メチル化シーケンシング

メチル化シトシンは時間的および空間的遺伝子発現ならびにクロマチンリモデリングを大きく変化させます。次世代シーケンサー（NGS）の力を活用し、ゲノムワイド解析とターゲットメチル化シーケンシングの両アプローチにより、研究者は単一ヌクレオチドレベルでのメチル化パターンについての洞察を得ることができます。

メチル化シーケンシングの利点：

• ヒトゲノムのCpG、CHH、CHG領域のメチル化パターンを検出します。
• ゲノムワイドなアプローチである全ゲノムバイサルファイトシーケンシング（WGBS）を用いて、ほとんどの種でゲノムのほぼすべてのシトシンのメチル化を確認することができます。
• 少量のDNAでサンプル多様性の全体像をキャプチャーします。
• ターゲットメチル化シーケンシングを用いて、ENCODE、FANTOM5およびEpigenomics RoadMap Consortiumにより同定されたゲノムデータなどのヒトゲノムの新たな関心領域をカバーします。

多くのアプローチがメチル化解析に高品質および高感度のNGSを活用しています。ほとんどの手法が、DNAのバイサルファイト変換に依拠して非メチル化シトシンの検出を行っています。バイサルファイト変換は、ライブラリー調製中に非メチル化シトシンをウラシルに変化させます。変換された塩基はシーケンスデータでチミンと同定され（PCR後）、リード数を使用してメチル化シトシンの割合が測定されます。

バイサルファイト変換シーケンスは、アンプリコンメチル化シーケンシングなどのターゲット法、または全ゲノムバイサルファイトシーケンシングにより行うことができます。さらに、メチル化（5-mc）解析とともにヒドロキシメチル化（5-hMc）の同定に、NGSでTAB-SeqやOxBSのような代替手法を使用できます。

メチル化解析の方法に関する詳細については、DNAメチル化解析法ガイド をご覧ください。