NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、細胞遺伝学研究のために国際コミュニティーからの最新情報を活用した初のSNPベースのヒトマイクロアレイです。
Infinium CytoSNP-850K BeadChip
コンソーシアムで構築された一塩基多型ベース（SNP）のマイクロアレイで、体質研究やがん研究のために細胞遺伝学的に関連する3,262の遺伝子の包括的なカバレッジを提供します。
概要
主な特長
専門家の情報に基づいた包括的なカバレッジ
遺伝子リストは、「臨床ゲノミクスのための国際協力（ICCG）1」および「がんゲノミクスコンソーシアム（CGC）2」のコンテンツに基づいて定義され、細胞ゲノム活性の全体像を提供します。
低レベルモザイクの高検出感度
SNPターゲットに対して高い特異性を持つ長い50-merプローブを使用すると、低レベルのモザイクに対する感度が向上し3、コピー数中立のヘテロ接合性欠失（LOH）に対する高解像度が得られます。15倍の高いビーズ冗長性により、ゲノム全体にわたって正確なコピー数バリアント（CNV）およびヘテロ接合性の欠如（AOH）コールを行うためのSignal to Noise比（SN比）が向上します。
仕様
| アッセイ時間 | 3日 |
|---|---|
| アッセイの種類 | Infinium HD Super |
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム |
| がんの種類 | 血液学, 固形腫瘍 |
| 説明 | Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。 |
| ハンズオンタイム | 自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分 |
| インプット量 | 200 ng DNA |
| システム | NextSeq 550システム, iScan |
| 手法 | 細胞遺伝学アレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ |
| 核酸の種類 | DNA |
| マーカー数 |
固定マーカー：~848,000 カスタムマーカーアドオン容量：なし |
| サンプル数 | アレイあたり8サンプル |
| サンプルスループット | iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 |
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織, 血液, 唾液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, コピー数バリアント（CNV） |
必要な製品
選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。
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件
アプリケーション
Infinium CytoSNP-850K BeadChipマイクロアレイには、ゲノムにまたがる約85万のSNPが含まれ、関連性が知られている3,262の遺伝子を包括的にカバーしています。これにより、研究者が、体質やがんのアプリケーションに対する染色体異常の影響を研究できるようにします。
ワークフローの例
関連するアプリケーションと手法
次世代シーケンサー（NGS）とアレイを併用することで、染色体異常の細胞遺伝学的解析が可能となり、体質やがんの研究に役立てることができます。
染色体マイクロアレイは、体質性疾患に関連するコピー数とアリル寄与の不均衡を高い信頼性で検出します。
イルミナのがん研究向けNGSとマイクロアレイテクノロジーが、がんゲノム分野における革新を牽引します。
ドキュメント
製品資料
Support documentation
- Infinium CytoSNP-850K BeadChipチェックリスト
- Infinium LiHaおよびInfinium RoMa操作マニュアル
- Infinium Global Clinical Research Array Documentation
- Infinium Assay Lab Setup and Procedures Guide
- Infinium CytoSNP-850K BeadChip Assay Reference Guide
- Infiniumアッセイ消耗品および機器リスト
- Infinium CytoSNP-850K BeadChip Assayリファレンスガイド
- CytoSNP-850K BeadChipのサポート
- All CytoSNP-850K BeadChipのサポート Support
比較する
| Infinium CytoSNP-850K BeadChip | Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8 | Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24 | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 3日 | 3日 | 3日 |
| アッセイの種類 | Infinium HD Super | ||
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム |
| がんの種類 | 血液学, 固形腫瘍 | 血液学, 固形腫瘍 | 血液学, 固形腫瘍 |
| 説明 | Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。 | 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。 | 24サンプルのInfinium Global Screening Array with Cytogenetics-24は、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子をターゲットとしています。BeadChipには約70万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能2.5 Mbを提供します。 |
| ハンズオンタイム | 自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分 | 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 | 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 |
| インプット量 | 200 ng DNA | 200 ng DNA | 200 ng DNA |
| システム | NextSeq 550システム, iScan | iScan | iScan |
| 手法 | 細胞遺伝学アレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ | 細胞遺伝学アレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ | ハイスループットジェノタイピングアレイ, 細胞遺伝学アレイ |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA |
