リキッドバイオプシーの研究
ctDNAシーケンスを実施して、リキッドバイオプシー研究サンプル中の希少バリアントや低頻度シグナルを検出します。
NovaSeq Xシリーズによるスピード、規模、探索力
より深い洞察を解き放ち、より有意義な成果を実現
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NovaSeq Xシリーズにより、以前は手が届かなかったプロジェクトを引き受けることができます。これまで以上に幅広いシーケンスとより深いシーケンスの両方を大規模に行うことができます。Gbあたりのコストが低く、スループットが高く、高速で合理化された運用ワークフローにより、これまで以上に簡単により多くのサンプルをシーケンスし、データを解析することができます。
NovaSeq Xシリーズと1.5B、10B、25Bフローセルは、ユーザーが予算を活用して、より大きな規模と深さのシーケンス研究を行うことを可能にします。
* NovaSeq Xシリーズで200米ドル相当のゲノムを25Bフローセル(消耗品のみのシーケンス)で提供する場合、100Gb/ゲノムを前提とした計算となります。
発見力の向上は、より大規模な研究、希少な遺伝子イベントを同定するためのより深いシーケンス、細胞活動をより包括的に把握するためのより幅広いシーケンス手法とマルチオミクスによってもたらされます。 NovaSeq Xシリーズで、より広範囲で深いシーケンスを実行し、これまで到達できなかったプロジェクトに取り組める方法をご覧ください。
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NovaSeq Xシリーズでは、より深いシーケンスにより希少バリアントを解析したり、アプリケーションをスケールアップしてより多くのサンプルを含めることができます。NovaSeq X Series 10Bおよび25Bフローセルを活用することで、最高レベルの信頼度で、かつてないほど迅速に、より大きなコホートを扱うことができます。
ctDNAシーケンスを実施して、リキッドバイオプシー研究サンプル中の希少バリアントや低頻度シグナルを検出します。
イルミナのComplete Long Readsで、歴史的に難解で、医学的意義のある遺伝子をシーケンスし、遺伝性疾患をより深く理解します。
より多くの条件下およびゲノム規模で、最大数百万の単一細胞を並行してプロファイリングすることで、複雑な組織における個々の細胞の寄与にアクセスします。
NovaSeq 6000 S4フローセルからNovaSeq X 25Bフローセルに移行して、統計的検出力とシーケンス数を2.5倍に増やします。
フローセルあたり最大64のヒト全ゲノムを手頃な価格で解析し、希少疾患研究を支援します。
NovaSeq X 25Bフローセルあたり約750エクソームのシーケンス能力により、大規模コホートグループ用のコーディングバリアントを効率的に同定します。
エクソームシーケンスは、25BフローセルのNovaSeq X PlusシステムおよびS4フローセルのNovaSeq 6000システムで、同じ総プロジェクト予算を使用して実施されました。この解析は、エクソームあたり8 Gbのシーケンスに基づいています。
NovaSeq Xシリーズでは、より深いシーケンスにより希少バリアントを解析したり、アプリケーションをスケールアップしてより多くのサンプルを含めることができます。NovaSeq X Series 10Bおよび25Bフローセルを活用することで、最高レベルの信頼度で、かつてないほど迅速に、より大きなコホートを扱うことができます。NovaSeq X Plusの25Bフローセルで、半分の時間*で2.5倍の細胞をシーケンスします。
NovaSeq Xフローセルタイプ |
1.5B
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10B
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25B
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ランあたりのシングルセルシーケンス数** | 約12万 | 約80万 | 約200万 |
ランタイム | 約17時間*** | 約18時間*** | 約48時間*** |
* NovaSeq 6000 S4 200サイクルキットとの比較。
** セルあたり25,000リードを想定しています。
*** 1.5Bおよび10Bフローセルのランタイムは、2 x 50 bpリード構成に基づいています。25Bフローセルのランタイムは、2 x 150 bpリード構成に基づいています。
NovaSeq Xシリーズにより、幅広いマルチオミクス研究の実行とさらなる次元の情報の追加が容易になりました。すべてのサンプルから最大限の情報を得ることで、ゲノミクスの最も複雑な質問に答えます。
より深い洞察を得るために複数の手法を組み合わせることで、より大きな視野でプロジェクトを考え、有用性を高めることができます。NovaSeq Xシリーズで検証され、一般的にマルチオミクス研究で組み合わされる主な方法をいくつかご紹介します。
一般的なマルチオミクスの組み合わせ | 利点 | NovaSeq Xがどのように役立つか | 定評のある手法 |
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ゲノミクス + トランスクリプトミクス | 疾患に関連するバリアントにアノテーションを付け、優先順位を付けるために、遺伝的変異の機能的結果を測定する |
WGS、WES、RNA-Seqの自動プッシュボタン内蔵の二次解析を並行して実行できる |
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ゲノミクス + エピジェネティクス | 特にノンコーディング領域において、遺伝子制御のパターンと、それらが原疾患である遺伝子型とどのように関連しているかを明らかにする |
自動内蔵独立レーンローディングにより、同じフローセル上で複数のオームを簡単にシーケンスできる |
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トランスクリプトミクス + エピジェネティクス | 遺伝子制御と遺伝子発現の関連性を推測ではなく、直接測定する |
クラウド上のDRAGEN二次解析パイプライン一式にシームレスに接続する |
NovaSeq Xシリーズは、DRAGEN内蔵によりターンアラウンドタイムを改善し、データ解析を簡素化します。
NovaSeq Xシリーズにより、シーケンスワークフローの実装がこれまで以上に迅速かつ容易になります。ラン計画からシーケンスや解析まで、タッチポイントやステップが少なくて済みます。DRAGEN内蔵のNovaSeq Xシリーズにより、合理化されたワークフローでシーケンスを加速し、大量のデータを簡単に管理できます。
Illumina Run Manager
*Connected Insightsは一部の国で利用可能です
XLEAP-SBSケミストリーは、ハイスループットゲノミクスに卓越したデータ品質を提供し、テクノロジーの進歩により、
NovaSeq Xシリーズはこれまでで最もパワフルでコスト効率の高いシーケンスシステムとなりました。このアプリケーションノートで詳細をご確認ください。
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イルミナではイノベーションほど重要なものはありません。これは、当社が現場を前進させる方法であり、当社のすべての行動の一部です。NovaSeq Xシリーズでは、使いやすさを高め、生産性を最大化し、ターンアラウンドを最小限に抑えて貴重なサンプルを最大限に活用するために、細部に至るまでどのように再設計されているかをご覧ください。
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オンタリオがん研究所は、ゲノミクスの活用により、腫瘍生物学をより深く理解し、がん治療の改善に取り組んでいます。プリンセス・マーガレット病院のDr. Stephanie Lheureuxのプロジェクトなど、OICRが、NovaSeq™ X Plusを使用してプロジェクトを加速する方法をご覧ください。
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