RNA-Seqライブラリー調製の進歩は、トランスクリプトームの研究に革命をもたらしています。
全トランスクリプトーム
遺伝子と転写産物の量を測定し、コーディングRNAとノンコーディングRNAの既知および新規の特徴を検出します。ターゲットハイブリダイゼーションは、トランスクリプトームの高価値部分に焦点を合わせるために、豊富なrRNAを除去します。
mRNA
遺伝子発現の定量化、コーディングトランスクリプトームにおける既知および新規のアイソフォームの同定、遺伝子融合の検出、アリル特異的発現の測定。
RNAエンリッチメント
目的とする遺伝子群にフォーカスして遺伝子発現を解析します。定量的な発現情報のほか、小さなバリアントや遺伝子融合の検出を提供します。
RNAアンプリコン
ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）アンプリコンの超ディープシーケンスを使用して、目的のRNAシーケンスの解析、発現差解析、アリル特異的発現測定、および遺伝子融合の検証を行います。
実験のためのRNAキットの選択
| アプリケーション | 製品 | 利点 |
|---|---|---|
| トータルRNAシーケンス | Illumina Stranded Total RNA Prep |
|
| mRNAシーケンス | Illumina Stranded mRNA Prep |
|
| ターゲットRNAシーケンス | Illumina RNA Prep with Enrichment |
|
RNAライブラリー調製の一覧
| アプリケーション | 全トランスクリプトーム | mRNA | RNA濃縮 |
|---|---|---|---|
| ハンズオンタイム | 3時間未満 | 3時間未満 | 2時間未満 |
| ターンアラウンドタイム | ～7時間 | 6.5時間 | 9時間未満 |
| インプット量 | 1～1,000 ng（標準品質RNA）。10 ng（最適性能、FFPEサンプル）。 | 25～1,000 ng（標準品質RNA） | 10 ng（標準品質RNA）。20 ng（低品質RNA、分解RNA、FFPE由来RNA） |
| 自動化対応 | リキッドハンドリングロボット | リキッドハンドリングロボット | リキッドハンドリングロボット |
| PCRプロトコール | 不要 | 不要 | 含まれる |
| ライブラリー定量 | 含まれる | 含まれる | 含まれる |
| 断片化 | 含まれる | 含まれる | 不要 |
| 製品 | Illumina Stranded Total RNA Prep | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment |
全3種類のキットでは、よりハイスループットのシーケンスを目的に、384種類のユニークデュアルインデックスを使用して最大384サンプルを1個のNovaSeq S4フローセルにロードすることでシーケンスコストを削減できます。
タグメンテーションの利点
ビーズリンクドのトランスポソームタグメンテーションは、当社のライブラリー調製ポートフォリオで利用されている革新的なテクノロジーです。gDNAの同時断片化とイルミナシーケンスプライマーの追加により、オンビーズタグメンテーションは、シーケンス用ライブラリーを、以前よりも迅速に提供できるようになりました。補助の試薬や設備無しでライブラリーをノーマライズする。ターンアラウンドタイムと複雑性を減らす。
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アダプターライゲーションを理解する
NGSライブラリー調製で利用されている主なその他のテクノロジーは、一貫性、高品質データで名高いアダプターライゲーションです。ライブラリーは、gDNAまたはcDNAサンプルを断片化し、両方の断片の端に特製アダプターをライゲーションして調製されます。これらのアダプターには、シーケンスプライマーハイブリダイゼーションサイトの完全な補完が含まれています。これにより、追加のPCRステップが不要になり、プロセスを完全に自動化できます。
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イルミナのライブラリー調製製品を最大限に活用する方法についての専門家へのお問い合わせ
お客様のニーズに合わせてご提案いたします。
RNA-Seqライブラリー調製方法とユースケース
2つのキットの物語
2つの一般的なRNA Library Prep Kitの重要な比較により、RNAシーケンス研究を実施する研究者にとって関心のある新しい情報が明らかになります。
RNAメソッドポスター
解析のためのNGSメソッドの包括的なセット：
- RNA転写
- RNA-タンパク質相互作用
- 低レベルのRNA
- RNA修飾
- RNA構造
RNAメソッドのレビュー
この論文コレクションでは、長所と短所、論文概要、参考文献など、科学文献からまとめられたRNAシーケンスのさまざまなNGS手法について説明します。
がん免疫研究のためのRNAシーケンスワークフローの例
ライブラリー調製
シーケンス
解析
製品選択ツール
ライブラリー調製キットセレクター
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでキットをフィルタリングする。キットを比較、共有、注文します。
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関連ソリューション
インデックス
ラン毎のシーケンスサンプル数を増やし、ユニークデュアルインデックスアダプターを使用して、ハイスループットシーケンスを最適化。
分子バーコード（UMI）
分子バーコード（UMI）は、エラー補正と正確性を可能にし、バリアント検出の感度を高めながら、偽陽性のバリアントコールを減らすことができます。
自動化
当社のパートナーは、ハイスループットとロースループットの両方で、自動化メソッドを開発し、ライブラリー調製ポートフォリオを拡大しています。
RNAシーケンス
転写アイソフォーム、遺伝子融合、一塩基バリアントなど、1つのアッセイで既知および新規の両方の特徴を、すべて事前の知識なしに検出します。