| マーカー数 |
固定マーカー：~848,000 カスタムマーカーアドオン容量：なし |
||
| サンプル数 | アレイあたり8サンプル | アレイあたり8サンプル | 24サンプル （１アレイあたり） |
| サンプルスループット | iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 | ||
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織, 血液, 唾液 | 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液 | 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ | マイクロアレイ | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, コピー数バリアント（CNV） |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。
図
Infinium CytoSNP-850K BeadChipのカバレッジ
Infinium CytoSNP-850K BeadChipには、ゲノムにわたる約85万の実験的に選択された一塩基多型（SNP）が含まれています。この高密度SNPにより、意義のある染色体異常を発見するための高解像度解析が可能となります。
| プローブ間隔 | 平均距離 |
| ターゲット領域プローブ間隔 |
～1 kb |
| ターゲット領域の解像度 |
～10 kb |
| ゲノムバックボーンプローブ間隔 |
～5 kb |
| 全体的なプローブ間隔 |
～1.8 kb |
| 全体的な有効分解能 |
～18 kb |
Infinium CytoSNP-850K BeadChipマーカー情報ª
| マーカーカテゴリーb | iScanシステム |
| マーカーの総数 |
848,902 |
| RefSeq遺伝子 |
467,422 |
| RefSeq +/- 10 kb |
541,515 |
| ADME遺伝子 |
15,153 |
| ADME +/- 10 kb |
18,590 |
| COSMIC遺伝子 |
418,131 |
| HLAマーカー |
5145 |
| HLA遺伝子 |
276 |
| GO遺伝子 |
137,873 |
| エクソン領域 |
68,801 |
| プロモーター領域 |
26,814 |
| X染色体マーカー |
29,894 |
| Y染色体マーカー |
1197 |
| PAR/相同マーカー |
728 |
a. 値はアッセイマニフェストファイルから取得。バリエーションは、各装置BeadChipを処理するために必要なマニフェスト/製品ファイルが異なるために発生します。
b. ヒトゲノムの問題であるhg19リファレンスゲノムと比較。略語：ADME＝吸着、分布、代謝、排泄 COSMIC＝がんにおける体細胞変異のカタログ MHC＝主要組織適合性複合体 HLA＝ヒト白血球抗原 PAR＝偽常染色体領域
リソース
Infinium-Arrayによる進歩を祝して
ターゲットゲノム研究や全ゲノム研究において、卓越したデータ品質と高密度ゲノムカバレッジを実現するように設計されたInfiniumマイクロアレイ製品の包括的なスイートについてご覧ください。
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (8 Samples)
20103480
体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、1つのBeadChipと、8つのDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (16 Samples)
20103481
体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、2つのBeadChipと、16のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (48 Samples)
20103482
体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、6つのBeadChipと、48のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (96 Samples)
20103483
体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、12のBeadChipと、96のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
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よくある質問（FAQ）
FFPEサンプルは、Infinium FFPE QC KitおよびInfinium FFPE Restore Kitを使用してCytoSNP-850Kでランできます。
FFPE固有のマニフェストおよびクラスターファイルは、CytoSNP-850Kサポートページからダウンロードできます。
バッチインポートファイルは、CytoSNP-850K Lab Plannerツールを使用して作成できます。バッチインポート.txtファイルが生成されたら、「File|Batch|Batch Import」に移動し、バッチインポートファイルを見つけてから、「Open」をクリックします。
詳細については、BlueFuse Multi Software GuideのImport 24sureとBeadArray Experimentsセクションをご覧ください。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフロー。
TruSight One Sequencing Panel
高い解析感度と特異性でエクソームの疾患関連領域をターゲットにする包括的なシーケンス研究パネルです。
Infinium FFPE QCおよびDNA Restoration Kits
Infiniumアレイベースのアッセイで使用するためのサンプル品質の評価と分解FFPE DNAサンプルの修復。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
参考文献：
1. Clinical Genome Resource. www.clinicalgenome.org. Accessed December 12, 2022.
2. Cancer Genomics Consortium. www.cancergenomics.org. Accessed December 12, 2022.
3. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.
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