Partek Flowソフトウェア

マルチオミクスデータの解析と視覚化のための使いやすい、バイオインフォマティクスソフトウェア。

概要

Partek Flowソフトウェアは、次世代シーケンシングと大規模マルチオミクスデータの視覚解析を可能にします。直感的なインターフェース、ロバストな統計アルゴリズム、情報豊富な視覚化により、あらゆるスキルレベルの研究者が自信を持ってデータを解析できます。 

 

バルクRNA-Seq、シングルセル、空間トランスクリプトミクス、クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)およびATAC-Seq、DNA-Seq、メタゲノム、マイクロアレイデータを簡単に探索できます。スケーラブルなDRAGEN二次解析との 互換性と柔軟な設置オプションにより、個々のユーザー、コアラボ、大規模企業組織のニーズに対応します。

主な特長

直感的

使いやすいツールを用いて、マルチオミクスデータセットを解析。高度なバイオインフォマティクススキルは必要ありません

強力な統計

業界標準の統計手法で、信頼できる結果を実現します

インタラクティブな視覚化

情報豊富で、公開可能な視覚化を用いてデータを探します

仕様

アプリケーション

バルクRNA-Seq

RNA-Seqデータを深く掘り下げ、発現差異、代替スプライシング、遺伝子融合などを同定することにより遺伝子発現の全体像を把握します。

Partek FlowがRNA-Seqの知見を解き放つ

RNA-Seqに関する教育

シングルセル解析

シングルセルRNA-Seq、ATAC-Seq、CITE-Seq、抗体キャプチャーシーケンシング、フローサイトメトリー、マスサイトメトリーなどのシングルセル研究から生物学的知見を引き出し、高解像度で細胞機能を理解します。

Partek Flowによるシングルセル解析の簡便化

シングルセルシーケンスに関する教育

クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)およびATAC-Seq

ATAC-Seq/クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)データを、使いやすく状況依存型のインターフェースで簡単に処理および解析し、ゲノム全体にわたるクロマチンアクセシビリティと遺伝子制御の変化を明らかにします。

Partek FlowによるATAC-Seq/ChIP-Seqの合理化

ChIP-SeqおよびATAC-Seqに関する教育

空間トランスクリプトミクス

空間分解シングルセルRNA-Seq、CITE-Seq、抗体キャプチャーシーケンスなどを解析および統合することで、無傷の組織における転写活性を明らかにし、遺伝子発現を構造や機能活性に結び付けます。

直感的な空間データ解析のためのPartek Flow

空間トランスクリプトミクスに関する情報

メタゲノム

微生物特性評価のための強力で使いやすい解析ツールを使用して、微生物の多様性と機能に関する洞察を得るために、さまざまな環境で細菌の多様性を評価し、微生物の存在量を検出します。

マイクロアレイ

疾患のメカニズムと制御を調査します。イルミナのジェノタイピングとメチル化アレイ、およびAffymetrix遺伝子発現のサポート。

DNA-Seq

WGSおよびWESデータ 内の疾患および表現型に寄与する、遺伝的バリアントを同定します

パスウェイ

遺伝子間の複雑な生物学的関係とパスウェイを探索し、有意な生物学的知見を発見します

プロテオミクス

健康な組織や疾患組織におけるタンパク質の発現レベルを解析し、疾患の早期発見、診断、予後のための潜在的なバイオマーカーを同定します。

ワークフローの例

1
ラボ
2
ラン
3
アナリティクス
4
知見

Partek Flowソフトウェア

マルチオミクスデータの解析と視覚化のための使いやすい、バイオインフォマティクスソフトウェア。

関連するアプリケーションと手法

プランと価格

年間ライセンスおよび複数年ライセンスを購入できます。料金については、担当者にご相談ください。

サブスクリプションオプション

機能 ラボ版 Enterprise
RNA-Seq
 
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クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)/ATAC-Seq
 
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DNA-Seq
 
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メタゲノム
 
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マイクロアレイ
 
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シングルセルと空間解析 追加 追加
パスウェイ解析 追加 追加
付属のデータストレージ(追加ストレージは有料で購入可能) 1 TB(イルミナホスト) 1 TB(イルミナホスト)
イルミナホスト
 
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顧客ホスト
 
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登録ユーザー 1シートにつき1件 制限なし
同時ユーザー なし 購入するシート数に基づく(例、1シートライセンスにつき1)
管理アカウント なし
 
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ユーザーのデータパーティション なし
 
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プロジェクトのコラボレーション機能 なし
 
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タスクキューの管理 なし
 
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ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

使いやすいビジュアルインターフェースで強力な解析ワークフローを構築する

保存して後で再利用したり、同僚と共有したりできる解析ワークフローを視覚的に構築します。状況依存のインターフェースは、適切なオプションを適切なタイミングで提供するために迷うことはありません。

インタラクティブな視覚化を使い、探索を加速する

業界標準の統計アルゴリズムで強化された、豊富な情報に基づく視覚化により、オミクスデータをリアルタイムで探索し操作できます。解析を保存し、世界中の同僚とコラボレーションができます。準備ができたら公開可能な形式でエクスポートします。

複数のオミクスデータタイプ、またはモダリティを一緒に解析

個々の細胞内で複数の分子情報を統合して、細胞の挙動と機能をより深く、より包括的に理解することができます。

リソース

このオンデマンドウェビナーでは、扁桃組織におけるin situ遺伝子とタンパク質の発現を調べ、有意で応用可能な結果を収集します。Partek Flowを使用して、空間マルチオミクス解析とリサーチ研究の実践的なアプリケーションに関する知見を得ることができます。

