低インプットDNAおよびRNAサンプルに対応した、既存パネルとカスタマイズ可能なパネルを備えた包括的なターゲットリシーケンスソリューション
AmpliSeq for Illumina製品は、低インプットDNAおよびRNAサンプルを用いたアンプリコンシーケンス向けに、高速かつ高度にマルチプレックス化されたPCRベースワークフローを実現します。AmpliSeq for Illuminaケミストリーは、イルミナの次世代シーケンサー（NGS）システムと互換性があり、疾患研究アプリケーション向けに高品質なデータを提供します。1回のランで数個から数百の遺伝子をターゲットにすることで、研究者の効率向上を支援します。
疾患または表現型に関連する重要な遺伝子をターゲットとするAmpliSeqケミストリーを使用した、事前に設計されたシーケンスパネル。
無料で、ユーザーフレンドリーなオンラインツールを使って、目的のコンテンツのために最適化した、カスタムシーケンスパネルを作成します。
ご希望の遺伝子でアンプリコンパネルを作成します。遺伝性疾患の研究に関連する既知の内容を含む、事前検査済みの遺伝子カタログから選択します。
これらの事前設計されたシーケンスパネルには、主要な疾患研究者からのインプットに基づいて選択および設計されたコンテンツが含まれています。
固形腫瘍との関連が判明している52種の遺伝子を調べるターゲットDNA／RNA研究パネル。
T細胞受容体ベータ鎖の再構成をシーケンスすることで、腫瘍サンプル中のT細胞の多様性とクローンの拡大を測定するためのFFPE互換パネル。
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
ライブラリー調製は、対象ゲノム領域のマルチプレックスPCR増幅から始まり、DNAまたはcDNAの入力量は最小1 ngから対応可能です。PCR後、残りのプライマーは消化され、残存するアンプリコンを用いてライブラリーを調製し、イルミナのNGSシステムでターゲットシーケンスを実施します。
シーケンスには、広く採用されているSequence by Synthesis（SBS）法を使用します。クラウド上のDRAGEN AmpliconパイプラインまたはLocal Run Managerを用いて装置上で実施することで、高度なバイオインフォマティクスのリソースがなくても高精度のデータ解析結果を得ることができます。
さまざまなサンプルタイプから得られたAmpliSeq for Illuminaのロバストな性能についてご覧ください。
マルチプレックスPCRベースのワークフローにより、高品質なライブラリーを迅速かつ簡単に調製できます。 ライブラリー調製には合計約5～7時間を要し、ハンズオンタイムは1.5時間です。シーケンスには17～32時間かかり、データ解析の所要時間は条件により異なります。
ユーザーフレンドリーなアッセイデザイン：
AmpliSeq for Illuminaパネルオプション：
BaseSpace Sequence Hubを活用し、AmpliSeq for Illuminaのデータをクラウド上で効率的に管理、解析、共有する方法をご紹介します。
Local Run Manager（LRM）を使用して、オンプレミス環境でアンプリコン解析を実行する手順の概要をご覧ください。
AmpliSeq for Illuminaデータは、DRAGEN Ampliconパイプラインによるクラウドで、またはLocal Run Managerによる装置上で、ユーザーフレンドリーな二次解析ワークフローによって解析することができます。DRAGEN DNA Ampliconは、リードをリファレンスゲノムにアライメントし、小規模バリアントのコールを実行します。DRAGEN RNA Ampliconは、遺伝子発現の差分解析および融合遺伝子のコールを行います。三次解析はCorrelation Engineで実施可能です。
AmpliSeq for Illumina製品は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があります。特に、ベンチトップシーケンスシステムがよく使用されています。
対象遺伝子がAmpliSeq for Illumina Ready-to-Use Panelとして利用できない場合は、DesignStudioアッセイデザインツールを使用してAmpliSeq for Illumina Custom Panelを設計できます。DesignStudioツールは、研究者が目的のターゲット領域を提出し、研究用にカスタマイズされたパネルコンテンツを入手できる無料のウェブベースのアッセイデザインソフトウェアです。
既存のワークフローを移行する場合や、初めてイルミナのテクノロジーを使用する場合は、以下のリソースを確認してください。
iSeq 100システムでのAmpliSeq for Illuminaへの移行
また、イルミナテクニカルサポートへお問い合わせいただくこともできます。
DesignStudioアッセイデザインツールについてサポートが必要な場合は、イルミナテクニカルサポートにお問い合わせください。ご注文に関するサポートが必要な場合は、営業担当者までお問い合わせください。
PCRアンプリコンのウルトラディープシーケンスを行うことで、1回のアッセイで数百のターゲットゲノム領域をコスト効率よく解析します。
NGSが臨床がん研究の可能性を広げ、個別化医療アプローチに貢献する方法をご紹介します。
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AmpliSeq for Illumina製品の詳細については、お気軽にお問い合わせください。
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