伝統的に、細胞および分子生物学の研究では、単一遺伝子の破壊または組み換えにより、単一遺伝子、遺伝子ファミリー、またはシグナル伝達パスウェイの機能の理解に努めます。研究者は、顕微鏡法、フローサイトメトリー、タンパク質ブロッティングなどのシグナルベースメソッドや、PCR/qPCR、サンガーシーケンシング、遺伝子発現アレイなどの分子アッセイを使用します。このアプローチは時間がかかり、必ずしも決定的な知見が得られるわけではありません。
イルミナのアレイおよび次世代シーケンサー(NGS)テクノロジーは、細胞および分子生物学研究を、タンパク質の相互作用や単一遺伝子の機能解析といった従来のメソッドを超えたものに広げられます。イルミナテクノロジーを使用すると、ゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノムを解析できます。結果は実験計画とその後の研究の情報を提供できるため、研究者は時間を節約して、早く公表できます。
シングルセルアプローチは、存在する細胞の種類と、個々の細胞がそのシステムの機能にどのように寄与しているかを明らかにすることができます。
UCSFの研究者が、シングルセルシーケンスとシングル核RNAシーケンスのサンプルバーコーディング戦略であるMULTI-Seqについて意見を交わします。このメソッドには最低限のサンプル処理のみが含まれるため、細胞生存率と内因性遺伝子発現パターンを保持します。
ウェビナーを見る研究者がCITE-Seqなどの個々の細胞で細胞外タンパク質を同時にシーケンスして検出できる方法で、疾患に関連する新しい細胞タイプと状態が明らかになります。
CITE-Seqを見るNGSがどのように疾患の細胞活動を調べ、理解するための新しい道を開くかを見ます。
高度なシーケンスとマイクロアレイアプローチで、転写、制御、エピジェネティクスなどを探ります。
複雑な組織内の各細胞に特有な生物学的特性を調査、または環境要因に対する亜集団反応の背後にある分子メカニズムを調べます。
NGSベースのRNAシーケンスを使用して、複雑な組織構造における転写活性を空間的に解決します。
シーケンスおよびアレイベースのテクニックを使用して定量的にメチル化パターンを調査し、遺伝子制御に関する有益な洞察を得ます。
ゲノムワイドまたはターゲットを絞ったアプローチを使用して、DNAの一塩基多型(SNP)、大きな構造変化などの遺伝的変異を調査します。
NGSにより、研究者がどのようにCRISPR遺伝子ノックアウトを確認し、オフターゲット効果を解析し、編集による機能的影響の評価をするかなどをご覧ください。
ATAC-Seqを使用して、単一細胞のクロマチンアクセシビリティを評価し、クロマチンの梱包とその他の要因がどのように遺伝子表現に影響するかを明らかにします。
NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステム:NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、エクソームシーケンス、ターゲットエンリッチメント、シングルセルプロファイリング、トランスクリプトームシーケンスなどの幅広い手法に加えて、新興およびミッドスループットシーケンスアプリケーションをサポートします。
NextSeq 1000および2000シングルセルRNAシーケンスアプリケーションノート:この費用対効果の高い柔軟なソリューションは、単一細胞の遺伝子発現を測定し、通常バルクサンプリング法で隠された細胞の違いを発見するための高解像度解析を提供します。このアプリケーションノートはワークフローを概説し、研究設計の例やスループットチャートなどを提供します。
ターゲットリシーケンス:NGSを用いたターゲットアプローチにより、研究者は特定の関心領域に時間、費用、データ解析を集中させることができます。
Infinium Global Screening Array:集団スケール遺伝学、バリアントスクリーニング、ファーマコゲノミクス研究、プレシジョンメディシン研究のための次世代ジェノタイピングアレイ。
MethylationEPIC BeadChip:広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。エピゲノムワイド関連解析に使用します。
Dr. Lachlan Jollyが、脳発生の細胞モデルにおける遺伝子機能について洞察を話します。
イルミナのベンチトップ型シーケンスシステムは、世界中のラボでNGSテクノロジーをより身近なものにしています。これらのシステムが、微生物学研究、がん研究などにおいて、画期的な進歩をもたらすスピード、パワー、柔軟性をどのように実現しているかをご覧ください。MiSeq i100シリーズや、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、NGS研究の目標を手の届くものにします。
Evaluating RNA sequencing options for cellular and molecular biology research including single-cell RNA sequencing
The ability to analyze gene expression signatures from individual cells is transforming the way neurons are classified.