruSeq Ampliconパネルの効率的なバリアント検出を可能にします。 

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム
  • NextSeq 550 System

DNAエンリッチメント解析モジュール

全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、特定の関心領域に対してバリアント解析を実行します。

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

FASTQ解析モジュールの生成

デマルチプレックスされたFASTQファイルを生成し、さらなる下流解析を行います。

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム
  • NextSeq 550 System

ライブラリーQC解析モジュール

このモジュールでは、DNAライブラリーの存在量、断片長、サンプル品質を評価します。ライブラリーQCワークフローは、各DNAサンプルの特性に関する高レベルのレポートを提供します。 

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

腫瘍学遺伝子パネル170解析モジュール

腫瘍学遺伝子パネル170 IUO/PEOアッセイから生成された調製済みDNAおよびRNAライブラリーのランセットアップ、シーケンス、解析をサポートします。

対応機器:

  • NextSeq 550Dxシステム(RUOモード)

PCRアンプリコン解析モジュール

全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、特定の関心領域に対してバリアント解析を実行します。このワークフローは、Nextera断片化を使用して断片化されたPCRアンプリコンの解析を目的としています。

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

リシーケンス解析モジュール

リードをアライメントし、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスのバリアント解析を実行します。

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

RNAアンプリコン解析モジュール

イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina RNAターゲットパネルの効率的な差次的発現解析を可能にします。

対応機器:

  • iSeq 100 システム
  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

RNA融合解析モジュール

TruSight RNA Fusion Panelキットで調製したRNAライブラリーのリードをアライメントし、融合を検出します。

対応機器:

  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

小型RNA解析モジュール

リードヒットと出力ヒットをアライメントします。オプションの新規前駆体発見とペアワイズ差次発現解析を実行します。

対応機器:

  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム 
  • NextSeq 550システム

TruSight Oncology 500解析モジュール

TruSight Oncology 500アッセイを使用して調製したサンプルについて、固形腫瘍に関連する> 500の遺伝子を解析し、フィルター処理したレポートを生成します。

対応機器:

  • NextSeq 550 システム

TruSight Tumor 15解析モジュール

固形腫瘍に関連する15の遺伝子について、TruSight Tumor 15アッセイを使用して調製されたサンプルについて、フィルター処理されたレポートを解析し、生成します。 

対応機器:

  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム

16Sメタゲノミクス解析モジュール

16SリボソームRNAの特定の領域を増幅することで、メタゲノムサンプルから生物を分類します。このワークフローは原核生物専用です。

対応機器:

  • MiniSeqシステム
  • MiSeqシステム

関連情報

解析モジュールをダウンロードするかサポートを受ける

特定の解析ソフトウェアモジュールをダウンロードするか、Local Run Managerテクニカルサポート情報にアクセスしてください。

お問い合わせ

Local Run Managerのさまざまなモジュールと、お客様のニーズに適したモジュールの詳細については、お問い合わせください。