Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChip

このコンソーシアムが構築したアレイは、先天性疾患およびがん研究のための細胞遺伝学的関連遺伝子を包括的にカバーします。 続きを読む...
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製品のハイライト

Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChipは、SNPベースのヒトマイクロアレイで初めて、細胞ゲノム研究のために国際コミュニティからの最新の情報を活用しました。遺伝子リストは、International Collaboration for Clinical Genomics(ICCG)1およびCancer Genomics Consortium(CGC)2のコンテンツに基づいて定義され、細胞ゲノム活性の包括的なビューを提供します。* この強化されたSNPカバレッジにより、遺伝性疾患に関連する領域で10 kbという小さなコピー数コールが可能になります。

憲法およびがんのアプリケーションに対する徹底したカバレッジ

Infinium CytoSNP-850K v1.3 BeadChipは、実績のあるプラットフォームで細胞遺伝学的に関連する遺伝子を包括的にカバーし、研究者が他の技術では見逃される可能性のある貴重な情報を見つけるのに役立ちます。これには、体質的アプリケーションとがんアプリケーションの両方で既知の細胞遺伝学に関連する3,262の遺伝子を網羅した、ゲノム全体にわたる約850,000の実験的に選択された一塩基多型(SNP)が含まれます。

低レベルモザイクの高感度検出

Infiniumアレイテクノロジーのユニークな特性は、SNPターゲットに対する特異性の高い長い50merプローブの使用です。これにより、低レベルのモザイク3に対する感度が高まり、コピー中立のヘテロ接合性喪失(LOH)に対する高解像度が得られます。さらに、各SNPは少なくとも15倍の冗長性で表され、正確なコピー数変動(CNV)およびヘテロ接合性(AOH)コールの不在をゲノム全体で行うためのシグナル対ノイズ比を増加させます。CNVコールを正確に行うには、わずか10個の連続プローブが必要で、Infiniumアッセイの高性能レベルを示しています。

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参考文献
  1. International Collaboration for Clinical Genomics
  2. Cancer Genomics Consortium
  3. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. 一塩基多型アレイ解析によって同定されたモザイク、キメラ、および片親の解剖のメカニズム。 Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003。

*ICCGおよびCGCは、以前は国際細胞遺伝学アレイ標準(ISCA)およびがん細胞遺伝学マイクロアレイコンソーシアム(CCMC)でした。