データ解析を簡単に

Local Run Managerは、iSeq 100システム上でデータ解析とラン管理を自動化します

iSeq 100 システム ソフトウェアツール

iSeq 100システムは、Local Run Managerソフトウェアが装置本体にインストールされています。Local Run Managerにより、実験計画の作成、シーケンスランの進捗モニタリング、シーケンス後のデータ解析が簡単に行えます。操作はタッチスクリーンを使って、ウェブブラウザを用いて簡単に行えます。

iSeq 100システムでのシーケンスランは、適切な解析モジュールと実験で使用したライブラリー調製キットを選択するだけで開始できます。シーケンスが完了するとソフトウェアは自動的にデータ解析を実行し、レポート形式で結果が出力されます。このレポートはiSeq 100システム本体上でも、ローカルエリアネットワーク上にある離れたコンピューターからでも閲覧できます。Local Run Managerは現在、以下の解析モジュールを提供しています。

Result count:  11

Language
Systems
Available Analysis Modules
TruSight Tumor 15解析モジュール
TruSight Tumor 15解析モジュール

固形がんに関連する15遺伝子を対象としたTruSight Tumor 15 パネルを使って調製したライブラリーの解析を行います。

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Small RNA解析モジュール
Small RNA解析モジュール

データベースに対して得られたリードの相同性検索を行い、ヒットした結果を出力します。オプションとして、新規の前駆体の検出、二群間の発現差解析を実行できます。

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RNA fusion 解析モジュール
RNA fusion 解析モジュール

TruSeq RNA Fusion パネルキットを使って調製した RNA ライブラリーのリードをアラインし、融合を検出します。

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リシーケンス解析モジュール
リシーケンス解析モジュール

小さなゲノムの全ゲノムシーケンスで得られたリードをゲノムに対してアライメントを行い、バリアント解析を行います。

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DNA濃縮解析モジュール
DNA濃縮解析モジュール

リードを全ゲノムの参照配列にアラインし、特定の対象領域でバリアント解析を行います。

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RNA アンプリコン解析モジュール
RNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina RNA ターゲットパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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Targeted RNA Module
Targeted RNA Module

Enables streamlined differential expression analysis of TruSeq Targeted RNA panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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GenerateFASTQ解析モジュール
GenerateFASTQ解析モジュール

デマルチプレックスを行いサンプルごとのFASTQファイルを生成します。

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DNA アンプリコン解析モジュール
DNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina DNA パネルと TruSeq アンプリコンパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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Amplicon Module
Amplicon Module

Enables streamlined variant detection of TruSeq Amplicon panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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アンプリコンDS解析モジュール
アンプリコンDS解析モジュール

TruSight Tumor 26およびデュアルプール(二本鎖)用TruSeqカスタムアンプリコンパネルで調整したライブラリーの解析を行います。

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解析モジュールのダウンロードまたはサポートのご依頼

特定の解析ソフトウェアモジュールのダウンロードやLocal Run Managerに関するテクニカルサポート情報へのアクセスは以下のリンクをご利用ください。

カスタムアッセイのデザインやデータ解析のカスタマイズに関心をお持ちのお客様を対象に、 iSeq 100システムは以下のソフトウェアソリューションにも対応しています。

DesignStudio
DesignStudioを用いたカスタムアッセイデザイン

DesignStudioソフトウェアは、カスタムシーケンスアッセイやカスタムマイクロアレイアッセイの作成をサポートします。このウェブベースのアッセイデザインツールは、ターゲットの選択、デザインの送信とレビュー、および必要なキットの購入を効率化します。

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BaseSpace Sequence Hub
BaseSpace Sequence Hubによるデータ解析

BaseSpace Sequence Hubは、データの解析、管理、共有のための強力なコンピューティング環境です。イルミナ装置と統合すると、ランのセットアップ、進捗のモニタリング、およびデータを直接クラウドに連続的にアップロードできます。またBaseSpace Sequence Hubでは、キュレーションされたデータ解析アプリ一式を利用できます。

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BaseSpace Clarity LIMS
BaseSpace Clarity LIMS

BaseSpace Clarity LIMSは、ラボにおけるサンプルのトラッキングや手順とワークフローの最適化に役立つラボ情報管理システムです。日常的な業務を自動化し、ラボのエコシステムと融合します。

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