Illumina DNA Prep with Enrichment Dx
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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx

A library preparation and enrichment solution for IVD targeted sequencing applications.

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Overview

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx enables clinical labs to add targeted sequencing enrichment panels to their diagnostic applications and is an approved IVD medical device in the United States, the European Union, the United Kingdom, and other international markets.

This FDA-registered and EU IVDR 2017/746–compliant library prep and enrichment kit enables clinical labs to add targeted sequencing enrichment panels to their diagnostic applications.

  • Essential component for building a targeted NGS IVD assay on Illumina Dx instruments

  • Flexible support for various sizes of fixed and custom panels, including exome panels

  • Compatibility with Illumina and third-party enrichment DNA probe panels 

  • Streamlined workflow enables smooth transition to assay development and implementation

Optimized performance

The kit is compatible with FDA-registered and CE-marked IVD NGS platforms that use proven sequencing by synthesis (SBS) chemistry to deliver highly accurate diagnostic testing. 

Integrated software

Local Run Manager in Dx mode offers onboard primary analysis with a user-friendly interface on the MiSeqDx or NextSeq 550Dx instruments. The DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment Dx App performs alignment and variant calling in DNA for somatic and germline mutations. This app automatically launches secondary analysis when paired with an On-Premise DRAGEN Server and the NextSeq 550Dx or NovaSeq 6000Dx instruments via Illumina Run Manager.  

Intended use

Intended use (CE-marked IVD) 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx Kit is a set of reagents and consumables used to prepare sample libraries from genomic DNA derived from human cells and tissue to develop in vitro diagnostic assays. User supplied probe panels are required for the preparation of libraries targeting specific genomic regions of interest. The generated sample libraries are intended for use on Illumina sequencing systems. The Illumina DNA Prep with Enrichment Dx includes software for sequencing run setup, monitoring, and analysis.

Intended use (FDA-registered) 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx is a set of reagents and consumables used to prepare sample libraries from genomic DNA derived from human cells and tissue. User-supplied probe panels are required for the preparation of libraries targeting specific genomic regions of interest. The generated sample libraries are intended for use on Illumina sequencing systems.

Specifications

アッセイ時間 約7時間
ハンズオンタイム 約1時間
インプット量 ヒト細胞、および全血またはFFPE組織を含む組織由来の50～1,000 ngのゲノムDNA
システム NovaSeq 6000Dx Instrument, MiSeqDx Instrument, NextSeq 550Dx Instrument
手法 カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮
核酸の種類 DNA
生物種カテゴリー ヒト
テクノロジー シーケンス

Required products

To prepare targeted NGS libraries, Illumina DNA Prep with Enrichment Dx requires a user-supplied compatible enrichment panel and Local Run Manager. Speak with an Illumina sales representative to arrange installation on your Dx instrument. 

Instrument-specific reagent kits are also required: MiSeqDx Reagent Kit v3 (Catalog no. 20037124), NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2.5 (300 cycles) (Catalog no. 20028871), or NovaSeq 6000Dx Reagent Kit v1.5 (300 Cycles) (Catalog no. 20046931 or 20046933).  

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Applications

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx is an approved and registered IVD library prep and enrichment solution for in vitro diagnostic applications on the MiSeqDx, NextSeq 550Dx, and NovaSeq 6000Dx Instruments. 

Example workflow

1
Prep

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx 

2
Sequence
3
Analyze

DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment Dx App*

*Automatically launches when paired with an On-Premise DRAGEN Server and the NextSeq 550Dx or NovaSeq 6000Dx instruments via Illumina Run Manager. 

Application notes

High-quality variant calling with the NovaSeq 6000Dx instrument

Access a validated workflow for highly accurate germline and somatic variant calling.

Related applications and methods

NextSeq 550Dx applications and methods

Explore the versatility of application workflows for developing IVD tests and a range of research methods on a single instrument.

