WGS、RNA-seq、エクソーム/エンリッチメント、アンプリコン、16Sメタゲノムなど、幅広いNGSメソッドをサポート
DRAGEN二次解析は、幅広いゲノム解析機能のためのアプリケーションとパイプラインを提供します。DRAGENアプリは、BaseSpace Sequence Hub上のクラウドで、正確かつ効率的でセキュアな解析を提供します。DRAGENパイプラインは、オンプレミスサーバー、Illumina Connected Analytics上のクラウド、またはNovaSeq Xシリーズ、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム、MiSeq i100シリーズのオンボードで起動できるデータ解析ツールです。
| アプリケーション | DRAGENオンプレミスサーバー | NovaSeq Xシリーズ | NextSeq 1000/2000 | MiSeq i100シリーズ | BaseSpace Sequence Hub | Illumina Connected Analytics |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BCL Convert | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
カスタムのみ
|
| DRAGEN ORA Compression | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
カスタムのみ
|
|
| DRAGEN FASTQC + MultiQC | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
ライブラリーQCアプリでサポート
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
| Whole genome | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列のみ | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | |
| エンリッチメント（エクソームを含む） | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | 生殖細胞系列 + 体細胞 | |
| DRAGEN Amplicon | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
DNAのみ | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
||
| RNA | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|
| Single-Cell RNA | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
||
| NanoString GeoMx NGS（空間トランスクリプトミクス） | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
||||
| メチル化 | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|||
| メタゲノム | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
||||
| COVID、IMAP、IMAP-FLU | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|||||
| TruSight Oncology 500ポートフォリオ | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|||
| ScATAC-Seq（トランスポーゼを用いたアクセスが可能なクロマチンのシングルセルシーケンスアッセイ） | チェックマーク
|
チェックマーク
|
チェックマーク
|
|||
| インピュテーション | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|||
| PGx Star Allele Caller | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
|||
| Illumina Complete Long Read | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
||||
| VSP、RVEK、RPIP、UPIP | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
ベータ版 | ||
| 小規模全ゲノムシーケンス（WGS） | チェックマーク
アイコンは利用できません
|
チェックマーク
アイコンは利用できません
|
*メタゲノムアプリケーションはK-mer分類によって有効化されます。その他のツールも近日公開予定です。
BaseSpace Sequence Hub用のTruSight Oncology 500ポートフォリオ：Illumina Connected Analyticsサブスクリプションが必要
| パイプライン | 説明 | 検出されたバリアントタイプa | 提供されたメトリクス | 論文 |
|---|---|---|---|---|
| DRAGENデマルチプレクス | NGS解析の迅速なデマルチプレクスを実行 | |||
| DRAGEN ORA Compression | データ整合性の維持と同時に、FASTQファイルの高圧縮率だけでなく、高速圧縮と高速解凍にも最適化されています。 |
|
設計上の検討事項と手法 | |
| DRAGEN Map + Align | スタンドアロンとして、またはDRAGENの一連のパイプラインの一部として実行できます。 |
|
|
|
| DRAGEN Germline | 精度を高める高度なエラーモデルキャリブレーション、Illumina Expansion Hunterによるリピート伸長検出とジェノタイピングなど、エンドツーエンドのNGS解析を提供します。 |
|
|
|
| DRAGEN Somatic | 腫瘍サンプルの体細胞バリアントを検出するために設計された、Tumor-onlyモードとTumor-normalモードがあります。どちらのモードも倍数性を仮定しないため、低頻度アリルの検出が可能です。 |
|
|
|
| DRAGEN Enrichment | DRAGENの生殖細胞系と体細胞系のコーラーを、エンリッチメントサンプルの解析専用に設計されたパイプラインにまとめたものです。エンリッチメントメトリクスとレポート作成一式が含まれます。 |
|
|
|
| DRAGEN RNA | スプライスジャンクションの発見とアライメントから始まり、迅速なアライメントとスプライスジャンクションのマッピングと定量化に続くトランスクリプトーム解析を実行します。（差次的発現について、イルミナは、BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Differential Expressionアプリを推奨します。） |
|
|
|
| DRAGEN Single Cell RNA | デマルチプレクス、セルバーコードおよびUMIエラー補正、Sequence Alignment Map（SAM）形式、遺伝子発現の定量化を実行します。 |
|
||
| DRAGEN Joint Genotyping | 複数のゲノムにまたがってバリアントを共同でコールし、精度を損ねることなく迅速なスピードで大規模なサンプルコホートにスケーリングします。 |
|
|
大規模ヒトゲノム研究のためのハイブリッドクラウドシステム |
| DRAGEN Methylation | アライメントとメチルコーリングを実行します。アライメントおよびメチル化メトリクスを計算します。 |
|
||
| DRAGEN Reference Builder | FASTAファイルを受け入れ、DRAGENアプリが使用する独自のリファレンスを構築します。 | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA解析ソフトウェア | TruSight Oncology 500 ctDNAの二次解析サポートを提供します。ローカルDRAGEN サーバー（バージョン3）でのみ利用可能 |
|
|
cfDNAアッセイを検証するための血液TMB標準物質の開発 |
| DRAGEN Imputation | スケーラブルなローパス全ゲノムシーケンス解析を可能にするエンドツーエンドのユーザーフレンドリーなツールを提供します。 |
|
バリアントコール性能 |
a. SNV：1塩基変異、CNV：コピー数多型、SV：小型バリアント、TMB：腫瘍変異量、MSI：マイクロサテライト不安定性、HLA：ヒト白血球抗原
変異を検出して新しいバリアントを特定し、COVID-19宿主反応を研究し、調査結果を共有データベースに提供します。
エクソームシーケンス用の Illumina DNA Prep with Enrichment と DRAGENの解析パワーを合わせることで、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルにおける効率的、高精度のバリアント解析が可能になります。
エクソームシーケンス用の Illumina DNA Prep with Enrichment と DRAGENの解析パワーを合わせることで、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルにおける効率的、高精度のバリアント解析が可能になります。
NanoString GeoMx DSPと実績のあるイルミナのシーケンスを組み合わせることで、遺伝子とタンパク質のプロファイリングに必要な高プレックスの空間解析と組織構造に関する情報が得られます。
DRAGEN解析機能の詳細、注文方法、製品ドキュメントの検索についての詳細をご覧ください。製品に関するお問い合わせにもお答えいたします。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。