タグメンテーション
オンビーズタグメンテーションでライブラリー調製時間を短縮
DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションを統合した新しいケミストリー
タグメンテーションとは？
タグメンテーションは、断片化されていないDNAを切断し、解析用にタグ付けするライブラリー調製の最初のステップです。
オンビーズタグメンテーションライブラリー調製では、ビーズ結合トランスポソームを使用して、溶液中のタグメンテーション反応と比較してより均一なタグメンテーション反応を行います。ビーズ結合トランスポソームケミストリーは、DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションの各ステップを統合します。これにより、ワークフローのステップ数が減り、必要なサンプル入力が少なくなり、ハンズオン時間とターンアラウンドタイムの両方が短縮されます。
オンビーズタグメンテーションが優れている理由
ビーズ結合トランスポソームライブラリー調製は、溶液中タグメンテーションよりも以下のような利点があります。
- 低サンプルインプット要件
- ライブラリーの定量とノーマライゼーションのステップが不要になり、ターンアラウンドが短縮され、ハンズオンタイムが短縮されました
- オンビーズ断片化によりDNA剪断の必要性を排除
- 幅広いDNAインプット範囲にわたり、均一で一貫したインサートサイズとライブラリー収量
オンビーズタグメンテーションは、DNAインプット量やゲノムサイズに関係なく、一貫したインサートサイズ、均一なカバレッジ、および最適化された性能を提供しながら、ライブラリー調製時間を短縮することができます。
詳細はこちら実験の柔軟性
オンビーズタグメンテーションライブラリー調製には、貴重なサンプルを含むさまざまなサンプルタイプの実験に柔軟性を提供する幅広いDNAインプットレンジがあります。このテクノロジーは、ヒト全ゲノムシーケンス、がんゲノミクス研究、環境メタゲノミクス、感染症研究、アグリゲノミクスなどのアプリケーションに最適です。
- 大小を問わず、あらゆる種のDNA全ゲノムシーケンス
- 全エクソームシーケンス、固定パネル、カスタムパネル、イルミナとサードパーティのオリゴベンダーなど、固有の分子識別子のないターゲットDNAエンリッチメントアプリケーション
- RNA濃縮
新しいライブラリー調製テクノロジー
イルミナDNA Prep（旧Nextera DNA Flex）が、新しいオンビーズタグメンテーションテクノロジーを使用して、酵素断片化の欠点に対処しながら、酵素断片化の利便性を維持する方法をご覧ください。
ウェビナーを視聴よく一緒に購入される製品
実験のためのタグメンテーションキットの選択
| アプリケーション | 製品 | 利点 |
|---|---|---|
| 16s rRNAシーケンス、アンプリコンシーケンス、デノボシーケンス、ショットガンシーケンス、全ゲノムシーケンス | Nextera XT |
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| アンプリコンシーケンス、デノボシーケンス、ショットガンシーケンス、全ゲノムシーケンス | Illumina DNA Prep |
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| ヒト全ゲノムシーケンス | イルミナDNA PCRフリー |
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NexteraとTruSeqテクノロジーの比較
Nexteraはビーズ結合トランスポソーム技術を使用しています。統合DNA抽出、自動断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションがプロトコールに含まれています。全ゲノムシーケンスやターゲットエンリッチメントアプリケーションに最適です。
TruSeqはアダプターライゲーション、断片化、エンドリペアを使用し、ポリ（A）キャプチャー効率を備えています。これには、個別のDNAせん断が必要です。コーディングトランスクリプトームを捕捉し、全トランスクリプトームRNA-Seq、エクソームエンリッチメント、大規模全ゲノムリシーケンス、ターゲットリシーケンス、de novoシーケンス、メタゲノム、メチル化研究に最適です。
お客様のニーズを満たすその他のテクノロジー
自動化
当社のパートナーは、当社のライブラリー調製ポートフォリオにまたがるハイスループットとロースループットの両方のウォークアウェイ自動化手法を開発しました。
インデックスアダプター
ランごとのシーケンスサンプル数を増やし、独自のデュアルインデックスアダプターを使用してハイスループットシーケンスを最適化します。
分子バーコード（UMI）
分子バーコード（UMI）によりエラーが修正され精確さが得られます。変異検出感度を高めながら、偽陽性変異コールを減らすことができます。