Correlation Engine

インタラクティブなオミクスの知識ベースとデータ検索エンジンで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。

概要

世界最大の生物学的データベースの1つであるCorrelation Engineは、ライフサイエンス分野の研究者に、膨大な数の高品質なオミクススケール解析と洞察に富んだ科学的ツールへの前例のないアクセスを提供します。 この知識ベースは、 オミクス研究の標準化された解析から導き出された数十億のデータポイントを精査することで、新たな発見を促進します。 独自のアルゴリズムが相関解析を自動化して簡素化し、プライベートデータと数千の公開データセットをスキャンすることで、比較可能な洞察を導き出します。"

Correlation Engineが提供するもの:

  • 包括的:生物学的状況を判断するための一連のアプリケーション、キュレーションされたデータセットの拡大を続けるライブラリー、複数の種やマルチオミクスデータセットに対応するサポート。

  • 使いやすい:シンプルなグラフィカルユーザーインターフェースを使用して、ガイド付きワークフロー、タッチパネル式のアプリケーション、APIを効果的に活用します。

  • 高品質な公開データ:26,000件以上(189,000件以上のシグネチャーから)のマルチオミクス研究にアクセスできます。これらの研究は、DRAGENによって検証、再解析され、厳格な品質管理プロセスと照らし合わせたものです。

仕様

コンプライアンス認証

アプリケーション

Correlation Engineは、プライベートデータを、高度にキュレーションされた公開データと生物学的コンテキストに統合する、使いやすいインタラクティブなゲノミクス解析プラットフォームを提供します。アプリケーションは、疾患メカニズム、薬物ターゲット、予後または予測バイオマーカーを特定するための初期段階の研究をサポートします。

ソフトウェア製品ポートフォリオ

1
ラボ
2
ラン
3
アナリティクス
4
洞察

Correlation Engine

インタラクティブなオミクスの知識ベースで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。

Partekフロー

Partek Flowソフトウェアは、使いやすいバイオインフォマティクスプラットフォームで、ビジュアルユーザーインターフェースで次世代シーケンサーと大規模マルチオミクスデータの解析を簡素化します。

主な使用例

バイオマーカーの探索と検証

重要なバイオマーカーを同定し、シグネチャー中のどの遺伝子が主な疾患領域の最良マーカー、最適な治療ターゲット、および作用機序を提供するのかを探索します。

ドラッグリポジショニング

逆相関を探索し、薬剤の新しい目的を示す遺伝子-疾患化合物間の繋がりを発見します。

作用機序

公開データや内部データのシグネチャーとの相関を見つけ、さらにパスウェイなどの生物学的状態や機能に対応するシグネチャーを特定することで、作用機序の解明を支援します。 

薬物安全性とトキシコゲノミクス

公開されている毒性試験を活用して化合物のシグネチャーを評価し、キュレーションされた研究やメタ解析アプリを利用して、他の既知の毒性ゲノムシグネチャーとの重複を明らかにします。


関連するアプリケーションと手法

本製品の用途例

ドキュメント

製品資料

オミクスデータから探索へ、道のりを加速

Correlation Engineの256 Kのキュレーションオミクスシグネチャーにより、データを迅速に相関付け、データに関する質問します。

さまざまなデータタイプを関連付ける

特定のクエリに対する新しい相関と関連性が迅速に特定され、遺伝子、疾患、化合物、組織、パスウェイ間のデータ主導の関連性が明らかになります。

Body Atlas

Body Atlasは、遺伝子が発現される場所とその場所における発現レベルに関する洞察を提供します。

Disease Atlas

Disease Atlasは、照会されたデータに関連する疾患、形質、および状態間の相関関係を提供します。

Pharmaco Atlas

Pharmaco Atlasは、化合物の探索、化合物に対するゲノムおよびエピゲノムの応答、およびクエリデータに関連する治療に役立ちます。

メタ解析

データシグネチャーの集合を使用してクエリを実行し、コンセンサスシグネチャーを導き出すほか、相関のあるバイオグループ(パスウェイ、機能グループなど)を探索することもできます。ダウンロード可能なヒートマップで結果を表示

リソース

動画資料

サムネール

Correlation Engineにおける遺伝子中心コンテンツの定量化

Correlation Engineに収録されている189,000件を超えるデータシグネチャーから得られる有意な結果を、効率的に調査・定量化する方法をご紹介します。

サムネール

Correlation Engineのチュートリアル - マルチオミクスの本質を見極める

Correlation Engineから有益な分析結果を引き出す3つの一般的な方法をご紹介します。

その他のリソース

Correlation Engine文献検索アプリケーションを無料でお試しください。

Correlation Engineを活用した高度なマルチオミクス解析ワークフローをご覧ください。

 

イルミナの包括的なディスカバリープラットフォーム、Correlation Engineなら、増え続ける複雑なオミクスデータから有益な洞察を導き出すことができます。その方法をご覧ください。

Partek Flowデータビューアーは、直感的な設定方法と機能を備えた視覚化機能を備えています。 このデモで、生産性を向上させる方法をご覧ください。

よくある質問(FAQ)

RNA発現(RNA-Seq、発現アレイ)、ジェノタイピング/SNP GWAS、DNAタンパク質相互作用解析、体細胞変異解析、DNAメチル化解析をサポートします。

はい、このような知識ベースのシグネチャーは、Correlation Engineではバイオグループと呼ばれます。Pathway Enrichmentアプリを使用して、GOコンソーシアムMSigDBTargetScanInterProの遺伝子またはタンパク質セットに対応するバイオグループでバイオセットが濃縮されているかどうかを判断します。 

Correlation Engineは、NCBI Gene ID、遺伝子記号、NCBIアクセッション番号、ENSEMBL ID、RefSeq識別子、IPI ID、およびほとんどのAffymetrix、Illumina、Agilent、およびGE HealthcareプラットフォームからのカスタムIDを含む、ほとんどの公開および標準商用プラットフォーム識別子を認識します。

Correlation Engineは、独自のランクベースの統計を使用して、インポートするデータとその他すべての実験データの間の関連性を計算します。これにより、実験結果を世界の実験の文脈に当てはめて、結果を検証し、新しい関連性を探索し、新しい実験をデザインすることができます。また、すべてのバイオグループとデータを関連付けるため、研究を構成する遺伝子やタンパク質に共通する特徴を探索できます。

Correlation Engineについては26,000を超える研究があり、 190,000を超える公開データシグネチャーに対応しています。Correlation Engineの研究は毎週更新されます。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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