Local Run Managerによる直感的なデータ解析

Local Run Managerソフトウェア

自動データ解析

Local Run Manager(LRM)ソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータ解析、および結果の表示を行うために設計された統合ソリューションです。LRMソフトウェアは装置制御ソフトウェアと統合されており、MiniSeqおよびiSeq 100プラットフォーム上でウェブブラウザから直接アクセスできます。同じ使いやすいLRMソフトウェアの装置外バージョンが利用可能で、iSeqシステム、MiniSeqシステム、MiSeqシリーズ、NextSeq 550シリーズと互換性があります。

さまざまなライブラリータイプ用に設計された解析手順を実行するために、さまざまなオプションのソフトウェアモジュールが利用可能です。LRMソフトウェアは現在、以下の解析ソフトウェアモジュールと連動しています。

互換性のあるライブラリー調製キットを探す

ほとんどのLocal Run Manager解析モジュールでは、特定のラン用のライブラリー調製キットを選択するように指示されます。各Local Run Managerソフトウェア解析モジュールと互換性のあるキットを見つけてください。

互換性のあるキットを見る
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systems
Available Analysis Modules
アンプリコンDS解析モジュール
アンプリコンDS解析モジュール

TruSight Tumor 26およびデュアルプール(二本鎖)用TruSeqカスタムアンプリコンパネルで調整したライブラリーの解析を行います。

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リシーケンス解析モジュール
リシーケンス解析モジュール

小さなゲノムの全ゲノムシーケンスで得られたリードをゲノムに対してアライメントを行い、バリアント解析を行います。

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Targeted RNA Module
Targeted RNA Module

Enables streamlined differential expression analysis of TruSeq Targeted RNA panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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Amplicon Module
Amplicon Module

Enables streamlined variant detection of TruSeq Amplicon panels sequenced on Illumina sequencing systems.

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Small RNA解析モジュール
Small RNA解析モジュール

データベースに対して得られたリードの相同性検索を行い、ヒットした結果を出力します。オプションとして、新規の前駆体の検出、二群間の発現差解析を実行できます。

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TruSight Tumor 15解析モジュール
TruSight Tumor 15解析モジュール

固形がんに関連する15遺伝子を対象としたTruSight Tumor 15 パネルを使って調製したライブラリーの解析を行います。

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DNA濃縮解析モジュール
DNA濃縮解析モジュール

リードを全ゲノムの参照配列にアラインし、特定の対象領域でバリアント解析を行います。

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GenerateFASTQ解析モジュール
GenerateFASTQ解析モジュール

デマルチプレックスを行いサンプルごとのFASTQファイルを生成します。

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RNA fusion 解析モジュール
RNA fusion 解析モジュール

TruSeq RNA Fusion パネルキットを使って調製した RNA ライブラリーのリードをアラインし、融合を検出します。

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RNA アンプリコン解析モジュール
RNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina RNA ターゲットパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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DNA アンプリコン解析モジュール
DNA アンプリコン解析モジュール

AmpliSeq for illumina DNA パネルと TruSeq アンプリコンパネルを使って調製したライブラリーを、イルミナシーケンスシステムで解析したデータの効率化されたバリアント検出を可能にします。

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テクニカルサポートのお知らせ

テクニカルサポートの掲示板には、一般的な手順の詳細とよくある質問への回答が記載されています。Local Run Managerの使用の詳細については、以下の資料を参照してください。

解析モジュールのダウンロードまたはサポートを受ける

特定の解析ソフトウェアモジュールをダウンロードするか、Local Run Managerテクニカルサポート情報にアクセスしてください。

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