MiSeqDx applications and methods

MiSeqDx applications include IVD approved and registered assays for cystic fibrosis testing and NGS-based assay development.

In vitro diagnostic (IVD) instruments

Explore IVD instruments designed for the clinical lab environment.

Documentation

製品資料
Support documentation

Figures

Assay performance with whole-exome panelsa

a. Coriell Cell Line gDNA NA12878, with a known truth set for germline variant detection (Coriell platinum genome). Libraries were sequenced on the NextSeq 550Dx Instrument with FASTQ files generated from base calls using the GenerateFASTQ Dx Module in Local Run Manager; custom scripts in the DRAGEN platform v3.8.4 were used for analysis.

Resources

サムネール

Introducing Illumina DNA Prep with Enrichment Dx

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set A (16 samples)

20051354

CE-marked and FDA-regulated IVD reagents , including index set A and size selection beads, for library preparation of genomic DNA isolated from 16 FFPE tissue samples. MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬を別途ご購入ください。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set B (16 samples)

20051355

CEマークおよびFDA規制のIVD試薬（インデックスセットBおよびサイズ選択ビーズを含む）は、16個のFFPE組織サンプルから分離したゲノムDNAのライブラリー調製用です。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬を別途ご購入ください。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set A (96 samples)

20051352

96の末梢全血サンプルから分離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットAおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマーク取得済みおよびFDA規制対象のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬を別途ご購入ください。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set B (96 samples)

20051353

末梢全血96サンプルから分離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットBおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマーク取得済みおよびFDA規制対象のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬を別途ご購入ください。

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DNA Prep Enrichment Dx-Customer Site

20076400

イルミナDNA Prep with Enrichment Dxライブラリー調製ワークフローに慣れるための、お客様のサイトでの1.5日間のハンズオン手順。本コースでは、最大4名のトレーニーを対象に、ハンズオンのサンプルとライブラリー調製、濃縮、品質管理、ベストプラクティス、トラブルシューティング、および関連するイルミナがサポートするシーケンスとデータ解析ツールを提供します。

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FAQs

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx uses innovative on-bead tagmentation, which uses bead-bound transposomes to mediate a uniform reaction that integrates DNA extraction, fragmentation, library prep, and library normalization. This provides a rapid library prep and enrichment solution when combined with a simplified hybridization step. The kit includes clean-up beads for library purification and sequencing indexes. 

You will need to order the Dx reagents designated for your Illumina Dx sequencing Instrument: 

Not all reagent kits will be available in all countries. Please visit each product page to learn more. 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx supports a wide range of genomic DNA (gDNA) derived from cells and tissue. This includes gDNA extracted from whole blood or formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue. 

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NovaSeq 6000Dx システムのご購入

NovaSeq 6000Dx システムは、診断（IVD）または研究（RUO）モードで高速データ解析が可能なハイスループットシーケンスを提供します。

NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit

医療機器届出済みのNextSeq 550Dx システム（届出番号：13B1X10303000001）専用のシークエンス試薬です。これらのシーケンス試薬キットは、臨床検査用にワークフローを簡素化して高いデータ品質を実現します。

TruSeq Custom Amplicon Kit Dx

臨床検査室において、MiSeqDx システムおよびNextSeq 550Dx システムで使用するための独自の次世代シーケンサー（NGS）アッセイを設計できる検証済みのFDA認証キットです。

MiSeqDx 試薬キット

医療機器届出済みのMiSeqDx システム（届出番号 13B1X10303000002）シーケンス試薬。以前のバージョンと比較して、クオリティスコアが向上しています。

NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit

医療機器届出済みのNextSeq 550Dx システム（届出番号：13B1X10303000001）専用のシークエンス試薬です。これらのシーケンス試薬キットは、臨床検査用にワークフローを簡素化して高いデータ品質を実現します。

NovaSeq 6000Dx 試薬キット

医療機器届出済みのNovaSeq 6000Dx システム（届出番号：13B1X10303000007）専用のシーケンス試薬です。

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