WGS、RNA-seq、エクソーム/エンリッチメント、アンプリコン、16Sメタゲノムなど、幅広いNGSメソッドをサポート
DRAGEN二次解析は、幅広いゲノム解析機能のためのアプリケーションとパイプラインを提供します。DRAGENアプリは、BaseSpace Sequence Hub上のクラウドで、正確で効率的で安全な解析を提供します。DRAGENパイプラインは、オンプレミスサーバー、Illumina Connected Analyticsのクラウド、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム、NovaSeq Xシリーズのオンボードで起動できるデータ解析ツールです。
| アプリケーション | DRAGENオンプレミスサーバー | NovaSeq Xシリーズ | NextSeq 1000/2000 | BaseSpace Sequence Hub | Illumina Connected Analytics |
|---|---|---|---|---|---|
| BCL Convert | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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カスタムのみ
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| DRAGEN ORA Compression | チェックマーク
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チェックマーク
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カスタムのみ
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| DRAGEN FASTQC + MultiQC | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| Whole genome | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列のみ | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 |
| エンリッチメント（エクソームを含む） | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 |
| DRAGEN Amplicon | チェックマーク
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DNAのみ | チェックマーク
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| RNA | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| Single-Cell RNA | チェックマーク
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チェックマーク
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| NanoString GeoMx NGS（空間トランスクリプトミクス） | チェックマーク
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| メチル化 | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| メタゲノム | チェックマーク
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| COVID | COVIDSeq、COVID系統 | COVIDSeq（クラウドのみ） | COVIDSeq、COVID系統 | ||
| TruSight Oncology 500ポートフォリオ | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| ScATAC-Seq（トランスポーゼを用いたアクセスが可能なクロマチンのシングルセルシーケンスアッセイ） | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| インピュテーション | チェックマーク
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チェックマーク
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チェックマーク
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| PGx Star Allele Caller | チェックマーク
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チェックマーク
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| Illumina Complete Long Read | チェックマーク
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| RPIPおよびUPIPパネル | チェックマーク
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チェックマーク
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ベータ版 |
*メタゲノムアプリケーションはK-mer分類によって有効化されます。その他のツールも近日公開予定です。
BaseSpace Sequence HubのTruSight Oncology 500ポートフォリオ：Illumina Connected Analyticsサブスクリプションが必要
| パイプライン | 説明 | 検出されたバリアントタイプa | 提供されたメトリクス | 論文 |
|---|---|---|---|---|
| DRAGENデマルチプレクス | NGS解析の迅速なデマルチプレクスを実行 | |||
| DRAGEN ORA Compression | データ整合性の維持と同時に、FASTQファイルの高圧縮率だけでなく、高速圧縮と高速解凍にも最適化されています。 |
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設計上の検討事項と手法 | |
| DRAGEN Map + Align | スタンドアロンまたは |
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| DRAGEN Germline | 精度を高める高度なエラーモデルキャリブレーション、Illumina Expansion Hunterによるリピート伸長検出とジェノタイピングなど、エンドツーエンドのNGS解析を提供します。 |
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| DRAGEN Somatic | 腫瘍サンプルの体細胞バリアントを検出するために設計された、Tumor-onlyモードとTumor-normalモードがあります。どちらのモードも倍数性を仮定しないため、低頻度アリルの検出が可能です。 |
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| DRAGEN Enrichment | DRAGENの生殖細胞系と体細胞系のコーラーを、エンリッチメントサンプルの解析専用に設計されたパイプラインにまとめたものです。エンリッチメントメトリクスとレポート作成一式が含まれます。 |
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| DRAGEN RNA | スプライスジャンクションの発見とアライメントから始まり、迅速なアライメントとスプライスジャンクションのマッピングと定量化に続くトランスクリプトーム解析を実行します。（差次的発現について、イルミナは、BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Differential Expressionアプリを推奨します。） |
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Bangladeshi SARS-CoV-2株における点変異の同定 |
| DRAGEN Single Cell RNA | デマルチプレクス、セルバーコードおよびUMIエラー補正、Sequence Alignment Map（SAM）形式、遺伝子発現の定量化を実行します。 |
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| DRAGEN Joint Genotyping | 複数のゲノムにまたがってバリアントを共同でコールし、精度を損ねることなく迅速なスピードで大規模なサンプルコホートにスケーリングします。 |
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大規模ヒトゲノム研究のためのハイブリッドクラウドシステム |
| DRAGEN Methylation | アライメントとメチルコーリングを実行します。アライメントおよびメチル化メトリクスを計算します。 |
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| DRAGEN Reference Builder | FASTAファイルを受け入れ、DRAGENアプリが使用する独自のリファレンスを構築します。 | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA解析ソフトウェア | TruSight Oncology 500 ctDNAの二次解析サポートを提供します。ローカルDRAGEN サーバー（バージョン3）でのみ利用可能 |
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cfDNAアッセイを検証するための血液TMB標準物質の開発 |
| DRAGEN Imputation | スケーラブルなローパス全ゲノムシーケンス解析を可能にするエンドツーエンドのユーザーフレンドリーなツールを提供します。 |
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バリアントコール性能 |
a. SNV：一塩基バリアント、CNV：コピー数バリエーション、SV：小バリアント、TMB：腫瘍変異量、MSI：マイクロサテライト不安定性、HLA：ヒト白血球抗原
変異を検出して新しいバリアントを特定し、COVID-19宿主反応を研究し、調査結果を共有データベースに提供します。
エクソームシーケンス用の Illumina DNA Prep with Enrichment と DRAGENの解析パワーを合わせることで、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルにおける効率的、高精度のバリアント解析が可能になります。
エクソームシーケンス用の Illumina DNA Prep with Enrichment と DRAGENの解析パワーを合わせることで、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルにおける効率的、高精度のバリアント解析が可能になります。
NanoString GeoMx DSPと実績のあるイルミナのシーケンスを組み合わせることで、遺伝子とタンパク質のプロファイリングに必要な組織構造に関する高プレックスの空間解析と情報が得られます。
DRAGEN解析機能の詳細、注文方法、製品ドキュメントの検索。また、スペシャリストに相談して、質問に対する回答を得ることもできます。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。