NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium Methylation Screening Arrayは、集団健康調査用の手頃な価格でスケーラブルなエピゲノミクスツールです。
Infinium Methylation Screening Array-48キット
集団健康研究用に最適化された超スケーラブルなメチル化アレイ。1,000を超えるサンプル、最大数百万のサンプルの研究に最適です。
16,128 samples per week
サンプルスループット
アレイあたり48サンプル
サンプル数
概要
主な特長
ヒト集団における一般的な疾患に関する非常に有益なコンテンツ
優れたサンプル処理効率
信頼性の高いメチル化データとシンプルなインフォマティクス
仕様
| Automation capability | Automated array loader, Liquid handling robot(s) |
|---|---|
| 説明 | 集団の健康アプリケーションのための既知の一般的な疾患との関連性の高度にスケーラブルで手頃な価格でのメチル化解析。>1,000のサンプル、最大数百万のサンプルの研究に最適です。 |
| インプット量 | DNA 50 ng |
| システム | iScan |
| 手法 | Methylation array |
| Nucleic acid type | DNA |
| サンプル数 | アレイあたり48サンプル |
| Sample throughput | 16,128 samples per week |
| Specialized sample types | Low-input samples |
| Species category | ヒト |
| テクノロジー | Microarray |
| バリアントクラス | Differentially methylated cytosines |
必要な製品
EXメチル化ワークフローにはInfinium Automated Pipetting System with ILASSおよびiScanが必要です。Infiniumを初めてご使用で、まだXTスターターキットをお持ちでない場合は、Infinium EX/ XTスターターキットが必要です。AutoLoader 2.xは、iScanへのビーズチップの自動ローディング用のオプションデバイスです。
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件
アプリケーション
メチル化スクリーニングアレイは、集団健康調査のための手頃な価格の大規模エピジェネティックな解析を可能にします。
ワークフローの例
関連するアプリケーションと手法
比較する
| Infinium Methylation Screening Array-48キット | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Automation capability | Automated array loader, Liquid handling robot(s) | Automated array loader | |||
| 説明 | 集団の健康アプリケーションのための既知の一般的な疾患との関連性の高度にスケーラブルで手頃な価格でのメチル化解析。>1,000のサンプル、最大数百万のサンプルの研究に最適です。 | Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、ゲノムワイドなメチル化スクリーニングツールであり、その機能コンテンツは強化され、専門家により選択されています。本キットはiScanまたはNextSeq 550システムで処理され、サンプルプーリングやインデックス作成を必要としない、シンプルで使いやすいワークフローに従います。 | |||
| インプット量 | DNA 50 ng | 250 ng DNA | |||
| システム | iScan | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan | |||
| 手法 | Methylation array | Methylation array | |||
| Nucleic acid type | DNA | DNA | |||
| サンプル数 | アレイあたり48サンプル | アレイあたり8サンプル | |||
| Sample throughput | 16,128 samples per week | 3024 samples per week on a single iSCAN | |||
| Specialized sample types | Low-input samples | Blood, FFPE tissue | |||
| Species category | ヒト | ヒト | |||
| テクノロジー | Microarray | Microarray | |||
| バリアントクラス | Differentially methylated cytosines | Differentially methylated cytosines |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
再現性の高いメチル化の結果—(A) メチル化の結果は、Infinium Methylation Screening ArrayとInfinium MethylationEPICv2.0 BeadChipと強く相関しています。(B) メチル化の結果は、Infinium Methylation Screening Arrayで解析されたレプリケートサンプル間の優れた再現性を示しています。
Infinium Methylation Screening Array上のマーカーは、多様な形質タイプの既知の形質関連CpGに高度に富んでいます。メチル化スクリーニングアレイ（MSA）上のマーカーは、形質関連に関するエビデンスに基づいて選択され、Infinium MethylationEPICv2.0（EPICV2）上の形質エンリッチメントとの比較により表示されます。
| Infinium Methylation Screening Array-48 集団健康研究のためのターゲットメチル化スクリーニング |
