NovaSeq Xシリーズのご購入
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
DRAGEN二次解析は強力なバイオインフォマティクスソフトウェアスイートで、あらゆる規模のラボによるゲノムデータの活用の幅を拡げます。
Illumina DRAGEN Secondary Analysisのご購入
DRAGEN二次解析でゲノムの洞察を最大化します。最新情報、よくある質問、製品サポートをご覧ください。
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概要
主な特長
ゲノム解析の課題を克服
高度にスケーラブルなDRAGEN解析は、精度を犠牲にしたり、バイオインフォマティクスインフラストラクチャに多額の投資を必要とすることなく、長時間にわたる計算と膨大なデータセットに対応します。再構成可能なフィールドプログラマブルゲートアレイテクノロジー（FPGA）は、さまざまな解析アルゴリズムのハードウェアアクセラレーションを提供します。
幅広いアプリケーションとパイプラインにアクセス
DRAGENアプリとパイプラインは、Illumina Connected AnalyticsとBaseSpace Sequence Hubにより、安全かつコンプライアンスに準拠したクラウド環境で利用できます。一部のパイプラインは、オンプレミスサーバーでも利用でき、NovaSeq Xシリーズ、NextSeq 1000、NextSeq 2000の各システム、およびMiSeq i100シリーズに組み込むことができます。
DRAGENサーバーを介してオンプレミスでConnected Insightsを使用し、DRAGEN サーバー解析パイプラインを体細胞腫瘍学バリアントの解釈とシームレスに統合します。
仕様
| Description | DRAGEN secondary analysis can be used to analyze data from any Illumina sequencing instrument. Certain pipelines are available onboard the NextSeq 1000 and 2000 Systems and NovaSeq X Series. |
|---|---|
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq X System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム |
| ソフトウェアフォーマット | オンプレミス, クラウド, オンボード |
| テクノロジー | シーケンス |
ソフトウェアアップデート
DRAGEN v4.4がオンプレミスとクラウドで利用可能になりました
*使用したHG002ベンチマークサンプルは、NIST T2TQ100とTruvari v.4.2.2およびCMRGのHG002 NIST T2T Q100 v1.1_v0.019（hg38）との比較 – Truvari v.4.2.2のHG002 CMRG v1.0（hg38）との比較、ベンチマーク。
DRAGEN v4.3がNovaSeqXで利用可能になりました
DRAGENがMiSeq i100シリーズで利用可能になりました
†サンプルの推奨に従ってランする場合
DRAGEN v4.2のアップデートには以下が含まれます。
アプリケーション
DRAGEN二次解析アプリケーションは、全ゲノムシーケンス、エクソームシーケンス、シングルセルRNA-Seq、メチル化解析など、1つのプラットフォームで多種の実験に包括的に対応します。
次世代シーケンサー解析のためのソフトウェアソリューション
ラボ
ゲノミクスラボのための効率的なサンプル追跡とワークフロー管理。
ラン
合理化されたクラウドベースのランセットアップとモニタリング。
このソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、およびデータ解析のための使いやすい統合ソリューションを提供します。
アナリティクス
DRAGEN二次解析
NGSデータの正確で包括的、効率的な解析。
Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、当社までお問い合わせください。
BaseSpace Sequence Hubは、一般的なイルミナシーケンス方法に対応したさまざまなNGSデータ分析アプリを提供します。
洞察
Emedgene（バリアント解釈ソフトウェア）は、希少疾患ゲノム解析やその他の生殖細胞研究用の三次解析ワークフローを合理化します。
Illumina Connected Insightsは、腫瘍学臨床研究およびその他の体細胞研究アプリケーションのための三次解析ワークフローを合理化します。
インタラクティブなオミクスのナレッジベースとデータ検索エンジンで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
マルチオミクスデータの解析と視覚化のための使いやすい、バイオインフォマティクスソフトウェア。
