Infinium Global Diversity Array-8 Kit

臨床研究用バリアントの卓越したカバレッジと、遺伝型スクリーニング用に最適化された多民族ゲノムワイドなコンテンツを組み合わせたBeadChip。

1週間に約1,728サンプル

サンプルスループット

アレイあたり8サンプル

サンプル数

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量:最大175,000。

マーカー数

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Infinium Global Diversity Array-8キットは、製造中止となったInfinium Multi-Ethnic Global、Multi-Ethnic AMR/AFR、Multi-Ethnic EUR/EAS/SASキットに代わる推奨品です。Global Diversity Arrayは、Multi-Ethnic Kitsの最新版です。

概要

Infinium Global Diversity Array 8-Kit(GDA)BeadChipは、最適化された多民族のゲノムワイドなコンテンツを備えた強力で費用対効果の高いアレイです。

主な特長

  • さまざまなアプリケーションに対応する臨床研究バリアントを幅広くカバーする最新版

  • 最適化されたコンテンツにより研究の多様性を実現

  • ハイスループットでスケーラブルなワークフローにより、ユーザーは、データを迅速に収集し、レポートすることが可能となります

All of Usプログラムによって選択

GDAは、このNIHプレシジョンメディシンイニシアチブによって信頼されるマイクロアレイの市販版で、>1M0万人の人々からデータを収集して健康転帰を向上させます。

バリアントカバレッジの最大化

ゲノムの集団横断的インピュテーションカバレッジのための高密度一塩基多型(SNP)グローバルバックボーンにより、多様な母集団におけるポリジェニックリスクスコアの開発と遺伝的構造の特徴付けが可能になります。

 

多民族コンテンツ

ロバストなゲノムワイドスキャフォールドは、アメリカ大陸のアフリカ系集団における喘息に関するコンソーシアム(CAAPA)およびゲノミクスと疫学を使用した人口構造(PAGE)との共同研究を通じて、世界的な集団における一般的なバリアントおよび低頻度のバリアントにタグ付けするように設計されました。コンテンツには、> アフリカ系の1K全ゲノムシーケンスと南北アメリカ全土の集団が含まれます。

 

 


仕様


必要な製品

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

DesignStudioを使用してコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なオプションのアドオンコンテンツのリストから選択できます。ブースターアドオンコンテンツが利用可能です:

  • 神経変性疾患(約7.5万SNP)

  • 腫瘍学(~9万SNP) 

  • キャリアスクリーニング(解釈のためのIgentify社とのパートナーシップ)

在庫状況と価格については、担当営業にご確認ください。

/ 結果

アプリケーション

Infinium Global Diversity Array-8 Kitは、集団規模の遺伝子研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究向けに最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツを備えた強力で費用対効果の高いBeadChipです。  

ワークフローの例

1
コンテンツを選択

Infinium Global Diversity Array

3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションとメソッド

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Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 v2.0 Kit Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
Assay type Infinium LCG Infinium LCG Infinium HTS Infinium LCG
Automation capability Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader
説明 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。

Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGxは、8サンプルのBeadChip上に構築されており、>190万のマーカーを含んでいます。ファーマコゲノミクス(PGx)研究用に市販されている最も包括的なジェノタイピングマイクロアレイであり、疾患や多様性の研究やその他のアプリケーションにも対応しています。  

Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。

Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 BeadChipは、キャリアスクリーニング研究を拡張し、Global Diversity Arrayのバックボーンに45,000を超えるインパクトの高いマーカーを備えています。Igentify Analyzeソフトウェアは解析を簡素化し、主要な障害に対する高い検出率を可能にします。 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA
システム iScan iScan iScan iScan iScan
手法 Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA DNA
マーカー数

