インタラクティブなオミクスのナレッジベースとデータ検索エンジンで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
世界最大の生物学的データベースの1つである Correlation Engine は、ライフサイエンス分野の研究者に、膨大な数の高品質なオミクススケール解析と洞察に富んだ科学的ツールへの前例のないアクセスを提供します。 このナレッジベースは、 オミクス研究の標準化された解析から導き出された数十億のデータポイントを精査することで、新たな発見を促進します。 独自のアルゴリズムが相関解析を自動化して簡素化し、プライベートデータと数千の公開データセットをスキャンすることで、比較可能な洞察を導き出します。"
Correlation Engine が提供するもの：
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム研究（RUO）モード, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, iScan, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
|---|---|
| ソフトウェアフォーマット | クラウド |
| テクノロジー | マイクロアレイ, シーケンス, リアルタイムPCR |
Schellman の ISO 27001 認証
イルミナでは、Correlation Engineをサポートする情報セキュリティ管理システム（ISMS）にISO 27001認証を取得しています。この認証は、これらのソリューションに含まれるまたは収集された機密データを保護します。この認証は、米国を基盤とする米国適合性認定機関（ANAB）および英国認証機関認定審議会（UKAS）公認の認定機関である Schellman によって実施されました。
Schellman によって認証された ISO 27701
Correlation Engine は、27701:2019 認証取得済みのグローバル／ローカルのデータプライバシーと要件に準拠しています。
GDPR
Correlation Engine は、認定、認証、必要に応じた削除を含むデータ管理を行うことを可能にする、複数システム管理の機能を持っています。アクセスログは7年間保存されます。これらの機能は、研究者が General Data Protection Regulation（一般データ保護規則）に準拠できるようサポートします。
Correlation Engine は、プライベートデータを、高度にキュレーションされた公開データと生物学的コンテキストに統合する、使いやすいインタラクティブなゲノミクス解析プラットフォームを提供します。アプリケーションは、疾患メカニズム、薬物ターゲット、予後または予測バイオマーカーを特定するための初期段階の研究をサポートします。
遺伝子解析ラボにおけるサンプル追跡と、ワークフローの効率的かつ安全な運用を支援する、高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システムです。
BaseSpaceによるリアルタイムシーケンスデータ、クラウド解析、ラン監視。
このソフトウェアは、シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、およびデータ解析のための使いやすい統合ソリューションを提供します。
次世代シーケンサー（NGS）データ解析のための、精確で包括的かつ効率的なバイオインフォマティクスパイプライン。
BaseSpace Sequence Hubは、Illuminaの一般的なシーケンス手法に対応した、多彩なNGSデータ解析アプリを提供しています。
Illumina BioInsight Platform Coreは、DRAGENアプリを使用したゲノミクスデータ、パイプライン、および解析向けのスケーラブルなクラウドを提供します。
Correlation Engine
生物学的コンテキストにおいて、プライベートなオミクスデータと高度にキュレーションされた公開データを比較できる、オミクスのインタラクティブなナレッジベースです。
インタラクティブな視覚化、インフラストラクチャのスケーラビリティ、そして安全なデータ管理を備えた、サンプルから洞察までのワークフローを実現する、強力なクラウドベースのマルチオミクス解析および解釈ソフトウェアです。
説明可能な AI とユーザー設定の自動化のサポートにより、希少疾患のゲノミクスやその他の生殖細胞系研究アプリケーションのための高効率 データ解釈ワークフローを実現します。
体細胞腫瘍学研究アプリケーションをはじめ、幅広い用途に対応した効率的なバリアント解釈を実現します。
重要なバイオマーカーを同定し、シグネチャー中のどの遺伝子が主な疾患領域の最良マーカー、最適な治療ターゲット、および作用機序を提供するのかを探索します。
逆相関を探索し、薬剤の新しい目的を示す遺伝子-疾患化合物間の繋がりを発見します。
公開データや内部データのシグネチャーとの相関を見つけ、さらにパスウェイなどの生物学的状態や機能に対応するシグネチャーを特定することで、作用機序の解明を支援します。
