Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
Infinium Methylation Screening Arrayは、優れたコスト効率とスケーラビリティを兼ね備えた、集団健康研究向けのエピゲノミクスツールです。
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit
集団健康研究向けに最適化された、1,000サンプルから数百万サンプル規模の研究に対応する超高スケーラブルなメチル化アレイです。
16,128
サンプルスループット
48
サンプル数
概要
主な特長
ヒト集団における一般的な疾患に関する非常に有益なコンテンツ
優れたサンプル処理効率
信頼性の高いメチル化データとシンプルなインフォマティクス
仕様
必要な製品
EXメチル化ワークフローにはInfinium Automated Pipetting System with ILASSおよびiScanが必要です。Infiniumを初めてご使用で、まだXTスターターキットをお持ちでない場合は、Infinium EX/ XTスターターキットが必要です。AutoLoader 2.xは、iScanへのビーズチップの自動ローディング用のオプションデバイスです。
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件
アプリケーション
Methylation Screening Arrayは、集団健康研究向けに、コスト効率に優れた大規模なエピジェネティクス解析を可能にします。
ワークフローの例
関連するアプリケーションと手法
ドキュメント
製品資料
製品比較
| Infinium Methylation Screening Array-48 Kit | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | |
|---|---|---|
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー, Liquid handling robot(s) | 自動化アレイローダー |
| 説明 | 集団の健康アプリケーションのための既知の一般的な疾患との関連性の高度にスケーラブルで手頃な価格でのメチル化解析。>1,000のサンプル、最大数百万のサンプルの研究に最適です。 | Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、ゲノムワイドなメチル化解析ツールであり、その機能コンテンツは強化され、専門家により選択されています。本キットはiScanまたはNextSeq 550システムで処理され、サンプルプーリングやインデックス作成を必要としない、シンプルで使いやすいワークフローに従います。 |
| インプット量 | DNA 50 ng | 250 ng DNA |
| システム | iScan | NextSeq 550 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan |
| 手法 | メチル化アレイ | メチル化アレイ |
| 核酸の種類 | DNA | DNA |
| サンプル数 | アレイあたり48サンプル | アレイあたり8サンプル |
| サンプルスループット | 1週間に16,128サンプル | 1回の iSCANで1週間に3024サンプル |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル | 血液, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 差異的メチル化シトシン | 差異的メチル化シトシン |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
再現性の高いメチル化の結果—(A) メチル化の結果は、Infinium Methylation Screening ArrayとInfinium MethylationEPICv2.0 BeadChipと強く相関しています。(B) メチル化の結果は、Infinium Methylation Screening Arrayで解析されたレプリケートサンプル間の優れた再現性を示しています。
Infinium Methylation Screening Array上のマーカーは、多様な形質タイプの既知の形質関連CpGに高度に富んでいます。メチル化スクリーニングアレイ（MSA）上のマーカーは、形質関連に関するエビデンスに基づいて選択され、Infinium MethylationEPICv2.0（EPICV2）上の形質エンリッチメントとの比較により表示されます。
| Infinium Methylation Screening Array-48 集団健康研究のためのターゲットメチル化スクリーニング |
|
|---|---|
| 推奨アプリケーション | 一般的な疾患の研究（非がん） 環境疫学 集団ゲノミクス 消費者ゲノミクス |
| コンテンツの焦点 | 既知の一般的な疾患特性の関連性 既知の環境曝露との関連性 細胞型特異的メチル化 中間メチル化 高MAF SNPを測定するマルチオミクス機能 |
| 総メチル化サイト数 | 270K |
| BeadChipあたりのサンプル数 | 48 |
| DNAインプット要件 | 50 ng |
| アッセイケミストリー | Infinium EX Methylation |
| 装置サポート | iScan |
| iScanシステムの最大サンプルスループットa | 16,128サンプル/週 |
| リキッドハンドリングの自動化 | Infinium自動分注システムと ILASS（必須） |
a概算値、スキャン時間、最大スループットは、ラボやシステムの構成によって異なります。ここに記載されているサンプルスループットは、AutoLoader 2.x自動アレイローディングの統合により達成されます。
Infinium Methylation Screening ArrayとInfinium MethylationEPICv2.0 BeadChipの含有量のハイレベルな比較
| Infinium Methylation Screening Array | Infinium MethylationEPIC v2.0 | |
|---|---|---|
| 総ユニークサイト数 | 269,094 | 930,301 |
| CpG | 262,470 | 926,849 |
| Infiniumメチル化アレイ由来 | 161,569 | - |
| シーケンス研究とデータベース由来 | 101,901 | - |
| CpH | 2776 | 2914 |
| Infiniumメチル化アレイ由来 | 308 | - |
| シーケンス研究とデータベース由来 | 2468 | - |
| SNP rsID | 3848 | 538 |
| Infiniumメチル化アレイ由来 | 64 | |
| シーケンス研究とデータベース由来 | 3784 |
Infinium Methylation Screening Arrayで以前に検証された形質関連含有量
| 特性カテゴリー | 形質関連をターゲットとするプローブの数 |
|---|---|
| 開発／老化 | 102,533 |
| 環境曝露 | 44,043 |
| 炎症／自己免疫疾患 | 41,894 |
| 祖先 | 31,843 |
| 性別 | 23,806 |
| 感染症 | 14,844 |
| 代謝障害 | 13,739 |
| 希少遺伝性疾患 | 13,429 |
| 神経疾患／神経発達疾患 | 8874 |
| 身体の特徴（身体形態） | 8109 |
