メチル化シーケンス

メチル化シーケンスの利点

シトシンのメチル化は、時間的かつ空間的遺伝子発現およびクロマチンリモデリングを大幅に修正します。次世代シーケンサー(NGS)の力を活用して、ゲノム全体の解析とターゲット化したアプローチの両方により、研究者らは単一ヌクレオチドレベルでのメチル化パターンについての洞察を得ることができます。

メチル化シーケンスの利点

  • ヒトゲノムのCpG、CHH、CHG領域のメチル化パターンを知る
  • ゲノムワイド手法の全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)で、ほとんどの種におけるゲノムの実質的全シトシンのメチル化を見る
  • 少量のDNAでフルサンプルの多様性を捕捉する
  • ターゲットメチル化シーケンスを用いて、ENCODE、FANTOM5およびエピジェノミクスロードマップコンソーシアムにより同定されたヒトゲノムの新たな関心領域をカバーする
NGSによるDNAメチル化研究の推進

このeBookは、遺伝子発現と制御の研究に関するものです。サイエンティスト達が、メチル化シーケンスとアレイ手法をどのように使って研究を発展させているかを見る。

今すぐダウンロード
全ゲノムメチル化カバレッジ

バイサルファイトシーケンスの仕組みとは?

NGSの高品質と高感度を活かして、メチル解析を行うアプローチが多い多くの手法は、DNAのバイサルファイト交換によって、非メチル化シトシンを検出します。バイサルファイト変換は、ライブラリー調製時、非メチル化シトシンをウラシルに変換します。PCR後変換されたベースは、シーケンスデータ中のチミンとして同定され、またリードカウントは、メチル化シトシンの割合(%)を決定するために使われます。

バイサルファイト変換シーケンスは、アンプリコンメチル化シーケンスまたはターゲットエンリッチメントなどのターゲット化された手法、または全ゲノムバイサルファイトシーケンスにより実施されます。さらに、OxBSやTAB-Seqのような代替ケミストリーは、NGSで、メチル化(5-mc)解析と組み合わせて、ヒドロキシメチル化(5-hMc)の同定に使われます。

DNAメチル化解析法ガイドでメチル化解析手法の詳細を見る。

注目のメチル化研究

依存症へのエピジェネティックの貢献
依存症へのエピジェネティックの貢献

マリリー・モーガンは、ターゲット化されたメチル化シーケンスを利用して、エピジェネティックシグネチャーと物質乱用者の脳画像スキャンを相関付けることを論じています。

記事を読む

メチル化および転移
メチル化および転移

研究者たちは、NGSベースメチル化シーケンスやマイクロアレイを用いて、がんの転移の背後にあるエピジェネティクスを研究しています。

記事を読む

ランナー
メチル化と運動

研究者たちは、RNA-Seqとメチル化アレイを用いて運動関連のエピジェネティックな変化を研究しています。

記事を読む

メチル化シーケンスのワークフロー

90%を超える世界のシーケンスデータは、イルミナのNGSテクノロジーを用いて生成されています。*

イルミナは、メチル化シーケンスにおいて、ライブラリー調製からデータ解析までを完全にサポートしたワークフローを提供します。

メチル化シーケンスデータ解析用のDRAGEN Bio-ITプラットフォーム

DRAGEN Bio-ITプラットフォームは、高カバレッジ密度のエピジェネティック研究に、正確で超高速のメチル化シーケンスデータ解析を提供します。

詳細はこちら
メチル化シーケンスデータ解析用のDRAGEN Bio-ITプラットフォーム

関連ソリューション

エピジェネティクスとがん

メチル化異常や転写因子の結合の変化など、エピジェネティクスの変化の研究は、重要な腫瘍パスウェイにおける洞察をもたらすことがあります。がんエピジェネティクス研究の詳細はこちら

複雑な疾患ゲノム

ゲノムワイドメチル化シーケンスは、研究者たちが、複雑な神経学や免疫学、その他の疾患における実際の機能メカニズムを理解するのに役立ちます。複雑な疾患研究の詳細はこちら

注目の出版物

チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)DP-12セルのDNAメチル化の状況。

J Biotechnol 199 38-46 2015

単一細胞DNAメチル化シーケンスとエピゲノム細胞状態のダイナミクスのバイオインフォマティクス推論。

Cell Rep 10 1386-97 2015

iPSC再組み替え要因における体細胞セル分化転換中の多能性の一過性発現。

Nat Biotechnol 33 769-74 2015

ゲノム解析技術に関する最新のニュース、事例研究、情報を提供します。ぜひご登録ください。

電子メールアドレスを入力してください。

Additional Resources

Peter Laird: Epigenetics, DNA Methylation, and Arrays
Peter Laird: Epigenetics, DNA Methylation, and Arrays

Peter Laird, PhD, discusses his studies of epigenetics and the role DNA methylation may play in contributing to cancer.

全ゲノムバイサルファイトシーケンスライブラリー調製
全ゲノムバイサルファイトシーケンスライブラリー調製

DNAメチル化の効率的なナノグラムスケールのライブラリー調製、シーケンス、および解析

Fraz SyedによるWGBSでのライブラリー調製
Fraz SyedによるWGBSでのライブラリー調製

イルミナの研究者Fraz Syedが、全ゲノムバイサルファイトシーケンスでのライブラリー調製を説明します。

*ファイルに基づいた計算Illumina, Inc., 2015