ショットガンメタゲノミクスシーケンスでは、特定の複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的にサンプリングできます。この方法により、微生物学者は細菌の多様性を評価し、さまざまな環境で微生物の存在量を検出できます。また、ショットガンメタゲノミクスは、他の方法では分析が困難または不可能な培養不可能な微生物を研究する手段を提供します。
キャピラリーシーケンスやPCRベースのアプローチとは異なり、次世代シーケンサー(NGS)を使用すると、研究者は何千もの生物を並行してシーケンスできます。NGSベースのメタゲノムシーケンスでは、1回のシーケンスランで多くのサンプルを組み合わせ、サンプルごとに高いシーケンスカバレッジを取得できるため、他の手法では見逃されたり同定するには高い費用がかかる可能性のある、低存在量の微生物群集のメンバーを検出できます。
16S rRNAシーケンスは、メタゲノム研究に使用されるもう1つの手法です。
Explifyプラットフォームは、臨床検査室向けに完全にサポートされたNGSベースの臨床メタゲノミクステクノロジースイートです。Explifyプラットフォームが検査室のプロセスの合理化、結果の改善などにどのように役立つかを理解するための仮想ツアーについては、この動画をご覧ください。
動画を視聴メタゲノミクスは、最も急速に成長している科学的専門分野の1つです。本文献は、イルミナのシーケンス技術をメタゲノミクス研究に適用する査読付きの出版物に焦点を当てています。
レビューを読むショットガンベースのメタゲノムシーケンス実験を実行する方法は複数ありますが、これらはワークフローの各ステップで推奨される製品です。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップに対応する製品をご覧ください。
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲の用途に対して迅速な統合ワークフロー。
Nextera XT Library Prep Kit小さなゲノム(バクテリア、古細菌、ウイルス)、アンプリコン、およびプラスミドのすぐにシーケンスできるライブラリーを90分未満で調製します。
全ゲノムシーケンスアプリケーション向けのシンプルで包括的なライブラリー調製。細菌などの小さなゲノムから全ヒトゲノムまで、多種多様な生物をシーケンスすることができます。
ベンチトップシーケンス
MiSeqシステム微生物学における広範囲のアプリケーション用の速度、真度、簡易性。
NextSeq 1000および2000システム画期的なベンチトップシーケンサーは、現在および将来のさまざまなアプリケーションにおいて、より高い効率性と少ない制約で新しい発見を探索することを可能にします。
ハイスループットシーケンス
ショットガンメタゲノミクスのパワーと、プロジェクトまたはワークフローのニーズに基づいて拡張できる柔軟性。
生産規模のゲノミクス用のハイスループット、低コスト。
k-merアラインメントおよび分類学的手法用BaseSpaceアプリ
DRAGEN EnrichmentThe DRAGEN Enrichmentアプリは、FASTQ、BAM、またはCRAMファイルを調整し、オプションでバリアントコールを行い、BAM、VCF、またはその両方を出力します。
高速で包括的な正確なデータプラットフォームを通じてBaseSpace Sequence Hubからのサンプルを迅速に評価することによってメタゲノム解析を可能にします
SARS-CoV-2を検出して特性化し、感染経路を追跡し、同時感染を研究し、ウイルスの進化を調査するためのソリューションを見つけます。ショットガンメタゲノミクスと他の病原体のNGS手法を比較してください。
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