数千もの生物を並行してシーケンスします。

複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的にサンプリングします。

ショットガンメタゲノミクスシーケンス

ショットガンメタゲノミクスシーケンスでは、特定の複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的にサンプリングできます。この方法により、微生物学者は細菌の多様性を評価し、さまざまな環境で微生物の存在量を検出できます。また、ショットガンメタゲノミクスは、他の方法では分析が困難または不可能な培養不可能な微生物を研究する手段を提供します。

キャピラリーシーケンスやPCRベースのアプローチとは異なり、次世代シーケンサー(NGS)を使用すると、研究者は何千もの生物を並行してシーケンスできます。NGSベースのメタゲノムシーケンスでは、1回のシーケンスランで多くのサンプルを組み合わせ、サンプルごとに高いシーケンスカバレッジを取得できるため、他の手法では見逃されたり同定するには高い費用がかかる可能性のある、低存在量の微生物群集のメンバーを検出できます。

16S rRNAシーケンスは、メタゲノム研究に使用されるもう1つの手法です。

ショットガンメタゲノミクス手法に関するガイド
ショットガンメタゲノミクス手法に関するガイド

複雑な微生物サンプルをシーケンスして、新たに出現した疾患を同定し、微生物群集の生物多様性と機能に関する洞察を得ます。

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メタゲノムシーケンス研究ストーリー

NGSは微生物の不思議な世界を解明しています
微生物の不思議な世界

Phil Hugenholtz医学博士が、NGSを使用したショットガンメタゲノミクスシーケンスが自身の研究にどのように影響を与えたかを説明します。

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微生物マルチオミクスがどのようにしてヒトの健康を支えられるか
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シーケンステクロノジーによって、腸内微生物をより深く解析し、それらがどのように疾患に寄与し、どのように疾患から保護するのかを解明することができます。

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今こそマイクロバイオーム研究の時代
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全ゲノムショットガンシーケンスとトランスクリプトミクスは、研究者や製薬会社に創薬や開発の精度を高めるためのデータを提供します。

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Explifyプラットフォームは、臨床検査室向けに完全にサポートされたNGSベースの臨床メタゲノミクステクノロジースイートです。Explifyプラットフォームが検査室のプロセスの合理化、結果の改善などにどのように役立つかを理解するための仮想ツアーについては、このビデオをご覧ください。

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高度な洞察を提供するIDbyDNAのExplifyプラットフォーム
微生物とメタゲノミクス研究レビュー

メタゲノミクスは、最も急速に成長している科学的専門分野の1つです。本書では、イルミナシーケンス技術をメタゲノム研究に適用した査読付き出版物を紹介します。

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微生物とメタゲノミクス研究レビュー
NovaSeq Reagent Kits
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Reagent kits for the NovaSeq 6000 System provide ready-to-use cartridge-based reagents for cluster generation and SBS.

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MiSeq System and Reagents
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The MiSeq benchtop sequencer enables targeted and microbial genome applications, with high-quality sequencing, simple data analysis, and cloud storage.

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NextSeq 550 System and Reagents
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The NextSeq 550 System brings the power of a high-throughput sequencing system to your benchtop.

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Nextera XT DNA
Nextera XT DNA

Prepare sequencing libraries for small genomes, amplicons, plasmids, and other applications.

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ショットガンベースのメタゲノムシーケンス実験を実行する方法は複数ありますが、これらはワークフローの各ステップで推奨される製品です。

以下のをクリックしてワークフローの各ステップに対応する製品をご覧ください。

Illumina DNA Prep

ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲のアプリケーション用の迅速な統合ワークフロー。

Nextera XT Library Prep Kit

小さなゲノム(バクテリア、古細菌、ウイルス)、アンプリコン、およびプラスミドのすぐにシーケンスできるライブラリーを90分未満で調製します。

TruSeq DNA PCR-Free Library Preparation Kits

全ゲノムシーケンスアプリケーション向けのシンプルで包括的なライブラリー調製。細菌などの小さなゲノムから全ヒトゲノムまで、多種多様な生物をシーケンスすることができます。