|
|---|---|
| 推奨アプリケーション | 一般的な疾患の研究（非がん） 環境疫学 集団ゲノミクス 消費者ゲノミクス |
| コンテンツの焦点 | 既知の一般的な疾患特性の関連性 既知の環境曝露との関連性 細胞型特異的メチル化 中間メチル化 高MAF SNPを測定するマルチオミクス機能 |
| 総メチル化Site | 270K |
| BeadChipあたりのサンプル数 | 48 |
| DNAインプット要件 | 50 ng |
| アッセイ化学 | Infinium EX Methylation |
| 装置サポート | iScan |
| iScanシステムの最大サンプルスループットa | 16,128サンプル/週 |
| リキッドハンドリングの自動化 | Infinium自動分注システムと ILASS（必須） |
a概算値、スキャン時間、最大スループットは、ラボやシステムの構成によって異なります。ここに記載されているサンプルスループットは、AutoLoader 2.x自動アレイローディングの統合により達成されます。
Infinium Methylation Screening ArrayとInfinium MethylationEPICv2.0 BeadChipの含有量のハイレベルな比較
| Infinium Methylation Screening Array | Infinium MethylationEPIC v2.0 | |
|---|---|---|
| ユニークSite数合計 | 269,094 | 930,301 |
| CpG | 262,470 | 926,849 |
| Infiniumメチル化アレイから | 161,569 | - |
| シーケンス研究とデータベースから | 101,901 | - |
| CpH | 2776 | 2914 |
| Infiniumメチル化アレイから | 308 | - |
| シーケンス研究とデータベースから | 2468 | - |
| SNP rsID | 3848 | 538 |
| Infiniumメチル化アレイから | 64 | |
| シーケンス研究とデータベースから | 3784 |
Infinium Methylation Screening Arrayで以前に検証された形質関連含有量
| 特性カテゴリー | 形質関連をターゲットとするプローブの数 |
|---|---|
| 開発／老化 | 102,533 |
| 環境曝露 | 44,043 |
| 炎症／自己免疫疾患 | 41,894 |
| 祖先 | 31,843 |
| 性別 | 23,806 |
| 感染症 | 14,844 |
| 代謝障害 | 13,739 |
| まれな遺伝性疾患 | 13,429 |
| 神経疾患／神経発達疾患 | 8874 |
| 身体の特徴（身体形態） | 8109 |
| 精神障害 | 7280 |
| 循環器疾患 | 7007 |
| 生殖生物学／健康 | 6999 |
| 神経変性疾患 | 4733 |
| 肺／呼吸器疾患 | 1748 |
| 腎臓病 | 982 |
Infinium Methylation Screening Array-48 v1.0 Kit (48 samples)
20112611
ハイスループットの一般的な疾患研究<(>と<)>スクリーニングのための252Kマーカーで最適化されたメチル化アレイ。キットには、48サンプルBeadChipが1つ含まれており、重亜硫酸塩変換後の48サンプル処理に必要な試薬がすべて含まれています。iScanシステムとILASS搭載のInfinium自動ピペットシステムが必要です。
Infinium Methylation Screening Array-48 v1.0 Kit (96 samples)
20112612
ハイスループットの一般的な疾患研究<(>と<)>スクリーニングのための252Kマーカーで最適化されたメチル化アレイ。キットには、48サンプルBeadChipが2つ含まれており、バイサルファイト変換後の96サンプルを処理するために必要な試薬がすべて含まれています。iScanシステムとILASS搭載のInfinium自動ピペットシステムが必要です。
Infinium Methylation Screening Array-48 v1.0 Kit (1,152 samples)
20112613
ハイスループットの一般的な疾患研究<(>と<)>スクリーニングのための252Kマーカーで最適化されたメチル化アレイ。キットには48サンプルBeadChipが24個含まれており、バイサルファイト変換後の1,152サンプルを処理するために必要な試薬がすべて含まれています。iScanシステムとILASS搭載のInfinium自動ピペットシステムが必要です。
Methylation Screening Array semi-custom kits (3)
Inf Methyl Screening Array+ Kit (48 Spl)
20119540
Reagent kit for 48 samples. Contains 1 48-sample BeadChip and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
Inf Methyl Screening Array+ Kit (96 Spl)
20119541
Reagent kit for 96 samples. Contains 2 48-sample BeadChips and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
Inf Methyl Screening Array+ Kit (1152 Spl)
20119542
Reagent kit for 1,152 samples. Contains 24 48-sample BeadChips and all required reagents for EX Methylation Assay after bisulfite conversion. Sample processing requires the iScan System and Infinium Automated Pipetting System with ILASS.