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量:最大175,000。

合計1,933,117マーカー、カスタムアドオン容量175,000

654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量: 最大100,000。 

サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり24サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル
サンプルスループット 1週間に約1,728サンプル 1週間に約1,728サンプル 1週間に約5,760サンプル
サンプルタイプ Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva
Species category ヒト ヒト ヒト ヒト ヒト
テクノロジー Microarray Microarray Microarray Microarray
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Chromosomal abnormalities, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)

選択ツール:

Infinium Global Diversity Arrayのコンテンツ

内側のパイは、ゲノムワイドカバレッジ、臨床研究、品質管理(QC)のために選択されたアレイの割合を示しています。外側のリングは、1kGP2に存在するユニークなバリアントに対する重み付けされた参照グローバル対立遺伝子頻度を示しています。カウントは、固有のバリアントを表します。

Global Diversity Arrayの臨床研究コンテンツ

コンテンツは、科学的に認知されたデータベースから専門的に選択され、臨床研究アプリケーションのための非常に有益なアレイを作成しました。バリアント数は変更される場合があります。

Global Diversity Arrayの幅広いファーマコゲノミクスマーカー

CPICガイドラインとPharmGKBデータベースに基づいて選択されます3。PGx公開データベースバリアント、PharmGKB、PharmVar、CPICにアノテーションされたバリアント。ゲノムワイドPGxカバレッジには、ターゲットインピュテーションタグSNPおよびCPICレベルA CNVタグを含む拡張ADME遺伝子またはCPICレベルA遺伝子に位置するマーカーが含まれます。

Global Diversity Arrayの疾病カテゴリーを幅広く網羅

(A)ClinVar米国医科遺伝学およびゲノミクス大学(ACMG)アノテーションに従って、病理分類の範囲別に分類されたバリアント。(B)ClinVarデータベース内のカテゴリー別のGlobal Diversity Array臨床研究コンテンツ。バリアント数は変更される場合があります。

グローバルダイバーシティアレイ上のQCマーカー

アレイ上のQCバリアントは、性別判定、大陸の祖先、ヒトの同定など、サンプル追跡のためのさまざまな機能を可能にします。

リソース

イルミナのPolygenic Risk Scoreソリューションは、トランスレーショナル研究者向けの包括的で実装が簡単な、汎用性の高いゲノム解析ツールセットです。

固定コンテンツ (4)

Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (16 samples)

20031669

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには2つのBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (48 Samples)

20031810

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度で切断可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには6つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (96 samples)

20031811

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、12個のBeadChipと、96個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (384 Samples)

20031812

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには48個のBeadChipと、384個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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追加製品 (4)

Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (16 Samples)

20031813

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには2つのBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (48 Samples)

20031814

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、6つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (96 Samples)

20031815

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、12個のBeadChipと、96個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (384 Samples)

20031816

Global Diversity Array(GDA)は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、48個のBeadChipと、384個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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よくある質問(FAQ)

Infinium GDAは、イルミナのヒトアレイポートフォリオの中で、バリアントカバレッジあたりのコスト効率が最も高く、ジェノタイピング投資に対するリターンを最大化するプレシジョンメディシンプログラムに最適です。Infinium GDA with Enhanced PGx Contentは、PGx研究に利用できる最も包括的なマイクロアレイで、市販されているすべてのマイクロアレイと比較できます。1 違いの詳細については、 Infinium GDA with Enhanced PGx Content製品ページを参照してください。

ポリジェニックリスクスコア(PRS)は、特定の複雑な状態または疾患の発症リスクを高める遺伝子変異の総数を表します。Global Diversity Array 8-Kitにより、研究者は、多様な集団におけるPRS評価を開発することを可能にします。  ポリジェニックリスクスコアの詳細はこちら。

/ 結果
参考文献
  1. Data calculations on file. Illumina, Inc. March 2021.

  2. The 1000 Genomes Project. 1000 genomes.org. Accessed August 24, 2021.

  3. PharmGKB, The Pharmacogenomics Knowledgebase. www.pharmgkb.org. Accessed August 4, 2021.

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