公開されている毒性試験を活用して化合物のシグネチャーを評価し、キュレーションされた研究やメタ解析アプリを利用して、他の既知の毒性ゲノムシグネチャーとの重複を明らかにします。
研究者らは、イルミナのCorrelation Engineを活用して成果を上げています
包括的なデータベースを活用し、探索と論文発表を迅速化している、ピッツバーグ大学ヘルスサイエンスライブラリーの研究者の事例をご紹介します。
オミクスデータから発見へ、道のりを加速
Correlation Engineの256 Kのキュレーションオミクスシグネチャーにより、データを迅速に相関付け、データに関する質問します。
さまざまなデータタイプを関連付ける
特定のクエリに対する新しい相関と関連性が迅速に特定され、遺伝子、疾患、化合物、組織、パスウェイ間のデータ主導の関連性が明らかになります。
Body Atlas
Body Atlas は、遺伝子が発現される場所とその場所における発現レベルに関する洞察を提供します。
Disease Atlas
Disease Atlasは、照会されたデータに関連する疾患、形質、および状態間の相関関係を提供します。
Pharmaco Atlas
Pharmaco Atlas は、化合物の探索、化合物に対するゲノムおよびエピゲノムの応答、およびクエリデータに関連する治療に役立ちます。
メタ解析
データシグネチャーの集合を使用してクエリを実行し、コンセンサスシグネチャーを導き出すほか、相関のあるバイオグループ（パスウェイ、機能グループなど）を探索することもできます。ダウンロード可能なヒートマップで結果を表示。
Correlation Engine に収録されている189,000件を超えるデータシグネチャーから得られる有意な結果を、効率的に調査・定量化する方法をご紹介します。
Correlation Engine から有益な分析結果を引き出す3つの一般的な方法をご紹介します。
Correlation Engine 文献検索アプリケーションを無料でお試しください。
Correlation Engine を活用した高度なマルチオミクス解析ワークフローをご覧ください。
イルミナの包括的なディスカバリープラットフォーム、Correlation Engine なら、増え続ける複雑なオミクスデータから有益な洞察を導き出すことができます。その方法をご覧ください。
Partek Flow データビューアーは、直感的な設定方法と機能を備えた視覚化機能を備えています。このデモで、生産性を向上させる方法をご覧ください。
RNA 発現（RNA-Seq、発現アレイ）、ジェノタイピング/SNP GWAS、DNA タンパク質相互作用解析、体細胞変異解析、DNA メチル化解析をサポートします。
はい、このようなナレッジベースのシグネチャーは、Correlation Engine ではバイオグループと呼ばれます。Pathway Enrichment アプリを使用して、GOコンソーシアム、MSigDB、TargetScan、InterPro の遺伝子またはタンパク質セットに対応するバイオグループでバイオセットが濃縮されているかどうかを判断します。
Correlation Engine は、NCBI Gene ID、遺伝子記号、NCBI アクセッション番号、ENSEMBL ID、RefSeq 識別子、IPI ID、およびほとんどの Affymetrix、Illumina、Agilent、および GE Healthcare プラットフォームからのカスタム ID を含む、ほとんどの公開および標準商用プラットフォーム識別子を認識します。
Correlation Engine は、独自のランクベースの統計を使用して、インポートするデータとその他すべての実験データの間の関連性を計算します。これにより、実験結果を世界の実験の文脈に当てはめて、結果を検証し、新しい関連性を探索し、新しい実験をデザインすることができます。また、すべてのバイオグループとデータを関連付けるため、研究を構成する遺伝子やタンパク質に共通する特徴を探索できます。
Correlation Engine については26,000を超える研究があり、190,000を超える公開データシグネチャーに対応しています。 Correlation Engine の研究は毎週更新されます。
Correlation Engineの詳細および30日間の無料トライアルについては、お問い合わせください。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な汎がん（Pan-Cancer）パネルでCGPを実現します。
幅広いシーケンスアプリケーションに対応するライブラリー調製を実現する、高速で統合されたワークフローです。
Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、弊社までお問い合わせください。
Illumina DRAGENアプリとパイプラインで、ゲノムの洞察を最大化します。最新情報、よくある質問、製品サポートをご覧ください。
プライベートデータと公開データセットを組み合わせて、コホートを迅速に構築および調査する試験デザインツールです。
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