ショットガンメタゲノミクスシーケンスは、複雑なサンプル中に存在するあらゆる生物の全遺伝子の網羅的なサンプリングを可能にします。<sup>1,2</sup>この次世代シーケンス（NGS）手法を用いることで、微生物学者は細菌の多様性を検証し、さまざまな環境における微生物の存在量を検出することができます。また、ショットガンメタゲノミクスは、他の手法では解析が困難または不可能な、培養できない微生物を研究する手段を提供します。3
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シーケンス深度とは、ゲノム内のリファレンス領域に一致するシーケンスリードの数のことです。この数値が重要な理由は、シーケンス深度が深いほど結果の正確性を示す強い指標となるためです。ショットガンメタゲノミクスシーケンスは網羅的な手法である一方、16Sシーケンスと比較してコストが高く、解析が複雑になる場合があります。これに対し、浅層ショットガンシーケンスは、フルショットガンシーケンスよりリード深度は浅いものの、16Sシーケンスよりも高い識別力と再現性を備えており、両者の欠点を補う有効な代替手段です。4
全ゲノムシーケンス（WGS）と微生物シーケンスのための幅広いDNAインプット（1～500 ng）をサポートする、高速の多目的タグメンテーションワークフローです。
PCRフリーのワークフローにより、非常に均一なWGS結果が得られ、高感度微生物アプリケーションの精度が向上します。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
低DNAインプット（1 ng）およびハイプレックスマルチプレックス用に最適化された超高速アンプリコンおよび小さなゲノム調製です。
TruSeq DNA Nano（平均インサートサイズ550 bp）
>低インプット（~100 ng）でのライブラリー調製により、信頼性の高いカバレッジの均一性と、ゲノム全体にわたるバイアスの低減を実現します。
TruSeq DNA PCR-Free（平均インサートサイズ550 bp）
シンプルなゲルフリーのPCRフリーWGS調製により、スケーラブルなスループットで複雑なゲノムを正確かつ包括的にカバーします。
MiSeq i100シリーズは、これまでで最速のランタイムを実現し、画期的なシンプルさとサステイナビリティの大幅な向上により、あらゆるラボの可能性を広げます。
実績のあるNGSテクノロジーと調整可能な出力を組み合わせ、さまざまなアプリケーションに対応したシーケンスおよびアレイ機能を実現します。
包括的なワークフローにより、プロセス全体を通して研究の成果に貢献します。
DRAGEN Metagenomicsパイプラインは、分類学的手法によるリードを実施し、単一サンプルおよび集計結果をレポートとして出力します。
全ゲノムシーケンス（WGS）と微生物シーケンスのための幅広いDNAインプット（1～500 ng）をサポートする高速の多目的タグメンテーションワークフローです。
PCRフリーのワークフローにより、非常に均一なWGS結果が得られ、高感度微生物アプリケーションの精度が向上します。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
低DNAインプット（1 ng）およびハイプレックスマルチプレックス用に最適化された超高速アンプリコンおよび小さなゲノム調製です。
TruSeq DNA Nano（平均インサートサイズ550 bp）
低インプット（~100 ng）ライブラリー調製により、信頼できるカバレッジ均一性とゲノム全体のバイアス低減を実現します。
TruSeq DNA PCR-Free（平均インサートサイズ550 bp）
シンプルなゲルフリーのPCRフリーWGS調製により、スケーラブルなスループットで複雑なゲノムを正確かつ包括的にカバーします。
包括的なワークフローにより、プロセス全体を通して研究の成果の創出に貢献します。
お客様のニーズに応え、探索を可能にするよう設計されたロバストでスケーラブルなシステムです。
データ集約型アプリケーションを生産規模で実行するための卓越したスループットと精度を実現します。
DRAGEN Metagenomicsパイプラインは、分類学的手法を用いてリードを分類し、単一サンプルおよび集計結果のレポートを提供します。
本ガイドでは、重要な疾患に関連する複雑な微生物サンプルのシーケンス方法と、微生物群集レベルにおける生物多様性および機能に関する洞察の取得方法を解説しています。
NGSベースの転写領域内部スペーサー（ITS）および16S rRNA遺伝子シーケンスは、複雑なマイクロバイオームや調査が困難または不可能な環境からのサンプルの系統や分類の比較のために確立された方法です。
ここでは、複雑な微生物群集から発現したmRNAを網羅的に解析する手法をご紹介します。これにより、微生物が特定の時点で特定の環境にどのように反応するかについて、重要な知見を得ることができます。
ラボでショットガンメタゲノミクスシーケンスを始めてみませんか？