このオンデマンドウェビナーでは、専門家パネルが、シングルセル解析の基本的な概念と利点、およびサイエンティストが自身の研究のために検討すべき理由について概説します。解析プロセスに光を投じ、一般的な解析課題を克服するための戦略について議論します。

このオンデマンドウェビナーでは、直感的な設定と機能を備えた視覚化機能を搭載したPartek Flowデータビューアを実演します。生産性向上戦略について視聴し学びましょう。

Partek Flow Lab Edition (Illumina Hosted) - One seat

20130166

小規模なラボや部門に、大規模なゲノムデータセットを保存・管理・解析するためのツールを提供します。イルミナのクラウドにインストールされ、1つの指定ユーザーライセンス、1 TBのデータストレージ、バルクRNA-Seq、DNA-Seq、クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)/ATAC-Seq、マイクロアレイ、メタゲノムアプリケーション用のツールが含まれます。追加のアドオンツールを購入できます。

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Partek Flow Lab Edition (Customer Hosted) - One seat

20130164

小規模なラボや部門に、大規模なゲノムデータセットを保存・管理・解析するためのツールを提供します。お客様のクラウドまたはサーバーにインストールされ、1つの指定ユーザーライセンス、バルクRNA-Seq、DNA-Seq、ChIP-Seq/ATAC-Seq、マイクロアレイ、メタゲノムアプリケーション用のツールが含まれます。追加のアドオンツールを購入できます。

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Partek Flow Enterprise Edition (Illumina Hosted) - One seat

20130167

Partek Flow Enterpriseは、多くのユーザーと多様なニーズを持つ大規模なラボ、部門、または組織を対象としています。イルミナのクラウドにインストールされ、購入したシート数に制限された同時使用の無制限ユーザーアカウント、1 TBのデータストレージ、データおよびユーザー管理、バルクRNA-Seq、DNA-Seq、ChIP-Seq/ATAC-Seq、マイクロアレイ、メタゲノムアプリケーション用のツールが含まれます。追加のシート、アドオンツール、およびストレージを購入できます。

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Partek Flow Enterprise Edition (Customer Hosted) - One seat

20130165

Partek Flow Enterpriseは、多くのユーザーと多様なニーズを持つ大規模なラボ、部門、または組織を対象としています。お客様のクラウドまたはサーバーにインストールされ、無制限のユーザーアカウントが含まれ、同時使用は購入したシート数に制限されます。1 TBのデータストレージ、データおよびユーザー管理、バルクRNA-Seq、DNA-Seq、ChIP-Seq/ATAC-Seq、マイクロアレイ、メタゲノムアプリケーション用のツールが含まれます。追加のシート、ツール、ストレージを購入できます。

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追加製品 (9)

Partek Flow Lab Edition Add on - Pathway (Customer Hosted) - One seat

20130172

パスウェイエンリッチメント解析用のPartek Flow Lab Editionのアドオンツール。

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Partek Flow Lab Edition Add on - Pathway (Illumina Hosted) - One seat

20130174

パスウェイエンリッチメント解析用のPartek Flow Lab Editionのアドオンツール。

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Partek Flow Lab Edition Add on - Single Cell and Spatial (Customer Hosted) - One seat

20130176

単一細胞および空間データの三次解析用のPartek Flow Lab Editionのアドオンツール。

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Partek Flow Lab Edition Add on - Single Cell and Spatial (Illumina Hosted) - One seat

20130178

単一細胞および空間データの三次解析用のPartek Flow Lab Editionのアドオンツール。

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Partek Flow Enterprise Edition Add on - Pathway (Customer Hosted) - One seat

20130173

パスウェイエンリッチメント解析用のPartek Flow Enterprise Editionのアドオンツール。購入したシート数は、購入したPartek Flowのシート数と一致している必要があります。

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Partek Flow Enterprise Edition Add on - Pathway (Illumina Hosted) - One seat

20130175

パスウェイエンリッチメント解析用のPartek Flow Enterprise Editionのアドオンツール。購入したシート数は、購入したPartek Flowのシート数と一致している必要があります。

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Partek Flow Enterprise Edition Add on - Single Cell and Spatial (Customer Hosted) - One seat

20130177

シングルセルおよび空間データの三次解析用Partek Flow Enterprise Editionのアドオンツール。購入したシート数は、購入したPartek Flowのシート数と一致している必要があります。

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Partek Flow Enterprise Edition Add on – Single and Spatial Cell (Illumina Hosted) - One seat

20130179

シングルセルおよび空間データの三次解析用Partek Flow Enterprise Editionのアドオンツール。購入したシート数は、購入したPartek Flowのシート数と一致している必要があります。

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Partek Flow Add on – 1TB Additional Data Storage (Illumina Hosted)

20130187

Partek Flow Illumina-Hostedソフトウェア用の1TBのデータストレージの追加を可能にするアドオン。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

単価

よくある質問(FAQ)

バルクRNA-Seq、シングルセル解析、空間トランスクリプトミクス、ChIP-SeqおよびATAC-Seq、DNA-Seq、メタゲノミクス、マイクロアレイ、パスウェイ解析

バルクおよびシングルセルNGS、空間解析、マイクロアレイ、フローサイトメトリー

Partek Flowソフトウェアは、データを操作および表示するための多くの方法を提供します。利用可能なオプション:PCA、t-SNE、UMAP、ボルケーノプロット、ヒートマップ、バブルマップ、ベン図、ドットプロット、KEGGパスウェイ、サンキープロット、ヒストグラム、TSSプロット、円グラフ、 Cell Trajectoryグラフ、ニー(膝)プロット、散布図(2Dまたは3D)、棒グラフ、組織スポットの組織画像、バイオリンプロット、および箱ひげ図。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500 v2

FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー(TMB、MSI、HRD)を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

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