ターゲットNGSを使用してコストを削減し、解析を高速化
ターゲット化した微生物シーケンシングとは、複雑なサンプル内で、微生物のDNA/RNA配列を非微生物のDNA/RNAから効率的に区別する方法です。これにより、研究者は目的の微生物を効率的に同定し、特性評価を行うことができます。次世代シーケンシング（NGS）の能力を活用することで、アンプリコンシーケンシングやハイブリダイゼーション（ハイブリッド）キャプチャー濃縮などの技術によって、シーケンシングのコストが削減され、データ解析を効率化することができます。
お客様の次回のワークフローからは、当て推量を排除します。NGSワークフローファインダーは、自信を持ってシーケンスができるように、パーソナライズされたソリューションの推奨事項とリソースを提供します。
アンプリコンシーケンシングとハイブリッドキャプチャーは、ターゲットシーケンスを行うための一般的な手法です。それぞれの手法については、研究の目的に応じて異なる考慮事項があります。アンプリコンシーケンシングは、特定のゲノム領域における遺伝的変異を解析するための非常に的確な手法です。この手法では、小さなゲノムや目的とする特定領域をターゲットにして増幅するように設計されたオリゴヌクレオチドプライマーを使用した後で、NGSで解析します。ハイブリッドキャプチャーは、目的のゲノム領域に特異的なビオチン化プローブを使用する手法です。一度結合すると、これらのハイブリッド化したゲノム断片は、ストレプトアビジンを使って捕捉され、増幅とシーケンシングが行われます。
| アンプリコンシーケンス | ハイブリッドキャプチャー | |
|---|---|---|
| ターゲット | ターゲット数が少ない場合 |
ターゲット数が多い場合 |
| ユースケースの例 | 単一ウイルス変異株の追跡 |
広範な病原体サーベイランス |
| ワークフロー | よりシンプルで迅速なターンアラウンドタイム |
より複雑で時間がかかる |
今こそ精密メタゲノム（PMG）の時代です。ハイブリッドキャプチャーエンリッチメントによる精密メタゲノムは、複雑なサンプル中の病原体を検出し、特性評価を行うための革新的なソリューションです。このeBookでは、その理由についてご紹介しています。PMGによる公共衛生、ワークフロー、および応用分野の改善についても詳しくご紹介しています。
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A low- to mid-throughput NGS assay to identify and track the emergence and prevalence of novel SARS-CoV-2 variants.
Illumina Microbial Amplicon Prep–Influenza A/B
A streamlined whole-genome NGS library prep kit for high-impact research and public health surveillance of influenza A and B viruses.
Illumina Microbial Amplicon Prep (IMAP)
A flexible and streamlined NGS library prep kit that enables various public health surveillance and microbial research applications.
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
A targeted NGS-based assay for sequencing mycobacterium, M. tuberculosis complex (MTBC) strains, and antimicrobial resistance markers.
Simple, accessible benchtop sequencing for targeted sequencing applications.
A powerful and compact system ideal for rapid, cost-effective microbial sequencing applications.
Combine proven NGS technology with tunable output to enable sequencing and array capabilities across a range of applications.
Empower discoveries with a comprehensive workflow from start to finish.
This app is designed to analyze sequencing libraries generated from Illumina hybrid capture (enrichment) panels or tiled amplicon panels (ie COVIDseq).
Interactive visualization and easy interpretation of results from the Deeplex Myc-TB targeted amplicon kit.
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
A streamlined workflow offering highly sensitive detection and characterization of common respiratory viruses, including SARS-CoV-2 strains.
Whole-genome sequencing of over 200 RNA and DNA viruses and subtypes identified as high-risk to public health.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
Library prep and enrichment kit that delivers highly sensitive, comprehensive respiratory pathogen identification and antimicrobial resistance insights.
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
A library prep and enrichment kit that enables sensitive, culture-free detection and analysis of common and underrecognized uropathogens and AMR genes.
Combine proven NGS technology with tunable output to enable sequencing and array capabilities across a range of applications.
Empower discoveries with a comprehensive workflow from start to finish.
Advanced chemistry, optics, and informatics combine to deliver exceptional speed and data quality, outstanding throughput, and scalability.
DRAGEN Microbial Enrichment Plus
This app is designed to analyze sequencing libraries generated from Illumina microbiology enrichment based (hybrid-capture) panels, including the Viral Surveillance Panel v2 and Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit.
この方法により、微生物学者は細菌の多様性を評価し、さまざまな環境における微生物の存在量を検出することができます。また、他の方法では分析が困難な（または不可能な）培養不可能な微生物を研究することもできます。その詳細をご紹介します。
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