品質管理のためのiSeq 100 システムの使用
Texas A&M AgriLifeのゲノミクスおよびバイオインフォマティクス担当ディレクターであるCharlie Johnsonが、品質管理のためにiSeq 100シーケンスシステムとNovaSeq 6000 システムをどのように組み合わせているか、そしてiSeq 100システムがワークフローにとって重要な存在になっていることを語っています。
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イルミナの次世代シーケンサー(NGS)テクノロジーのパワーを、ラボですぐに使える、使いやすく安価なエコシステムで活用しましょう
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イルミナのポートフォリオの中で最も手頃な価格のコンパクトなベンチトップシーケンスシステムの舞台裏をご覧になり、ラボでNGSのパワーを活用することがいかに簡単かをご覧ください。
相補型金属酸化膜半導体(CMOS)技術のスピードと手頃な価格、およびSequence by Synthesis(SBS)ケミストリーの精度を活用し、ほぼすべてのラボで強力なNGS技術の導入を可能にすることで、iSeq 100システムは、ほぼすべてのラボで強力なNGS技術を導入することが可能にします。
iSeq 100 システム、qPCRやサンガーシーケンスと比較して、より高いデータ分解能とより深いカバレッジを提供することで、結果を得るまでの時間を短縮し、ハンズオンステップを減らすことで、バリアントコーリングまたは低頻度アレルに対して統計的に高い信頼度を実現します。1,2
iSeq 100 システム、大規模なシーケンスシステムやアウトソーシングと比較して、迅速で費用対効果の高い小規模ラン、アウトソーシングへの依存解消、シーケンスプロセスの最初から最後までの制御を提供します。
iSeq 100 システム、サポートされる最長リード長で最大1.2 Gbの出力を備え、スモールゲノムシーケンス、ターゲット遺伝子シーケンス、遺伝子発現プロファイリングなど、DNAおよびRNAシーケンスの幅広いアプリケーションに対応する高速マルチプレックスシーケンスを提供します。
ViromicsのラボリードサイエンティストであるWestmead Institute for Medical ResearchのJohn-Sebastian Eden博士は、シーケンスプロジェクトを社内で行う体制を整えました。iSeq 100 システムに決定した理由と方法をご覧ください。
iSeq 100 システム、迅速で費用対効果の高い遺伝子解析を行うあらゆるラボに最適な、包括的で合理化されたワークフローです。
Clarity LIMSソフトウェアまたは既存のLIMSシステムでワークフローをシームレスに管理できます。
幅広いアプリケーション向けの高性能ライブラリー調製キットでライブラリーを調製します。
実績のあるイルミナのSBSケミストリーを採用したすぐに使用できる試薬で、最短9.5時間でシーケンスを生成できます。
装置上のソフトウェア、Local Run Manager、およびタッチスクリーンインターフェースを使用してシーケンスランを監視および解析します。
BaseSpace Sequence Hubにあるアプリを使用して、結果を解釈し、共有します。
iSeq 100 システム、1ランあたり最大1.2 Gbの出力範囲、最適化されたライブラリー調製キット、高解像度と分析感度を備え、スモールゲノムシーケンス、16Sメタゲノム研究、遺伝子編集検証など、幅広いアプリケーションに対応する汎用性の高いオプションです。
Texas A&M AgriLifeのゲノミクスおよびバイオインフォマティクス担当ディレクターであるCharlie Johnsonが、品質管理のためにiSeq 100シーケンスシステムとNovaSeq 6000 システムをどのように組み合わせているか、そしてiSeq 100システムがワークフローにとって重要な存在になっていることを語っています。
実証済みのアンプリコンケミストリーは、がん関連のターゲットリシーケンスアプリケーション向けの業界最先端のシーケンステクノロジーと融合しています。
iSeq 100システム |
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ランタイム(範囲) | 9~19時間 | 約4~15.5時間 | 8~44時間 |
1ランあたり最大アウトプット | 1.2 Gb | 30 Gb | 540 Gb |
ランあたり最大シングルリード数 | 4M | 100億シングルリード 200億ペアエンドリード |
1.8億シングルリード 3.6億ペアエンドリード |
データ解析の提供b | BaseSpace Sequence Hub、Illumina Connected Analytics、オンプレミスDRAGEN サーバー | 装置上: LRM解析モジュール クラウド: BaseSpace Sequence HubおよびIllumina Connected Analyticsで利用可能な、DRAGEN解析アプリケーションの幅広いメニュー オンプレミス: DRAGEN解析のアプリケーションの幅広いメニュー |
装置上: DRAGEN解析のパイプラインのカスタムメニュー クラウド: BaseSpace Sequence HubおよびIllumina Connected Analyticsで利用可能な、DRAGEN解析アプリケーションの幅広いメニュー オンプレミス: DRAGEN解析のアプリケーションの幅広いメニュー |
a. 100Mフローセル仕様に基づく最大出力。50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムについてのみ2025年から利用可能になります。
b. 専用のDRAGEN サーバーがイルミナシーケンサーに装備されており、Illumina Run Managerを用いたシーケンスランの一部として二次解析を計画する際に使用できます。オンプレミスのDRAGEN サーバーは、シーケンスシステムと直接接続していませんが、コマンドラインを介してIlluminaシーケンスシステムからデータを取り込み、処理することができます。
次世代シーケンサー(NGS)について学び、シーケンスプロジェクトを開始するのに適した製品を選択するための教育リソースとサポートリソースをご覧ください。
ステップバイステップのガイドとトレーニングビデオを使用して、iSeq 100 システムを開始する方法を学びます。ラボにNGSを持ち込むのがいかに簡単かをご覧ください。
NGSデータ解析プロセスでは、ほとんどの手作業が取り除かれています。Local Run ManagerソフトウェアはすべてのiSeq 100 システムにインストールされ、装置上のデータ解析を自動的に実行します。このソフトウェアには、シーケンスランの開始、ランステータスのモニタリング、結果の表示、およびデータ解析のための使いやすいタッチスクリーンインターフェースがあります。
iSeq 100 システムは自分で簡単にインストールできます。開始にあたっては、さまざまなサポートリソースを利用できます。イルミナのサイエンティストとエンジニアが、オンラインまたは対面でサポートとトレーニングを提供し、ラボのスタッフが迅速に対応できるよう支援します。長期メンテナンスの場合、システムは1年間保証の対象となり、ダウンタイムを最小限に抑えるために交換機器またはフィールドサービスエンジニアサポート(地域によって異なります)が含まれます。
参考文献
この小型で強力なベンチトップシーケンスシステムのメリットをラボが享受できるかどうかの判断にサポートを受けてください。iSeq 100 システムの詳細については、今すぐお問い合わせください。
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