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よくある質問（FAQ）
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、プロモーターとエンハンサーに特化した99%を超えるRefSeq遺伝子をカバーする約930,000のCpGサイトを搭載した包括的なゲノムワイド探索ツールです。Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、すべての遺伝子およびプロモーター領域にわたるメチル化プロファイリングが最大限の探索力を得るために必要となるプロジェクトに最適です。また、重要ながん遺伝子のカバレッジ、FFPE組織との互換性、およびコピー数バリエーションプロファイリング機能を備えているため、すべてのがんアプリケーションに最適です。
Infinium Methylation Screening Arrayは、集団健康プロジェクトにおける一般的な疾患の研究に、より費用対効果の高いメチル化スクリーニングツールを提供します。約27万のメチル化Siteは、過去10年間のエピゲノムワイド関連研究による既知の形質との関連に加え、細胞型特異的メチル化、中間メチル化、CoRSIV、SNPなどをカバーする新たなコンテンツに焦点を当てています。Infinium Methylation Screening Arrayは、大規模なエピゲノムワイド関連研究（EWAS）やバイオバンクスクリーニングプロジェクトに最適です。
包括的な製品比較表は、Infinium Methylation Screening Arrayデータシートに記載されています。
はい、メチル化スクリーニングアレイにはEXメチル化ワークフローが必要ですが、EPICv2.0ではHDメチル化ワークフローを使用します。EX Methylationは、48サンプルのEX BeadChipと自動化によって実現した新たなサンプル処理効率と、50ngという低DNAインプットを提供します。EXメチル化ワークフローには、自動リキッドハンドリング用のInfinium Automated Pipetting System with ILASSが必要です。
イルミナの製品マニフェストファイルには基本的なゲノムマッピングアノテーションが記載されていますが、Zhou Lab Infinium Annotations GitHubページでは、Infinium Methylation Screening Arrayでカバーされている形質関連などの詳細なアノテーションが記載されています。
Infinium Methylation Screening Arrayは、以下の理由により腫瘍学アプリケーションには推奨されません。
·ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）の互換性は未検証
·広く使用されているがん分類器のプローブが十分にカバーされていない
·MGMTプロモーターのメチル化は対象外
·コピー数バリエーションのプロファイル作成能力が限られている
·BeadChipあたりの最小バッチ数が48サンプルと大きいため、結果のターンアラウンドタイムが長くなる場合があります
イルミナは、メチル化スクリーニングアレイに組み込まれたInfiniumコントロールを解析するための使いやすいツールを提供しています。詳細については、メチル化アレイデータ解析のヒントページをご覧ください。
はい。サービスラボでは、GenomeStudio Methylation Module Controls Dashboardを使用してアッセイの性能を評価することができます。下流のメチル化解析には、SeSAMeなどのバイオコンダクタパッケージが推奨されます。
BeadChipあたりのスキャン時間は最長20分です。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用にメチローム全体で285Kを超えるマーカーを表示します。
Infinium Custom Methylation Kit
大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。
Infinium自動化オプションパッケージ
Infiniumアッセイ用のロボット制御ソフトウェアによる自動化オプションは、サンプル調製ワークフローを合理化し、エラーを削減します。
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