DNAメチル化解析
遺伝子発現の制御におけるメチル化の役割についての理解
DNAメチル化解析とは？
DNAメチル化解析により、サイエンティストは、遺伝子制御に関する貴重な洞察を得て、潜在的なバイオマーカーを同定することができます。DNAメチル化の異常は、がん、肥満、依存症を含む多くの疾患プロセスに関与しています。DNAメチル化は、干ばつ、極端な温度、その他の環境変化が、農業ゲノミクスまたはアグリゲノミクスにどのように影響するかをよりよく理解する目的でも利用されています。
次世代シーケンサー（NGS）やマイクロアレイなどのハイスループットテクノロジーにより、ゲノムワイドなメチル化プロファイリング研究が可能になります。これらのテクノロジーにより、DNAメチル化の重要性を理解するための新たな方法が生まれることで、エピジェネティックな変異の機能的結果に関する新たな洞察をもたらします。
DNAメチル化の解析方法
メチル化マイクロアレイテクノロジーは、DNAメチル化を解析するための実績のあるアプローチです。これらのアレイは、ゲノム全体にわたる選択されたメチル化サイトの定量的精査を可能にし、サンプルあたりのコストを最小限に抑えるハイスループット機能を提供します。メチル化マイクロアレイの特徴：
- ハイスループット（サンプル数が多い）
- 専門的にキュレーションされたコンテンツをゲノムワイドにカバー
- 再現性
- 合理的なワークフロー
- ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルに対する検証済み
- 3,000～850,000 CpGに対応
- 他のカスタムアレイのオプションを備えた主要なヒトおよびマウスアレイで利用可能
メチル化プロファイリングの研究における使用方法
メチル化解析を使って遺伝子制御を研究する方法を、さまざまなアプリケーションから探ります。
メチロームと臨床転帰
メチル化アレイが、COVID-19やその他の感染症の研究にどのように新たな一面を加えるかについて、遺伝疫学者であるDr. Kathleen C. Barnesが論じています。
依存症へのエピジェネティックの貢献
ターゲットメチル化シーケンスにより、薬物乱用者の脳画像スキャンと相関するエピジェネティックなシグネチャーを同定します。
メチル化および転移
研究者たちは、DNAメチル化マイクロアレイやNGSを用いて、がん転移の背後にあるエピジェネティクスを調査しています。
関連ソリューション
がんにおけるエピジェネティックな変化
メチル化異常や転写因子結合など、がんにおけるエピジェネティックな変化の研究は、重要な腫瘍パスウェイにおける洞察をもたらすことがあります。
クロマチンアクセシビリティ解析
ATAC-Seqは、規制要素に関する事前知識を必要としないため、強力でエピジェネティックな探索ツールとなります。それは、ゲノム全体のクロマチンアクセシビリティを決定するための定評のある手法です。
主な製品
iScanシステム
この革新的なアレイスキャナーは、遺伝子解析のための高精度、ハイスループットのマイクロアレイスキャンが可能になります。このシステムは、高性能レーザー、光学系、検出システムを使用して、データ品質または再現性を落とすことなく、サブミクロンの解像度、ハイスループット、超高速なスキャン時間を実現します。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。エピゲノムワイド関連解析に使用します。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。エピゲノムワイド関連解析に使用します。
補足資料
メチル化シーケンス
バイサルファイト変換シーケンスなど、メチル化シーケンスの利点の詳細はこちら。
マルチオミクスデータからのエピジェネティック制御のモデリング
シングルセルマルチオミクスデータから遺伝子発現のエピジェネティック制御をモデル化する方法については、このウェビナーをご覧ください。
エピジェネティクスおよび神経精神疾患
Dr. Kristen Brennandが、疾患に関与する遺伝子やパスウェイの同定に役立てるために、どのように全ゲノムまたは全エクソームシーケンスデータを、トランスクリプトームおよびエピジェネティック情報と統合するかについてご覧ください。