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    Infinium CytoSNP-850K BeadChip

    コンソーシアムで構築された一塩基多型ベース（SNP）のマイクロアレイで、体質研究やがん研究のために細胞遺伝学的に関連する3,262の遺伝子の包括的なカバレッジを提供します。

    iScanシステム…

    サンプルスループット

    アレイあたり8サン…

    サンプル数

    固定マーカー：~8…

    マーカー数

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    概要

    Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、SNPベースのヒトマイクロアレイで初めて、細胞ゲノム研究のために国際コミュニティからの最新の情報を活用しました。

    主な特長

    • 15倍の冗長性を持つ約850K SNPを含む徹底的なカバレッジ、および3,262の用量感受性遺伝子の包括的カバレッジ

    • ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）を含む幅広いサンプルタイプで再現可能なデータ

    • 強力な解析ソフトウェアが、データを解析するための統合フレームワークを提供します

    専門家の情報に基づいた包括的なカバレッジ

    遺伝子リストは、「臨床ゲノミクスのための国際協力（ICCG）1」および「がんゲノミクスコンソーシアム（CGC）2」のコンテンツに基づいて定義され、細胞ゲノム活性の全体像を提供します。 

    低レベルモザイクの高検出感度

    SNPターゲットに対して高い特異性を持つ長い50-merプローブを使用すると、低レベルのモザイクに対する感度が向上し3、コピー数中立のヘテロ接合性欠失（LOH）に対する高解像度が得られます。15倍の高いビーズ冗長性により、ゲノム全体にわたって正確なコピー数バリアント（CNV）およびヘテロ接合性の欠如（AOH）コールを行うためのSignal to Noise比（SN比）が向上します。

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    仕様

    アッセイ時間 3日
    アッセイの種類 Infinium HD Super
    自動化機能 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム
    がんの種類 血液学, 固形腫瘍
    説明 Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。
    ハンズオンタイム 自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分
    インプット量 200 ng DNA
    システム NextSeq 550システム, iScan
    手法 細胞遺伝学アレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ
    核酸の種類 DNA
    マーカー数 固定マーカー：~848,000
    カスタムマーカーアドオン容量：なし
    サンプル数 アレイあたり8サンプル
    サンプルスループット iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。
    特殊なサンプルタイプ FFPE組織, 血液, 唾液
    生物種カテゴリー ヒト
    テクノロジー マイクロアレイ
    バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, コピー数バリアント（CNV）

    必要な製品

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    よくある質問（FAQ）

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    NovaSeq Xシリーズの注文

    進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

    MiSeq Reagent Kit v3

    以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

    TruSight Oncology 500

    すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

    Illumina DNA Prep

    幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフロー。

    参考文献:

    1. Clinical Genome Resource. www.clinicalgenome.org. Accessed December 12, 2022.

    2. Cancer Genomics Consortium. www.cancergenomics.org. Accessed December 12, 2022.

    3. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.

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