シーケンスランを簡単に作成し、ランステータスをモニターし、シーケンスデータを分析し、結果を表示します。
Local Run Managerソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータ解析、および結果の表示を行うために設計された統合ソリューションです。アンプリコンシーケンス、ターゲットシーケンスなど、幅広いアプリケーションに対応する幅広い自動データ解析ツールを提供します。
さまざまな解析モジュールを使用してデータ解析を実行
解釈しやすい包括的なPDFレポートの作成
マニフェストやリファレンスゲノムなどのサンプルと入力ファイルを記録する
解析終了時点での解析メトリクスの表示
対応装置
Local Run Managerソフトウェアは装置制御ソフトウェアと統合されており、MiniSeqおよびiSeq 100システムに直接ウェブブラウザからアクセスできます。装置外バージョンが利用可能で、iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、NextSeq 550システムと互換性があります。
ほとんどのLocal Run Manager解析モジュールでは、特定のラン用のライブラリー調製キットを選択するように指示されます。各Local Run Managerソフトウェア解析モジュールと互換性のあるキットをご確認ください。
イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina DNAおよびTruSeq Ampliconパネルの効率的なバリアント検出を可能にします。
対応装置
リードを全ゲノムの参照配列にアラインし、特定の対象領域でバリアント解析を行います。
対応装置
リードをアラインし、ヒットを出力します。新規の前駆体を選択的に検出し、差次的発現の対解析を行います。
対応装置
このモジュールでは、DNAライブラリーの存在量、断片長、サンプル品質を評価します。ライブラリーQCワークフローは、各DNAサンプルの特性について大まかなレポートを提供します。
対応装置
腫瘍学遺伝子パネル170 IUO/PEOアッセイから生成された調製済みDNAおよびRNAライブラリーのランセットアップ、シーケンス、解析をサポートします。
対応機器：
リードを全ゲノムの参照配列にアラインし、特定の対象領域でバリアント解析を行います。このワークフローは、Nextera断片化を使用して断片化されたPCRアンプリコンの解析を目的としています。
対応装置
リードをアラインし、小さいゲノムの全ゲノムシーケンスで得られたデータのバリアント解析を行います。
対応装置
イルミナのシーケンスシステムでシーケンスされたAmpliSeq for Illumina RNAターゲットパネルの効率的な発現差解析を可能にします。
対応装置
TruSight RNA Fusion Panelキットで調製したRNAライブラリーのリードをアライメントし、融合を検出します。
対応装置
リードヒットと出力ヒットをアライメントします。オプションの新規前駆体発見とペアワイズ発現差解析を実行します。
対応装置
固形がんに関連する500の遺伝子について、TruSight Oncology 500アッセイを使用して調製したサンプルを解析し、フィルタリングされたレポートを生成します。
対応装置
固形腫瘍に関連する15の遺伝子について TruSight Tumor 15 アッセイを使用して調製したサンプルを解析し、フィルタリングされたレポートを生成します。
対応装置
16SリボソームRNAの特定の領域を増幅することで、メタゲノムサンプルから生物を分類します。このワークフローは原核生物専用です。
対応装置
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