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より高い効率かつより少ない制約下で、多種多様な新旧アプリケーションにわたって新たな科学の探究を可能にする画期的なベンチトップシーケンサー
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By Dr. Phil Febbo, Chief Medical Officer at Illumina
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大阪大学大学院医学系研究科 谷内田 真一教授、高田創先生、金井悠先生
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COVID-19対策を支援することに尽力するグローバルカンパニーとして、イルミナはそのテクノロジーが世界中のサイエンティストの力となっていることを光栄に思います。
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植物のゲノム情報解析や計算モデルを用いた表現型予測、微細藻類による物質生産に向けたゲノム編集など、さまざまな研究手法を駆使する理化学研究所の持田先生に研究の現状と展望を伺いました。
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イルミナが包括的なゲノムプロファイリングを前進させるためBristol Myers Squibb、Kura Oncology、Myriad GeneticsおよびMerckとの新しいさまざまな腫瘍学パートナーシップを発表
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これらのリソースでは、ビギナー向けの次世代シーケンサー(NGS)における主要なトピックが取り上げられています。ワークフロー、チュートリアル、および最初の実験の計画作成をご案内します。
次世代シーケンサーは研究に大変革をもたらし、これまでは不可能であった実験を可能にします。
NGSを他のテクノロジーと比較して、お客様自身やお客様の研究目標に最適かどうかをご確認ください。
2つのテクノロジーの主な違いを知り、NGSがより効果的なオプションとなりうる場合をご覧ください。
NGSがどのようにqPCRよりも発見に高い力を発揮し、バリエーションの定量に役立つ方法となるのかをご覧ください。
NGSを用いたRNAシーケンスでは、新規転写産物の検出でなぜ幅広いダイナミックレンジと高い感度を達成できるのかをご確認ください。
基本的な次世代シーケンサープロセスでは、DNA/RNAの断片化、アダプターの付加、ライブラリーのシーケンス、ゲノム配列を得るための再構築が行われます。原理上、この概念はキャピラリー電気泳動と似ています。決定的な違いは、NGSでは何百万もの断片を大規模並列処理方式でシーケンスし、シーケンス費用を抑えながらスピードと正確さが向上する点です。
次世代シーケンサーには、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析という3つの基本ステップがあります。各ステップの準備に役立つリソースを見つけて、一般的なNGSアプリケーションである微生物全ゲノムシーケンスのワークフローの例をご覧ください。
NGSは想像する以上に簡単に始められます。ワークフローの主なステップごとのチュートリアルをご覧ください。
NGSにかかる費用は近年、大幅に低下しており、あらゆる規模のラボでシーケンスを研究に導入することが可能になりました。ラボ設備やサンプル量など、予算作成時には検討すべき要素がいくつかあります。
次世代シーケンサーワークフローの主要ステップを詳しく見ていくことから始めましょう。
イルミナのオンラインコミュニティで他のイルミナユーザーとつながりましょう。イルミナのモデレータ、ユーザー、および開発者と連携していただけます。ベストプラクティスやトラブルシューティングについて話し合い、他の研究者がどのようにイルミナのシーケンサー、ライブラリー調製キット、自動データ解析を使って研究を加速しているのかをご覧ください。
NGSにおける一般用語の定義や重要な概念の図解をご覧いただけます。
いち早く始めることをご希望なら、当社の実験計画の専門家にご相談ください。*お客様に適したNGSワークフローを設計できるよう支援します。
当社の公開フォーラムでは、研究者たちが集い、相互支援、質問、大規模な共同研究を行うことができます。
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