結核（TB）サーベイランス
世界の健康危機に対する結核サーベイランス
結核（TB）サーベイランスは、COVID-19に次ぐ世界第2位の感染症キラーである疾患を根絶するための重要なステップです。1結核菌（Mtb）を含む結核菌群（MTBC）の細菌によって引き起こされる結核は、治療可能な疾患ですが、多剤耐性結核（MDR-TB）は依然として公衆衛生上の危機であり、保健安全保障上の脅威です。1ゲノムベースの結核サーベイランスは、以下の分野で公衆衛生当局を支援することができます。
- Mtbおよび非TB種の検出
- 抗結核薬耐性の特性評価
- 送信経路の追跡
- マイコバクテリウムの進化と、既存および新規の治療法に抵抗性を示す新規変異のモニタリング
次世代シーケンサーの識別力により、感染拡大により高いスピードと自信をもって対処することができます。
薬剤耐性結核を検出するためのゲノム解析
薬剤耐性TB（DR-TB）は、1つ以上の抗TB薬に耐性を示すMTBCであり、病原体の診断、治療、根絶を制御する上で大きな課題となります。2したがって、これらの菌株の検出と特性評価は疾患サーベイランスの重要な部分です。
ターゲットNGS（tNGS）や全ゲノムシーケンス（WGS）などの次世代シーケンス（NGS）ベースのソリューションは、DR-TBの検出において重要な利点を提供します。以下に詳細を示します。
ターゲット次世代シーケンスの利点
サンプル調製
- サンプルから直接開始し、タイムリーな培養は不要
検出機能
- Mtbのジェノタイピングとスポリゴタイピング
- 幅広い抗結核薬耐性検出のためのターゲット薬剤耐性マーカー
- ヘテロ耐性亜集団の検出
焦点を絞った検出
- Mtbおよび非TBマイコバクテリウム株の検出
- ヌクレオチドレベルの遺伝子多型を正確に特性化
全ゲノムシーケンスの利点
サンプル調製
- 培養分離株から開始
検出機能
- 事前の知識にかかわらず、バリアント検出と耐性メカニズムのための完全なゲノムシーケンスデータ
焦点を絞った検出
- 高解像度疫学研究のための全ゲノムの偏りのない特性評価
- あらゆる解析ニーズに対応する全ゲノム
結核のリソース
結核インフォグラフィック
この包括的なインフォグラフィックでは、結核の薬剤、治療、サーベイランス方法、その他の事実や数字に関する情報を視覚的な形式で表示します。
細菌の直接コロニーシーケンス
効率的でコスト効率の高いFlex Direct Colonyメソッドにより、個別のDNA単離と高精度な定量ステップの必要性を排除します。
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臨床微生物学ラボへの次世代シーケンスの移行
ECCMID 2022 Symposiumが利用可能になりました。結核のメタゲノミクス、ゲノムサーベイランス、マイクロバイオーム、次世代シーケンスについて学びます。
動画を視聴補足資料
結核サーベイランスのためのゲノミクスの使用
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世界結核デー：3月24日
世界結核デーは、Robert Koch博士が1882年に結核の原因菌を発表した日を記念するものです。この日は、結核の深刻な影響が続くことや、私たちが制御と予防に向けて前進する上で直面する課題について、一般の人々の認識を高めています。
参考文献
- who.int/news-room/fact-sheets/detail/tuberculosisWHO.com
- Castro RAD、Borrell S、Gagneux S。結核菌における抗菌薬耐性の宿主内進化。FEMS Microbiol Rev. 2021 Aug 17;45(4) doi: 10.1093/femsre/fuaa071