メチル化シーケンスの利点
シトシンのメチル化は、時間的かつ空間的遺伝子発現およびクロマチンリモデリングを大幅に修正します。次世代シーケンサー（NGS）の力を活用して、ゲノム全体の解析とターゲット化したアプローチの両方により、研究者らは単一ヌクレオチドレベルでのメチル化パターンについての洞察を得ることができます。
メチル化シーケンスの利点
- ヒトゲノムのCpG、CHH、CHG領域のメチル化パターンを知る
- ゲノムワイド手法の全ゲノムバイサルファイトシーケンス（WGBS）で、ほとんどの種におけるゲノムの実質的全シトシンのメチル化を見る
- 少量のDNAでフルサンプルの多様性を捕捉する
- ターゲットメチル化シーケンスを用いて、ENCODE、FANTOM5およびエピジェノミクスロードマップコンソーシアムにより同定されたヒトゲノムの新たな関心領域をカバーする
NGSによるDNAメチル化研究の推進
このeBookは、遺伝子発現と制御の研究に関するものです。サイエンティスト達が、メチル化シーケンスとアレイ手法をどのように使って研究を発展させているかを見る。
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バイサルファイトシーケンスの仕組みとは？
NGSの高品質と高感度を活かして、メチル解析を行うアプローチが多い多くの手法は、DNAのバイサルファイト交換によって、非メチル化シトシンを検出します。バイサルファイト変換は、ライブラリー調製時、非メチル化シトシンをウラシルに変換します。PCR後変換されたベースは、シーケンスデータ中のチミンとして同定され、またリードカウントは、メチル化シトシンの割合（％）を決定するために使われます。
バイサルファイト変換シーケンスは、アンプリコンメチル化シーケンスまたはターゲットエンリッチメントなどのターゲット化された手法、または全ゲノムバイサルファイトシーケンスにより実施されます。さらに、OxBSやTAB-Seqのような代替ケミストリーは、NGSで、メチル化（5-mc）解析と組み合わせて、ヒドロキシメチル化（5-hMc）の同定に使われます。
DNAメチル化解析法ガイドでメチル化解析手法の詳細を見る。
メチル化シーケンスのワークフロー
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J Biotechnol 199 38-46 2015
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*ファイルに基づいた計算Illumina, Inc., 2015