研究者がデータを生物学的な状況に当てはめるのに役立つ、高度にキュレーションされた公開データを用いてプライベートオミクスデータを解析するインタラクティブなオミクスナレッジベース。
Correlation Engineは、世界最大の生物学的データベースの1つであり、ライフサイエンス研究者に、膨大な数の高品質な全ゲノム解析と洞察に富んだ科学ツールへの前例のないアクセスを提供します。ナレッジベースは、全ゲノム研究の標準化された解析から得られた数十億のデータポイントを調査することで、新しい発見を可能にします。
Correlation Engineが提供するもの：
Correlation Engineの256 Kのキュレーションオミクスシグネチャーにより、データを迅速に相関付け、データに関する質問します。
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, iScan, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
|---|---|
| Software format | Cloud, Cloud |
| テクノロジー | Microarray, イルミナシーケンサー |
ISO 27001 Certified by Schellman
Illumina has received ISO 27001 certification of its information security management system (ISMS) supporting Correlation Engine. This certification ensures that sensitive data contained or collected by these solutions are protected. The certification was performed by Schellman, an ANSI National Accreditation Board (ANAB) and United Kingdom Accreditation Service (UKAS) accredited certification body based in the US.
ISO 27701 Certified by Schellman
Correlation Engine is compliant with global and local data privacy and requirements with 27701:2019 certification.
GDPR
Correlation Engine features multiple system controls that you can use to manage authorization, authentication, and data control, including deletion as needed. Access logs are retained for seven years. These features help researchers ensure compliance with the General Data Protection Regulation.
Correlation Engineは、プライベートデータを生物学的な状況に、高度にキュレーションされた公開データとともに置く、使いやすいインタラクティブなゲノミクス解析プラットフォームを提供します。アプリケーションは、疾患のメカニズム、薬剤ターゲット、予後バイオマーカーまたは予測バイオマーカーを特定するための早期研究をサポートします。
高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システムにより、遺伝子解析ラボはサンプルを追跡し、ワークフローを効率的かつ安全に管理することができます。
安全で高性能なシーケンス操作のための使いやすいクラウドベースのゲノムラン管理とバイオインフォマティクスコンピューティングおよびストレージ環境。
NGSデータを正確、包括的かつ効率的に二次解析します。
BaseSpace Sequence Hubでは、イルミナの一般的なシーケンス手法で使えるNGSデータ解析アプリをご提供しています。
シーケンサーのシームレスな統合と柔軟なワークフローのための安全でスケーラブルなバイオインフォマティクスプラットフォーム。
Correlation Engine
プライベートなオミクスデータを、高度にキュレーションされた公開データとともに生物学的な文脈に当てはめるインタラクティブなオミクス知識ベース。
説明可能なAIとユーザー設定の自動化のサポートにより、希少疾患ゲノミクスやその他の生殖細胞系研究アプリケーションのための高効率 データ解釈ワークフローを実現します。
重要なバイオマーカーを同定し、シグネチャー中のどの遺伝子が主な疾患領域の最良マーカー、最適な治療ターゲット、および作用機序を提供するのかを発見します。
逆相関を探して、薬剤の新たな目的を示す遺伝子と疾患の化合物の関連性を発見します。
キャンパス全体の研究者が、高度にキュレーションされたパブリックオミクスデータを照会し、使用して、データを状況に合わせ、研究プロジェクトを加速し、出版物を作成できるようにします。
公開されている毒性試験を活用して化合物のシグネチャを評価し、キュレーションされた研究やメタ解析アプリを使用して、他の既知の毒性ゲノムシグネチャとの重複を明らかにします。
イルミナは、医薬品開発パイプラインの多くのフェーズのNGSシステム、製品およびサービスの革新的ポートフォリオを提供しています。
マルチオミクスプロファイリングを使用して発見力を高め、遺伝型と表現型のマッチング精度を高めます。
SARS-CoV-2サーベイランスのための包括的な解析ソリューション
コロナウイルスの検出と同定の加速化、宿主応答研究の実行、サンプル追跡の簡素化、公開データベースへの貢献を無料で実施します。
さまざまなデータタイプを関連付ける
特定のクエリに対する新しい相関や関連性が迅速に特定され、遺伝子、疾患、化合物、組織、パスウェイ間のデータ主導の関連性が明らかになります。
Body Atlas
Body Atlasは、遺伝子が発現する場所とその場所における発現レベルに関する洞察を提供します。
Disease Atlas
疾患アトラスは、照会されたデータに関連する疾患、形質、および状態間の相関関係を提供します。
Pharmaco Atlas
Pharmaco Atlasは、化合物の発見、化合物に対するゲノムおよびエピゲノムの応答、およびクエリデータに関連する治療を支援します。
バリアントアノテーションと解析ソフトウェアツールは研究者が、膨大なゲノムデータから生物学的洞察を抽出してレポート作成するのに役立ちます。
Correlation Engineを活用した高度なマルチオミクス解析ワークフローをご覧ください。
いいえ。現在、Correlation Engineはヒト生物学と動物モデルシステムのみをサポートしています。しかし、このプラットフォームは感染に対する宿主の反応を解析するために使用することができます。
Correlation Engineは、RNA発現（RNA-Seq）、ジェノタイピング/SNP GWAS、DNAタンパク質相互作用解析、体細胞変異解析、DNAメチル化解析をサポートします。
Correlation Engineは、インタラクティブで使いやすいインターフェースとあらかじめ構築されたワークフローを、高品質でキュレーションされた包括的な公開データと組み合わせて、ユーザーが遅延なく次の実験に進むことができるように迅速な結果を可能にします。
Correlation Engineには23,000を超える研究があります。Correlation Engineの研究は毎週更新されます。
Correlation Engineは、NCBI Gene ID、遺伝子記号、NCBIアクセッション番号、ENSEMBL ID、RefSeq識別子、IPI ID、およびほとんどのAffymetrix、Illumina、Agilent、およびGE HealthcareプラットフォームからのカスタムIDを含む、ほとんどの公開および標準商用プラットフォーム識別子を認識します。
Correlation Engineは、独自のランクベースの統計を使用して、インポートするデータと他のすべての実験データの間の関連性を計算します。これにより、実験結果を世界の実験の文脈に当てはめて、結果を検証し、新しい関連性を発見し、新しい実験を設計することができます。すべてのバイオグループとデータを関連付けるため、研究を構成する遺伝子やタンパク質に共通する特徴を発見できます。
Correlation Engineは、PubMedの1,900万を超える抄録とPubMed Centralの130,000を超える全文論文のインデックスを作成します。文献検索では、Correlation Engineは以下のようないくつかのヒューリスティックを使用します。
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
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プライベートデータと公開データセットを組み合わせた研究デザインツールで、コホートを迅速に構築し、探索します。
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