| 精神障害 | 7280 |
| 循環器疾患 | 7007 |
| 生殖生物学／健康 | 6999 |
| 神経変性疾患 | 4733 |
| 肺／呼吸器疾患 | 1748 |
| 腎臓病 | 982 |
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (48 samples)
20112611
ハイスループットの一般的な疾患研究とスクリーニングのための27万のマーカーを備えた最適化されたメチル化アレイ。キットには、48サンプルBeadChipが1個と、バイサルファイト変換後の48サンプルの処理に必要なすべての試薬が含まれています。iScanシステムとInfiniが必要です
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (96 samples)
20112612
ハイスループットの一般的な疾患研究とスクリーニングのための27万のマーカーを備えた最適化されたメチル化アレイ。キットには、48サンプルBeadChipが2個と、バイサルファイト変換後の98サンプルの処理に必要なすべての試薬が含まれています。iScanシステムとInfinが必要です
Infinium Methylation Screening Array-48 Kit (1,152 samples)
20112613
ハイスループットの一般的な疾患研究とスクリーニングのための27万のマーカーを備えた最適化されたメチル化アレイ。キットには、48サンプルBeadChipが24個と、バイサルファイト変換後の1,152サンプルの処理に必要なすべての試薬が含まれています。iScanシステムとIが必要です
Methylation Screening Array semi-custom kits (3)
Inf Methyl Screening Array+ Kit (48 Spl)
20119540
48サンプル用の試薬キット。48サンプルBeadChipが1個と、亜硫酸水素塩変換後のEXメチル化アッセイに必要なすべての試薬が含まれています。サンプル処理には、iScanシステムおよびInfinium Automated Pipetting System with ILASSが必要です。
Inf Methyl Screening Array+ Kit (96 Spl)
20119541
96サンプル用の試薬キット。48サンプルBeadChipが2個と、亜硫酸水素塩変換後のEXメチル化アッセイに必要なすべての試薬が含まれています。サンプル処理には、iScanシステムおよびInfinium Automated Pipetting System with ILASSが必要です。
Inf Methyl Screening Array+ Kit (1152 Spl)
20119542
1,152サンプル用の試薬キット。48サンプルBeadChipが24個と、亜硫酸水素塩変換後のEXメチル化アッセイに必要なすべての試薬が含まれています。サンプル処理には、iScanシステムおよびInfinium Automated Pipetting System with ILASSが必要です。
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よくある質問（FAQ）
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChipは、プロモーターお呼びエンハンサー領域に重点を置き、RefSeq遺伝子の99%超をカバーする約93万か所のCpGサイトを搭載した、包括的なゲノムワイド探索ツールです。全遺伝子およびプロモーター領域にわたるメチル化プロファイリングを必要とするプロジェクトに最適であり、検出性能を最大限に発揮します。また、主要ながん遺伝子のカバレッジ、FFPE組織への対応、コピー数バリエーションプロファイリング機能を備えているため、あらゆるがんアプリケーションに適しています。
Infinium Methylation Screening Arrayは、一般的な疾患の集団健康研究に適した、費用対効果の高いメチル化スクリーニングツールを提供します。約27万か所のメチル化サイトには、過去10年以上にわたるエピゲノムワイド関連研究で明らかになった形質関連マーカーに加え、細胞型特異的メチル化、中間メチル化、CoRSIV、SNPなどをカバーする新たなコンテンツが含まれています。このため、大規模なエピゲノムワイド関連研究（EWAS）やバイオバンクを活用したスクリーニングプロジェクトに最適です。
両製品の詳細な比較いついては、Infinium Methylation Screening Arrayデータシートをご参照ください。
Methylation Screening ArrayにはEXメチル化ワークフローが必要なのに対し、EPICv2.0ではHDメチル化ワークフローを使用します。EX Methylationは、48サンプルのEX BeadChipと自動化によって実現した新たなサンプル処理効率と、50ngという低DNAインプットを提供します。EXメチル化ワークフローには、自動分注用のInfinium Automated Pipetting System with ILASSが必要です。
イルミナの製品マニフェストファイルには基本的なゲノムマッピングアノテーションが記載されていますが、Infinium Methylation Screening Arrayでカバーされている形質関連などの詳細なアノテーションについては、Zhou Lab Infinium Annotations GitHubのページに記載されています。
Infinium Methylation Screening Arrayは、以下の理由により腫瘍学アプリケーションには推奨されません。
·ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）の互換性は未検証
·広く使用されているがん分類器のプローブが十分にカバーされていない
·MGMTプロモーターのメチル化は対象外である
·コピー数バリエーションのプロファイル作成能力が限られている
·BeadChipあたりの最小バッチ数が48サンプルと大きいため、結果のターンアラウンドタイムが長くなる場合がある
イルミナは、メチル化スクリーニングアレイに組み込まれたInfiniumコントロールを解析用の使いやすいツールを提供しています。詳細については、メチル化アレイデータ解析のヒントページをご覧ください。
BeadChipあたりのスキャン時間は最長20分です。
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件
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用にメチローム全体で285Kを超えるマーカーを表示します。
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip
大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。
Infinium自動化オプションパッケージ
Infiniumアッセイ用のロボット制御ソフトウェアによる自動化オプションは、サンプル調製ワークフローを合理化し、エラーを削減します。
Infinium XT iSelect-96 Kit
非ヒトの場合は最大10万の単一生物種または複数生物種のカスタムバリアント、ヒトの場合は最大5万のカスタムバリアントの生産規模のジェノタイピングを可能にする包括的なマイクロアレイソリューションです。
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