Illumina DNA Prep with Enrichment Dx

IVDターゲットシーケンスアプリケーションのためのライブラリー調製と濃縮ソリューション。

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概要

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxにより、臨床検査室は診断アプリケーションにターゲットシーケンス濃縮パネルを追加できるようになりました。Dxは、米国、欧州連合、英国、その他の国際市場で承認されたIVD医療機器です。

FDA登録済み、EU IVDR 2017/746準拠のライブラリー調製・濃縮キットにより、臨床検査室はターゲットシーケンス濃縮パネルを診断アプリケーションに追加することができます。

  • イルミナDx装置でターゲットNGS IVDアッセイを構築するための必須コンポーネント

  • エクソームパネルなど、さまざまなサイズの固定パネルやカスタムパネルを柔軟にサポート

  • イルミナおよびサードパーティのエンリッチメントDNAプローブパネルとの互換性 

  • 合理化されたワークフローにより、アッセイの開発から実装へのスムーズな移行が可能

性能の最適化

このキットは、FDA登録およびCEマークのIVD NGSプラットフォームと互換性があり、実証済みのSequence by Synthesis(SBS)ケミストリーを使用して、高精度の診断検査を提供します。 

統合ソフトウェア

Dx モードのLocal Run Managerは、MiSeqDxまたはNextSeq 550Dxシステム上でユーザーフレンドリーなインターフェースを備えた、オンボードの一次解析を提供します。DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment Dxアプリは、体細胞変異および生殖系列変異のDNAにおけるアライメントとバリアントコーリングを実行します。このアプリは、Illumina Run Managerを介してオンプレミスDRAGEN サーバーとNextSeq 550DxまたはNovaSeq 6000Dxシステムとペアリングすると、二次解析を自動的に起動します。  

使用用途

使用用途(CEマーク付きIVD) 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxキットは、ヒトの細胞や組織由来のゲノムDNAからサンプルライブラリーを調製して、臨床検査アッセイを開発するために使用する試薬と消耗品のセットです。研究対象の特定ゲノム領域をターゲットとするライブラリーの調製には、ユーザー提供のプローブパネルが必要です。生成されたサンプルライブラリーは、イルミナのシーケンスシステムで使用することを目的としています。Illumina DNA Prep with Enrichment Dxには、シーケンスランのセットアップ、モニタリング、解析用のソフトウェアが含まれています。

使用目的(FDA登録済み) 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxは、ヒトの細胞や組織由来のゲノムDNAからサンプルライブラリーを調製するために使用する試薬と消耗品のセットです。研究対象の特定ゲノム領域をターゲットとするライブラリーの調製には、ユーザー提供のプローブパネルが必要です。生成されたサンプルライブラリーは、イルミナのシーケンスシステムで使用することを目的としています。

仕様

必要な製品

Illumina DNA Prep with Enrichment DxでターゲットNGSライブラリーを調製するには、ユーザーが用意した互換性のあるエンリッチメントパネルとLocal Run Managerが必要です。イルミナの営業担当者と相談し、お客様のDx装置の導入を手配してください。 

装置固有の以下の試薬キットも必要になります。MiSeqDx Reagent Kit v3(カタログ番号:20037124)、NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2.5(300サイクル)(カタログ番号:20028871)、またはNovaSeq 6000Dx Reagent Kit v1.5(300サイクル)(カタログ番号:20046931または20046933)。  

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アプリケーション

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxは、MiSeqDx、NextSeq 550Dx、NovaSeq 6000Dxシステムでの臨床検査アプリケーション向けの、承認済み・登録済みのIVDライブラリー調製・濃縮ソリューションです。 

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx 

3
解析

DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment Dx アプリ*

*Illumina Run Managerを介してオンプレミスDRAGEN サーバーとNextSeq 550DxまたはNovaSeq 6000Dxシステムとペアリングすると自動的に起動します。 

アプリケーションノート

関連するアプリケーションと手法

ドキュメント

製品資料

全エクソームパネルによるアッセイ性能a

a. 生殖系列バリアント検出用の既知の真理値セットを備えたCoriell Cell Line gDNA NA12878(Coriellプラチナゲノム)。ライブラリーは、Local Run ManagerのGenerateFASTQ Dxモジュールを使用してベースコールから生成されたFASTQファイルを使用し、NextSeq 550Dxシステムでシーケンスされました。解析には、DRAGENプラットフォームv3.8.4のカスタムスクリプトが使用されました。

Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set A (16 samples)

20051354

16のFFPE組織サンプルから単離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットAおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマークおよびFDA規制のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬は別売りです。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set B (16 samples)

20051355

16のFFPE組織サンプルから単離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットBおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマークおよびFDA規制のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬は別売りです。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set A (96 samples)

20051352

96の末梢血サンプルから単離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットAおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマークおよびFDA規制のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬は別売りです。

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Illumina DNA Prep with Enrichment Dx with UD Indexes Set B (96 samples)

20051353

96個の末梢血サンプルから単離されたゲノムDNAのライブラリー調製用のインデックスセットBおよびサイズ選択ビーズを含む、CEマークおよびFDA規制のIVD試薬。MiSeqDx、NextSeq 550Dx、またはNovaSeq 6000Dxシーケンス試薬は別売りです。

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DNA Prep Enrichment Dx-Customer Site

20076400

イルミナDNA Prep with Enrichment Dxライブラリー調製ワークフローに慣れるための、お客様のサイトでの1.5日間のハンズオン手順。本コースでは、最大4名のトレーニーを対象に、ハンズオンのサンプルとライブラリー調製、濃縮、品質管理、ベストプラクティス、トラブルシューティング、および関連するイルミナがサポートするシーケンスとデータ解析ツールを提供します。

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TruSight Whole Genome Customer Training – Customer Site

20122846

A 1.5-day onsite training for the complete TruSight Whole Genome Dx Library Preparation workflow, with detailed hands-on instruction. Participants will learn all steps of the workflow including sample and library preparation, quality control, best practices, and troubleshooting. Training on Illumina-supported sequencing and data analysis tools specific to the TruSight Whole Genome workflow will be included.

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よくある質問

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxは、革新的なオンビーズタグメンテーションを採用しており、ビーズ結合型トランスポソームを使用して均一な反応を実現します。このプロセスにより、DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーの正規化を統合的に行うことが可能です。これにより、簡素化されたハイブリダイゼーションステップと組み合わせることで、迅速なライブラリー調製および濃縮ソリューションが得られます。キットには、ライブラリー精製およびシーケンスインデックス用のクリーンアップビーズが含まれています。 

Illumina Dxシーケンス装置用に指定されたDx試薬を注文していただく必要があります。 

国によっては、一部の試薬キットがご利用いただけない場合があります。詳細については、各製品ページをご覧ください。 

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxは、細胞や組織由来の幅広いゲノムDNA(gDNA)に対応します。これには、全血またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織から抽出されたgDNAが含まれます。 

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NovaSeq 6000Dx システムのご購入

NovaSeq 6000Dx システムは、診断(IVD)または研究(RUO)モードで高速データ解析が可能なハイスループットシーケンスを提供します。

NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit

医療機器届出済みのNextSeq 550Dx システム(届出番号:13B1X10303000001)専用のシークエンス試薬です。これらのシーケンス試薬キットは、臨床検査用にワークフローを簡素化して高いデータ品質を実現します。

製品に関するお問い合わせ

Illumina DNA Prep with Enrichment Dxについてその他のご質問がある場合は、今すぐ当社までお問い合わせください。