クラウドベースのマルチオミクス解析および解釈ソフトウェアで、視覚化、スケーラビリティ、安全なデータ管理を提供し、サンプルから洞察までのワークフローを可能にします。
関連するアプリケーションと手法
全ゲノムシーケンスは、発見に最適な全体像を提供します。新しいゲノムシーケンサーは、これまで以上に高速にWGSを実行します。
全エクソームシーケンスは、ゲノムのタンパク質コード領域を調べ、疾患や集団の健康に対する遺伝的影響を明らかにするために使用されます。
RNA-Seqは、次世代シーケンサー（NGS）を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
次世代シーケンサーで、プロテオームとしても知られる生物内のタンパク質の総体を探求。
プランと価格
DRAGEN二次解析では、オンプレミスサーバー用の1年ライセンスの購入が必要です。すべてのライセンスタイプは、100,000 GB（レベル1）から2,000,000 GB（レベル5）までの5つのレベルで利用できます。
イルミナのシーケンスシステムのご購入には、DRAGENライセンスとオンボードハードウェアが含まれています。BaseSpace Sequence Hub またはIllumina Connected Analyticsを介してクラウドにDRAGENを導入する場合、データの保存および分析には、年間サブスクリプションと追加のiCreditをご購入いただく必要があります。
ドキュメント
製品資料
図
DRAGENパイプラインの柔軟性
DRAGEN解析には柔軟性があるため、さまざまな入力ファイルを挿入し、さまざまな出力文書を作成できます。ユーザーは自分の体験をカスタマイズし、希望するファイル形式を使用して作成できます。実際のステップは、パイプラインごとに異なります。
マルチプラットフォームアクセシビリティ
すべてのラボのNGS解析ニーズに適合するように設計された機能を備えたDRAGEN解析パイプラインアクセスオプション。
イルミナのクラウドプラットフォームにおけるDRAGEN解析
Illumina Connected Analytics上でのDRAGEN解析は、DRAGEN二次解析の精度と速度を、解析パイプラインのカスタマイズ機能と組み合わせ、安全なプラットフォームでインフォマティクスを運用可能な状態にします。
BaseSpace Sequence Hub でのDRAGEN解析により、BaseSpace Sequence Hubのセキュアなコンプライアンス、ストレージ機能により、直感的で使いやすいインターフェースを備えたプッシュボタン式解析機能を提供します。
データセットの例を見る
BaseSpace Sequence Hubのさまざまな方法に関するサンプルデータセットを確認したり、興味のあるDRAGEN二次解析アプリをテストしたりして、結果を双方向的に評価します。ページ内で「dragen」を検索し、DRAGEN解析に固有のデータをご覧ください。
リソース
ビデオリソース
Meet Illumina DRAGEN secondary analysis
イルミナDRAGEN二次解析の紹介
DRAGENはNGSデータの正確で包括的かつ効率的な解析を提供します。
NGSによる先駆的なネコ遺伝学
Zoetis社グループのBasepaws社は、DRAGEN二次解析を活用して、ネコの飼い主がペットの健康に関する洞察を得るための消費者直送DNAキットを開発しています。
Kazusa DNA Research Institute：DRAGENが複雑な植物ゲノムの解析時間を短縮する方法
磯部祥子博士は、DRAGEN二次解析により、大規模植物ゲノムの解析が従来の手法の約40分の1の時間で完了できたことについて共有しています。
オーストラリアのコアラ保全プログラムでは、全ゲノムシーケンスを使用して種の保全に取り組んでいます
シドニー大学の研究者は、DRAGEN解析を使用して、希少で絶滅危惧種の全ゲノムシーケンスを強化し、保全計画に情報提供を行っています。
GeneDx：DRAGENによる運用上の成長の実現
GeneDxの最高イノベーション責任者、Kyle Retterer氏が、DRAGENサーバーを既存のオンプレミスソリューションにシームレスに統合し、コスト削減と、ターンアラウンドタイムの短縮を実現した事例を詳しく説明します。
その他のリソース
ハンブルクにあるCardio-CARE社は、2台のDRAGENで1ペタバイトのデータを処理し、心臓病の理解を深めました。
施設全体がゲノミクスを日常のケアにうまく統合する方法
Illumina DRAGEN Server v4
20051343
初年度Avance Exchangeサポートが含まれます。年間DRAGENライセンスの購入が必要です。
List Price:
Discounts:
DRAGEN Server Lvl 1 1 year License
20060397
オンプレミスサーバー用100,000 Gbのスループット
DRAGEN Server Lvl 2 1 year License
20060398
オンプレミスサーバー用250,000 Gbのスループット
DRAGEN Server Lvl 3 1 year License
20060399
オンプレミスサーバー用500,000 Gbのスループット
