Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8

このマイクロアレイで、先天性疾患、がん研究、ファーマコゲノミクス(PGx)、エクソームコンテンツに関連する臨床研究バリアントをプロファイルします。

概要

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、約180万のプローブを含むスケーラブルで費用対効果の高いマイクロアレイで、そのうち16万のプローブは、4,800を超える階層化遺伝子に対する現在のGlobal Diversity Arrayのマニフェストを補完します。細胞遺伝学研究コンソーシアムからの意見を基に補足プローブを選択し、既存のプローブ配置を空間的に考慮し、コピー数バリエーション解析で最適なパフォーマンスを提供するために、エクソンの近くに戦略的に局在化しました。

  • 重複、欠失、増幅、コピー数中立的なヘテロ接合性欠失、モザイク現象など、ヒトゲノムの構造的変異を検出します。

  • 体質性疾患、がんなどの細胞ゲノムの変化を調べます。

  • PCRフリーのInfinium HDアッセイを使用して、サンプルあたりわずか200 ngのDNAで、唾液、血液、口腔粘膜スワブなどの複数のサンプルタイプを処理します。

  • 適切なFFPEクラスターファイルとともに使用する場合、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ペア腫瘍/正常サンプルを解析します。

幅広い臨床研究アプリケーション

マーカーは、リスクプロファイリング、ファーマコゲノミクス、健康特性評価、疾患発見など、さまざまな研究アプリケーションのために、ClinVar、CPIC、PharmGKBなどの臨床研究データベースから選定されました。


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Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8 Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium CytoSNP-850K BeadChip
アッセイ時間 3日 3日
Automation capability Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader
Cancer type Hematologic, Solid tumor Hematologic, Solid tumor
説明 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。 Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。
ハンズオンタイム 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA
システム iScan iScan NextSeq 550 Desktop Sequencer, iScan
手法 Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array
Nucleic acid type DNA DNA DNA
サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル
Specialized sample types Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva FFPE tissue, Blood, Saliva
Species category ヒト ヒト ヒト
テクノロジー Microarray Microarray Microarray
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)

Infinium GDACyto-8 v1.0 Kit, 16 Sample (Includes array and consumables)

20066507

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics, 16 Samples Kitは、疾患にフォーカスした汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと、高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイは、合計約180万のバリアントです。各キットには、BeadChipが2個と、16のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GDACyto-8 v1.0 Kit, 48 Sample (Includes array and consumables)

20066508

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics, 48 Samples Kitは、疾患に焦点を合わせた汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと、高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイは、合計約180万のバリアントです。各キットには、6つのBeadChipと、48のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GDACyto-8 v1.0 Kit, 96 Sample (Includes array and consumables)

20066509

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics, 96 Samples Kitは、疾患にフォーカスした汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと、高度な細胞遺伝学解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイは、合計約180万のバリアントです。各キットには、12個のBeadChipと、96のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GDACyto-8 v1.0 Kit, 384 Sample (Includes array and consumables)

20066510

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics, 384 Samples Kitは、疾患に焦点を合わせたゲノムワイドバックボーンと、高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイは、合計約180万のバリアントです。各キットには、48個のBeadChipと、384のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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