WGS、RNA-seq、エクソーム/エンリッチメント、アンプリコン、16Sメタゲノミクスなど、幅広いNGSメソッドをサポート
DRAGEN二次解析は、幅広いゲノム解析機能のためのアプリケーションとパイプラインを提供します。DRAGENアプリは、BaseSpace Sequence Hub上のクラウドで、正確で効率的で安全な解析を提供します。DRAGENパイプラインは、オンプレミスサーバーを介して、Illumina Connected Analyticsのクラウドで、またはNextSeq 1000およびNextSeq 2000システム、NovaSeq Xシリーズに搭載して起動できるデータ解析ツールです。
| アプリケーション | DRAGENオンプレミスサーバー | NovaSeq Xシリーズ | NextSeq 1000/2000 | BaseSpace Sequence Hub | コネクテッドアナリティクス |
|---|---|---|---|---|---|
| BCL Convert | チェックマーク
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（カスタムのみ）
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| DRAGEN ORA Compression | チェックマーク
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（カスタムのみ）
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| DRAGEN FASTQ + MultiQC | チェックマーク
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| Whole genome | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系列のみ | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 |
| エンリッチメント（エクソームを含む） | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 | 生殖細胞系 + 体細胞 |
| DNA Amplicon | チェックマーク
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| RNA | チェックマーク
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| Single-Cell RNA | チェックマーク
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| 発現差異 | チェックマーク
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| NanoString GeoMx NGS（空間トランスクリプトミクス） | チェックマーク
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| RNA Amplicon | チェックマーク
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| メチル化 | チェックマーク
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| メタゲノム | チェックマーク
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| RNA Pathogen Detection | チェックマーク
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| COVID | COVIDSeq、COVID系統 | COVIDSeq（クラウドのみ） | COVIDSeq、COVID系統 | ||
| TruSight Oncology 500 | ctDNAが利用可能（固体は近日発売） | v3.10で有効 | チェックマーク
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| ScATAC-Seq（トランスポサーゼでアクセス可能なクロマチンのためのシングルセルシーケンスアッセイ） | チェックマーク
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| インピュテーション | チェックマーク
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| PGx Star Allele Caller | チェックマーク
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| Illumina Complete Long Read | チェックマーク
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| RPIPおよびUPIPパネル | チェックマーク
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Native Explifyソリューション | ベータ版 |
| パイプライン | 説明 | 検出されたバリアントタイプa | 提供されたメトリクス | 論文 |
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| DRAGENデマルチプレクス | NGS解析の迅速なデマルチプレクスを実行 | |||
| DRAGEN ORA Compression | FASTQファイルの圧縮率が高く、データの整合性を保ちながら迅速な圧縮と解凍に最適化 |
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設計上の検討事項と手法 | |
| DRAGEN Map + Align | スタンドアロンまたは |
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| DRAGEN Germline | 精度の向上、Illumina Expansion Hunterによる反復拡張検出とジェノタイピングのための高度なエラーモデルキャリブレーションを含むNGS解析を提供 | 1塩基変異（SNV） インデル コピー数バリアント（CNV） 構造バリアント（SV） リピート伸長 |
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| DRAGEN Somatic | 腫瘍サンプルの体細胞バリアントを検出するために設計された、Tumor-onlyモードとTumor-normalモードがあります。両モードとも倍数性を仮定せず、低頻度のアリルの検出を可能にします | 1塩基変異（SNV） インデル コピー数バリアント（CNV） 構造バリアント（SV） TMB腫瘍変異負荷（TMB） MSI HLA |
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| DRAGEN Enrichment | DRAGEN生殖細胞系と体細胞コーラーを、エンリッチメントサンプルの解析専用に設計されたパイプラインに組み合わせます。エンリッチメントメトリクスとレポート作成のフルスイートを含む | 1塩基変異（SNV） コピー数バリアント（CNV） 構造バリアント（SV） |
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| DRAGEN RNA | スプライスジャンクションの発見とアライメントから始まり、迅速なアライメントとスプライスジャンクションのマッピングと定量化に続くトランスクリプトーム解析を実行します。（差次的発現について、イルミナは、BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Differential Expressionアプリを推奨します。） | 1塩基変異（SNV） インデル 遺伝子融合 |
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Bangladeshi SARS-CoV-2株における点変異の同定 |
| DRAGEN Single Cell RNA | デマルチプレックス、セルバーコード、UMIエラーの補正、シーケンスアライメント、遺伝子発現の定量化を実施 |
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| DRAGEN Joint Genotyping | 複数のゲノムにまたがってバリアントを共同で呼び出し、妥協のない精度で高速でサンプルの大規模コホートにスケーリング | 1塩基変異（SNV） インデル コピー数バリアント（CNV） 構造バリアント（SV） リピート伸長 |
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大規模ヒトゲノム研究のためのハイブリッドクラウドシステム |
| DRAGEN Methylation | アライメントとメチルコーリングを実行します。アライメントおよびメチル化メトリクスを計算します。 |
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| DRAGEN Reference Builder | FASTAファイルを受け入れ、DRAGENアプリが使用する独自のリファレンスを構築 | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA解析ソフトウェア | TruSight Oncology 500 ctDNAの二次解析サポートを提供します。ローカルDRAGEN サーバー（バージョン3）でのみ利用可能 | 1塩基変異（SNV） インデル コピー数バリアント（CNV） DNA融合遺伝子 MSI TMB腫瘍変異負荷（TMB） |
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cfDNAアッセイを検証するための血液TMB標準物質の開発 |
| DRAGEN Imputation | ユーザーフレンドリーなツールでスケーラブルなローパス全ゲノムシーケンス解析を実現 | 1塩基変異（SNV） インデル インデル |
バリアントコールパフォーマンスの向上 |
a. SNV：一塩基バリアント、CNV：コピー数変動、SV：小バリアント、TMB：腫瘍変異量、MSI：マイクロサテライト不安定性、HLA：ヒト白血球抗原
説明：変異を検出して新しいバリアントを特定し、COVID-19宿主反応を研究し、調査結果を共有データベースに提供します。
Illumina DNA PrepとEnrichmentをエクソームシーケンスに組み合わせ、DRAGENの分析能力により、FFPE腫瘍サンプルにおける効率的かつ正確なバリアント解析が可能になります。
Illumina DNA PrepとEnrichmentをエクソームシーケンスに組み合わせ、DRAGENの分析能力により、FFPE腫瘍サンプルにおける効率的かつ正確なバリアント解析が可能になります。
NanoString GeoMx DSPと実績のあるイルミナのシーケンスを組み合わせることで、遺伝子やタンパク質のプロファイリングに必要な組織構造に関する高プレックスの空間解析と情報が得られます。
DRAGEN解析機能の詳細、注文方法、製品ドキュメントの検索。また、専門家に相談して、質問に対する回答を得ることもできます。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。