DRAGEN Server Lvl 4 1 year License
20060400
オンプレミスサーバー用1,000,000 Gbのスループット
DRAGEN Server Lvl 5 1 year License
20060401
オンプレミスサーバー用2,000,000 Gbのスループット
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よくある質問
DRAGENは、マルチゲノムリファレンスや機械学習アルゴリズムなど、さまざまな最先端テクノロジーにより高精度を実現します。詳細については、Accuracy improvements in germline small variant calling（生殖系列の小規模バリアントコールの精度の向上）のテクニカルノートをご覧ください。
DRAGEN解析は、高度に再構成可能なフィールドプログラマブルゲートアレイ（FPGA）を使用して、ゲノム解析アルゴリズムのハードウェアアクセラレーションを提供します。アルゴリズムはロジック回路として実装され、ほぼ瞬時の出力を提供します。FPGAは並行して操作できるため、CPUベースのシステムの場合のようにノードに依存しません。
いいえ、DRAGEN解析はDRAGENサーバーでのみ実行できます。また、ユーザーには、ライセンスの使用を特定のサーバーに結び付ける独立したライセンスも発行されます。
BaseSpace Sequence Hub DRAGENアプリは、オンサイトのDRAGENサーバーにあるパイプラインを模倣しており、オンサイトのパイプライン（アプリと同じソフトウェアバージョン）と同じ結果が得られるはずです。ただし、オンサイトのDRAGENサーバーで利用可能なパイプラインやソフトウェアのバージョンによっては、BaseSpace DRAGENアプリとして利用できない場合があります。必要に応じて、BaseSpace DRAGENアプリとしてオンサイトパイプラインをリリースできるよう努めています。
DRAGEN解析は、物理的DRAGENシステムとクラウドベースのDRAGENシステム間の安全なデータ転送を通じて、オンサイト、ホスト、またはその両方のハイブリッドとして利用できます。ハイブリッドソリューションにより、ユーザーは、より高い解析能力が必要な場合に、クラウドでワークフローをスケールアップする柔軟性を得ることができます。
DRAGEN解析システムは、一度に1人のユーザーのみが使用できます。複数のユーザーを取り扱う最善の方法は、ユーザーからのジョブを受け入れ、DRAGENソフトウェアによる処理のためにキューに入れることができるジョブキューツールを使用することです。このツールは、一度に1つのジョブでDRAGENソフトウェアを呼び出し、ジョブが完了するとユーザーに通知します。DRAGEN解析は、SlurmまたはLSF（Load Sharing Facility）スケジューラーと連携し、複数のユーザーを管理します。
オンサイトおよびクラウド解析では、DRAGENは利用可能なすべてのFPGAおよびCPUリソースを使用して、一度に1つのサンプルを処理します。通常、ランタイムは非常に高速であるため、単一のDRAGENサーバーでNovaSeq 6000システムランに簡単に対応できます。多くのNovaSeq 6000システムで大規模なWGS処理を行うには、追加のDRAGENサーバーが必要になる場合があります。また、多くのDRAGENインスタンスをクラウドで並列にスケジュールすることもできます。この場合も、各インスタンスは1つのサンプルを処理します。
現在、装置上のDRAGENは、NextSeq 1000/2000およびNovaSeq Xで利用でき、追加のライセンスは必要ありません。搭載されているアプリケーションや機能は装置ごとに異なり、搭載されているものとは異なります。詳細については、アプリケーション表を参照してください。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500 v2
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
BaseSpace Sequence Hubのご注文
BaseSpace Sequence Hubで、ランの管理、解析、保存、シーケンスデータの共有を行います。アプリケーション、サブスクリプションオプション、ドキュメントを検索。
Illumina Connected Analyticsの注文
Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、当社までお問い合わせください。
Clarity LIMSソフトウェア
高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システムにより、遺伝子解析ラボはサンプルを追跡し、ワークフローを効率的かつ安全に管理することができます。
参考文献
- イルミナ社内データ、2024年 DRAGENサーバー v4.3を使用して計算されたランタイム。構造バリアント、リピート伸長、ターゲットコーラーのフルスイートコーリングが含まれます。
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