ベンチトップシーケンス

MiSeqシステム

微生物学における広範囲にわたる用途のための速度、真度、簡易性。

NextSeq 1000および2000システム

画期的なベンチトップシーケンサーは、現在および将来のさまざまなアプリケーションにおいて、より高い効率性と少ない制約で新しい発見を探索することを可能にします。

ハイスループットシーケンス
ショットガンメタゲノミクスのパワーと、プロジェクトまたはワークフローのニーズに基づいて拡張できる柔軟性。

NovaSeq 6000システム

生産規模のゲノミクス用のハイスループット、低コスト。

k-merアラインメントおよび分類学的手法用BaseSpaceアプリ

DRAGEN Enrichment

The DRAGEN Enrichmentアプリは、FASTQ、BAM、またはCRAMファイルを調整し、オプションでバリアントコールを行い、BAM、VCF、またはその両方を出力します。

One Codex

高速で包括的な正確なデータプラットフォームを通じてBaseSpace Sequence Hubからのサンプルを迅速に評価することによってメタゲノム解析を可能にします

Frequently Purchased Together

感染症サーベイランス
人込み

NGSは、感染症の伝染を追跡するための効果的な戦略をサポートします。メタゲノミクスは、サイエンティストが新規病原体を同定し、人畜共通感染症蓄積を研究し、感染拡大の予測および防止に役立てることができるよう支援します。

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COVID-19宿主リスクと反応
T細胞

宿主の遺伝的バリエーションと免疫反応の研究により、COVID-19の治療標的が明らかになる可能性があります。メタゲノミクスは、研究者が重症または軽度のCOVID-19罹患者間の微生物叢の差異を分析する上で役立ちます。

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COVID-19シーケンスソリューション

SARS-CoV2を検出して特性化し、感染経路を追跡し、複数感染を研究し、ウィルスの進化を調査するためのソリューションを見つけます。 ショットガンメタゲノミクスを他の病原体NGS法と比較します。 

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COVID-19ソリューション
土壌微生物叢のプロファイリング
土壌サンプル

このメタゲノムショットガンシーケンスワークフローは、完全に自動化された土壌サンプルの準備、シーケンス、および分析を提供し、研究者が土壌微生物群集を特徴づける上で役立ちます。

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eDNAのショットガンシーケンス
魚の群れ

環境DNA(eDNA)シーケンスは、生物多様性と生態系の研究のための新しい方法であり、サンプル中に豊富に存在する可能性のある種(細菌や小さな真核生物など)を分析するために使用されます。

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ポッドキャストを聴いている人
臨床メタゲノミクスとCOVID-19

IDbyDNAのRobert Schlaberg氏とLauge Farnaes氏が、臨床領域での感染症へのメタゲノミクスの応用について議論します。

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環境水サンプルのメタゲノム解析
環境サンプルのメタゲノム解析

NextSeq 500システムを使用したショットガンメタゲノミクスシーケンスにより、貯水池の環境変化に対する微生物の反応に関する洞察を得ることができます。

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NGSで皮膚上の新種のウイルスを発見
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イルミナのシーケンサーは、非黒色腫性の皮膚がんに関連する新種のHPVを同定する上で深い探知範囲を提供します。

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土壌ショットガンメタゲノミクスのためのNextera DNA Flex Library Prep
土壌メタゲノミクスワークフロー

包括的なショットガンメタゲノミクスワークフローを使用して、土壌微生物群集の分類学的および機能的多様性を探ります。

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NovaSeqとショットガンメタゲノミクスシーケンス
NovaSeqとメタゲノミクスシーケンス

NovaSeq SP 2x251を使用した微生物メタゲノムシーケンスとアセンブリ。

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SARS-CoV-2
メタゲノムと新たな病原体

IDbyDNAの専門家らが、新たな病原体の脅威に直面する際のメタゲノミクスの使用について議論します。

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