メイトペアシーケンス

断片化されたDNAは、標識されたdNTPで末端修復を行います。 DNA断片の環状化を行います。環状化されなかったDNAは除去します。 環状化されたDNAは、その後、断片化を行い、ビオチン標識をもつDNA断片（元のDNAの両端がライゲーションされたもの）のみを選択的に濃縮します。 濃縮されたDNA断片は、さらに末端修復を行い、次世代シーケンサー用のアダプターを付加します。

フローセル上のオリゴヌクレオチドに補完的な付加配列は、tailed PCRプライマーを用いてアダプター配列に付加します。 最終的に調製されたライブラリーは、元は数キロベース離れていた2つのDNAセグメントからなる短い断片で構成されます。 このライブラリーにより、クラスター形成後、イルミナの次世代シーケンサー（NGS）プラットフォームを使用したペアエンドのシーケンスを行うと、元の2‐5KbのDNA末端に由来する配列情報が得られます。