データ解析を容易にする

Local Run Managerは、iSeq 100システムでのデータ解析とラン管理を自動化します

iSeq 100システムソフトウェアツール

各iSeq 100システムは、装置にインストール済みのLocal Run Managerソフトウェアとともに提供されます。Local Run Managerでは、実験の計画、進行に応じたシーケンスランのモニタリング、シーケンス完了後のデータ解析を簡単に行うことができます。装置制御ソフトウェアと統合され、使いやすいタッチスクリーンでウェブブラウザから簡単にアクセスできます。

iSeq 100システムでシーケンスランを開始する場合は、実験で使用する適切な解析モジュールとライブラリー調製キットを選択するだけです。このソフトウェアは、シーケンス完了後に装置上のデータ解析を自動的に実行し、直感的なレポートで結果を提供します。これらのレポートは、iSeq 100システム自体で表示することも、同じローカルエリアネットワーク上のコンピューターからリモートで表示することもできます。Local Run Managerは現在、以下の解析モジュールを提供しています。

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systems
Available Analysis Modules
アンプリコンDS解析モジュール
アンプリコンDS解析モジュール

TruSight Tumor 26およびデュアルプール(二本鎖)用TruSeqカスタムアンプリコンパネルで調整したライブラリーの解析を行います。

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リシーケンス解析モジュール
リシーケンス解析モジュール

小さなゲノムの全ゲノムシーケンスで得られたリードをゲノムに対してアライメントを行い、バリアント解析を行います。

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Targeted RNA Module
Targeted RNA Module

Enables streamlined differential expression analysis of TruSeq Targeted RNA panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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Amplicon Module
Amplicon Module

Enables streamlined variant detection of TruSeq Amplicon panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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Small RNA解析モジュール
Small RNA解析モジュール

データベースに対して得られたリードの相同性検索を行い、ヒットした結果を出力します。オプションとして、新規の前駆体の検出、二群間の発現差解析を実行できます。

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TruSight Tumor 15解析モジュール
TruSight Tumor 15解析モジュール

固形がんに関連する15遺伝子を対象としたTruSight Tumor 15 パネルを使って調製したライブラリーの解析を行います。

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DNA濃縮解析モジュール
DNA濃縮解析モジュール

リードを全ゲノムの参照配列にアラインし、特定の対象領域でバリアント解析を行います。

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GenerateFASTQ解析モジュール
GenerateFASTQ解析モジュール

デマルチプレックスを行いサンプルごとのFASTQファイルを生成します。

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RNA fusion 解析モジュール
RNA fusion 解析モジュール

TruSeq RNA Fusion パネルキットを使って調製した RNA ライブラリーのリードをアラインし、融合を検出します。

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RNA アンプリコン解析モジュール
RNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina RNA ターゲットパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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DNA アンプリコン解析モジュール
DNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina DNA パネルと TruSeq アンプリコンパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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解析モジュールのダウンロードまたはサポートを受ける

特定の解析ソフトウェアモジュールをダウンロードするか、Local Run Managerテクニカルサポート情報にアクセスしてください。

DesignStudio
DesignStudioによるカスタムアッセイデザイン

DesignStudio Softwareは、カスタムシーケンスとマイクロアレイアッセイの作成をガイドします。このウェブベースのアッセイデザインツールは、ターゲットの選択、デザインの提出とレビュー、および完全なキットの購入を合理化します。

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BaseSpace Sequence Hub
BaseSpace Sequence Hubにおけるデータ解析

BaseSpace Sequence Hubは、データの解析、管理、共有のための強力なコンピューティング環境です。イルミナの機器と統合されているため、ランのセットアップ、進捗状況のモニタリング、クラウドへのデータの直接ストリーミングが可能です。BaseSpace Sequence Hubでは、厳選されたデータ解析アプリへのアクセスも可能です。

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BaseSpace Clarity LIMS
BaseSpace Clarity LIMS

BaseSpace Clarity LIMSは、ラボがサンプルを追跡し、手順とワークフローを最適化するのに役立つラボ情報管理システムです。ルーチンタスクを自動化し、ラボのエコシステムと統合します。

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